原发性骨质疏松症肾阳虚证骨组织全基因表达谱研究

目的通过检测原发性骨质疏松症不同中医证型患者骨组织基因表达谱的差异,探讨原发性骨质疏松症肾阳虚证相关基因的信息学特征。方法随机选择原发性骨质疏松症患者,中医辨证分型为肾阳虚证组3例,肾阴虚证组3例,无肾虚证组3例,并选择正常骨密度人群3例设为正常对照组。用人全基因组表达谱芯片检测4组人群骨组织基因表达谱,筛选共同的差异表达基因,并对这些差异表达基因进行基因通路等相关功能分析。结果肾阳虚证组与正常对照组、肾阴虚证组、无肾虚证组的差异表达基因分别为2631条、3976条、6184条;肾阳虚证组与其他3组比较共同的差异表达基因有1037条。这些差异基因参与补体与凝血级联反应、Hedgehog、TGF-beta、细胞周期等22条信号通路。结论原发性骨质疏松症肾阳虚证的相关基因主要与免疫调节、TGF-beta、细胞周期等信号通路相关。

用聚类法分析受抗真菌物质处理后的酵母细胞全基因表达谱

微阵列DNA芯片技术可以并行分析成千上万个基因的表达情况 ,它为研究药物的作用机制提供了一个新的高效技术平台 .用 9种已知和未知作用机理的抗真菌化合物处理酵母细胞 ,并得到酵母细胞的全基因表达谱 ,然后对其进行聚类分析 .结果表明作用机制类似的化合物具有相近的聚类关系 .两性霉素B和制霉菌素、酮康唑和克霉唑都是已知的作用机制类似的抗真菌药物 .通过对基因表达谱进行聚类分析 ,发现前一组和后一组分别被聚类在一起 .另外已知澳洲茄胺抑制的是细胞膜上麦角固醇的合成 ,聚类分析表明它与酮康唑 ,克霉唑的聚类很靠近 .对微阵列DNA芯片产生的基因表达谱进行聚类分析 ,由于作用机制相似的药物会被聚类在一起 ,因此根据未知药物和已知药物的聚类关系 ,可以了解未知药物的作用机制 。

基于十二指肠全基因表达谱研究模型大鼠脾虚湿阻的分子机制

目的:研究脾虚水湿不化大鼠脾虚湿阻的分子机制。方法:20只Wistar大鼠随机分为模型组和正常对照组,每组10只。高脂低蛋白加负重力竭游泳复合因素诱导6周,建立脾虚水湿不化大鼠模型。Agilent全基因组表达谱芯片检测大鼠十二指肠组织基因表达谱变化,筛选差异基因,基于基因本体数据库(GO)进行基因功能分类,基于《京都基因与基因组百科全书(KEGG)》数据库进行信号通路分析,实时荧光定量PCR验证部分基因Tff2和Trpm6表达。结果:与正常对照组比,模型大鼠筛选出1275个差异表达基因,上调660个,下调615个。GO分析结果显示差异基因生物学过程主要包括跨膜转运、免疫应答、铁离子稳态等,分子功能主要包括水通道活性、磷脂酶D活性、受体活性、氧化还原酶活性等,细胞组分包括微绒毛、刷状缘膜等。信号通路主要包括矿物质吸收、补体级联反应、细胞因子-细胞因子相互作用、钙离子信号通路、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸代谢通路。结论:模型大鼠十二指肠组织参与消化吸收、水及离子代谢、免疫功能的基因出现异常,其脾虚湿阻的机制涉及矿物质吸收、钙离子信号通路、补体激活通路及甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸代谢等。

