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在体阿霉素干预联合全克隆培养方法富集肾上腺皮质癌肿瘤干细胞的研究
1
作者 曾文清 陈小舟 +3 位作者 黄振兴 杨海燕 郭飘婷 罗佐杰 《广东医学》 CAS 2023年第4期436-440,共5页
目的通过阿霉素在体干预联合全克隆的富集方法来研究肾上腺皮质癌SW13肿瘤干细胞的特性.方法建立裸鼠SW13移植瘤连续传代3代模型,实验组尾静脉注射阿霉素,对照组注射等量生理盐水.收集移植瘤细胞进行单克隆培养,所获克隆分别进行克隆转... 目的通过阿霉素在体干预联合全克隆的富集方法来研究肾上腺皮质癌SW13肿瘤干细胞的特性.方法建立裸鼠SW13移植瘤连续传代3代模型,实验组尾静脉注射阿霉素,对照组注射等量生理盐水.收集移植瘤细胞进行单克隆培养,所获克隆分别进行克隆转移实验、克隆连续传代实验、Hoechst33342/PI双染色检测凋亡率实验,并通过RT-qPCR检测肿瘤标志物CXCR4在两组瘤体细胞中的表达.结果与对照组相比,实验组的瘤体直径小、CXCR4表达更高,实验组全克隆细胞的克隆转移能力、连续传代能力最高、凋亡率最低(P<0.05).结论在体阿霉素干预联合全克隆富集方法可以有效富集肾上腺皮质癌肿瘤干细胞,肾上腺皮质癌肿瘤干细胞高表达CXCR4. 展开更多
关键词 肾上腺皮质癌 肿瘤干细胞 阿霉素 CXCR4 全克隆
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全克隆与肿瘤干细胞 被引量:1
2
作者 周志华 王卫兵 张建东 《国际病理科学与临床杂志》 CAS 2011年第5期420-423,共4页
干细胞在体外单个培养时,形成的克隆具有规则而致密的形态,这种独特的克隆被称为全克隆。近年来发现肿瘤内也存在具有干细胞特性的肿瘤细胞,即肿瘤干细胞,是肿瘤发生、复发和转移的根源。而研究证实,多种类型的肿瘤干细胞在体外单克隆... 干细胞在体外单个培养时,形成的克隆具有规则而致密的形态,这种独特的克隆被称为全克隆。近年来发现肿瘤内也存在具有干细胞特性的肿瘤细胞,即肿瘤干细胞,是肿瘤发生、复发和转移的根源。而研究证实,多种类型的肿瘤干细胞在体外单克隆培养亦可形成特征性的全克隆,这对分离富集肿瘤干细胞及深入研究其生物学特性具有重要意义。全克隆可望作为肿瘤干细胞研究一个有用的体外模型。 展开更多
关键词 全克隆 肿瘤干细胞 克隆
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禽流感病毒分离株A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)全基因克隆及序列分析 被引量:32
3
作者 张建林 于康震 +2 位作者 陈化兰 唐秀英 田国斌 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第3期232-235,共4页
本研究用无特定病原体 (SPF)鸡胚增殖禽流感病毒鹅体分离株A/Goose/Guangdong/1/96 (H5N1) (GD1/96 ) ,提取病毒基因组总RNA ,运用反转录_聚合酶链反应 (RT_PCR)技术分别扩增该病毒分离株的 8个基因片段的cDNA ,分别克隆后进行序列测定... 本研究用无特定病原体 (SPF)鸡胚增殖禽流感病毒鹅体分离株A/Goose/Guangdong/1/96 (H5N1) (GD1/96 ) ,提取病毒基因组总RNA ,运用反转录_聚合酶链反应 (RT_PCR)技术分别扩增该病毒分离株的 8个基因片段的cDNA ,分别克隆后进行序列测定。序列分析结果表明 ,所扩增到的 8个片段均包含相应的病毒基因的完整开放阅读框架。GD1/96株与 1997年香港禽流感事件中的 4株香港流感病毒分离株 (分别来自人、鸡、鸭和鹅 )的HA基因的高度同源性说明它们可能起源于同一种系 ,但NS基因的差异说明它们分属于不同的基因群系。GD1/96株与香港流感病毒分离株的核苷酸和推导的氨基酸序列的同源性较低 ( 6 3.9%~ 98.1%) ,而香港流感病毒分离株之间的核苷酸和氨基酸序列的同源性很高 ( 96 .5 %~ 10 0 %) ,且香港各流感病毒分离株的NA均缺失 5 7个核苷酸 ( 19个氨基酸 )残基。因此 ,内地H5N1分离株GD1/96与 展开更多
关键词 禽流感病毒 分离株 基因克隆 序列分析
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鸭圆环病毒全基因组克隆与序列分析 被引量:41
4
作者 傅光华 程龙飞 +3 位作者 施少华 彭春香 陈红梅 黄瑜 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期138-143,共6页
