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禽流感病毒分离株A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)全基因克隆及序列分析 被引量:32
1
作者 张建林 于康震 +2 位作者 陈化兰 唐秀英 田国斌 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第3期232-235,共4页
本研究用无特定病原体 (SPF)鸡胚增殖禽流感病毒鹅体分离株A/Goose/Guangdong/1/96 (H5N1) (GD1/96 ) ,提取病毒基因组总RNA ,运用反转录_聚合酶链反应 (RT_PCR)技术分别扩增该病毒分离株的 8个基因片段的cDNA ,分别克隆后进行序列测定... 本研究用无特定病原体 (SPF)鸡胚增殖禽流感病毒鹅体分离株A/Goose/Guangdong/1/96 (H5N1) (GD1/96 ) ,提取病毒基因组总RNA ,运用反转录_聚合酶链反应 (RT_PCR)技术分别扩增该病毒分离株的 8个基因片段的cDNA ,分别克隆后进行序列测定。序列分析结果表明 ,所扩增到的 8个片段均包含相应的病毒基因的完整开放阅读框架。GD1/96株与 1997年香港禽流感事件中的 4株香港流感病毒分离株 (分别来自人、鸡、鸭和鹅 )的HA基因的高度同源性说明它们可能起源于同一种系 ,但NS基因的差异说明它们分属于不同的基因群系。GD1/96株与香港流感病毒分离株的核苷酸和推导的氨基酸序列的同源性较低 ( 6 3.9%~ 98.1%) ,而香港流感病毒分离株之间的核苷酸和氨基酸序列的同源性很高 ( 96 .5 %~ 10 0 %) ,且香港各流感病毒分离株的NA均缺失 5 7个核苷酸 ( 19个氨基酸 )残基。因此 ,内地H5N1分离株GD1/96与 展开更多
关键词 禽流感病毒 分离株 全基因克隆 序列分析
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鸡贫血病毒哈尔滨分离株全基因克隆和序列分析 被引量:5
2
作者 何成强 丁乃峥 +1 位作者 李景鹏 李云龙 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期436-441,共6页
通过PCR方法克隆了从哈尔滨分离的一株鸡贫血病毒 (CAV)的全基因 ,并对其进行了测序 ,该病毒基因组为环状 ,全长 2 2 98bp ,含有三个互相重叠的开放读码框和一个调控区。将克隆的基因与GenBank收录的CAV基因比较 ,同源性至少为 97% ,未... 通过PCR方法克隆了从哈尔滨分离的一株鸡贫血病毒 (CAV)的全基因 ,并对其进行了测序 ,该病毒基因组为环状 ,全长 2 2 98bp ,含有三个互相重叠的开放读码框和一个调控区。将克隆的基因与GenBank收录的CAV基因比较 ,同源性至少为 97% ,未发现与本次克隆的CAV基因完全一致的分离株。与德国分离株Cux la、2 6p4和马来西亚分离株分别有 42、42和72个核苷酸不同 ,同源性分别为 98 2 %、98 2 %和 96 9%。与德国分离株Cux 1b相比 ,除在调控区内少一个类似增强子的重复序列外 ,尚有 3 9处核苷酸不同。它与分离于欧洲的几株CAV的亲源性要比来自亚洲的马来西亚株近。对CAV哈尔滨分离株、2 6p4、Cux 1b、Cux 1a和马来西亚株的VP1、VP2和VP3蛋白比较 。 展开更多
关键词 鸡贫血病毒 哈尔滨分离株 全基因克隆 序列分析
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5株猪圆环病毒2型全基因克隆和序列分析 被引量:5
3
作者 唐志玲 肖建雄 +1 位作者 陈瑞爱 罗满林 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第5期14-18,共5页
为了解广东地区猪圆环病毒2型(PCV2)流行势态及毒株的基因变异情况,从广东珠三角地区疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)患病死亡猪中采集淋巴结,将PCR鉴定为阳性的病料在PK-15细胞上进行增殖培养,成功分离到5株猪圆环病毒2型毒株,分... 为了解广东地区猪圆环病毒2型(PCV2)流行势态及毒株的基因变异情况,从广东珠三角地区疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)患病死亡猪中采集淋巴结,将PCR鉴定为阳性的病料在PK-15细胞上进行增殖培养,成功分离到5株猪圆环病毒2型毒株,分别标记为GD-jm、GD-sz、GD-pz、GD-gj和GD-ss。再从细胞培养物中提取病毒基因组DNA,对5株PCV2分离株全基因组进行PCR扩增并克隆到pMD18-T Simple Vector进行测序,测序结果提交GenBank,登录号分别为JX912914、JX912915、JX945575、JX945576和JX945577。借助相关生物学软件作同源性分析,这5株PCV2基因组长度均为1767bp,其中3株为PCV2b亚型,2株为PCV2d亚型。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 全基因克隆 序列分析
