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大剂量抗乙肝免疫RNA腹腔注射治疗慢乙肝的疗效观察 被引量:5
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作者 蔡聪麟 蔡卫民 刘荣华 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 1998年第1期63-64,共2页
用大剂量抗乙肝免疫RNA腹腔注射治疗31例慢性乙型肝炎患者,HBeAg转阴率或HBVDNA(治前抗HBe阳性)转阴率51.6%,无明显副作用。
关键词 乙型肝炎 慢性 抗乙肝免疫rna 注射疗法
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三阴性乳腺癌免疫相关LncRNA筛选及预后预测模型构建
2
作者 曹雷雨 刘伟 +5 位作者 高艳 马晓丽 魏瑜 渠成程 努尔斯曼古丽·买买提明 张莉 《山东医药》 CAS 2023年第15期28-32,共5页
目的筛选出三阴性乳腺癌(TNBC)免疫相关LncRNA基因,构建TNBC预后预测模型。方法①从癌症基因组图谱(TCGA)项目下载TNBC组织和癌旁组织的转录组RNA表达谱原始数据,结合Immport数据库,筛选TNBC免疫相关的LncRNA。进一步应用单因素及多因素... 目的筛选出三阴性乳腺癌(TNBC)免疫相关LncRNA基因,构建TNBC预后预测模型。方法①从癌症基因组图谱(TCGA)项目下载TNBC组织和癌旁组织的转录组RNA表达谱原始数据,结合Immport数据库,筛选TNBC免疫相关的LncRNA。进一步应用单因素及多因素Cox分析筛选TNBC与预后关系密切的免疫相关LncRNA,然后再根据最佳AIC值确定与预后关系密切的免疫相关LncRNA。②根据预后关系密切的免疫相关LncRNA,构建TNBC预后预测模型。③根据TNBC预后风险模型测算的风险评分值的中位值将TNBC患者样本分为高风险组和低风险组,比较高低风险组生存率。④采用ROC、主成分分析(PCA)评估构建的TNBC预后预测模型的预测效能。⑤采用多因素Cox分析TNBC预后预测模型预测效能的独立性。结果共计65例份TNBC组织样本,得到369个免疫相关LncRNA,通过单因素和多因素Cox分析,共得到3个与预后关系密切的免疫相关LncRNA(AC090181.2、LINC01235、LINC01943),并构建TNBC预后预测模型,该模型表达公式如下:风险评分(RS)=(-6.24904×A C090181.2)+(0.240562×LINC01235)+(-2.18153×LINC01943)。高风险组和低风险组患者生率差异有统计学意义(P<0.001)。TNBC预后预测模型对患者预后预测效能好(AUC=0.910;高、低风险组投影点分布有区别,区分度高)。TNBC预后预测模型能独立预测TNBC预后(HR=1.028,P<0.05)。结论成功构建了由3个与预后关系密切的免疫相关LncRNA(AC090181.2、LINC01235、LINC01943)组成的TNBC预后预测模型,其能较好预测TNBC患者的预后。 展开更多
关键词 预后预测模型 三阴性乳腺癌 长链非编码rna 免疫相关长链非编码rna 预后相关长链非编码rna
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梅毒螺旋体对HIV感染初治患者HIV RNA水平与T细胞计数的影响
3
作者 尹白露 程娟 +2 位作者 姜天俊 杨宝鹏 王福生 《传染病信息》 2024年第2期113-118,共6页
目的本研究拟探索梅毒螺旋体(Treponema pallidum,TP)对人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染初治患者HIV RNA与T细胞计数的影响,HIV感染初治患者基线CD4^(+)T低于最低正常值范围的影响因素。为临床诊断中为TP合并HI... 目的本研究拟探索梅毒螺旋体(Treponema pallidum,TP)对人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染初治患者HIV RNA与T细胞计数的影响,HIV感染初治患者基线CD4^(+)T低于最低正常值范围的影响因素。为临床诊断中为TP合并HIV感染者确定合适的ART与梅毒治疗方案提供参考。方法本研究纳入我院爱心门诊收治的HIV感染初治患者106例,其中TP合并HIV感染者51例(合并感染组)、单纯HIV感染者56例(单纯感染组),准确记录血常规、生化、T细胞数值、HIV RNA等变量;根据2022年中国梅毒诊疗指南与2021中国艾滋病诊疗指南制定纳入排除标准,使用卡方检验、Mann-Whitney检验、二元Logistic回归分析TP对HIV感染初治患者基线HIV RNA水平、T淋巴细胞以及生化定量指标的影响、及HIV初治患者CD4^(+)T低于最低正常值范围的影响因素。结果合并感染组与单纯感染组HIV初治患者相比,T淋巴细胞计数(CD4^(+)、CD3^(+)、CD8^(+)标记)、CD4^(+)/CD8^(+)以及HIV RNA水平差异无统计学意义(P均>0.05)。白细胞计数、婚姻状况(离异或分居)作为独立保护因素促进HIV初治患者基线CD4^(+)T淋巴细胞数值高于最低正常值范围,无危险因素。结论合并梅毒不会影响HIV感染初治患者HIV RNA与T淋巴细胞数值,但白细胞计数与婚姻状况(离异)是影响CD4^(+)T淋巴细胞数值的独立影响因素。 展开更多
