一种最长扩展公共子序列新算法

在最长填充公共子序列问题中提出一种新问题:假设有一个完整序列C和一个不完整序列Q,长度分别为m和n,Q中丢失的元素为相邻的相同元素,要求寻找一个丢失前的序列Q,使得C和Q具有最长的公共子序列。针对此问题,首先将Q中每个元素复制m-1个并插入Q中原来的位置,生成长度为mn的扩展序列Q^(*),然后证明了C和Q的最长扩展公共子序列是两序列C和Q^(*)的最长公共子序列,最后提出一种时空复杂度为O(mn)的最长扩展公共子序列求解新算法,并用轨迹实验证明了该算法对强噪声干扰和轨迹点丢失的同时有效性。

一种带匹配路径约束的最长公共子序列长度算法

在带约束的最长公共子序列问题中提出一种特殊的新问题:假设有两序列Q和C,Q中指定的匹配位置序列I,计算两序列Q和C的最长公共子序列,且这个最长公共子序列的匹配路径必须经过位置序列I。针对此问题,该文提出一种带匹配路径约束的最长公共子序列算法。首先定义带匹配路径约束的最长公共子序列模型,其次推出该序列的性质,最后求出带匹配路径约束的最长公共子序列长度的基础算法和快速算法。基础算法和快速算法时间复杂度分别为O(mnt)和O(mn),m,n,t分别为序列Q,C,I的长度。

结合Hausdorff距离和最长公共子序列的轨迹分类

为了提高运动目标轨迹分类的准确性,该文综合考虑了轨迹的位置信息和方向信息,提出了一种结合Hausdorff距离和最长公共子序列(Longest Common SubSequence,LCSS)的轨迹分类算法。该算法首先采用改进的Hausdorff距离对轨迹的位置信息进行相似性测量,然后采用改进的LCSS算法对轨迹的方向信息进行相似性测量。与其他轨迹聚类算法不同,该算法融合了Hausdorff距离和LCSS两种算法的优点,提高了轨迹分类的准确性。此外,为了进一步降低计算复杂度,该文还实现了一种基于插值的保距变换算法和一种LCSS快速算法。实验结果表明,该轨迹分类算法可以明显提高轨迹的聚类准确率,聚类准确率可达到96%;基于插值的保距变换算法和LCSS快速算法可以很大程度上降低算法的计算复杂度,下降幅度最大可达到80%。该方法可以同时满足轨迹分类对精确度、实时性和鲁棒性的要求。

带约束最长公共子序列快速算法

带约束最长公共子序列(CLCS)问题有很深的生物学应用背景,常被用来表示同源基因序列相似性的度量,但计算CLCS时间代价很高,最早的CLCS算法的时间复杂度为O(rn4),目前,最快的CLCS算法的时间复杂性为O(rn2).运用对偶原理将带约束最长公共子序列问题转换为带约束最小覆盖集问题,并建立带权的ref树结构,构造包含约束序列的约束覆盖子集,约简带约束覆盖子集并从中搜索关键路径,再通过关键路径构造CLCS,该算法将算法时间复杂度提升到O(nlogn+(q+r)L),r是约束序列的长度,q是两序列序偶的个数,L是两序列的最长公共子序列(LCS)长度.

基于滑动窗口最长公共子序列Wi-Fi指纹定位算法

针对基于Wi-Fi瞬时指纹定位算法中由于RSS信号的时变特性引起的Wi-Fi定位精度差问题,提出了一种基于滑动窗口最长公共子序列指纹定位算法.该算法将时间序列的RSS信号指纹转化为基于滑动窗口的数据模型,增加了指纹特征信息,提高比对准确性.通过计算请求定位数据与样本的最长公共子序列来获得样本点的相似性,解决由于窗口伸缩或滑动窗口中个别采样点无信号引起的比对不准确问题,从而提高了定位的精确性和鲁棒性.实验结果表明,所提定位算法的结果明显优于瞬时指纹定位算法.

最长公共子序列算法在程序代码相似度度量中的应用

阐述了最长公共子序列算法在程序代码结构相似度度量中的应用,列举了两种计算最优值和一种获取最长公共标识符子序列的算法.根据最优值得到结构相似度值,进而可以查找出结构相似程序对.最后探讨了程序代码相似度的实际应用.