为研究鸭圆环病毒全基因组的分子生物学特性,运用重叠PCR技术从鸭组织脏器提取的DNA中扩增出2条核苷酸序列,拼接后对其核酸组成、基因组结构及病毒的遗传变异进行分析。结果表明所获病毒核酸为大小1995nt的环型DNA,包含6个ORF,与登录在G... 为研究鸭圆环病毒全基因组的分子生物学特性,运用重叠PCR技术从鸭组织脏器提取的DNA中扩增出2条核苷酸序列,拼接后对其核酸组成、基因组结构及病毒的遗传变异进行分析。结果表明所获病毒核酸为大小1995nt的环型DNA,包含6个ORF,与登录在GenBank中克隆株MuDCV(AY228555)的同源性高达97·4%,可见所扩增的核酸序列为鸭圆环病毒基因组序列。 展开更多
关键词 鸭圆环病毒 基因组克隆 序列分析
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山羊地方性鼻内肿瘤病毒Shaanxi株前病毒全基因组克隆及生物信息学分析 被引量:8
5
作者 何亚鹏 付明哲 +4 位作者 许信刚 庞文静 王景 周曼 张琪 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期63-66,共4页
为研究山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV)Shaanxi株前病毒全基因组序列,本研究根据Gen Bank中收录的ENTV前病毒基因组序列设计5对引物,通过PCR方法从肿瘤组织中分段扩增获得了ENTV前病毒全基因组的5个片段,测序并分析。结果显示该病毒基因... 为研究山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV)Shaanxi株前病毒全基因组序列,本研究根据Gen Bank中收录的ENTV前病毒基因组序列设计5对引物,通过PCR方法从肿瘤组织中分段扩增获得了ENTV前病毒全基因组的5个片段,测序并分析。结果显示该病毒基因组全长7 275 bp,包含相互重叠的gag-pro-pol-env编码区及5'端非编码区;ENTV Shaanxi株基因组全序列与NC004994.2、AY197548.2、ENTV-SC株(HM104174.1)核苷酸同源性分别为89%、89%、99%。本研究为ENTV的分子生物学特性研究提供资料,为进一步研究其检测方法与致病机理奠定了基础。 展开更多
关键词 山羊 地方性鼻内肿瘤病毒 基因克隆 生物信息学分析
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鸡贫血病毒哈尔滨分离株全基因克隆和序列分析 被引量:5
6
作者 何成强 丁乃峥 +1 位作者 李景鹏 李云龙 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期436-441,共6页
通过PCR方法克隆了从哈尔滨分离的一株鸡贫血病毒 (CAV)的全基因 ,并对其进行了测序 ,该病毒基因组为环状 ,全长 2 2 98bp ,含有三个互相重叠的开放读码框和一个调控区。将克隆的基因与GenBank收录的CAV基因比较 ,同源性至少为 97% ,未... 通过PCR方法克隆了从哈尔滨分离的一株鸡贫血病毒 (CAV)的全基因 ,并对其进行了测序 ,该病毒基因组为环状 ,全长 2 2 98bp ,含有三个互相重叠的开放读码框和一个调控区。将克隆的基因与GenBank收录的CAV基因比较 ,同源性至少为 97% ,未发现与本次克隆的CAV基因完全一致的分离株。与德国分离株Cux la、2 6p4和马来西亚分离株分别有 42、42和72个核苷酸不同 ,同源性分别为 98 2 %、98 2 %和 96 9%。与德国分离株Cux 1b相比 ,除在调控区内少一个类似增强子的重复序列外 ,尚有 3 9处核苷酸不同。它与分离于欧洲的几株CAV的亲源性要比来自亚洲的马来西亚株近。对CAV哈尔滨分离株、2 6p4、Cux 1b、Cux 1a和马来西亚株的VP1、VP2和VP3蛋白比较 。 展开更多
关键词 鸡贫血病毒 哈尔滨分离株 基因克隆 序列分析
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猪Ⅱ型圆环病毒豫A株的全基因组克隆与序列分析 被引量:14
7
作者 曹胜波 陈焕春 +3 位作者 肖少波 赵俊龙 吕建强 钱平 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期137-141,共5页