关键词 梅毒 人类免疫缺陷病毒 人类免疫缺陷病毒rna CD4^(+)T淋巴细胞
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采用MS2 pulldown和质谱分析法检测BT549细胞中的LncRNA SNHG15结合蛋白
4
作者 陈少英 彭佩 +1 位作者 周艳春 顾巍 《癌变.畸变.突变》 CAS 2024年第5期395-398,共4页
目的:鉴定乳腺癌BT549细胞中与长链非编码RNA SNHG15结合的蛋白。方法:用慢病毒感染乳腺癌BT549细胞,构建稳定过表达SNHG15的BT549-SNHG15-MS2细胞株。通过MS2 pulldown和质谱分析法,检测BT549细胞中与SNHG15结合的蛋白。随后采用RNA免... 目的:鉴定乳腺癌BT549细胞中与长链非编码RNA SNHG15结合的蛋白。方法:用慢病毒感染乳腺癌BT549细胞,构建稳定过表达SNHG15的BT549-SNHG15-MS2细胞株。通过MS2 pulldown和质谱分析法,检测BT549细胞中与SNHG15结合的蛋白。随后采用RNA免疫共沉淀(RIP)和逆转录-定量PCR(RT-qPCR)法,以HEAD框肽5(DEAD box helicases 5,DDX5)为模板验证共沉淀蛋白和SNHG15的结合。结果:经MS2 pulldown和质谱分析筛选出386个潜在的SNHG15结合蛋白。RNA免疫沉淀结合RT-qPCR检测结果证实DDX5与SNHG15的结合。结论:本研究介绍了一种有效分析RNA-蛋白质相互作用的生物学方法,同时为深入研究SNHG15的作用机制提供了新的实验证据。 展开更多
关键词 长链非编码rna MS2 pulldown 小核仁rna宿主基因15 rna免疫沉淀 rna结合蛋白
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胃癌免疫相关长链非编码RNA预测模型的构建
5
作者 陈彬 崔洪全 +2 位作者 杨懿瑾 徐海燕 张玲 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1394-1403,共10页
目的·通过生物信息学方法构建胃癌患者免疫相关长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)预测模型并探讨其应用价值。方法·通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载413例胃癌样本的转录组测序(RNA seq... 目的·通过生物信息学方法构建胃癌患者免疫相关长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)预测模型并探讨其应用价值。方法·通过癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载413例胃癌样本的转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)数据,其中正常样本32例、肿瘤样本381例。通过ImmPort网站获得免疫相关基因。通过相关性分析获得免疫相关lncRNA (immune-related lncRNA, irlncRNA)。通过limma R软件包获得差异表达irlncRNA(differentially expressed immune-related lncRNA,DEirlncRNA)并绘制热图和火山图。通过构建DEirlncRNA对解决样本批次矫正问题。下载TCGA胃癌患者临床病理特征数据,通过单因素分析获得预后相关的DEirlncRNA对,进而通过LASSO回归分析筛选DEirlncRNA对,最后通过COX比例风险回归分析构建风险预测模型。通过计算曲线下面积(area under curve,AUC)分析并比较该模型与传统临床病理特征的预测效能。根据公式计算患者风险值,并依据最优阈值将患者分为高、低风险组。使用Kaplan-Meier曲线绘制生存图,并通过Log-rank检验比较2组患者生存率差异。根据Wilcoxon符号秩检验分析风险评分与临床病理特征之间的关系。通过单因素分析和多因素分析,验证胃癌患者独立预后因子。根据Spearman相关性分析验证风险评分与免疫浸润细胞和免疫相关基因之间的关系。通过pRRophetic R软件包比较药物在高、低风险组患者中的半数抑制浓度(half-maximal inhibitory concentration,IC50)值。结果·与正常组织相比,胃癌组织中有106个DEirlncRNA,其中11个为低表达、95个为高表达。32对DEirlncRNA对被纳入COX比例风险模型中,其中20对DEirlncRNA对为胃癌独立预后因子。