伴癌与非伴癌胃高级别上皮内瘤变全基因表达谱的比较

目的比较伴癌患者的胃高级别上皮内瘤变(HGIN)与非伴癌患者的胃HGIN组织全基因表达谱的差异。方法收集北京协和医院2010年3月至2013年5月间行放大染色胃镜检查的21例患者的标本,胃镜活检组织病理均为HGIN。21例患者均行内镜黏膜下剥离术,病理示10例为HGIN,11例为HGIN伴部分癌变。采用4×44K人全基因表达谱芯片,用非配对t检验和Benjamini-Hochberg假发现率(FDR)校正筛选差异基因,采用Gene Spring GX 12.6进行基因本体(GO)富集分析。结果伴癌HGIN与非伴癌HGIN组织的全基因表达谱比较,共有差异基因470个(P<0.05,倍数变化>2),其中表达上调的基因180个,表达下调的基因290个。上调基因GO富集主要与三酰甘油合成、甘油酯合成、中性脂质合成、甘油醚代谢、有机醚代谢及甘油酯类代谢有关。结论脂质代谢改变可能是胃癌发生的早期事件。

白斑膏对外阴硬化性苔藓患者全基因表达谱影响的研究

目的:研究白斑膏对外阴硬化性苔藓治疗前后外阴病变组织基因表达谱的影响,并为外阴硬化性苔藓的早期诊断及临床治疗提供理论依据。方法:以病理诊断为外阴硬化性苔藓的患者9例为研究对象,局部外涂白斑膏3个月。应用基因芯片技术,检测患者治疗前后同一部位外阴皮肤组织,并以周边正常处皮肤作为正常对照组,分析基因表达谱的变化,以FC及P值为研究指标,差异表达的标准为FC≥1.5,P<0.05。筛选差异表达基因,并进行GO分析和KEGG数据库基因通路分析。结果:与正常对照组比较,治疗前A组差异表达基因共22个,其中上调21个,下调1个;治疗前A组与治疗后B组比较,差异表达基因23个,均为上调。与白斑膏治疗相关的差异表达基因包括:TBK1、STAT1、ITGAM、VCAN、PRKACB、PROM1、PLAT、SERPINA1。GO分析显示:上调的差异基因主要集中在胞外体,胞浆、细胞外间隙、高尔基体等细胞组分,利用细胞代谢正调控、信号转导调节、细胞黏附等生物过程,起到蛋白结合、酶活性调节等分子功能。KEGG信号通路显示:差异表达基因明显富集于Toll样受体、NOD样受体、FcεRI等信号通路上,均为上调信号通路。其中Toll样受体、NOD样受体信号通路与本病关系最密切。结论:白斑膏对外阴硬化性苔藓治疗,可能是通过调节相关基因的表达,影响Toll样受体等信号通路转导,从而起到调节代谢,炎症和免疫反应等作用,而本研究所筛选出的通路及基因为今后研究本病提供方向。

卵巢癌肿瘤间质中癌相关成纤维细胞全基因表达谱分析

目的:寻找上皮性卵巢癌(epithelial ovarian cancer,EOC)癌相关成纤维细胞(cancer associated fibroblasts,CAFs)和正常成纤维细胞(normal fibroblasts,NFs)中差异表达的m RNA并进行分析,为进一步阐明肿瘤间质中癌相关成纤维细胞影响卵巢癌细胞恶性行为的机制提供依据。方法:分别提取3例上皮性卵巢癌的CAFs及3例正常卵巢组织的NFs,抽提总RNA,进行全基因表达谱分析。对差异基因进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集及信号通路联合分析,推定相关差异基因生物学功能,并对MDM2、NR3C1等6个上调的差异基因进行荧光定量PCR验证。结果:对芯片结果的分析显示差异基因共1 636个。q RTPCR对MDM2、NR3C1等6个差异基因的验证结果与芯片结果相符,生物信息学分析显示上述差异基因与癌相关通路、肌动蛋白细胞骨架重塑通路等有关,提示可能参与了对卵巢癌细胞恶性行为的促进作用。结论:EOC肿瘤间质中的成纤维细胞存在调控癌细胞的差异基因,分析这些差异基因为进一步研究卵巢癌成纤维细胞调控癌细胞生物学行为的分子机制提供了基本依据。