基于公共子序列的OPSM双聚类算法

OPSM作为一种基于模式的双聚类方法,被广泛应用于基因数据矩阵的分析上.在一个OPSM聚类中,形成聚类的若干基因在特定的条件子集下具有一致的表达模式,其中隐含着基因的关联调控信息,对基因数据矩阵进行双聚类分析具有生物学意义.其中,Deep OPSM是OPSM聚类中行数少列数多的特殊聚类.根据OPSM模型,该文提出了一种快速有效的精确性算法,用于挖掘分散在基因数据矩阵中的OPSM聚类.首先寻找基因数据矩阵中任意两行的公共子序列,然后利用STL map对找到的公共子序列进行支持度统计,并将符合支持度阈值的OPSM聚类输出,且通过阈值的设置即可输出Deep OPSMs.结果证明该算法能够快速地找到符合条件的Deep OPSMs.通过P-value值分析,验证了找到的Deep OPSM具有明显的生物学意义.

基于最长公共子序列的非同步相似轨迹判断

针对非同步相似轨迹判断问题,提出了一种基于最长公共子序列理论的相似轨迹判断新算法。首先,求出查询轨迹线段与候选轨迹线段之间的距离;其次,利用最长公共子序列算法,计算两轨迹的最长公共子轨迹长度;最后,根据相似度门限,判断轨迹是否相似。数值实例验证了所提算法能够提高非同步轨迹的相似度。

基于格代数的最长公共子序列近似求解

多条序列的最长公共子序列可以代表多条序列的公共信息,其在诸多领域里有着重要的应用,如信息检索、基因序列匹配等。求解多条序列的最长公共子序列是著名的NP难问题,本质为多解问题。一些近似算法虽然时间复杂度较低,但只能求出单解,对于有多解的序列集合,求得的结果信息量损失较大。因此提出一个新的近似算法来解决最长公共子序列问题。算法引入了代数结构"格",通过动态规划求解出两条序列的公共格,并递归求解当前格与当前序列的公共格。公共格中的路径保存了多条公共子序列使得最终求解出的最长公共子序列为多个。对算法的相关定理给出了理论证明,并通过实验验证了算法的正确性。

基于最长公共子序列的随机路径选择算法设计

针对传统算法只能求出一个最长公共子序列而无法求出多个最长公共子序列,设计了一种可求多个最长公共子序列的算法。简述了最长公共子序列的算法原理,描述了求最长公共子序列长度的动态规划算法,在此基础上求出一个最长公共子序列,通过对算法改进得到可求多个最长公共子序列的随机路径选择算法。该算法具有计算速度快、占用内存小、计算机易于实现等优点。其核心是寻优路径的选择,提出了寻找最优解的路径选择问题,讨论并给出了搜索多个可行解的快速算法,该算法充分利用了动态规划算法计算过程中提供的寻优方向信息得到最优路径的随机选择算法,与传统算法相比可求多个最长公共子序列。

最长公共子序列算法的分析与实现

本文首先分析最长公共子序列的特点,利用动态规划法求出最长公共子序列的长度数组和状态数组并通过矩阵搜索求出所有有效的跳跃点,构造了求解所有最长公共子序列的算法并通过程序给予实现。算法能有效避免重复搜索,时间效率大大提高,特别适用于基因工程中的基因片段分析。

基于高效精确的最大公共子序列的视频片段匹配

为视频序列匹配提出一个高效精确的最大公共子序列(Efficient and Effective Longest Common Subsequence,EELCS)算法。首先,利用矢量量化(Vector Quantization,VQ)将多维最大公共子序列算法(Multi-dimensionalLCS,MLCS)中元素对匹配过程中的实际距离的计算简化成比较操作,较原始的最大公共子序列匹配算法(Original LCS,OLCS),该处理不仅可以继承MLCS的可应用到实际多维时序匹配问题中的优点,同时大大降低了匹配的复杂度;然后进一步区分待匹配序列中由于匹配子序列和未匹配子序列在时间轴上连续性而产生的差异;最后将该算法应用到视频片段的匹配中。实验结果表明,与具有代表性的基于时间规扭曲的最大公共子序列(Time-Warped LCS,T-WLCS)和连续最大公共子序列(Continuous LCS,CLCS)相比,该算法能较好地应用于视频序列的匹配。