参照国外发表的猪Ⅱ型圆环病毒 (porcinecircovirustype 2 ,PCV - 2 )全基因组序列 ,设计一对PCV - 2特异性引物 ,用该室分离的PCV - 2豫A株感染PK - 15细胞 ,从中提取PCV - 2复制型基因组DNA ,并以之为模板进行PCR扩增。回收PCR产物 ,... 参照国外发表的猪Ⅱ型圆环病毒 (porcinecircovirustype 2 ,PCV - 2 )全基因组序列 ,设计一对PCV - 2特异性引物 ,用该室分离的PCV - 2豫A株感染PK - 15细胞 ,从中提取PCV - 2复制型基因组DNA ,并以之为模板进行PCR扩增。回收PCR产物 ,构建重组测序质粒T -PCV - 2。测序结果表明 ,猪Ⅱ型圆环病毒豫A株的全基因组为 176 7bp ,与GenBank收录的PCV - 2国外分离株核苷酸的同源性可高达 97%。序列分析表明 ,复制型豫A株的基因组包含 10个读码框架 ,其中ORF1、ORF2是其两个最主要的读码框架 ,分别编码 314、2 34个氨基酸。豫A株和PCV - 1间的ORF1、ORF2的氨基酸序列同源性分别为 85 %、6 6 % ,与其它PCV - 2毒株间的ORF1氨基酸同源性均在 98%以上 ,而ORF2的氨基酸同源性为 92 %~ 97%。 展开更多
关键词 猪Ⅱ型圆环病毒豫A株 基因组克隆 序列分析 PCV-2
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猪肺表面活性蛋白A的DNA全序列克隆与生物信息学分析 被引量:2
8
作者 乔莉娟 王立贤 +1 位作者 苏振环 颜华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期393-398,共6页
猪肺表面活性蛋白A(Porcine surfactant proteinA,SP-A)是猪肺泡表面活性蛋白中含量最多、最先被发现具有炎症免疫调节功能的表面活性蛋白。本研究利用比较基因组学方法,设计了6对引物进行PCR扩增,克隆测序后进行拼接,获得了长为4... 猪肺表面活性蛋白A(Porcine surfactant proteinA,SP-A)是猪肺泡表面活性蛋白中含量最多、最先被发现具有炎症免疫调节功能的表面活性蛋白。本研究利用比较基因组学方法,设计了6对引物进行PCR扩增,克隆测序后进行拼接,获得了长为4037bp猪SP-A基因的全序列(gi:DQ985806)。经生物信息学分析,此序列包含了猪SP-A基因启动子区,含有1个747bp的完整开放阅读框,编码248个氨基酸;预测猪SP-A蛋白理论分子量约为26.37ku,蛋白的等电点为5.20;在1~20位氨基酸可能是信号肽序列;在大约1~20、120~135、145~160位氨基酸存在疏水性区域;跨膜结构分析表明此蛋白所有氨基酸都位于膜表面;并且发现猪SP-A蛋白同人SP-A蛋白一样也含有保守的碳水化合物识别区、胶原样区域和茎区。本结果为进一步对SP-A与猪呼吸道疾病相关性的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 SP-A基因 序列克隆 生物信息学分析
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在MDCK细胞上高产的乙型流行性感冒病毒株的筛选及其全基因组克隆 被引量:9
9
作者 齐立 吴昆昱 +4 位作者 李梓 张烨 董婕 张立国 张智清 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期195-199,共5页
流行性感冒(流感)病毒可引起世界范围的大流行,因此需要及时地生产流感疫苗来预防流感的流行。乙型流感病毒是疫苗的重要组成部分。传统制备疫苗的方法是使用鸡胚生产,存在很多缺陷,应用哺乳动物细胞生产流感疫苗是个更好的选择。但是,... 流行性感冒(流感)病毒可引起世界范围的大流行,因此需要及时地生产流感疫苗来预防流感的流行。乙型流感病毒是疫苗的重要组成部分。传统制备疫苗的方法是使用鸡胚生产,存在很多缺陷,应用哺乳动物细胞生产流感疫苗是个更好的选择。但是,乙型流感病毒感染MDCK细胞后,很难得到持续的高产。此实验筛选到的乙型流感病毒在MDCK细胞连续传代15代后,PFU值从第1代的8×104到第15代2×109,TCID50从第1代6 5到第15代的8 0。将筛选到的毒株进行全基因组克隆,用两套引物获得乙型流感病毒的全部8个节段。此结果为利用反向遗传技术将高产毒株与流行毒株重配,进而在哺乳动物细胞上生产基因工程流感疫苗打下基础。 展开更多
关键词 流行性感冒 病毒 乙型流感 毒株 通用引物 哺乳动物细胞 疫苗 基因组克隆
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5株猪圆环病毒2型全基因克隆和序列分析 被引量:5
10
作者 唐志玲 肖建雄 +1 位作者 陈瑞爱 罗满林 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第5期14-18,共5页