风险预测模型的1、2和3年AUC值分别为0.889、0.966、0.935,显著高于传统临床病理特征的AUC值。高风险组患者生存率显著低于低风险组(P=0.000)。风险评分高与肿瘤分期高、存在远处转移和患者死亡密切相关。单因素分析显示,年龄、TNM分期、T分期、N分期、M分期和风险评分与胃癌患者预后密切相关(均P<0.05)。多因素分析显示,年龄、TNM分期和风险评分是胃癌患者的独立预后因子(均P<0.05)。风险评分与多种T细胞、肥大细胞呈负相关,而与肿瘤相关纤维细胞、巨噬细胞及内皮细胞呈正相关。在高风险组中,免疫相关基因IFNG与MSH2表达水平均低于低风险组。在高风险组患者中,药物阿霉素、顺铂、替比法尼、丝裂霉素的敏感性均低于低风险组(均P<0.05)。结论·DEirlncRNA对构建的COX比例风险模型可准确预测胃癌患者的生存状态、生存率及对化学治疗药物的敏感性。 展开更多
关键词 胃癌 免疫相关长链非编码rna COX比例风险模型 LASSO回归 曲线下面积
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基于免疫相关lncRNAs的胃癌早期诊断和预后风险模型的构建和验证 被引量:2
6
作者 王洪英 李岩 +4 位作者 韩鑫浩 魏孝礼 贾慧珣 袁文娟 张秋菊 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2022年第2期119-126,共8页
目的基于胃癌免疫相关lncRNAs,建立早期诊断模型和预后风险模型,为胃癌早期诊断和预后预测提供数据支持。方法利用TCGA-STAD数据集与immport数据库筛选胃癌相关免疫lncRNAs。将TCGA-STAD作为训练集,利用logistic回归分析构建胃癌早期诊... 目的基于胃癌免疫相关lncRNAs,建立早期诊断模型和预后风险模型,为胃癌早期诊断和预后预测提供数据支持。方法利用TCGA-STAD数据集与immport数据库筛选胃癌相关免疫lncRNAs。将TCGA-STAD作为训练集,利用logistic回归分析构建胃癌早期诊断模型;单因素Cox和LASSO回归分析用于筛选影响患者总生存期的免疫lncRNAs并构建预后基因标签,最后结合基因标签和患者临床指标,构建胃癌预后风险模型。胃癌基因芯片数据集GSE54129和GSE62254分别作为诊断和预后模型的验证集进行外部验证。结果筛选出9个免疫相关lncRNAs用于构建胃癌早期诊断模型,模型构建和验证的Hosmer-Lemeshow检验P值分别为0.9982和1.0000,ROC曲线下面积分别为0.991和0.958。获得6个影响患者总生存期的免疫lncRNAs用于构建基因标签。根据标签风险得分中位数将患者分为高、低风险组,生存分析表明高风险组患者总生存率低于低风险组患者(训练集及验证集,P<0.05)。生存状态预测基因标签构建构建及验证的C-index分别为0.61和0.59,1、3、5年总生存率ROC曲线下面积分别为0.623、0.623、0.677和0.581、0.613、0.622。多因素Cox回归分析表明基因标签、年龄、肿瘤分期是影响胃癌患者总生存率的独立预后因素,以此构建预后风险模型。C-index、ROC曲线和校准曲线分析表明,预后风险模型的预测效能优于基因标签。结论早期诊断模型可以有效协助胃癌早期筛查;基因标签是影响胃癌患者总生存率的独立因素,可以中等程度地预测患者的预后,相比而言,预后风险模型可以进一步提高模型的预测能力。 展开更多
关键词 胃癌 诊断 预后 免疫相关长链非编码rnas
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微孔板核酸杂交-酶联免疫吸附试验检测人类免疫缺陷病毒RNA
7
作者 史志旭 杨晋川 +1 位作者 杨喜玲 顾可梁 《上海医学检验杂志》 北大核心 2001年第5期299-299,302,共2页
关键词 人类免疫缺陷病毒rna 微孔板核酸杂交-酶联免疫吸附试验
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构建乳腺癌免疫相关长链非编码RNA预后风险模型
8
作者 肖冉 杨盟 +2 位作者 丁茹梦 谭远远 李朵璐 《肿瘤基础与临床》 2021年第4期299-302,共4页
目的联合免疫相关长链非编码RNA(lncRNA),探索一种新的用于评估乳腺癌预后的模型。方法从癌症基因组图谱数据库中提取乳腺癌(BRCA)差异表达的lncRNA,结合ImmLnc数据库,筛选出与乳腺癌免疫相关的lncRNA。采用单因素Cox回归分析及多因素Co... 目的联合免疫相关长链非编码RNA(lncRNA),探索一种新的用于评估乳腺癌预后的模型。方法从癌症基因组图谱数据库中提取乳腺癌(BRCA)差异表达的lncRNA,结合ImmLnc数据库,筛选出与乳腺癌免疫相关的lncRNA。采用单因素Cox回归分析及多因素Cox回归分析筛选与乳腺癌预后相关的lncRNAs,并建立风险模型;依据中位风险评分将BRCA患者分为高风险组和低风险组。