基于全连接自动编码器的疾病相关microRNA预测

MicroRNA (miRNA)是一类长度约为22~24个核苷酸的非编码RNA,在细胞的生长和发育过程中发挥着重要的调节作用。识别与疾病相关的miRNA候选,有助于探索疾病的发生机理,先前的多数预测方法主要聚焦在整合miRNA和疾病相关的多源数据,忽略了miRNA家族和聚簇信息,但是相似的疾病通常更可能与具有相似功能和属于相同家族或聚簇的miRNA相关。本文根据miRNA和疾病节点形成的拓扑结构,结合miRNA的家族和聚簇属性,建立了基于全连接自动编码器的miRNA-疾病关联预测模型。采用了五倍交叉验证进行了实验评估,实验结果表明新的预测模型取得了比其它几个模型更优的性能。