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SARS-CoV-2与受体ACE2独特的相互作用与结合/解离过程
1
作者
刘深鑫
张博
+1 位作者
刘迎春
王琦
《中国科学:化学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期721-730,共10页
2019年12月由新型肺炎冠状病毒(SARS-Co V-2)感染导致的肺炎(COVID-19)疫情大规模爆发,并于2020年3月被世界卫生组织宣布为全球大流行.其显著的传染性和致死率对全人类的生命安全构成了巨大的威胁,迫切需要从分子层面上了解并掌握病毒...
2019年12月由新型肺炎冠状病毒(SARS-Co V-2)感染导致的肺炎(COVID-19)疫情大规模爆发,并于2020年3月被世界卫生组织宣布为全球大流行.其显著的传染性和致死率对全人类的生命安全构成了巨大的威胁,迫切需要从分子层面上了解并掌握病毒的感染/传播行为.新冠病毒和2003年爆发的严重急性呼吸系统综合征冠状病毒(SARS-Co V)同属于蝙蝠SARS样冠状病毒(SARSr-Co V)物种,其表面刺突糖蛋白具有高度的同源性,它们侵入人体细胞的关键步骤同为表面刺突蛋白的受体结合域(RBD)部分和人血管紧张素转化酶2(ACE2)的结合,许多实验工作报道了SARS-Co V-2拥有比SARS-Co V更强的结合能力.为了进一步诠释实验结果,本工作对这两种病毒的野生型RBD(RBDWT)和ACE2的结合进行了分子动力学模拟、拉伸分子动力学模拟和伞状取样,结果表明,β-loop区的不同行为导致关键结合残基和相互作用的不同,并进一步导致结合/解离机制的不同,SARS-Co V-2-RBD和ACE2的结合亲和力是SARS-Co V-RBD的约30倍.
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关键词
SARS-CoV-2
SARS-COV
拉伸分子动力学
伞状取样
关键结合残基
结合
自由能
原文传递
题名
SARS-CoV-2与受体ACE2独特的相互作用与结合/解离过程
1
作者
刘深鑫
张博
刘迎春
王琦
机构
浙江大学化学系
出处
《中国科学:化学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期721-730,共10页
基金
国家自然科学基金(编号:21673206)资助项目。
文摘
2019年12月由新型肺炎冠状病毒(SARS-Co V-2)感染导致的肺炎(COVID-19)疫情大规模爆发,并于2020年3月被世界卫生组织宣布为全球大流行.其显著的传染性和致死率对全人类的生命安全构成了巨大的威胁,迫切需要从分子层面上了解并掌握病毒的感染/传播行为.新冠病毒和2003年爆发的严重急性呼吸系统综合征冠状病毒(SARS-Co V)同属于蝙蝠SARS样冠状病毒(SARSr-Co V)物种,其表面刺突糖蛋白具有高度的同源性,它们侵入人体细胞的关键步骤同为表面刺突蛋白的受体结合域(RBD)部分和人血管紧张素转化酶2(ACE2)的结合,许多实验工作报道了SARS-Co V-2拥有比SARS-Co V更强的结合能力.为了进一步诠释实验结果,本工作对这两种病毒的野生型RBD(RBDWT)和ACE2的结合进行了分子动力学模拟、拉伸分子动力学模拟和伞状取样,结果表明,β-loop区的不同行为导致关键结合残基和相互作用的不同,并进一步导致结合/解离机制的不同,SARS-Co V-2-RBD和ACE2的结合亲和力是SARS-Co V-RBD的约30倍.
关键词
SARS-CoV-2
SARS-COV
拉伸分子动力学
伞状取样
关键结合残基
结合
自由能
Keywords
SARS-Co V-2
SARS-Co V
steered molecular dynamics
umbrella sampling
key binding residues
binding free energy
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SARS-CoV-2与受体ACE2独特的相互作用与结合/解离过程
刘深鑫
张博
刘迎春
王琦
《中国科学:化学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
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