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禽流感病毒A/TurKey/England/N28/73(H5N2)全基因克隆及序列分析 被引量:1
4
作者 刘丽玲 王秀荣 +2 位作者 陈化兰 邓国华 姜永萍 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期8-12,共5页
通过反转录_聚合酶链式反应 (RT_PCR)技术分别扩增了禽流感病毒A/TurKey/England/N2 8/ 73(H5N2 ) (TEN2 8/73)的 8个基因片段即PA、PB1、BP2、NS、NP、M、HA、NA基因 ,将其分别克隆到PMD18_T载体后进行序列测定 :并将克隆到的 8个基因... 通过反转录_聚合酶链式反应 (RT_PCR)技术分别扩增了禽流感病毒A/TurKey/England/N2 8/ 73(H5N2 ) (TEN2 8/73)的 8个基因片段即PA、PB1、BP2、NS、NP、M、HA、NA基因 ,将其分别克隆到PMD18_T载体后进行序列测定 :并将克隆到的 8个基因片段与GenBank发表的相应序列进行比较分析 ,绘制HA和NA基因的进化树。结果表明所克隆到的 8个片段均包含相应的病毒基因的完整开放阅读框架 ;HA、NA基因的序列分析表明TEN2 8/ 73符合低致病力禽流感病毒的特征 :HA进化分析发现TEN2 8/ 73与A/Duck/Hongkong/ 6 98/ 79处于不同的分支中 ,与A/Goose/Guangdong/ 1/ 96和A/Goose/Guangdong/ 3/ 97亲缘关系较远 ;NA进化分析表明TEN2 8/ 73与A/Duck/Hongkong/ 86 / 76亲缘关系较近 ,但和A/Leningrad/4 7/ 5 7的NA基因却在不同的分支中。TEN2 8/ 73全基因序列的测定是首次对H5N2亚型AIV的全基因进行序列测定工作。 展开更多
关键词 禽流感病毒 全基因克隆 序列分析 RT-PCR 同源性分析 禽流感
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猪圆环病毒2型的全基因克隆和序列分析
5
作者 杨顺利 尹双辉 +1 位作者 杨亚民 刘湘涛 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第10期1-5,共5页
参考GenBank中发表的猪圆环病毒2型(PCV-2)全基因序列,设计一对PCR引物,从病料中扩增获得4株PCV-2的全基因组序列,分别命名为SDNY-PCV-2、ShD-PCV-2、HBbd-PCV-2、GSLN-PCV-2,经测序确定长度均为1 767 bp。应用DNA Star序列分析表明,4... 参考GenBank中发表的猪圆环病毒2型(PCV-2)全基因序列,设计一对PCR引物,从病料中扩增获得4株PCV-2的全基因组序列,分别命名为SDNY-PCV-2、ShD-PCV-2、HBbd-PCV-2、GSLN-PCV-2,经测序确定长度均为1 767 bp。应用DNA Star序列分析表明,4个PCV-2分离株与国外部分分离株的核苷酸序列同源性达95.5%-99.8%,与PCV-1毒株的序列同源性为76.2%-77.6%。与国内外部分分离毒株序列进化树分析表明,4个PCV-2分离毒株处于不同分支中,存在一定差异。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 全基因克隆 序列分析
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吉林磐石新分离株PCV2全基因克隆及Cap蛋白B细胞抗原表位预测
6
作者 苗丽娟 尹柏双 +1 位作者 张立春 刘东旭 《吉林农业科技学院学报》 2018年第4期1-3,7,115,共5页
对吉林市磐石某猪场采集疑似为猪圆环病毒2型感染的病死猪的脏器进行PCR检测,同时接种PK15细胞,成功分离到1株猪圆环病毒2型。通过对该毒株全基因组进行克隆并测序,采用DNAstar软件对Cap蛋白进行二级结构分析和B淋巴细胞抗原表位的预测... 对吉林市磐石某猪场采集疑似为猪圆环病毒2型感染的病死猪的脏器进行PCR检测,同时接种PK15细胞,成功分离到1株猪圆环病毒2型。通过对该毒株全基因组进行克隆并测序,采用DNAstar软件对Cap蛋白进行二级结构分析和B淋巴细胞抗原表位的预测,结果表明:该新分离株Cap蛋白具有多处抗原优势表位,为抗原表位鉴定、基因工程疫苗研制和单克隆制备奠定基础。 展开更多
