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题名先天性晚发白内障FVB小鼠突变基因定位及筛选
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作者
庞铂实
钱强
徐园
肖君华
周宇荀
李凯
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机构
东华大学化学化工与生物工程学院
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出处
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2020年第1期81-87,共7页
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基金
上海市创新行动计划课题(17140903100)
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文摘
目的以自发突变导致的先天性晚发白内障小鼠为模型,进行遗传方式鉴定和白内障相关基因定位分析。方法首先通过显微镜观察组织切片鉴定白内障病理状态,其次通过构建家系确定先天性晚发白内障在FVB小鼠中的遗传方式,其次利用多重PCR靶向测序进行100只F2代小鼠的全基因组SNP扫描定位,最后利用全外显子测序筛选出候选突变基因。结果组织切片表明自发突变引起为典型白内障性状,全基因组扫描定位显示11号染色体上的rs4228772 SNP位点与白内障表型连锁程度最高;全外显子测序结果进一步表明11号染色体上有三个基因产生了自发突变,分别是Sfi1,Obscn和Ptrh2。结论本研究使用全基因组SNP扫描连锁分析与外显子测序相结合的策略,可在已知参考基因组的物种中快速定位基因突变,结果确定了11号染色体上的三个突变基因为先天性晚发型白内障的候选基因,并以显性方式遗传。该策略亦可应用于其它遗传背景清晰的模式哺乳动物的基因功能研究。
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关键词
先天性晚发白内障
FVB小鼠
全基因组扫描连锁分析
全外显子测序
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Keywords
late-onset congenital cataract
FVB mouse
whole-genome scanning linkage analysis
wholeexome sequencing
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分类号
R-33
[医药卫生]
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