假小链双歧杆菌W112对免疫检查点阻断疗法的促进作用研究

该研究分析了一株假小链双歧杆菌W112对PD-1抗体免疫治疗的促进作用。首先通过在小鼠背部皮下注射B16-F10黑色素瘤细胞建立黑色素瘤小鼠模型,随后对肿瘤小鼠进行PD-1抗体治疗、灌胃假小链双歧杆菌W112及两者联合处理。结果表明,灌胃假小链双歧杆菌W112提高了PD-1抗体对肿瘤的抑制率,增加了小鼠的存活率,增加了肿瘤组织的CD8+T细胞浸润,并增加了肿瘤组织白细胞介素-12(interleukin-12,IL-12)和γ-干扰素(interferon-γ,IFN-γ)的富集。收集小鼠粪便并进行宏基因组测序分析发现,灌胃假小链双歧杆菌W112提高了小鼠肠道菌群的多样性,促进了有益菌的富集,降低了有害菌的富集。该研究表明,假小链双歧杆菌W112在促进免疫检查点疗法中具有一定的潜力。

假小链双歧杆菌比较基因组学分析

该研究对分离自中国、日本和美国的104株假小链双歧杆菌进行比较基因组学分析。结果表明,在基因组特征上,日本分离株的编码序列数量显著高于中国和美国分离株(P<0.01)。基于核心基因构建的系统发育树和平均核苷酸一致性聚类热图发现分离自相同国家的菌株更相似。功能基因注释结果进一步表明分离地会影响菌株的功能基因分布,碳水化合物活性酶注释结果显示15个碳水化合物活性酶存在地域性差异;经耐药基因和毒力因子数据库注释发现中国分离株携带的耐药基因和黏附型毒力因子的数量显著高于日本分离株;中国和日本分离株携带复制、重组和修复及噬菌体相关可移动遗传元件数量均与美国分离株存在差异。该研究发现分离地会影响假小链双歧杆菌的功能基因,不同分离地假小链双歧杆菌存在差异功能基因。研究结果可为解析假小链双歧杆菌的功能差异提供理论依据。

不同假小链双歧杆菌对碳水化合物利用能力的比较研究

该研究通过生长曲线和体外发酵实验对12株假小链双歧杆菌利用17种碳水化合物的能力进行了比较探究。从整体上看,假小链双歧杆菌能在葡萄糖、乳糖、低聚半乳糖培养基中达到较高的生长量(OD_(600)≥0.99),在蔗糖、低聚半乳糖培养基中达到高的生长速率(代时≤150 min)。研究发现12株假小链双歧杆菌对于碳水化合物利用具有较大的差异性,其中FJSNT36M3仅能利用5种碳水化合物,而3株菌(FHNBA14M1、FGZ16I1M1、FXJWS49M21)能利用10种以上。3株菌(FGSYC12M4、FGZ16I1M1、FFJND17M1)在9种碳源培养基中的生长速率(代时)和生长量(OD_(600))较高。12株假小链双歧杆菌编码的大多为降解植源性碳水化合物的糖苷水解酶,在碳水化合物利用中展现出的差异可能是因为降解和转运碳水化合物的酶具有差异性。人粪便体外发酵实验证明,假小链双歧杆菌对碳水化合物利用能力的不同与其占据肠道内丰度的潜力相关。

分离自母婴肠道的假小链双歧杆菌的耐药性分析

【背景】由于滥用抗生素导致细菌耐药性日益严重。对于双歧杆菌,人们往往注重其益生功能的挖掘而忽视了对其耐药性的研究,存在一定的安全隐患。【目的】检测母婴肠道中假小链双歧杆菌的耐药性,探究婴儿肠道中假小链双歧杆菌耐药性的来源。【方法】利用微量肉汤稀释法测定48株分离自母婴肠道的假小链双歧杆菌对14种抗生素的耐药性,比较分离自不同家庭母婴肠道中假小链双歧杆菌的耐药性。【结果】48株母婴肠道分离株对四环素、氯霉素、新霉素、环丙沙星100%耐药,对其余10种抗生素耐药率依次为:卡那霉素98%、利福平80%、克林霉素78%、甲氧苄啶63%、红霉素59%、庆大霉素43%、链霉素16%、万古霉素14%、氨苄西林6%、利奈唑胺2%。母婴肠道分离株的耐药性无显著差异,分离自同一家庭母婴肠道的菌株具有相似的耐药表型。【结论】分离自母婴肠道的假小链双歧杆菌对多种抗生素具有耐药性,婴儿肠道中假小链双歧杆菌的耐药性可能是由母亲肠道垂直传递而来。

一名肥胖儿童营养干预后肠道内假小链双歧杆菌碳水化合物利用能力的探究

双歧杆菌被认为是肠道内的有益菌,可以利用膳食中的多种植物多糖或寡糖,能够被人体无法消化的复杂碳水化合物选择性富集。本研究采用序列引导的分离策略,于厌氧条件下采用MRS琼脂培养基,得到了一名肥胖儿童营养干预后肠道内优势的双歧杆菌。采用ERIC指纹图谱技术对分离物进行基因水平上的分型,并通过16S r RNA基因测序鉴定分离株的分类地位。73个双歧杆菌分离物分为5种ERIC类型,均为假小链双歧杆菌。与Bacteroides thetaiotaomicron ATCC 29148、Eschrichia coli D45和Anaerostipes hadrus BPB5这些肠道中常见共生菌的代表菌株相比,丰度最高的ERIC类型代表菌株Bifidobacterium pseudocatenulatum C95利用复杂碳水化合物的能力更强。Bifidobacterium pseudocatenulatum C95被膳食中的复杂碳水化合物和益生元显著富集,成为该儿童营养干预后肠道内的优势菌。菌株自身较强的碳水化合物利用能力可能是其生长优于肠道中其他共生细菌的原因。

一株人源假小链双歧杆菌缓解小鼠DSS致溃疡性结肠炎

肠道菌群在炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)发生发展中十分重要,通过补充有益菌预防和治疗IBD是有潜力的手段。因此,仍需发现和筛选更多能够改善IBD的益生菌。假小链双歧杆菌C95菌株是从一名肥胖儿童膳食干预后的粪便样品中分离而来,已被证明在宿主慢性炎症降低及相关的肥胖等表型改善中有重要作用。本研究探究C95菌株对葡聚糖硫酸钠(dextran sulphate sodium,DSS)致溃疡性结肠炎小鼠的疾病表型及肠道菌群的影响。给DSS处理的小鼠补充灌胃C95菌株后,小鼠的体重损失、疾病活动指数增加和结肠缩短等指标得到显著的改善。另外,补充C95菌株小鼠肠道菌群alpha多样性显著下降。基于Bray-Curtis距离的主坐标分析证明C95菌株明显改变了小鼠的肠道菌群整体结构,并且在门和属水平的肠道菌群组成也与对照组有显著差异。我们通过随机森林模型鉴定出67个响应C95菌株的可操作分类单元(operational taxonomic units,OTU),其中50个OTU的丰度在C95组中显著降低;8个OTU的丰度显著增加。综上,假小链双歧杆菌C95菌株缓解了小鼠的DSS致急性溃疡性结肠炎并改变了其肠道菌群。这些发现预示C95菌株或通过调节肠道菌群来发挥抗炎效果,并可能作为新型潜能益生菌应用于炎症性肠病的治疗。