关键词 PCV2 全基因克隆 B细胞抗原表位预测
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以色列急性麻痹病毒LN株全基因克隆与遗传进化分析
7
作者 陈路 李林熹 +3 位作者 梁爽 韩宇 李明 孙莉 《现代畜牧兽医》 2024年第5期19-22,共4页
研究旨在了解辽宁省以色列急性麻痹病毒(IAPV)的遗传进化特点。试验选取成年患病蜜蜂提取IAPV并进行PCR测序,选取China-BJ (GenBank登录号:KX421583.1)基因序列设计12对引物进行全基因克隆,将获得的基因序列与GenBank已公布的19株IAPV... 研究旨在了解辽宁省以色列急性麻痹病毒(IAPV)的遗传进化特点。试验选取成年患病蜜蜂提取IAPV并进行PCR测序,选取China-BJ (GenBank登录号:KX421583.1)基因序列设计12对引物进行全基因克隆,将获得的基因序列与GenBank已公布的19株IAPV序列进行遗传进化分析。结果显示:试验成功分离出IAPV,并将其命名为IAPV-LN株(GenBank登录号:MZ269472.1)。IAPV-LN株与China-BJ和China-BJ2 (GenBank登录号:MG599488.1)同属一个分支。研究表明,丹东市某蜂场患病蜜蜂中分离得到的IAPV-LN株与China-BJ2、China-BJ的亲缘关系最近,可能来自同一个原始毒株。 展开更多
关键词 以色列急性麻痹病毒 全基因克隆 遗传进化分析
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乙型肝炎病毒全基因克隆及序列分析发现一D/C基因型重组株 被引量:9
8
作者 黄维金 张华远 +4 位作者 王佑春 林京香 吴星 周诚 李河民 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期418-422,共5页
目的 构建含有adr、adw、ayw 3个血清型的HBV全基因组质粒 ,并进行测序及序列分析。方法 从HBsAg携带者的血清中扩增出S区克隆 ,筛选出adr、adw、ayw血清型的血清 ,然后扩增HBV的全基因组 ,对扩增产物进行克隆测序。利用DNAStar的MegA... 目的 构建含有adr、adw、ayw 3个血清型的HBV全基因组质粒 ,并进行测序及序列分析。方法 从HBsAg携带者的血清中扩增出S区克隆 ,筛选出adr、adw、ayw血清型的血清 ,然后扩增HBV的全基因组 ,对扩增产物进行克隆测序。利用DNAStar的MegAlign ,Phylogenetictree对HBV全基因序列以及分段序列进行比较和进化树分析。结果 构建了含有adw、adr、ayw 3种血清型的HBV全基因组质粒 ,代码分别为 :H1、H2、H3,对 3株完成序列测定 ,按照S区核苷酸顺序划分基因型分别为B、C、D ,全序列分型显示H1、H2为B、C基因型 ,与按S区的分型一致 ,但H3为C基因型 ,与按S区的分型不同 ,进一步的序列分析表明H3为一株异常的基因型 ,按照S区和preS2区分型为D基因型 ,但是全基因组 C P X区的进化树分析 ,H3株均位于C基因型 ,提示该异常的基因型可能是由于D C基因型间基因重组引起 ,对重组位点进行了分析 :3181nt~ 10nt、799~ 834nt为可能的重组位点所在区。结论 H3病毒株的发现进一步证明了HBV基因型间的基因重组 ,但澄清该问题需要在HBV感染的高流行区进一步的积累HBV异常基因型的全序列 ,以及发现新的基因型资料。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 全基因克隆 序列分析 D/C基因 重组
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山羊地方性鼻内肿瘤病毒Shaanxi株前病毒全基因组克隆及生物信息学分析 被引量:8
9
作者 何亚鹏 付明哲 +4 位作者 许信刚 庞文静 王景 周曼 张琪 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期63-66,共4页
为研究山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV)Shaanxi株前病毒全基因组序列,本研究根据Gen Bank中收录的ENTV前病毒基因组序列设计5对引物,通过PCR方法从肿瘤组织中分段扩增获得了ENTV前病毒全基因组的5个片段,测序并分析。结果显示该病毒基因... 为研究山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV)Shaanxi株前病毒全基因组序列,本研究根据Gen Bank中收录的ENTV前病毒基因组序列设计5对引物,通过PCR方法从肿瘤组织中分段扩增获得了ENTV前病毒全基因组的5个片段,测序并分析。结果显示该病毒基因组全长7 275 bp,包含相互重叠的gag-pro-pol-env编码区及5'端非编码区;ENTV Shaanxi株基因组全序列与NC004994.2、AY197548.2、ENTV-SC株(HM104174.1)核苷酸同源性分别为89%、89%、99%。本研究为ENTV的分子生物学特性研究提供资料,为进一步研究其检测方法与致病机理奠定了基础。 展开更多