运用Kaplan-Meier生存分析和受试者工作特征(ROC)曲线检验该模型的辨别力;并计算模型中的lncRNAs和临床病理特征的关系。结果单因素Cox回归分析筛选出10个与BRCA患者预后相关的免疫相关lncRNA,多因素Cox回归分析最终确定LINC00578、NIFK-AS1和LINC00667是BRCA患者预后的独立预测因素,并建立BRCA患者预后的预测模型。Kaplan-Meier分析显示高风险组和低风险组的患者生存率差异有统计学意义(P<0.001)。ROC曲线分析显示,该模型预测BRCA患者预后具有良好的辨别能力曲线下面积0.706(95%CI0.676~0.771,P<0.001)。结合BRCA患者的临床信息发现,模型中的lncRNA和T分期关系密切(P<0.05)。结论本研究成功创建了一种用于BRCA患者预后评估的新评分模型。 展开更多
关键词 免疫相关长链非编码rna 乳腺癌 预后
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人类抗病毒感染的“RNAi自限假说”及其初步论证
9
作者 王厚伟 田景振 +1 位作者 杨振宁 张成博 《山东中医药大学学报》 2014年第5期415-419,共5页
提出人类抗病毒感染的"RNAi自限假说":在反转录酶和整合酶介导下,部分侵染病毒的mRNA被人类或其他动物宿主随机反转录成cDNA分子,并整合进宿主基因组中,形成能够抑制同种病毒增殖的免疫RNA(imRNA)分子。imRNA激活宿主的小RNA... 提出人类抗病毒感染的"RNAi自限假说":在反转录酶和整合酶介导下,部分侵染病毒的mRNA被人类或其他动物宿主随机反转录成cDNA分子,并整合进宿主基因组中,形成能够抑制同种病毒增殖的免疫RNA(imRNA)分子。imRNA激活宿主的小RNA依赖性的防御机制,抑制病毒在宿主体内的繁殖扩增,使被感染宿主与侵染病毒之间达成一种"病毒持续低水平存在而宿主无明显病征"的潜伏感染状态。本研究进一步从"人类基因组中反转录酶基因和整合酶基因类似功能序列的存在性"、"人类基因组中病毒基因组片段的存在性",以及"病毒感染动物模型"三方面,初步论证假说的科学性,并简述假说在"病毒病流行趋势预测"方面的应用。上述假说与中医理论精神交融,应用中药干预病毒与宿主的互作程序,促使二者建立和谐共处的潜伏感染状态,而非直接抑杀病毒,应是研发抗病毒中药新药的新思路。 展开更多
关键词 中药 病毒 免疫rna rna干扰 潜伏感染
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抗毒复肝汤联合人脾免疫核糖核酸注射治疗乙型肝炎30例 被引量:3
10
作者 程志文 潘泰川 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第8期504-505,共2页
关键词 抗毒复肝汤 人脾免疫rna 乙型肝炎
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RNA干扰PCGF4/Bmi-1抑制白血病K562细胞系增殖 被引量:5
11
作者 黄丽芳 李君君 +1 位作者 孔卫红 颜家运 《陕西医学杂志》 CAS 北大核心 2007年第3期296-299,共4页
目的:利用RNAi方法针对PCGF4/Bmi-1基因,抑制其在慢性髓性白血病K562细胞中的过表达,观察K562细胞的增殖性改变。方法:RT-PCR检测PCGF4/Bmi-1基因在K562中的表达情况。利用Invitrogen公司RNAi慢病毒表达载体系统,构建针对PCGF4/Bmi-1基... 目的:利用RNAi方法针对PCGF4/Bmi-1基因,抑制其在慢性髓性白血病K562细胞中的过表达,观察K562细胞的增殖性改变。方法:RT-PCR检测PCGF4/Bmi-1基因在K562中的表达情况。利用Invitrogen公司RNAi慢病毒表达载体系统,构建针对PCGF4/Bmi-1基因慢病毒RNAi表达载体。转染K562细胞,瞬时干扰PCGF4/Bmi-1基因的表达,实时定量PCR检测干扰前后基因表达变化。利用生长曲线测定干扰载体转染前后细胞生长速度变化。结果:PCGF4/Bmi-1慢病毒RNAi表达载体成功地构建,并建立瞬时干扰PCGF4/Bmi-1基因的K562细胞系。实时定量PCR检测,PCGF4/Bmi-1基因在K562细胞系中过表达被显著抑制。生长曲线测定,PCGF4/Bmi-1基因干扰后细胞增殖明显变慢。结论:干扰PCGF4/Bmi-1基因,降低该基因表达后能明显减低细胞的生长速度。 展开更多
关键词 白血病 髓样 慢性/免疫学@PCGF4/BMI-1基因 rna/免疫 聚合酶 链反应 细胞分裂
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干扰素猪苓多糖及免疫核糖核酸治疗116例慢性乙型肝炎的近期疗效观察
12
作者 徐思强 徐永泽 敖子荣 《内蒙古医学杂志》 1996年第2期81-82,共2页
