基于不同测序技术的微生物群落结构比较

文章分别采用变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)、克隆文库(clone library,CL)及16S rRNA高通量测序(high-throughput sequencing,HS)技术,分析厌氧-缺氧-好氧(anaerobic-anoxic-oxic,A 2/O)反应器稳定运行期间各个反应器内微生物群落结构多样性,评价3种测序技术在具体应用中的特色及其局限性。结果表明:对于厌氧反应器古菌分析,HS比DGGE和CL分别多检测出50.00%、83.00%,而在细菌分析中,HS比DGGE和CL分别多检测出21.42%、50.00%;对于缺氧反应器和好氧反应器中细菌的群落结构分析,3种方法测得的微生物种类差别不大。CL操作简单,适用于样品量少的情况;DGGE能直观地反映微生物群落的变化情况,但1次最多分析32个样品;而在分类水平低时,CL和DGGE会低估样品中微生物物种组成,高估相对丰度。