关键词 山羊 地方性鼻内肿瘤病毒 全基因克隆 生物信息学分析
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重型乙型肝炎患者血清乙型肝炎病毒全基因克隆及测序 被引量:3
10
作者 吴炜 李兰娟 +3 位作者 陈瑜 李君 钱香 程东庆 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期734-737,共4页
目的建立重型乙型肝炎患者血清乙型肝炎病毒(HBV)DNA克隆并测序,从全基因水平分析HBV基因变异与重型乙型肝炎发病的关系。方法10例重型乙型肝炎患者血清提取HBV DNA,聚合酶链反应(PCR)扩增HBV全基因。PCR产物构建到pUCm-T载体上,转化至... 目的建立重型乙型肝炎患者血清乙型肝炎病毒(HBV)DNA克隆并测序,从全基因水平分析HBV基因变异与重型乙型肝炎发病的关系。方法10例重型乙型肝炎患者血清提取HBV DNA,聚合酶链反应(PCR)扩增HBV全基因。PCR产物构建到pUCm-T载体上,转化至大肠杆菌感受态DH-5α细胞, 经酶切鉴定,获得含3.2 Kb HBV DNA的重组克隆菌,全基因测序, 分析各读码框核苷酸和氨基酸变化。结果4例成功构建HBV DNA克隆,并完成全基因测序。其中3例在前C区发生G1896A变异,产生一个终止密码子,导致HBeAg缺失; 1例在C启动子区1762、1764双位点出现突变;有多处点突变及缺失变异分布于PreS2区及C区已知细胞毒T淋巴细胞、B淋巴细胞和T淋巴细胞的细胞表位。结论该法可用于临床研究HBV病毒基因结构与重型乙型肝炎发病的关系,并为进一步研究其HBV基因功能奠定基础。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 基因 病毒 肝炎 重型 血清乙型肝炎病毒 重型乙型肝炎 乙型肝炎患者 基因测序 全基因克隆 乙型肝炎病毒(HBV) 聚合酶链反应(PCR)
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猫杯状病毒GX2019的分离鉴定及全基因克隆遗传进化分析 被引量:4
11
作者 王浩 秦树英 +3 位作者 刘金凤 白安斌 覃绍敏 吴健敏 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期880-885,共6页
从南宁某宠物医院疑似感染猫杯状病毒(Feline calicivirus,FCV)猫鼻咽拭子中,利用F81细胞分离1株FCV后,RT-PCR和电镜鉴定,测定TCID50和理化性质。同时利用RT-PCR分段扩增病毒全基因序列,进行同源性及遗传进化分析。结果显示,FCV GX2019... 从南宁某宠物医院疑似感染猫杯状病毒(Feline calicivirus,FCV)猫鼻咽拭子中,利用F81细胞分离1株FCV后,RT-PCR和电镜鉴定,测定TCID50和理化性质。同时利用RT-PCR分段扩增病毒全基因序列,进行同源性及遗传进化分析。结果显示,FCV GX2019分离株的TCID50为1×10-8.67/0.1 mL,基因组全长为7687 bp,与FCV CH-JL4(长春株)毒株核苷酸序列相似性最高,为85.3%,属于同一分支。氨基酸分析表明,与国内FCV疫苗株255、国外FCV疫苗株F9、FCV跛行综合征株2280及FCV GX01分离株氨基酸变异率分别为46.7%、26.7%、53.3%、40.0%,其中B细胞抗原识别表位中氨基酸位点发生了改变。 展开更多
关键词 猫杯状病毒 分离鉴定 全基因克隆 遗传进化分析
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我国分离的XJ-160病毒全基因组克隆的构建 被引量:1
12
作者 何海怀 杨益良 +4 位作者 付士红 李蕾 周国林 吕新军 梁国栋 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期161-165,共5页
