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16S rRNA基因序列分析在非典型菌株鉴定中的应用 被引量:11
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作者 张守印 李振军 +5 位作者 张集 朱勇 庞慧 郑宵 贺金荣 海荣 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第4期616-617,726,共3页
目的:建立16S rRNA基因序列分析鉴定细菌的方法,评价其对常规方法不能鉴定菌株的鉴定效果。方法:选择细菌的16S rRNA基因为靶序列,在两端保守区设计引物,对三株生化、形态不典型菌株提取模板进行PCR扩增,PCR产物纯化后进行克隆,测序。结... 目的:建立16S rRNA基因序列分析鉴定细菌的方法,评价其对常规方法不能鉴定菌株的鉴定效果。方法:选择细菌的16S rRNA基因为靶序列,在两端保守区设计引物,对三株生化、形态不典型菌株提取模板进行PCR扩增,PCR产物纯化后进行克隆,测序。结果:三株细菌的16S rRNA基因序列与Genbank比较,YC1序列与大肠杆菌相似性>99%,YC2序列与肺炎克雷伯菌相似性>99%,YC3序列与缓症链球菌相似性>98%。结论:16S rRNA基因序列分析的方法可以较好地鉴定常规方法难以鉴定的不典型菌株。 展开更多
关键词 16S RRNA基因 序列分析 典型菌
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新型A/O/A/O-SBR中DPB的富集及其典型菌株特性研究 被引量:1
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作者 胡筱敏 杨辉 《安全与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期104-108,共5页
为能更好地达到同步除磷脱氮的目的,对反硝化聚磷菌(Den-itrifying Phosphorus Removal Bacteria,DPB)进行了富集培养,并对其中的典型菌株进行了特性研究。以校园生活区污水为研究对象,在温度为25℃,pH值为7.5,乙酸钠为碳源,进水COD为31... 为能更好地达到同步除磷脱氮的目的,对反硝化聚磷菌(Den-itrifying Phosphorus Removal Bacteria,DPB)进行了富集培养,并对其中的典型菌株进行了特性研究。以校园生活区污水为研究对象,在温度为25℃,pH值为7.5,乙酸钠为碳源,进水COD为316.5 mg/L的条件下,采用三阶段的污泥驯化,对反硝化聚磷菌种进行了分离纯化,并对富集的典型菌株进行了生理生化试验、吸磷试验、硝酸盐还原产气试验。结果表明,富集培养后的DPB在A/O/A/O-SBR系统(厌氧2 h,好氧1.5 h,缺氧1.5 h,后置曝气0.5 h)中成为优势菌群,系统中COD、NH4+-N、TN、TP的出水质量浓度分别为28.35 mg/L、0.87 mg/L、4.05mg/L和0.37 mg/L。分离鉴定出具有反硝化除磷能力的Z7、Z9两株典型菌株,其吸磷率均在50%左右。经细菌形态观察、生理特性分析及16S rDNA序列测定,鉴定Z7、Z9为缺氧反硝化聚磷菌,与假单胞菌(Pseudomonas)最相似,其同源性均达99.9%。 展开更多
关键词 环境工程学 SBR A/O/A/O DPB 典型菌
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鸡蛋壳表面典型菌株的分离鉴定及其对全蛋液致腐能力分析 被引量:2
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作者 弓敏 马艳秋 +2 位作者 王瑞红 迟媛 迟玉杰 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第4期153-160,共8页
以市售鸡蛋为原料,建立鸡蛋壳表面菌落总数与全蛋液货架期之间的相关性,并采用梯度稀释法和划线纯化法对蛋壳表面典型菌种进行分离纯化。通过形态学特征观察、生理生化实验及16S rRNA分子生物学方法进行菌种鉴定,并将分离得到的典型菌... 以市售鸡蛋为原料,建立鸡蛋壳表面菌落总数与全蛋液货架期之间的相关性,并采用梯度稀释法和划线纯化法对蛋壳表面典型菌种进行分离纯化。通过形态学特征观察、生理生化实验及16S rRNA分子生物学方法进行菌种鉴定,并将分离得到的典型菌株接种到全蛋液样品中,通过测定全蛋液在4℃贮藏期间典型菌株的生长动力学曲线及样品挥发性盐基氮(total volatile base nitrogen,TVB-N)值、pH值、质构特性和感官特性等,比较5种不同典型菌株对全蛋液样品的致腐能力。结果表明:鸡蛋壳表面微生物污染是影响全蛋液货架期的重要因素(P<0.05),且从鸡蛋壳表面分离纯化得到5株典型菌种,分别为大肠埃希氏菌(Escherichia coli)E、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)B、考克氏菌(Kocuria marina)D及2株蜡样芽孢杆菌(B.cereus)A、C。接种菌株的全蛋液样品,4℃贮藏30 h后发生明显的腐败变质,样品的TVB-N值显著高于对照组样品;此外,样品pH值、凝胶硬度、凝胶持水性也显著低于对照组。通过比较样品贮藏品质变化确定腐败能力最强的为蜡样芽孢杆菌属A、C,其次为大肠杆菌E、枯草芽孢杆菌B及考克氏菌D。 展开更多