干扰素猪苓多糖及免疫核糖核酸治疗116例慢性乙型肝炎的近期疗效观察徐思强,徐永泽,敖子荣(海拉尔市传染病医院)我院自1991年6月以来对116例慢性乙型肝炎分别应用干扰素、猪苓多糖、抗乙肝免疫核糖核酸进行治疗,对其抗... 干扰素猪苓多糖及免疫核糖核酸治疗116例慢性乙型肝炎的近期疗效观察徐思强,徐永泽,敖子荣(海拉尔市传染病医院)我院自1991年6月以来对116例慢性乙型肝炎分别应用干扰素、猪苓多糖、抗乙肝免疫核糖核酸进行治疗,对其抗病毒疗效进行了对比观察,总结如下。... 展开更多
关键词 乙型肝炎 药物疗法 干扰素 猪苓多糖 免疫rna
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免疫核糖核酸治疗婴儿巨细胞包涵体病疗效的探讨
13
作者 孙梅 罗丽玲 《中国实验临床免疫学杂志》 1989年第5期21-27,共7页
关键词 免疫rna CID 婴儿
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斑马鱼胸苷酸合成酶与自身mRNA的相互作用
14
作者 宋春霞 牛荣丽 +2 位作者 杜长青 杨少丽 林秀坤 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1321-1326,共6页
斑马鱼(zebrafish,Danio rerio)是生物学领域中公认的研究脊椎类生物的模式生物.胸苷酸合成酶(thymidylate synthase,TS)是DNA从头合成的限速酶,多年来一直作为肿瘤化疗的重要靶酶.前期的研究表明,人和大肠杆菌中TS能与自身的mRNA结合,... 斑马鱼(zebrafish,Danio rerio)是生物学领域中公认的研究脊椎类生物的模式生物.胸苷酸合成酶(thymidylate synthase,TS)是DNA从头合成的限速酶,多年来一直作为肿瘤化疗的重要靶酶.前期的研究表明,人和大肠杆菌中TS能与自身的mRNA结合,在翻译水平上具有反馈抑制自调控现象.斑马鱼作为药物模型的研究已成为热点研究领域,为了探讨斑马鱼的胸苷酸合成酶的调控规律,以及与人TS的相关性,利用原核表达,纯化获得高均一性斑马鱼TS蛋白,采用凝胶迁移研究了TS和其mRNA的体外结合,采用免疫共沉淀:RT-PCR技术研究了它们在体内的相互作用,实验结果表明,斑马鱼的TS在体内外均与自身的mRNA存在特异性的相互作用.研究说明,斑马鱼和人的TS具有高度生物学过程相关性,为构建斑马鱼抗肿瘤药理模型提供了理论基础. 展开更多
关键词 斑马鱼 胸苷酸合成酶 凝胶迁移(EMSA) 蛋白质和rna相互作用 免疫共沉淀 RT-PCR
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核仁素蛋白调节嗅觉介导素4mRNA表达的研究
15
作者 安娜 吴莉雅 +3 位作者 宋利华 黄轶 蒋雪 刘先俊 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期657-660,共4页
目的:探讨核仁素(nucleolin,NCL或C23)蛋白与嗅觉介导素4(olfaetomedin 4,OLFM4)mRNA之间是否存在相互作用,以及NCL对OLFM4转录水平的调控。方法:本研究利用RNA染色质免疫共沉淀(RNA chromatin immunoprecipitation assay,RNA chip)结合... 目的:探讨核仁素(nucleolin,NCL或C23)蛋白与嗅觉介导素4(olfaetomedin 4,OLFM4)mRNA之间是否存在相互作用,以及NCL对OLFM4转录水平的调控。方法:本研究利用RNA染色质免疫共沉淀(RNA chromatin immunoprecipitation assay,RNA chip)结合RT-PCR确定NCL是否能与OLFM4 mRNA相互作用,以及双荧光素酶报告基因试验检测NCL对OLFM4报告基因的影响。结果:在SGC-7901细胞内,NCL能与OLFM4 mRNA结合,且过表达NCL质粒的相对荧光素酶活性约为对照质粒的1.15倍,敲低NCL质粒的相对荧光素酶活性约为对照质粒的0.8倍,NCL对OLFM4具正向调节作用。结论:NCL与OLFM4mRNA可以相互结合,且NCL可以通过增加OLFM4转录水平和延长OLFM4 mRNA的半衰期来增加OLFM4 mRNA的稳定性。 展开更多
关键词 核仁素 嗅觉介导素4 rna染色质免疫共沉淀(rna Chip) 双荧光素酶报告基因试验
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骨髓间充质干细胞对软骨诱导分化过程中microRNA调控机制 被引量:5
16
作者 刘军政 张书艳 高建强 《陕西医学杂志》 CAS 2017年第8期989-991,共3页