杀草强对人甲状腺Nthy-ori-3-1细胞全基因表达谱的影响

目的研究杀草强对人甲状腺Nthy-ori-3-1细胞全基因表达谱的影响。方法以100μg/ml杀草强处理Nthy-ori-3-1细胞24 h后,进行全基因表达谱分析,采用实时定量PCR验证芯片结果,并用GO分析和pathway分析芯片结果。结果实时定量PCR验证差异基因表达与芯片结果一致。GO和pathway分析结果显示共检测了41 001个基因,按P<0.005和FC≤0.5或FC≥2的标准筛选,共有20个差异基因涉及44条通路。Agt、cd70、bmp2、arnt2和wint5b基因出现在多条信号通路中。结论杀草强主要影响Nthy-ori-3细胞肿瘤发生相关基因,即上调cd70和wint5b基因表达及下调bmp2和arnt2基因表达,可能是其导致甲状腺肿瘤的机制之一。

染料木黄酮对体外培养乳鼠睾丸组织全基因表达谱的影响

目的利用基因芯片技术研究染料木黄酮(Genistein,Gen)对体外培养的小鼠睾丸组织全基因表达谱的影响,从基因水平分析Gen影响睾丸细胞增殖凋亡的作用机制。方法利用旋转通气法体外培养乳鼠睾丸组织,给予5μmol/L Gen干预,同时设立DMSO溶剂对照组。培养72h后提取组织总RNA,用单标Agilent小鼠全基因芯片检测两组睾丸组织基因表达,筛选差异基因,进行基因功能分类。结果与对照组比较,Gen组筛选出84个表达差异有统计学意义的基因(P<0.05),其中47个基因表达上调,37个基因表达下调。按差异基因功能富集分析(GO)分类标准进行分类,筛选出有统计学意义的GO分类14个(P<0.05),主要涉及生殖发育、细胞增殖、细胞周期等功能。结论通过全基因芯片检测发现,Gen主要影响睾丸组织生殖发育、细胞增殖和细胞周期等功能相关基因表达,从而影响精子发生和睾丸细胞的增殖和凋亡,影响睾丸的功能。

全基因组表达谱芯片在筛选慢性牙周炎相关基因中的作用

背景:全基因组表达谱芯片是一种用于基因表达研究的技术手段,具有高度敏感性以及特异性,它可以在全基因组范围内检测与慢性牙周炎相关的差异基因,从而高效快速地发现与慢性牙周炎密切相关的因子。目的:应用全基因组表达谱芯片筛选慢性牙周炎相关基因。方法:选取15例正畸拔牙患者正常牙周膜组织作为对照组,21例慢性牙周炎患者牙周组织。比对4例慢性牙周炎组织和4例正常组织的全基因组表达谱芯片,筛选出上调基因及下调基因。通过Real-Time PCR(7例正常及13例患者)和Western Blot(4例正常及4例患者)对2组牙周膜组织中差异基因PI3K-Akt信号通路的表达进行验证。实验方案由海南医学院第一附属医院伦理委员会批准(批准号:HNM20180034)并获得所有患者的知情同意。结果与结论:①全基因组表达谱芯片结果分析发现慢性牙周炎样本中均存在显著差异表达的上调基因1565个,下调基因1849个;②富集分析发现其中在慢性牙周炎中PI3K-Akt信号通路表达有显著差异(P<0.001);③Real-Time PCR及Western Blot检测发现PI3K及Akt的mRNA和蛋白在慢性牙周炎中较对照组表达高(P<0.05);④结果说明,全基因组表达谱芯片在筛选慢性牙周炎相关基因的改变时具有快速且高敏感度等特点。PI3K-Akt信号通路在慢性牙周炎表达出现明显差异,为慢性牙周炎的治疗提供实验依据。