关键词 全蛋液 落总数 分离鉴定 典型菌
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布鲁氏菌非典型菌株生长状态的热谱学研究
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作者 郝宗宇 张爱梅 +5 位作者 吕家锐 付玉生 谭宗民 谢昌礼 谢小红 屈松生 《河南预防医学杂志》 1993年第1期30-31,共2页
针对大型水电站经济运行问题,在传统动态规划方法的基础上,提出了一种多重动态规划模型,通过求解模型,获得了在水库入流和水头为定值时的大型水电站各台机组的最佳负荷运行分配方案。实例研究表明,文中提出的模型是可行的,对大型... 针对大型水电站经济运行问题,在传统动态规划方法的基础上,提出了一种多重动态规划模型,通过求解模型,获得了在水库入流和水头为定值时的大型水电站各台机组的最佳负荷运行分配方案。实例研究表明,文中提出的模型是可行的,对大型水电站经济运行具有一定的意义,同时也说明,大型水电站的经济运行比常规运行更能取得效益。 展开更多
关键词 典型菌 热谱 布鲁氏杆
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基于16S rRNA序列分析的动物饮片典型菌污染特征研究 被引量:1
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作者 于志君 李腊梅 +2 位作者 刘婧 江珍玉 邓海英 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1737-1750,共14页
目的:探讨以动物组织为药用部位的饮片微生物污染模式及典型菌污染特点。方法:收集16味46批常见动物类饮片,依据2020年版《中华人民共和国药典》规定方法,对样品进行需氧菌总数(TAMC)、酵母霉菌总数(TYMC)、耐热菌及规定控制菌检验;采... 目的:探讨以动物组织为药用部位的饮片微生物污染模式及典型菌污染特点。方法:收集16味46批常见动物类饮片,依据2020年版《中华人民共和国药典》规定方法,对样品进行需氧菌总数(TAMC)、酵母霉菌总数(TYMC)、耐热菌及规定控制菌检验;采用多因素线性回归分析方法探究与样品微生物污染载量相关的因素;运用16S rRNA序列分析方法鉴定饮片污染典型菌。结果:37.0%的样品TAMC超过10^(4)CFU·g^(-1),32.6%的样品TYMC超过10^(3)CFU·g^(-1),60.9%的样品可检出耐热菌;不含内脏组织动物饮片lg TYMC均值高于含内脏组织饮片(P=0.01),其TYMC检出不合格率高于含内脏组织组(χ^(2)=7.59,P=0.00);采收加工炮制过程中未经热处理样品lg TYMC均值高于热处理组(P=0.02),TYMC检出不合格率高于热处理组(χ^(2)=3.99,P=0.04)。13.0%(6/46)的样品检出耐胆盐革兰阴性菌,8.7%(4/46)的样品耐胆盐革兰阴性菌载量超过10^(4)MPN·g^(-1),8.7%(4/46)样品中检出大肠埃希菌,1批蝉蜕样品中检测到铜绿假单胞菌。样品TAMC载量与耐热菌载量呈相关性(P=0.00)。样品中共分离到55株典型菌,芽胞杆菌属细菌占47.3%,肠杆菌属细菌占23.6%,肠球菌占16.4%,样品中检出蜡样芽胞杆菌、阴沟肠杆菌复合体成员等条件致病菌。结论:含动物组织类饮片微生物负载水平高,耐热菌污染严重,耐胆盐革兰阴性菌污染率低,需氧菌负载与耐热菌负载水平具有相关性,饮片典型菌以芽胞杆菌属细菌污染最常见,但污染频率高的条件致病菌在动物饮片微生物控制中应引起足够重视。 展开更多
关键词 动物饮片 微生物污染 典型菌 16S rRNA序列分析 鉴定 聚类分析
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CT与超声引导下经皮穿刺肺活检在菌阴不典型肺结核中的对比研究
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作者 沈小娇 吴学荣 +2 位作者 颜小明 王小玲 更藏尖措 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2024年第10期0005-0008,共4页