目的:探讨microRNA(miRNA)在骨髓间充质干细胞对软骨诱导分化过程中的调控机制。方法:以大鼠骨髓中分离出的骨髓间充质干细胞(BMSCs)作为研究对象,用转化生长因子-β_1(TGF-β_1)诱导MSCs软骨分化,利用基因芯片技术检测软骨诱导分化过程... 目的:探讨microRNA(miRNA)在骨髓间充质干细胞对软骨诱导分化过程中的调控机制。方法:以大鼠骨髓中分离出的骨髓间充质干细胞(BMSCs)作为研究对象,用转化生长因子-β_1(TGF-β_1)诱导MSCs软骨分化,利用基因芯片技术检测软骨诱导分化过程中miRNA表达情况,并用实时荧光定量PCR验证;采用SAM软件筛选出软骨诱导过程中差异表达的miRNA。结果:基因芯片技术共筛选出BMSCs向软骨分化过程中9个表达差异miRNA,其中表达上调的共有7个,分别为miR-34a、miR-130b、miR-193b、miR-30a、miR-152、miR-90a、miR-99a;表达下调的共有2个,分别为miR-424、miR-135。选择软骨诱导分化过程中表达明显升高的miR-130b、miR-193b,及表达明显降低的miR-424、miR-135;在原样本中进行实时荧光定量PCR,结果显示实时荧光定量PCR验证结果与基因芯片结果一致,证实了芯片结果真实可信。结论:高表达的miR-34a、miR-130b、miR-193b、miR-30a、miR-152、miR-90a、miR-99a和低表达的miR-424、miR-135共同参与了骨髓间充质干细胞软骨分化的调节过程。 展开更多
关键词 造血干细胞 骨髓 软骨分化 微小rna/免疫
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Key questions about the checkpoint blockade-are microRNAs an answer? 被引量:3
17
作者 Mihnea Dragomir Baoqing Chen +1 位作者 Xiao Fu George A.Calin 《Cancer Biology & Medicine》 SCIE CAS CSCD 2018年第2期103-115,共13页
The introduction of immune-checkpoint blockade in the cancer therapy led to a paradigm change of the management of late stage cancers. There are already multiple FDA approved checkpoint inhibitors and many other agent... The introduction of immune-checkpoint blockade in the cancer therapy led to a paradigm change of the management of late stage cancers. There are already multiple FDA approved checkpoint inhibitors and many other agents are undergoing phase 2 and early phase 3 clinical trials. The therapeutic indication of immune checkpoint inhibitors expanded in the last years, but still remains unclear who can benefit. Micro RNAs are small RNAs with no coding potential. By complementary pairing to the 3' untranslated region of messenger RNA, microRNAs exert posttranscriptional control of protein expression. A network of microRNAs directly and indirectly controls the expression of checkpoint receptors and several microRNAs can target multiple checkpoint molecules,mimicking the therapeutic effect of a combined immune checkpoint blockade. In this review, we will describe the microRNAs that control the expression of immune checkpoints and we will present four specific issues of the immune checkpoint therapy in cancer:(1) imprecise therapeutic indication,(2) difficult response evaluation,(3) numerous immunologic adverse-events, and(4)the absence of response to immune therapy. Finally, we propose microRNAs as possible solutions for these pitfalls. We consider that in the near future microRNAs could become important therapeutic partners of the immune checkpoint therapy. 展开更多
