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题名犬细小病毒兰州分离株VP2基因的克隆及进化树分析
被引量:4
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作者
王俊
舒龙
郭慧琛
曹随忠
彭广能
孙世琪
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机构
甘肃农业职业技术学院
中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室国家口蹄疫参考实验室
四川农业大学动物医学院
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出处
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第8期814-818,共5页
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基金
留学回国人员科研启动基金项目
甘肃省科技重大专项(1102NKDA033
+3 种基金
1102NDKA034)
国家自然科学基金项目(31100688
31101838)
甘肃省国际科技合作计划项目(1104WCGA185)
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文摘
本研究首次对地处西北地区的兰州的犬细小病毒分离株(命名为CPV/LZ-kbz11)进行了VP2基因克隆、测序,并与参考株、我国各地区流行株以及周边国家流行株进行了进化树分析和核苷酸同源性比较。结果显示,该毒株能在犬肾细胞系(MDCK)上成功生长,但不引起细胞病变。该分离株为CPV-2b亚型毒株,与M19296(CPV-2亚型参考毒株)、EU659118(CPV-2a亚型参考毒株)、EU145954(CPV-2b亚型参考毒株)、AB054224(CPV-2c亚型参考毒株)的核苷酸序列同源性分别为99.0%、99.3%、99.2%、99.2%;与我国及周边主要流行毒株EU213079(CPV-2a,浙江)、EF666059(CPV-2a,北京)、EF599096(CPV-2a,韩国)、EF592511(CPV-2a,台湾)、EU483512(CPV-2b,浙江)、FJ222821(CPV-2c,意大利)的核苷酸同源性分别为99.6%、99.5%、99.4%、99.4%、99.4%、99.4%。对VP2基因中非同义置换的氨基酸分析结果显示,兰州分离株与对比毒株的非同义突变位点共有4处,分别在第267位、324位、426位和440位的氨基酸处。
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关键词
犬细小病毒
兰州分离株
VP2基因
CPV-2b亚型
进化树分析
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Keywords
canine parvovirus
Lanzhou isolate
VP2 gene
phylogenetic tree analysis
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分类号
S852.655
[农业科学—基础兽医学]
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