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方剂研究中数据挖掘方法的适用性探讨 被引量:25
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作者 范欣生 尚尔鑫 +6 位作者 王崇峻 孙世发 李文林 孙江文 叶亮 赵凤英 段金廒 《南京中医药大学学报》 CAS CSCD 2008年第6期379-382,共4页
探讨数据挖掘方法在方剂研究中的应用。就嵌入数据挖掘功能的关联型数据库,关联规则、对应分析、聚类分析方法应用、图形化知识挖掘以及多指标优化分析方法进行讨论。提出根据方剂复杂科学体系的特点,以及方剂效应评价多靶点的特征,需... 探讨数据挖掘方法在方剂研究中的应用。就嵌入数据挖掘功能的关联型数据库,关联规则、对应分析、聚类分析方法应用、图形化知识挖掘以及多指标优化分析方法进行讨论。提出根据方剂复杂科学体系的特点,以及方剂效应评价多靶点的特征,需要在兼顾方剂文本特性和数量化特征方面丰富技术方法,提高挖掘技术的针对性和适用性,为集成方剂文献信息、评价方剂效应以及达到中医药知识发现的目的发挥更大作用。 展开更多
关键词 数据挖掘 关联型数据 方剂 方证对应
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基于图数据库的电力设备绝缘状态文本数据存储 被引量:3
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作者 张钊棋 宋辉 +4 位作者 崔国栋 刘广辉 王建军 盛戈皞 江秀臣 《电气自动化》 2020年第5期64-66,共3页
电力设备绝缘状态文本数据包含现场局放检测的原始记录,为提高数据的利用率、挖掘对设备绝缘状态产生影响的关联信息,需要对其进行统一的处理与存储。使用了知识图谱技术对绝缘状态文本数据进行处理,并规定了绝缘状态文本记录格式,进而... 电力设备绝缘状态文本数据包含现场局放检测的原始记录,为提高数据的利用率、挖掘对设备绝缘状态产生影响的关联信息,需要对其进行统一的处理与存储。使用了知识图谱技术对绝缘状态文本数据进行处理,并规定了绝缘状态文本记录格式,进而基于图数据库完成了数据存储。通过与关系型数据库进行对比发现,图数据库有着更高效的复杂关系查询性能,更适于存储关系复杂的绝缘状态文本数据。 展开更多
关键词 绝缘状态文本 数据 知识图谱 关联型数据 高效查询
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构建“免疫相关lncRNA基因对”模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后及药物敏感性 被引量:1
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作者 李睿哲 薛军帅 +4 位作者 杨龙山 董兆如 洪建国 李涛 王东旭 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2022年第7期406-413,共8页
目的构建“免疫相关lncRNA基因对”模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后并分析不同组别肿瘤免疫微环境特征及药物敏感性。方法从XENA数据库获取肝细胞肝癌样本正常肝脏样本的RNA-seq数据,筛选出未发生远处转移的原位肝癌样本,提取免... 目的构建“免疫相关lncRNA基因对”模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后并分析不同组别肿瘤免疫微环境特征及药物敏感性。方法从XENA数据库获取肝细胞肝癌样本正常肝脏样本的RNA-seq数据,筛选出未发生远处转移的原位肝癌样本,提取免疫相关lncRNA,构建免疫相关lncRNA基因对的预测模型;随后将免疫相关lncRNA基因对预测模型与患者的预后及临床因素进行相关性分析;同时利用肿瘤免疫细胞浸润数据计算高低风险组免疫微环境特征差异,并评估肝癌相关药物在不同风险组的敏感性。结果筛选出免疫相关lncRNA基因对13个,并结合生存状况建立预测模型,低风险组患者的生存获益显著优于高风险组(P<0.001)。在肿瘤免疫微环境方面,高风险组表现出了更为突出的免疫抑制状态,药物敏感性分析表明索拉非尼、阿昔替尼在基于风险分组的患者中敏感性显著不同。结论免疫相关lncRNA的基因对模型能够较好的预测未发生远处转移的原位肝癌患者预后情况,高风险的患者中免疫抑制状态明显,而不同的风险组对肝癌特定药物治疗敏感性不同。 展开更多
关键词 肝细胞肝癌 肿瘤预后 癌症基因组图谱数据库(TCGA) 基因和基因表达量关联数据库(GTEx) 免疫微环境 长链非编码RNA
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基于转录组学膀胱癌临床预后模型的构建 被引量:1
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作者 陈遒 蔡良良 梁景岩 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期79-86,共8页