XJ 160 virus was isolated in 1990 from Xinjiang, China. The biological characteristics of XJ 160 virus suggested that it might be a Togavirus. The serological tests showed that XJ 160 virus is a Sindbis like virus. Th... XJ 160 virus was isolated in 1990 from Xinjiang, China. The biological characteristics of XJ 160 virus suggested that it might be a Togavirus. The serological tests showed that XJ 160 virus is a Sindbis like virus. The complete 11626 base nucleotide sequence of XJ 160 has been determined recently. It is necessary to establish a reverse genetic system for rescue of XJ 160 virus from its cDNA clone. We describe here the constructon of full length cDNA clone of XJ 160 virus. The total RNA were extracted from BHK cells infected with XJ 160 virus. Specific primers were used to amplify five fragments covering the whole genome of XJ 160 virus. All of these five fragments have the restriction enzyme sites at both termini to be assembled into the full length cDNA clone. The five PCR fragments were cloned into pGEM T vector. The clones with SP6 inserted direction were selected for subsequent manipulation. After a series of plasmid manipulation, the full length cDNA clone of XJ 160 virus was assembled into pBluescript vector. The restriction enzyme assay and sequencing analysis demonstrated that the whole genome of XJ 160 virus was correctly assembled into pBluescript vector, with added SP6 promoter in 5′ terminus and poly A in its 3′ terminus. 展开更多
关键词 XJ-160病毒 辛德毕斯病毒 全基因克隆
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鸭圆环病毒全基因组克隆与序列分析 被引量:41
13
作者 傅光华 程龙飞 +3 位作者 施少华 彭春香 陈红梅 黄瑜 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期138-143,共6页
为研究鸭圆环病毒全基因组的分子生物学特性,运用重叠PCR技术从鸭组织脏器提取的DNA中扩增出2条核苷酸序列,拼接后对其核酸组成、基因组结构及病毒的遗传变异进行分析。结果表明所获病毒核酸为大小1995nt的环型DNA,包含6个ORF,与登录在G... 为研究鸭圆环病毒全基因组的分子生物学特性,运用重叠PCR技术从鸭组织脏器提取的DNA中扩增出2条核苷酸序列,拼接后对其核酸组成、基因组结构及病毒的遗传变异进行分析。结果表明所获病毒核酸为大小1995nt的环型DNA,包含6个ORF,与登录在GenBank中克隆株MuDCV(AY228555)的同源性高达97·4%,可见所扩增的核酸序列为鸭圆环病毒基因组序列。 展开更多
关键词 鸭圆环病毒 基因克隆 序列分析
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猪Ⅱ型圆环病毒豫A株的全基因组克隆与序列分析 被引量:14
14
作者 曹胜波 陈焕春 +3 位作者 肖少波 赵俊龙 吕建强 钱平 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期137-141,共5页
