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基于TCGA数据库分析富含丝氨酸/精氨酸剪接因子家族在不同癌症中的表达及其预后意义
被引量:
1
1
作者
刘经纬
李浩
+1 位作者
任玲
邢承忠
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期402-407,共6页
目的揭示不同类型癌症中富含丝氨酸/精氨酸剪接因子(SRSF)的整体表达及其对预后的作用。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载患者SRSF表达和临床信息,分析33种癌症类型中SRSF基因家族的表达差异及预后价值。利用R语言分析SRSF基因...
目的揭示不同类型癌症中富含丝氨酸/精氨酸剪接因子(SRSF)的整体表达及其对预后的作用。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载患者SRSF表达和临床信息,分析33种癌症类型中SRSF基因家族的表达差异及预后价值。利用R语言分析SRSF基因表达、突变及其相关细胞信号通路。结果SRSF在多种癌症中异常表达,并与G2/M检查点、DNA修复、IL-2/STAT5信号转导、缺氧和KRAS多种信号转导通路以及免疫细胞浸润密切相关。SRSF的异常表达与癌症患者的预后显著相关。结论SRSF基因异常表达可以预测癌症的预后,其可能作为癌症潜在标志物。
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关键词
富含丝氨酸/精氨酸剪接因子
选择性剪接
全肿瘤分析
预后
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职称材料
题名
基于TCGA数据库分析富含丝氨酸/精氨酸剪接因子家族在不同癌症中的表达及其预后意义
被引量:
1
1
作者
刘经纬
李浩
任玲
邢承忠
机构
中国医科大学附属第一医院肛肠外科
出处
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期402-407,共6页
基金
辽宁省自然科学基金(2019-ZD-0748)。
文摘
目的揭示不同类型癌症中富含丝氨酸/精氨酸剪接因子(SRSF)的整体表达及其对预后的作用。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载患者SRSF表达和临床信息,分析33种癌症类型中SRSF基因家族的表达差异及预后价值。利用R语言分析SRSF基因表达、突变及其相关细胞信号通路。结果SRSF在多种癌症中异常表达,并与G2/M检查点、DNA修复、IL-2/STAT5信号转导、缺氧和KRAS多种信号转导通路以及免疫细胞浸润密切相关。SRSF的异常表达与癌症患者的预后显著相关。结论SRSF基因异常表达可以预测癌症的预后,其可能作为癌症潜在标志物。
关键词
富含丝氨酸/精氨酸剪接因子
选择性剪接
全肿瘤分析
预后
Keywords
serine/arginine-rich splicing factor
alternative splicing
pan-cancer analysis
prognosis
分类号
R730.2 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
基于TCGA数据库分析富含丝氨酸/精氨酸剪接因子家族在不同癌症中的表达及其预后意义
刘经纬
李浩
任玲
邢承忠
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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