大鼠良性前列腺增生完全去神经支配后基因表达谱动态变化研究

目的:探索大鼠BPH组织完全去神经支配后进行性萎缩过程中全基因表达谱动态变化情况。方法:29周龄雄性自发性高血压大鼠(SHR,已自发形成BPH)12只,9只手术切断前列腺全部支配神经。分别于手术当天取对照组(C)3只、术后3 d(D3)、7 d(D7)、11 d(D11)SHR各3只,取前列腺腹侧叶进行组织病理学检查和RNA提取,所有RNA样本进行全基因表达谱芯片检测、实时荧光PCR验证和生物信息学分析。结果:完全去神经支配后大鼠BPH组织进行性萎缩。各样本全基因组表达谱芯片检测均成功完成,随机选择的6个差异表达基因的实时荧光PCR结果证实芯片检测可靠。分层聚类分析显示:D3/C表达上调基因108个,下调基因175个;D7/C上调基因462个,下调基因189个;D11/C上调基因548个,下调基因256个。GO功能富集分析显示各比较组差异表达的基因涉及数百上千数量不等的分子功能、生物学进程和细胞组分。Pathway通路富集分析显示各比较组差异表达的基因涉及数百条信号通路,其中多条信号通路在各比较组均能富集到且排名靠前,其涉及的基因大部分都表达上调,且大多数与补体系统激活相关。结论:完全去神经支配后大鼠BPH组织进行性萎缩过程伴随着大量基因的异常表达,这些基因涉及众多的分子功能、生物学进程、细胞组分和信号通路,补体系统的异常激活可能在该进行性萎缩过程中有重要作用。

哮喘患儿外周血单个核细胞全基因组表达谱的差异研究

目的:筛选哮喘患儿与对照组儿童外周血的基因表达谱差异,寻找与哮喘防治相关的靶基因。方法:从5名哮喘患儿和5名对照组儿童外周血单个核细胞中提取总RNA,利用全基因组表达谱芯片进行检测,选取经非配对t检验计算所得P≤0.05、同时基因表达变化≥2倍的差异表达基因,以荧光定量PCR(qRT-PCR)验证芯片结果。通过生物信息学软件对初步筛选的差异基因进行层次聚类分析和Gene Ontology(GO)功能分类分析。结果:从45 033条表达基因谱中筛选出哮喘患儿与对照组儿童差异表达2倍以上且P≤0.05的已命名基因758个(含上调基因345个,下调基因413个),其GO生物学过程功能分类主要涉及免疫反应、对外部刺激的反应、信号转导及分子功能的负性调节、细胞死亡、凋亡及其调节等。其中有29个基因与哮喘、气道炎症或气道重构有关,且变化趋势与文献报道一致(含上调基因14个,下调基因15个),并可被层次聚类分析划分为9类。qRT-PCR验证结果与芯片结果一致。结论:用全基因组表达谱芯片可以筛选出哮喘患儿与对照组儿童外周血单个核细胞中的差异表达基因,进一步的数据挖掘很可能寻找到与哮喘防治相关的靶基因或靶通路。

宫颈癌及癌前病变的全基因组表达谱分析及下调表达候选基因鉴定

目的探讨维吾尔族妇女宫颈癌组织特异的下调表达基因谱,建立基于下调表达基因的宫颈癌早期诊断方法。方法收集维吾尔族妇女宫颈病变新鲜组织标本72例,其中宫颈鳞癌(cervical squamous cell carcino-ma,CSCC)25例,宫颈内上皮瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)22例,正常宫颈组织(normal cervix,NC)25例。选择20例组织标本(CSCC 7例,CINⅢ6例,NC 7例),提取组织RNA,通过人类全基因组表达谱芯片及生物信息分析,筛选宫颈癌及癌前病变(CIN)特异性下调表达候选基因。通过对CSCC与正常对照(NC)组的基因差异表达谱进行比较分析,选取10种差异表达倍数较高的候选基因,利用72例宫颈病变组织RNA,对10种下调表达候选基因的表达水平进行半定量RT-PCR鉴定,确定宫颈癌及癌前病变与该基因表达水平变化的关系。结果以2倍及以上表达差异为量化标准,有下调表达候选基因112种。72例宫颈病变组织RNA的半定量RT-PCR筛查分析,发现在CSCC与正常对照组之间,FOSB、DNASE1L3、SCARA5、EGR1、ABI3BP、FOS、KLF4、RHOB、IER2和ID4等10种下调表达基因的差异均有统计学意义(P<0.05)。DNASE1L3、EGR1、FOS、KLF4和IER2等5种基因的表达水平差异在CIN与正常对照组之间有统计学意义(P<0.05),但是除了FOS基因外,其余4种基因表达在CSCC与CIN组之间无差异(P>0.05)。结论维吾尔族妇女宫颈癌发病进程可能与一系列基因的下调表达密切相关,而DNASE1L3、EGR1、FOS、KLF4和IER2等5种基因的表达水平变化可能成为宫颈癌早期预警指标。