为了解广东地区猪圆环病毒2型(PCV2)流行势态及毒株的基因变异情况,从广东珠三角地区疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)患病死亡猪中采集淋巴结,将PCR鉴定为阳性的病料在PK-15细胞上进行增殖培养,成功分离到5株猪圆环病毒2型毒株,分... 为了解广东地区猪圆环病毒2型(PCV2)流行势态及毒株的基因变异情况,从广东珠三角地区疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)患病死亡猪中采集淋巴结,将PCR鉴定为阳性的病料在PK-15细胞上进行增殖培养,成功分离到5株猪圆环病毒2型毒株,分别标记为GD-jm、GD-sz、GD-pz、GD-gj和GD-ss。再从细胞培养物中提取病毒基因组DNA,对5株PCV2分离株全基因组进行PCR扩增并克隆到pMD18-T Simple Vector进行测序,测序结果提交GenBank,登录号分别为JX912914、JX912915、JX945575、JX945576和JX945577。借助相关生物学软件作同源性分析,这5株PCV2基因组长度均为1767bp,其中3株为PCV2b亚型,2株为PCV2d亚型。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 基因克隆 序列分析
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我国分离的XJ-160病毒全基因组克隆的构建 被引量:1
11
作者 何海怀 杨益良 +4 位作者 付士红 李蕾 周国林 吕新军 梁国栋 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期161-165,共5页
XJ 160 virus was isolated in 1990 from Xinjiang, China. The biological characteristics of XJ 160 virus suggested that it might be a Togavirus. The serological tests showed that XJ 160 virus is a Sindbis like virus. Th... XJ 160 virus was isolated in 1990 from Xinjiang, China. The biological characteristics of XJ 160 virus suggested that it might be a Togavirus. The serological tests showed that XJ 160 virus is a Sindbis like virus. The complete 11626 base nucleotide sequence of XJ 160 has been determined recently. It is necessary to establish a reverse genetic system for rescue of XJ 160 virus from its cDNA clone. We describe here the constructon of full length cDNA clone of XJ 160 virus. The total RNA were extracted from BHK cells infected with XJ 160 virus. Specific primers were used to amplify five fragments covering the whole genome of XJ 160 virus. All of these five fragments have the restriction enzyme sites at both termini to be assembled into the full length cDNA clone. The five PCR fragments were cloned into pGEM T vector. The clones with SP6 inserted direction were selected for subsequent manipulation. After a series of plasmid manipulation, the full length cDNA clone of XJ 160 virus was assembled into pBluescript vector. The restriction enzyme assay and sequencing analysis demonstrated that the whole genome of XJ 160 virus was correctly assembled into pBluescript vector, with added SP6 promoter in 5′ terminus and poly A in its 3′ terminus. 展开更多
关键词 XJ-160病毒 辛德毕斯病毒 基因克隆