参照国外发表的猪Ⅱ型圆环病毒 (porcinecircovirustype 2 ,PCV - 2 )全基因组序列 ,设计一对PCV - 2特异性引物 ,用该室分离的PCV - 2豫A株感染PK - 15细胞 ,从中提取PCV - 2复制型基因组DNA ,并以之为模板进行PCR扩增。回收PCR产物 ,... 参照国外发表的猪Ⅱ型圆环病毒 (porcinecircovirustype 2 ,PCV - 2 )全基因组序列 ,设计一对PCV - 2特异性引物 ,用该室分离的PCV - 2豫A株感染PK - 15细胞 ,从中提取PCV - 2复制型基因组DNA ,并以之为模板进行PCR扩增。回收PCR产物 ,构建重组测序质粒T -PCV - 2。测序结果表明 ,猪Ⅱ型圆环病毒豫A株的全基因组为 176 7bp ,与GenBank收录的PCV - 2国外分离株核苷酸的同源性可高达 97%。序列分析表明 ,复制型豫A株的基因组包含 10个读码框架 ,其中ORF1、ORF2是其两个最主要的读码框架 ,分别编码 314、2 34个氨基酸。豫A株和PCV - 1间的ORF1、ORF2的氨基酸序列同源性分别为 85 %、6 6 % ,与其它PCV - 2毒株间的ORF1氨基酸同源性均在 98%以上 ,而ORF2的氨基酸同源性为 92 %~ 97%。 展开更多
关键词 猪Ⅱ型圆环病毒豫A株 基因克隆 序列分析 PCV-2
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在MDCK细胞上高产的乙型流行性感冒病毒株的筛选及其全基因组克隆 被引量:9
15
作者 齐立 吴昆昱 +4 位作者 李梓 张烨 董婕 张立国 张智清 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期195-199,共5页
流行性感冒(流感)病毒可引起世界范围的大流行,因此需要及时地生产流感疫苗来预防流感的流行。乙型流感病毒是疫苗的重要组成部分。传统制备疫苗的方法是使用鸡胚生产,存在很多缺陷,应用哺乳动物细胞生产流感疫苗是个更好的选择。但是,... 流行性感冒(流感)病毒可引起世界范围的大流行,因此需要及时地生产流感疫苗来预防流感的流行。乙型流感病毒是疫苗的重要组成部分。传统制备疫苗的方法是使用鸡胚生产,存在很多缺陷,应用哺乳动物细胞生产流感疫苗是个更好的选择。但是,乙型流感病毒感染MDCK细胞后,很难得到持续的高产。此实验筛选到的乙型流感病毒在MDCK细胞连续传代15代后,PFU值从第1代的8×104到第15代2×109,TCID50从第1代6 5到第15代的8 0。将筛选到的毒株进行全基因组克隆,用两套引物获得乙型流感病毒的全部8个节段。此结果为利用反向遗传技术将高产毒株与流行毒株重配,进而在哺乳动物细胞上生产基因工程流感疫苗打下基础。 展开更多
关键词 流行性感冒 病毒 乙型流感 毒株 通用引物 哺乳动物细胞 疫苗 基因克隆
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中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160病毒株感染性全基因组cDNA克隆的构建与分析 被引量:10
16
作者 杨益良 梁国栋 +6 位作者 付士红 何海怀 李晓宇 邓娟 苏乃伦 王力华 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期173-180,共8页
报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个... 报告了中国首次分离的辛德毕斯病毒XJ-160株的感染性全基因组cDNA克隆的构建与鉴定.利用RT-PCR方法获得覆盖病毒全长基因组的cDNA片段,以低拷贝质粒pBR322作为骨架,将基因组cDNA置于SP6 RNA聚合酶启动子之后,基因组3'末端带有35个连续的A,通过DNA重组技术组装成病毒基因组全长cDNA克隆.该克隆可在大肠杆菌DH5a中稳定扩增.经体外转录,RNA转录体转染BHK-21细胞,细胞发生病变,恢复病毒滴度达到107~108pFU/ml.全基因组cDNA克隆构建过程中引入的沉默突变(8 453位核苷酸由C变为T)产生Xba Ⅰ酶切位点作为遗传标记,在子代恢复病毒的基因组中稳定存在.从细胞病变的特征、BHK-21细胞的空斑形态、病毒的抗原性、病毒在细胞中的生长动力学特征以及对乳鼠的致病性等方面比较,恢复病毒和亲本病毒XJ-160没有显著区别,提示获得了具有感染性的XJ-160病毒全长cDNA克隆.该病毒感染性全基因组cDNA克隆可以作为反向遗传学系统,为进一步研究病毒复制和致病机制,以及开发相应的载体表达系统提供分子生物学工具. 展开更多
关键词 感染性基因组cDNA克隆 恢复病毒 辛德毕斯病毒 XJ-160病毒株 中国 分离
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4株鸭圆环病毒全基因组克隆与遗传进化分析 被引量:3
17
作者 张济培 陈冈 +5 位作者 廖洁丹 曹梦蕊 李荣旭 伍辉吉 张溢珊 陈济铛 《中国家禽》 北大核心 2018年第17期49-51,共3页