目的:筛选膀胱癌预后相关基因,建立膀胱癌预后评分模型。方法:通过UCSC Xena平台下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因型和基因表达量关联数据库(GTEx)中406例膀胱癌患者的临床信息和膀胱癌组织RNA测序数据,以及28名健康对照者正常膀... 目的:筛选膀胱癌预后相关基因,建立膀胱癌预后评分模型。方法:通过UCSC Xena平台下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因型和基因表达量关联数据库(GTEx)中406例膀胱癌患者的临床信息和膀胱癌组织RNA测序数据,以及28名健康对照者正常膀胱组织RNA测序数据。采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单因素Cox回归分析、LASSO回归分析和多因素Cox回归分析筛选膀胱癌预后相关基因并建立预后模型,结合Kaplan-Meier生存曲线、受试者操作特征曲线(ROC曲线)验证模型的准确性。结果:分析得到膀胱癌相关差异表达基因共2308个。WGCNA拟合得到6个基因模块,筛选出对膀胱癌预后有显著作用的基因829个。运用单因素Cox回归与LASSO回归分析筛选出24个与膀胱癌患者预后相关的基因,多因素Cox回归分析训练集数据得到9个作为独立预测因子的基因,分别是ADCY9、MAFG_DT、EMP1、CAST、PCOLCE2、LTBP1、CSPG4、NXPH4、SLC1A6,以此建立膀胱癌患者预后预测模型。训练集中高风险组和低风险组3年存活率分别为31.814%和59.821%,测试集中高风险组和低风险组3年存活率分别为32.745%和68.932%,模型预测训练集和测试集患者预后的ROC曲线下面积均在0.7以上。结论:本研究建立的模型对膀胱癌高风险和低风险人群的生存情况具有较好的预测能力。 展开更多
关键词 膀胱肿瘤 预后 转录组学 癌症基因组图谱数据 基因和基因表达量关联数据 加权基因共表达网络分析 回归分析
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基于改进YOLOv3的密集行人检测 被引量:20
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作者 邓杰 万旺根 《电子测量技术》 北大核心 2021年第11期90-95,共6页
行人检测是目标检测领域的一个重要分支,目前行人检测算法已经取得了较好的发展,但拥挤场景下存在着行人间的严重遮挡,这为检测任务带来了极大地挑战。为有效缓解该问题,在YOLOv3的基础上进行改进,提出单阶段密集行人检测算法:Crowd-YO... 行人检测是目标检测领域的一个重要分支,目前行人检测算法已经取得了较好的发展,但拥挤场景下存在着行人间的严重遮挡,这为检测任务带来了极大地挑战。为有效缓解该问题,在YOLOv3的基础上进行改进,提出单阶段密集行人检测算法:Crowd-YOLO,该算法将可见框标注信息加入到网络中,使网络同时预测全身框与可见框信息从而提升检测性能;提出时频域融合注意力模块(TFFAM),将频域通道注意力和空间注意力加入到网络中重新分配特征权重;采用数据关联型上采样代替传统的双线性插值,使深层特征图获取更为丰富的信息表达。使用非常具有挑战性的大型拥挤人群场景数据集CrowdHuman进行训练和测试,实验结果表明,所提方法比基础网络在AP50指标上提高了约3.7%,在召回率(Recall)指标上提高了3.4%,其中时频域融合注意力模块为网络带来了2.3%AP的性能增益。实验结果验证了所提方法在拥挤人群场景下的有效性。 展开更多
关键词 行人检测 遮挡问题 YOLO 融合注意力 数据关联上采样
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IMM/MHT FUSING FEATURE INFORMATION IN VISUAL TRACKING
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作者 Li Shuangquan Sun Shuyan Jiang Sheng Huang Zhipei Wu Jiankang 《Journal of Electronics(China)》 2009年第6期765-770,共6页
In multi-target tracking,Multiple Hypothesis Tracking (MHT) can effectively solve the data association problem. However,traditional MHT can not make full use of motion information. In this work,we combine MHT with Int... In multi-target tracking,Multiple Hypothesis Tracking (MHT) can effectively solve the data association problem. However,traditional MHT can not make full use of motion information. In this work,we combine MHT with Interactive Multiple Model (IMM) estimator and feature fusion. New algorithm greatly improves the tracking performance due to the fact that IMM estimator provides better estimation and feature information enhances the accuracy of data association. The new algorithm is tested by tracking tropical fish in fish container. Experimental result shows that this algorithm can significantly reduce tracking lost rate and restrain the noises with higher computational effectiveness when compares with traditional MHT. 展开更多
关键词 Multiple Hypothesis Tracking (MHT) Interacting Multiple Model (IMM) Feature information fusion Data association
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