口腔黏膜白斑基因表达谱中重要致病差异表达基因的筛选及分析

目的:筛选口腔黏膜白斑中重要致病差异表达基因,并对其进行相关生物信息学分析。方法:提取白斑黏膜组织的总RNA,合成单标Cy3荧光标记的cRNA,然后与含有41000个基因/ESTs序列的Agilent全基因表达谱芯片杂交,以Ratio≥2和Ratio≤0.5为阈值来筛选差异表达基因;对差异表达基因行GO(Gene Ontology)功能分类和pathway通路分析;用RT-PCR对部分差异表达基因进行验证。结果:在41000个基因/ESTs序列中,共筛选到892条差异表达基因,其中上调基因623条,下调基因269条。GO分析发现这些差异表达基因主要涉及代谢、细胞结构等12类功能基因;pathway通路分析共得到7条有显著性改变的通路,在667条已知差异表达基因中,有9条基因在以上7条通路上发生富集。对上调基因Cyp2b13和下调基因Tyms行RT-PCR验证结果与芯片结果相符。结论:口腔黏膜白斑的发生主要由Cyp2b13、Tyms、Casp3、Cc15、CXCL12、Cc124、Dhfr、Apoe、Alb基因的异常表达导致Caspase-3激活通路、趋化因子受体粘附活性通路、E2F转录因子对DNA复制调节通路、G1/S期过渡相关调控通路、脂蛋白代谢通路、花生四烯酸代谢通路、细胞色素P450代谢通路的改变,最终导致白斑的发生,因此通过对以上9条基因的靶向调控进而变所涉及的7条通路将成为预防口腔白斑的关键。

金黄地鼠颊癌差异表达基因谱的构建及相关生物信息学分析

目的:构建二甲基苯并蒽(9,10-Dimethylen-1,2Benzanthracene,DMBA)诱导金黄地鼠颊囊黏膜癌变过程中基因差异表达谱,用相关生物信息学分析方法筛选在癌变过程中起重要作用的基因和信号通路。方法:用DMBA诱导建立金黄地鼠颊鳞癌模型,以Ratio≥2和Ratio≤0.5为阈值,用Agilent全基因表达谱芯片检测金黄地鼠颊囊黏膜癌变的差异表达基因,并对这些差异基因进行(Gene ontology,GO)功能分类和Pathway通路分析。结果:金黄地鼠正常颊黏膜和癌变组织之间共有1 943条差异表达基因,其中上调基因787条,下调基因1 156条;GO分析差异表达基因涉及结构分子相关基因群、转录调控相关基因群和代谢相关基因群等10类;Pathway分析在颊黏膜癌变中共有27条通路发生显著性异常改变,有136条差异基因在以上27条异常通路上发生富集,其中Ppp3r2、Actn1、Src等13条基因均分别富集在3条以上异常改变的通路上。结论:金黄地鼠颊癌的发生共有1 943条基因发生差异表达和27条通路发生异常改变,其中Ppp3r2、Actn1、Src等13条基因是导致细胞通路改变而最终发生癌变的重要致病基因,针对以上基因和通路的深入研究,将有助于揭示口腔黏膜癌变的分子机制,并为基因治疗提供新的靶点。

