食源性致病菌全基因组测序及全球数据共享平台发展趋势

随着用于监测食源性致病菌和暴发调查的分子分型技术迅猛发展,全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)正逐渐显露出其重要性。在食品贸易全球化背景下,急需建立食源性致病菌与人类感染间联系的详尽认识,从而精确监测并减少其发生。在该方面,WGS的精确性明显优于之前的分析工具。本文主要以单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)为例,阐述食源性致病菌监测情况和感染暴发调查现状,强调WGS在食源性疾病溯源方面的价值,概述用于数据生成和分析的技术,着重介绍WGS在全球食源性致病菌分型领域的实际应用进展,并对其未来所面临的挑战进行展望。

KML在OneGeology和Google Earth之间的桥接作用浅析

为了促进全球范围内的地质图数据网络共享,国际地球科学联合会发起了OneGeology项目。目前该项目已经得到超过100个国家和地区和大量国际组织的参与,且已有40多个国家和地区在OneGeology项目的网站上登记了共享的地质图数据。由于这些数据源的服务器由各参与国的地质调查机构自己负责,OneGeology网站本身只通过一个数据接口OneGeology Portal提供对这些分布式数据源的浏览窗口。同时,另外一个重要的功能就是通过OneGeology Portal把选择的数据导出为KML文件,通过在Google Earth中打开该KML文件,可以把对应的数字地质图和和其他数据叠加浏览和分析,这也扩大了地质图数据的使用方式和服务目的。本文对KML文件在OneGeology和Google Earth之间的这种桥接作用做了分析并介绍了具体的操作过程。