最长公共子序列算法在文字录入测试中的应用

测试Word中的文字录入内容,是开发Office等考试软件过程中的一个关键技术问题。常用的处理方法是关键字检测法。通过检测Word文件中的关键字,可以测试出考生操作的大概结果,但是很不准确。利用最长公共子序列算法进行文字录入测试,可以很好地解决这一问题。

基于分层匹配和最长公共子序列的SCD文件比较算法

IEC61850通信已经在电力系统中广泛使用,其中变电站通信系统使用SCD文件进行描述.SCD文件是XML格式的层次化结构,不适合直接用文本按行对比来分析差异.同时由于SCD文件层次结构多,使用纯结构化的比较方法,会导致比较结果冗长,执行效率低.本文基于SCD文件的特征,提出了分层匹配的半结构化半文本比较思路.先按照智能电子设备、连接接入点、逻辑设备等层次结构,提取关键属性名,进行对齐匹配.之后在逻辑设备范围内,针对逻辑节点的内容,采用最长公共子序列的匹配算法对比局部文本内容,该算法可去除仅调整顺序不影响实体内容的无效差异,比较速度快,比较结果准确直观.

算法分析与设计课程中最长公共子序列问题的教学探讨

介绍算法分析与设计课程中最长公共子序列问题的动态规划算法,利用该算法解决最长递减子序列问题和回文词的构造问题,通过这两个问题的求解,有助于学生举一反三,启发学生思维,以学致用,提高问题求解能力。

最长公共子序列问题的改进快速算法

现在几个最常用的解决最长公共子序列（ＬＣＳ）问题的算法的时间复杂度分别是O（ｐｎ），O（ｎ（ｍ－ｐ））．这里ｍ、ｎ两个待比较字符串的长度，ｐ是最长公共子串的长度．给出一种时间复杂度为Ｏ（ｐ（ｍ－ｐ））；空间复杂度为Ｏ（ｍ＋ｎ）的算法．与以前的算法相比；不管在ｐ＜＜ｍ的情况下，还是在ｐ接近ｍ时，这种算法都有更快的速度．

采用改进最长公共子序列的人名消歧

将名词、形容词、动名词和命名实体作为文本特征,考虑词序与词频,结合特征项的语义,提出一种基于改进最长公共子序列的文本聚类(LCSC)方法.实验结果表明:相对于传统的余弦值聚类方法,LCSC方法在人名消歧的P-IP指标上,F平均值由74.2%提高到了84.9%;相对于最长公共子序列方法,总体性能也提高了3.7%.

最长公共子序列的量子算法

本文给出了求给定两个序列最长公共子序列（Longest Common Subsequence，LCS）问题的量子算法，能在O（n）时间内求解两个长为n字符序列的最长公共子序列．算法在分析传统动态规划填表过程潜在并行性的基础上，对填表过程进行量子化，并通过带有量子存储器的量子Oracle，完成量子并行填表的计算．算法最后对前面计算获得的所有局部LCS的均匀叠加态应用Grover搜索，找出最终解，相对于经典动态规划实现了二次加速．

基于多重序列所有公共子序列的启发式算法度量多图的相似度

提出了启发式A*算法度量任意多个图的相似度方法,该算法将多图表示多重序列,在多重序列的匹配点上计算多重序列的所有公共子序列数,得到的所有公共子序列数用来度量多图的相似度。该算法避免了在非匹配点上的冗余计算,最大化后缀序列的所有公共子序列数的启发函数值,将访问的节点限制在两个序列匹配的子集,减少了计算节点的个数。与现有度量图的相似度方法相比,该算法不仅可以度量任意多个图的相似度,而且计算过程简单,通过启发信息的引导能够快速地度量多图的相似度。

求解最长循环公共子序列问题的两个算法

最长循环公共子序列(LCCS)是两个字符串在所有可能的循环移位操作下能得到的最长公共子序列(LCS)。针对穷举移位量求解LCCS效率过低的问题,设法对候选移位量进行筛选。通过证明循环移位操作对两字符串间LCS长度增量影响的上下限,得到最优移位量的必要条件,从而减小了求解LCCS的枚举量;在此基础上,建立了求解LCCS的迭代方法,只经过少数几次迭代便可消除绝大部分无效候选移位量;此外,还提出一个可在O(mn)时间复杂度下快速估算LCCS长度的近似算法。大量随机模拟表明,当两字符串间的相似度明显高于随机字符串的相似度时,提出的两种算法表现良好。