克什米尔熊蜂转录组分析及SSR位点开发

作为众多农作物和野生植物的重要传粉者,熊蜂在维持农业和生态系统平衡中发挥十分重要的作用。本研究以克什米尔熊蜂(Bombus kashmirensis)为研究对象,使用Illumina Novaseq平台进行转录组测序,并基于转录组数据进行微卫星位点的开发。结果显示,克什米尔熊蜂转录组测序共获得95 639条测序良好的unigene, GO注释和KEGG通路富集主要集中在分子功能、细胞进程和碳水化合物代谢上。基于转录组数据共获得27 414个微卫星位点,位点发生频率17.81%。简单重复序列主要重复类型为单碱基,其中A/T为优势基元,占总微卫星数量的55.89%,且微卫星主要重复次数范围在11~15次(48.61%)。用10头不同克什米尔熊蜂样品对30个微卫星位点进行验证,有17对引物可稳定扩增。本研究为克什米尔熊蜂的适应与进化等种群遗传学研究提供了重要参考。