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禽流感病毒A/TurKey/England/N28/73(H5N2)全基因克隆及序列分析 被引量:1
12
作者 刘丽玲 王秀荣 +2 位作者 陈化兰 邓国华 姜永萍 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期8-12,共5页
通过反转录_聚合酶链式反应 (RT_PCR)技术分别扩增了禽流感病毒A/TurKey/England/N2 8/ 73(H5N2 ) (TEN2 8/73)的 8个基因片段即PA、PB1、BP2、NS、NP、M、HA、NA基因 ,将其分别克隆到PMD18_T载体后进行序列测定 :并将克隆到的 8个基因... 通过反转录_聚合酶链式反应 (RT_PCR)技术分别扩增了禽流感病毒A/TurKey/England/N2 8/ 73(H5N2 ) (TEN2 8/73)的 8个基因片段即PA、PB1、BP2、NS、NP、M、HA、NA基因 ,将其分别克隆到PMD18_T载体后进行序列测定 :并将克隆到的 8个基因片段与GenBank发表的相应序列进行比较分析 ,绘制HA和NA基因的进化树。结果表明所克隆到的 8个片段均包含相应的病毒基因的完整开放阅读框架 ;HA、NA基因的序列分析表明TEN2 8/ 73符合低致病力禽流感病毒的特征 :HA进化分析发现TEN2 8/ 73与A/Duck/Hongkong/ 6 98/ 79处于不同的分支中 ,与A/Goose/Guangdong/ 1/ 96和A/Goose/Guangdong/ 3/ 97亲缘关系较远 ;NA进化分析表明TEN2 8/ 73与A/Duck/Hongkong/ 86 / 76亲缘关系较近 ,但和A/Leningrad/4 7/ 5 7的NA基因却在不同的分支中。TEN2 8/ 73全基因序列的测定是首次对H5N2亚型AIV的全基因进行序列测定工作。 展开更多
关键词 禽流感病毒 基因克隆 序列分析 RT-PCR 同源性分析 禽流感
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中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160病毒株感染性全基因组cDNA克隆的构建与分析 被引量:10
13
作者 杨益良 梁国栋 +6 位作者 付士红 何海怀 李晓宇 邓娟 苏乃伦 王力华 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期173-180,共8页
报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个... 报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个连续的A,通过DNA重组技术组装成病毒基因组全长cDNA克隆.该克隆可在大肠杆菌DH5a中稳定扩增.经体外转录,RNA转录体转染BHK-21细胞,细胞发生病变,恢复病毒滴度达到107~108pFU/ml.全基因组cDNA克隆构建过程中引入的沉默突变(8 453位核苷酸由C变为T)产生Xba Ⅰ酶切位点作为遗传标记,在子代恢复病毒的基因组中稳定存在.从细胞病变的特征、BHK-21细胞的空斑形态、病毒的抗原性、病毒在细胞中的生长动力学特征以及对乳鼠的致病性等方面比较,恢复病毒和亲本病毒XJ-160没有显著区别,提示获得了具有感染性的XJ-160病毒全长cDNA克隆.该病毒感染性全基因组cDNA克隆可以作为反向遗传学系统,为进一步研究病毒复制和致病机制,以及开发相应的载体表达系统提供分子生物学工具. 展开更多
关键词 感染性基因组cDNA克隆 恢复病毒 辛德毕斯病毒 XJ-160病毒株 中国 分离
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母猪VEGF基因mRNA全序列的克隆与分析 被引量:2
14
作者 陈来华 王立贤 +3 位作者 王立刚 季跃光 颜华 张龙超 《中国畜牧兽医》 CAS 2008年第6期47-51,共5页
本研究运用多种分子生物学方法对母猪胎盘VEGF mRNA全序列进行克隆和分析,结果发现:母猪胎盘VEGFmRNA全长约3500 bp,其完整的cDNA编码190个氨基酸,通过同源性比较预测了VEGF基因的DNA序列全长约为16kb。VEGF基因编码的氨基酸序列与人... 本研究运用多种分子生物学方法对母猪胎盘VEGF mRNA全序列进行克隆和分析,结果发现:母猪胎盘VEGFmRNA全长约3500 bp,其完整的cDNA编码190个氨基酸,通过同源性比较预测了VEGF基因的DNA序列全长约为16kb。VEGF基因编码的氨基酸序列与人、小鼠和恒河猴的同源性分别为78.82%、79.44%和96.34%。经生物信息学分析,预测VEGF蛋白理论分子量为22.33 kD,其等电点为7.89;大约在1-20,40-45,50-60,65-80,100-105位之间的氨基酸存在疏水性区域,用TMHMM2.0分析猪VEGF的跨膜结构发现此蛋白所有氨基酸都位于膜表面,证实了VEGF是一种表面蛋白。用signalP 3.0分析发现在1-27位氨基酸可能为信号肽(P=0.999),且可能在26和27位氨基酸之间发生切割(P=0.956)。对VEGF核苷酸序列和氨基酸序列、蛋白质结构和功能的分析,进一步证实本研究得到了VEGF基因mRNA的全序列,为VEGF基因与母猪繁殖性能的关联性研究提供依据。 展开更多