汉族和高加索人糖尿病肾病肾小球全基因组表达数据分析

目的:观察中国汉族和高加索糖尿病肾病(DN)患者肾小球内差异表达基因和发生调节的分子信号通路的异同。方法:分别选取中国汉族DN患者29例和正常对照5例,高加索DN患者21例及正常对照35例,微分离肾小球进行全基因组数据表达检测,分析不同人种DN患者与正常对照相比出现差异表达的基因;分析两个人种DN患者肾小球内与估算的肾小球滤过率(eGFR)变化相关的表达基因;比较差异表达基因与eGFR变化相关基因在两个人群中的异同。结果:(1)中国汉族DN患者肾小球中有565个基因存在差异表达,高加索DN患者肾小球中有775个基因存在差异表达;(2)比较分析提示,有200个基因在两个人种均存在差异表达。分子通路分析提示,共有13条信号通路在两个人种中均发生调节,其中大部分为免疫炎症反应相关性通路;(3)中国汉族人群中有225个基因与eGFR明显相关;而在高加索人群中有293个基因与eGFR明显相关。比较分析提示,共有CRISPLD2、SPON1、LUM等55个基因在两个人种中均与eGFR水平明显相关。结论:通过比较分析中国汉族人群和高加索人群DN患者肾小球全基因组表达谱的异同发现,免疫炎症通路在不同人种DN的发生发展中均发挥重要作用。同时,我们还证实了55个与DN患者肾功能改变明显相关的基因,可作为判断DN患者疾病进展分子标志物的候选基因进行研究验证。

口腔鳞状细胞癌及癌旁正常组织基因表达谱芯片检测

背景:近年在整体水平上以高通量分子扫描手段为基础的基因组学、蛋白质组学以及计算机辅助设计等技术的整合及相互关联的"技术链"的应用已在乳腺癌、肺癌、胃癌、结肠癌、卵巢癌、黑色素瘤等的研究中取得了丰硕的成果,但关于口腔鳞状细胞癌的研究较少。目的:实验通过基因表达谱芯片检测口腔鳞状细胞癌组织与癌旁正常组织的基因表达谱。方法:收集广东省口腔医院2013年手术切除的口腔鳞癌及癌旁正常组织各2例,采用Roche Nimble Gen全基因组表达谱芯片进行口腔鳞癌及癌旁正常组织的基因表达谱检测。结果与结论:按差异基因筛选标准,从32 448条检测基因中筛选出口腔鳞癌肿瘤组织的差异基因共有7 872条,占筛选基因总数的24%;其中上调表达的基因有3 800条,下调表达的有4 072条。结果证实,通过基因表达谱芯片检测并根据表达差异1倍以上的筛选标准得到了7 872个表达差异的基因。由此可见肿瘤的发生发展不是单个或几个基因的作用结果,以往实验往往针对某个或某几个基因的研究有很大的局限性。同时也说明了肿瘤的产生是多基因成网络相互调节作用的结果,而且这个网络的作用关系是非常复杂的。

利用肾小球全基因组表达数据筛选治疗糖尿病肾病的药物

目的:利用2型糖尿病肾病(T2DN)患者微分离的肾小球全基因组表达数据,借助关联性图谱(CMAP)数据库和生物信息学方法,探寻具有T2DN治疗作用的潜在药物。方法:选取中国汉族T2DN患者23例和正常对照6例,微分离肾小球,利用Affymetrix U133 Plus 2.0全基因组表达谱芯片检测获得基因表达数据,获得T2DN患者不同分期之间的差异表达基因后,进一步通过2种不同的生物信息学方法寻找T2DN的潜在治疗药物,并阐明其可能的分子作用机制。结果:利用T2DN晚期和早期相比的差异表达基因和CMAP数据库,筛选出小白菊内酯(parthenolide)、荜茇酰胺(piperlongumine)、15-脱氧前列腺素J2(15d-PGJ2)和LY-294002(PI3K抑制剂)等候选药物。上述药物能够逆转T2DN患者在疾病进展过程中肾小球基因表达的变化,提示这些药物可能具有治疗T2DN的潜能。既往研究证实这些药物对T2DN有一定的治疗作用,验证了该药物筛选方法的可靠性。结论:利用T2DN患者肾小球全基因组表达谱和CMAP数据库能够快速筛选出具有T2DN治疗潜能的药物,候选药物可进行下一步的动物实验和临床试验以证实其治疗的安全性和有效性,应用前景广阔。