关键词 Microrna PD-1 PD-L1 CTLA-4 checkpoint inhibitors
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多能干细胞关键因子Oct4 RNA结合蛋白的分离与鉴定
18
作者 马姬 郭传亮 +2 位作者 范书玥 薛燕 曾凡一 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期4-10,共7页
目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白。方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为m RNA。采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选... 目的·分离多能干细胞关键因子Oct4的RNA结合蛋白。方法·培养小鼠胚胎干细胞(R1),从中提取细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增Oct4并转录为m RNA。采用链霉素亲和层析和质谱技术筛选候选RNA结合蛋白,采用RNA免疫沉淀技术鉴定候选RNA结合蛋白。结果·经高效液相色谱-质谱法鉴定和筛选出121个能与Oct4 3'非翻译区(untranslated region,UTR)和Oct45'UTR相结合的RNA结合蛋白,肽段图谱匹配数≥2的有11个。并对其中的7个候选RNA结合蛋白进行了进一步验证,结果显示Oct4可与DSP、SOD1、LMNA、NPM1、PSIP1、NCL和HDGF蛋白发生相互作用,其中HDGF与Oct4结合能力最强。结论·Oct4RNA结合蛋白的鉴定将为Oct4的调控机制提供一定理论依据,为后续其功能研究提供基础。 展开更多
关键词 OCT4 rna结合蛋白 胚胎干细胞 rna免疫沉淀
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RNA结合蛋白与RNA相互作用鉴定技术 被引量:6
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作者 陈伟 许馨 孙绍光 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期103-107,共5页
RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)通过与RNA相互作用,广泛参与到RNA的剪切、转运、编辑、胞内定位及翻译调控等过程中。RNA领域尤其是非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究的快速发展,催生了多种RBPs-RNAs相互作用鉴定技术。这... RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)通过与RNA相互作用,广泛参与到RNA的剪切、转运、编辑、胞内定位及翻译调控等过程中。RNA领域尤其是非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究的快速发展,催生了多种RBPs-RNAs相互作用鉴定技术。这些技术反之又推动了RNA领域的研究进程。本文对紫外交联免疫沉淀(ultraviolet crosslinking and immunoprecipitation,CLIP),CLIP cDNA文库高通量测序(high-throughput sequencing of CLIP cDNA library,HITS-CLIP),光活化核苷增强的CLIP(photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation,PAR-CLIP),单核苷酸分离CLIP(individual nucleotide resolution CLIP,i CLIP),TRIBE(targets of RNA-binding protein identified by editing),RNA标记,相互作用组捕获(interactome capture,IC)和Ser IC(serial RNA interactome capture)等RBPs-RNAs相互作用鉴定技术的基本原理和优缺点以及应用进行综述。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 紫外交联免疫沉淀 CLIP cDNA文库高通量测序 光活化核苷增强的CLIP rna结合蛋白免疫沉淀微阵列 TRIBE rna标记 相互作用组捕获
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Combination of small interfering RNAs mediates greater inhibition of human hepatitis B virus replication and antigen expression 被引量:9