关键词 VEGF基因 序列克隆 生物信息学分析
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猪圆环病毒2型的全基因克隆和序列分析
15
作者 杨顺利 尹双辉 +1 位作者 杨亚民 刘湘涛 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第10期1-5,共5页
参考GenBank中发表的猪圆环病毒2型(PCV-2)全基因序列,设计一对PCR引物,从病料中扩增获得4株PCV-2的全基因组序列,分别命名为SDNY-PCV-2、ShD-PCV-2、HBbd-PCV-2、GSLN-PCV-2,经测序确定长度均为1 767 bp。应用DNA Star序列分析表明,4... 参考GenBank中发表的猪圆环病毒2型(PCV-2)全基因序列,设计一对PCR引物,从病料中扩增获得4株PCV-2的全基因组序列,分别命名为SDNY-PCV-2、ShD-PCV-2、HBbd-PCV-2、GSLN-PCV-2,经测序确定长度均为1 767 bp。应用DNA Star序列分析表明,4个PCV-2分离株与国外部分分离株的核苷酸序列同源性达95.5%-99.8%,与PCV-1毒株的序列同源性为76.2%-77.6%。与国内外部分分离毒株序列进化树分析表明,4个PCV-2分离毒株处于不同分支中,存在一定差异。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 基因克隆 序列分析
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斑节对虾金属硫蛋白全基因DNA克隆及生物学信息分析
16
作者 周发林 郑丽明 +3 位作者 杨其彬 黄建华 杨丽诗 江世贵 《湖北农业科学》 2017年第3期575-578,582,共5页
为深入研究斑节对虾(Penaeus monodon)金属硫蛋白MT(Pm-MT)基因参与斑节对虾性腺发育调控的分子机制,根据Pm-MT基因的c DNA序列,利用普通PCR和染色体步移(Genome Walking)技术获得Pm-MT基因的DNA全长序列,该基因序列DNA全长为2 744 bp,... 为深入研究斑节对虾(Penaeus monodon)金属硫蛋白MT(Pm-MT)基因参与斑节对虾性腺发育调控的分子机制,根据Pm-MT基因的c DNA序列,利用普通PCR和染色体步移(Genome Walking)技术获得Pm-MT基因的DNA全长序列,该基因序列DNA全长为2 744 bp,由2个内含子和3个外显子组成。其中启动子区域为806 bp,2个内含子长度分别为1 194、242 bp,3个外显子长度分别为22、78、77 bp。在启动子区域预测到转录因子糖皮质激素应答元件和雌激素应答元件与卵巢发育密切相关。 展开更多
关键词 斑节对虾(Penaeus monodon) 金属硫蛋白 基因DNA克隆 生物信息学分析
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猪圆环病毒2型分离毒株全基因组克隆与序列分析
17
作者 罗玉均 张桂红 +4 位作者 陈建红 杨林 廖明 任涛 罗开健 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第5期14-16,共3页
关键词 猪圆环病毒2型 分离毒株 基因组克隆 序列分析 断奶猪多系统衰竭综合征 PCV2 DNA病毒 细胞培养物
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白花泡桐羟基肉桂酰辅酶A还原酶mRNA全序列克隆及序列分析 被引量:2
18
作者 陈占宽 杨艳坤 +3 位作者 叶金山 李荣幸 刘志刚 王军军 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2011年第4期99-103,共5页