用全基因芯片技术对金黄地鼠口腔颊黏膜癌前病变相关基因的筛选和分析

目的:利用全基因芯片技术筛选口腔颊黏膜癌前病变发生发展的相关致病基因。方法:用9、10-二甲基;1,2-苯并蒽(Dimethyl benzanthracene,DMBA)诱导建立金黄地鼠颊鳞癌模型,分别提取正常颊黏膜和癌前病变组织的总RNA并合成用Cy3荧光标记的cRNA,分别与含有41000个基因/ESTs序列的Agilent大鼠全基因芯片杂交,以Log2Ratio≥2.5和Log2Ratio≤-2.5为阈值来确定差异表达基因,然后用Gene Ontology对差异表达基因行功能分类分析,最后用RT-PCR对部分差异表达基因进行验证。结果:金黄地鼠颊黏膜自正常黏膜到癌前病变发展过程中,共得到1331条差异表达基因,其中上调基因747条,下调基因584条。Gene Ontology分析发现这些差异基因主要涉及到大分子代谢、信号传导等8大功能分类。对上调基因Atp6v0d2和下调基因Sfrp2行RT-PCR验证结果与芯片结果相符。结论:口腔颊黏膜癌前病变的发生涉及众多基因表达的改变,通过对这些基因的进一步研究,将对探索口腔黏膜癌前病变的发病机制、有效的干预防止癌前病变的发生或逆转癌前病变具有重要意义。

肾精亏虚证老年性痴呆差异基因表达分析

目的：基于人类全基因表达谱芯片高通量测序技术,分析肾精亏虚证老年性痴呆发病机制与差异基因表达的相关性。方法：在辽宁中医药大学附属医院和上海中医药大学附属龙华医院门诊选择60岁以上16例肾精亏虚证AD患者,对照组为同龄健康状态老年人12例,男女各半。清晨取静脉血5 m L,加入百泰克生产血液总RNA快速提取试剂盒,-70℃保存。统一干冰冷冻寄送北京博奥生物有限公司,利用Affymetrix公司的Human Gene Expression Array基因表达谱芯片,分析两组基因差异表达。结果：肾精亏虚证AD患者特异性表达的探针有308个,对应247个基因（FC≥1.5,q-value≤5%）,其中上调基因228个,下调基因19个。实时定量PCR验证了其中差异最大的9个基因的表达。结论：肾精亏虚证AD的发病机制之一与人类基因表达谱中9个差异表达基因调控有关。

参芪复方对糖尿病大血管病变KK-A^y小鼠主动脉基因表达影响的拆方研究

目的:本研究旨在通过全基因组表达谱芯片研究参芪复方及其拆方组分中药对糖尿病大血管病变KKA^y小鼠主动脉的作用,以分析参芪复方配伍的合理性和科学性。方法:8周龄SPF级雄性自发性2型糖尿病KKA^y小鼠60只,随机分为模型组、参芪复方组、益气养阴组、活血组。予高脂饲料及添加L-NAME的纯净水连续饲养8周,建立糖尿病大血管病变模型。造模后分别予生理盐水、参芪复方全方、益气养阴组分和活血组分中药对各组进行灌胃干预,疗程8周。干预后第8周末处死全部动物,取腹主动脉做HE染色及全表达谱芯片。结果:第8周末,参芪复方组动物主动脉病理损伤较模型组明显减轻,益气养阴组和活血组动物组织病变程度较模型组轻,但较参芪复方组为重。差异基因分析显示,参芪复方可能通过调节膜偶联蛋白在膜泡运输中的相互作用、不饱和脂肪酸的合成、MAPK信号通路和花生四烯酸的代谢等信号通路,调节了糖脂代谢、细胞凋亡、分化、增殖及炎症反应,从而改善糖尿病大血管病变,对整体的调节作用优于益气养阴组及活血组作用之和。结论:参芪复方对糖尿病大血管病变KKA^y小鼠主动脉的基因表达有着广泛的正面调节作用,其疗效依靠药物之间的合理配伍、协同增效,共同达到改善糖尿病大血管病变的作用。