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作者 陈喆 许则丰 +3 位作者 叶景佳 姚航平 郑树 丁佳逸 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE EI CAS CSCD 2005年第4期236-241,共6页
Objectives: To evaluate the inhibitory effect mediated by combination of small interfering RNAs (siRNAs) targeting different sites of hepatitis B virus (HBV) transcripts on the viral replication and antigen expression... Objectives: To evaluate the inhibitory effect mediated by combination of small interfering RNAs (siRNAs) targeting different sites of hepatitis B virus (HBV) transcripts on the viral replication and antigen expression in vitro. Methods: (1) Seven siRNAs targeting surface (S), polymerase (P) or precore (PreC) region of HBV genome were designed and chemically synthesized. (2) HBV-producing HepG2.2.15 cells were treated with or without siRNAs for 72 h. (3) HBsAg and HBeAg in the cell culture medium were detected by enzyme-linked immunoadsorbent assay. (4) Intracellular viral DNA was quantified by real-time PCR (Polymerase Chain Reaction). (5) HBV viral mRNA was reverse transcribed and quantified by real-time PCR. (6) The change of cell cycle and apoptosis was determined by flow cytometry. Results: Our data demonstrated that synthetic small interfering RNAs (siRNAs) targeting S and PreC gene could efficiently and specifically inhibit HBV replication and antigen expression. The ex- pression of HBsAg and HBeAg and the replication of HBV could be specifically inhibited in a dose-dependent manner by siRNAs. Furthermore, our results showed that the combination of siRNAs targeting various regions could inhibit HBV replication and antigen expression in a more efficient way than the use of single siRNA at the same final concentration. No apoptotic change was observed in the cell after siRNA treatment. Conclusion: Our results demonstrated that siRNAs exerted robust and specific inhibi- tion on HBV replication and antigen expression in a cell culture system and combination of siRNAs targeting different regions exhibited more potency. 展开更多
关键词 Hepatitis B virus Combination of sirnas HBV replication Antigen expression
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