经过对其他物种CCR mRNA序列的对比分析后,设计保守区兼并引物,首先用RT-PCR方法得到229 bp CCR mRNA部分序列,之后通过RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)方法,成功克隆得到包括5'UTR和3'UTR在内的CCR全部mRNA序列,并进... 经过对其他物种CCR mRNA序列的对比分析后,设计保守区兼并引物,首先用RT-PCR方法得到229 bp CCR mRNA部分序列,之后通过RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)方法,成功克隆得到包括5'UTR和3'UTR在内的CCR全部mRNA序列,并进行了分析,所得CCRmRNA全序列共1 243个碱基,CDS共999个碱基(103-1 101),编码氨基酸332,和其他多个物种的CCR序列比对结果显示相似度均在80%以上。此序列成功克隆之前,尚未见到白花泡桐木质素代谢关键酶基因的报道,这对丰富白花泡桐基因资源、有针对性的进行白花泡桐品质或材质改良有巨大的意义。 展开更多
关键词 白花泡桐 木质素代谢 羟基肉桂酰辅酶A还原酶 序列克隆 材质改良
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白花泡桐尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶mRNA全序列克隆及序列分析 被引量:2
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作者 熊治国 刘志刚 +6 位作者 李建祥 裴海朝 高福玲 秦采风 陈占宽 叶金山 付晓 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期263-267,共5页
尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose Pyrophosphorylase UGPase)是白花泡桐(Paulownia fortunei(Seem.)Hemsl.)纤维素特异途径的关键酶.在经过对其他物种UGP mRNA序列的对比分析后,设计保守区简并引物,首先用RT-PCR方法得到413 bp ... 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose Pyrophosphorylase UGPase)是白花泡桐(Paulownia fortunei(Seem.)Hemsl.)纤维素特异途径的关键酶.在经过对其他物种UGP mRNA序列的对比分析后,设计保守区简并引物,首先用RT-PCR方法得到413 bp UGP mRNA部分序列,之后通过RACE方法,成功克隆得到包括5’UTR和3’UTR在内的UGP全部mRNA序列,并进行了分析,所得UGP mRNA全序列共1 694个碱基,CDS共1 428个碱基(112-1539),编码氨基酸475,和其他多个物种的UGP序列比对结果显示相似度均在80%以上. 展开更多
关键词 白花泡桐 纤维素代谢 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶 序列克隆
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1株圆环病毒3型美国毒株全基因组克隆与遗传演化分析 被引量:1
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作者 郑晶 郝桂英 +8 位作者 谢礼 安微 杨苗 陈瑛琪 张婧 郑巧 陈溪 陈孝宇 林华 《中国动物检疫》 CAS 2022年第1期116-123,共8页
为了解进口美国种猪中获取的猪圆环病毒3型(PCV3)毒株全基因组序列及遗传变异情况,根据GenBank中收录的PCV3基因组序列,设计2对特异性引物,对确诊感染PCV3的病死猪组织进行全基因组序列扩增、拼接、测序和序列分析。结果显示,获得的PCV... 为了解进口美国种猪中获取的猪圆环病毒3型(PCV3)毒株全基因组序列及遗传变异情况,根据GenBank中收录的PCV3基因组序列,设计2对特异性引物,对确诊感染PCV3的病死猪组织进行全基因组序列扩增、拼接、测序和序列分析。结果显示,获得的PCV3美国毒株(命名为PCV3_USA2021,GenBank登录号OL799306)全基因组序列长度约为2000 bp,与国内外不同地区的38个PCV3参考毒株同源性为98.7%~99.8%。其中,PCV3_USA2021株开放阅读框ORF1和ORF2与国内外38个参考毒株同源性分别为99.1%~99.9%和98.0%~100%。构建的全基因组系统进化树显示,该毒株为PCV3a亚型,与美国毒株(PCV3-US_SD2016)亲缘关系最近。本研究为PCV3的遗传变异、流行病学分析提供了参考,也为相关疫苗的研制打下了基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 基因组克隆 遗传演化分析 CAP蛋白 美国毒株
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