基于全外显子组测序的胸腺癌基因组分析和生物标志物探索的回顾性队列研究

目的检测胸腺癌(thymic carcinoma,TC)患者基因突变情况,以探索预后相关因素和治疗的潜在靶点。方法回顾性纳入四川省肿瘤医院2015年1月—2021年2月收治的TC患者。对TC患者肿瘤组织及其对照外周血样本进行全外显子组测序,并对原始数据进行生物信息学分析和统计学分析。结果最终纳入24例TC患者,其中男16例、女8例,中位年龄55(42~74)岁。TC患者单核苷酸突变频率最高的为TTN基因(42%)、HSPG2(29%)和OBSCN(29%)。发生染色体拷贝数变异频率较高的是ZNF276基因(54%,loss),BEND3(50%,loss),DHODH(50%,loss)和VAC14(50%,loss)。其中25%TC患者为微卫星不稳定(microsatellite instability,MSI)型,平均肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)为9.86。结论此研究是迄今为止第一个关于中国TC患者基因突变情况的全面分析。TTN、OBSCN和ZNF276基因的突变频率较高,通过MSI、TMB等生物标志物分析,表明TC患者有从免疫治疗中获益的潜能。