通过对广东佛山、中山等地出现以脱毛,皮肤潮红,生长缓慢为特征的樱桃谷商品肉鸭群的病鸭组织进行病原检测,初步诊断为鸭圆环病毒(DuCV)感染。采用常规PCR方法,扩增出4株DuCV的全基因序列,并进行序列比较及遗传进化分析。结果显示:4株D... 通过对广东佛山、中山等地出现以脱毛,皮肤潮红,生长缓慢为特征的樱桃谷商品肉鸭群的病鸭组织进行病原检测,初步诊断为鸭圆环病毒(DuCV)感染。采用常规PCR方法,扩增出4株DuCV的全基因序列,并进行序列比较及遗传进化分析。结果显示:4株DuCV全基因与德国株AY228555,广西株KC460527、KC460530、KC460532、KC460535属于同一进化分支,同源性为94.8%~99.3%,均属于DuCV-1型;而与DuCV-2型代表株台湾株AY394721的同源性为82.9%~83.4%。该研究为鸭圆环病毒感染的监控和诊断提供了依据。 展开更多
关键词 鸭圆环病毒 全基因克隆 序列分析
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猪圆环病毒2型分离毒株全基因组克隆与序列分析
18
作者 罗玉均 张桂红 +4 位作者 陈建红 杨林 廖明 任涛 罗开健 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第5期14-16,共3页
关键词 猪圆环病毒2型 分离毒株 基因克隆 序列分析 断奶猪多系统衰竭综合征 PCV2 DNA病毒 细胞培养物
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斑节对虾金属硫蛋白全基因DNA克隆及生物学信息分析
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作者 周发林 郑丽明 +3 位作者 杨其彬 黄建华 杨丽诗 江世贵 《湖北农业科学》 2017年第3期575-578,582,共5页
为深入研究斑节对虾(Penaeus monodon)金属硫蛋白MT(Pm-MT)基因参与斑节对虾性腺发育调控的分子机制,根据Pm-MT基因的c DNA序列,利用普通PCR和染色体步移(Genome Walking)技术获得Pm-MT基因的DNA全长序列,该基因序列DNA全长为2 744 bp,... 为深入研究斑节对虾(Penaeus monodon)金属硫蛋白MT(Pm-MT)基因参与斑节对虾性腺发育调控的分子机制,根据Pm-MT基因的c DNA序列,利用普通PCR和染色体步移(Genome Walking)技术获得Pm-MT基因的DNA全长序列,该基因序列DNA全长为2 744 bp,由2个内含子和3个外显子组成。其中启动子区域为806 bp,2个内含子长度分别为1 194、242 bp,3个外显子长度分别为22、78、77 bp。在启动子区域预测到转录因子糖皮质激素应答元件和雌激素应答元件与卵巢发育密切相关。 展开更多
关键词 斑节对虾(Penaeus monodon) 金属硫蛋白 基因DNA克隆 生物信息学分析
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1株圆环病毒3型美国毒株全基因组克隆与遗传演化分析 被引量:1
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作者 郑晶 郝桂英 +8 位作者 谢礼 安微 杨苗 陈瑛琪 张婧 郑巧 陈溪 陈孝宇 林华 《中国动物检疫》 CAS 2022年第1期116-123,共8页
为了解进口美国种猪中获取的猪圆环病毒3型(PCV3)毒株全基因组序列及遗传变异情况,根据GenBank中收录的PCV3基因组序列,设计2对特异性引物,对确诊感染PCV3的病死猪组织进行全基因组序列扩增、拼接、测序和序列分析。结果显示,获得的PCV... 为了解进口美国种猪中获取的猪圆环病毒3型(PCV3)毒株全基因组序列及遗传变异情况,根据GenBank中收录的PCV3基因组序列,设计2对特异性引物,对确诊感染PCV3的病死猪组织进行全基因组序列扩增、拼接、测序和序列分析。结果显示,获得的PCV3美国毒株(命名为PCV3_USA2021,GenBank登录号OL799306)全基因组序列长度约为2000 bp,与国内外不同地区的38个PCV3参考毒株同源性为98.7%~99.8%。其中,PCV3_USA2021株开放阅读框ORF1和ORF2与国内外38个参考毒株同源性分别为99.1%~99.9%和98.0%~100%。构建的全基因组系统进化树显示,该毒株为PCV3a亚型,与美国毒株(PCV3-US_SD2016)亲缘关系最近。本研究为PCV3的遗传变异、流行病学分析提供了参考,也为相关疫苗的研制打下了基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 基因克隆 遗传演化分析 CAP蛋白 美国毒株
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