评价 CT和超声导向下肺部活检术对细菌阴性非典型结核病的诊断价值及其可能出现的并发症。方法 选择160例菌阴不典型结核病患者,按随机数表分成两组,各80人。分别行 CT导向下经皮穿刺活检术以及超声引导下经皮穿刺肺活检,比较观察组与... 评价 CT和超声导向下肺部活检术对细菌阴性非典型结核病的诊断价值及其可能出现的并发症。方法 选择160例菌阴不典型结核病患者,按随机数表分成两组,各80人。分别行 CT导向下经皮穿刺活检术以及超声引导下经皮穿刺肺活检,比较观察组与对照组之间的检出率,以及相应的并发症。结果 使用CT引导下经皮穿刺肺活检的检出率明显优于超声引导组(P<0.05),穿刺相关并发症发生率低于超声引导穿刺组(P<0.05),差异具有统计学意义。结论 在菌阴不典型肺结核的诊断中,使用CT引导下经皮穿刺肺活检的检出率较高,安全性好,具有较高的临床应用价值,值得临床的推广及应用。 展开更多
关键词 CT引导下经皮穿刺肺活检 阴不典型肺结核 超声引导下肺穿刺活检
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中药饮片微生物污染现状及典型菌鉴定研究进展 被引量:36
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作者 邓海英 龚勇祥 +4 位作者 李连凤 邓雪丹 唐诗 康四和 江珍玉 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期2242-2250,2256,共10页
微生物污染是饮片外源性污染的主要形式之一,也是影响人体健康的重要途径。对近10年来饮片微生物污染及典型菌研究进展进行综述,结果显示目前我国饮片微生物污染较为严重,不同品种、来源及炮制方法饮片间微生物污染存在较大差异,耐热菌... 微生物污染是饮片外源性污染的主要形式之一,也是影响人体健康的重要途径。对近10年来饮片微生物污染及典型菌研究进展进行综述,结果显示目前我国饮片微生物污染较为严重,不同品种、来源及炮制方法饮片间微生物污染存在较大差异,耐热菌及耐胆盐革兰阴性菌污染率高,其他控制菌检出率较低。污染典型菌的分离鉴定研究主要集中于耐热菌及革兰阴性杆菌,典型耐热菌主要是来源于土壤及其他外环境的芽胞杆菌属,少数分离菌株对人类有致病报道;分离的典型革兰阴性杆菌70%以上菌株有致病报道,以阴沟肠杆菌为常见分离菌。近年来,一些新的污染典型菌检测方法逐步被应用,如API、Vitek2 Compact鉴定系统、FRIT、MALDI-TOF/MS、核糖体分型技术及16 S rRNA宏基因组高通量测序技术等,这些方法较传统方法更灵敏、快捷和准确。 展开更多
关键词 饮片 微生物污染 典型菌 耐热 革兰阴性杆
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从血培养中分离出一株不典型大肠埃希菌
8
作者 张宽深 吴灵芝 《中国卫生检验杂志》 CAS 2006年第6期758-758,共1页
关键词 血培养 典型大肠埃希
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3株非典型羊源布鲁菌的基因分型研究
9
作者 沈利平 王正廷 刘志国 《畜牧与饲料科学》 2019年第12期108-112,共5页
[目的]探讨采用基因分型方法对非典型布鲁菌鉴定的实用性,为非典型菌株的鉴别提供参考。[方法]采用常规鉴定方法和VITEK 2.0全自动细菌鉴定分析系统对菌株进行初步鉴定,利用AMOS-PCR进行种型鉴定,应用多位点可变数目串联重复序列分析方... [目的]探讨采用基因分型方法对非典型布鲁菌鉴定的实用性,为非典型菌株的鉴别提供参考。[方法]采用常规鉴定方法和VITEK 2.0全自动细菌鉴定分析系统对菌株进行初步鉴定,利用AMOS-PCR进行种型鉴定,应用多位点可变数目串联重复序列分析方法(MLVA)确定菌株的基因型。[结果]常规鉴定结果显示试验菌株为疑似布鲁菌;VITEK 2.0全自动细菌鉴定系统显示3株试验菌株均为布鲁菌;AMOS-PCR扩增表明试验菌株均为羊种菌,MLVA聚类分析表明试验菌株与羊种2型布鲁菌紧密地聚为一类,属东地中海基因型,并在Panel 2B中发现了新的基因型(4-4-3-7-5),命名为CN2B-45。[结论]MLVA基因分型方法对非典型布鲁菌具有极高的分辨力,是非典型布鲁菌分型鉴别的最佳策略。 展开更多
关键词 典型布鲁 MLVA 基因分型
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李斯特菌毒力因子及其进化 被引量:24
10
作者 陈健舜 江玲丽 方维焕 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期738-742,共5页
李斯特菌属包含6个种,毒力各有差异。在细菌耐受外界环境、黏附侵袭及细胞内感染过程中,毒力因子各司其职又相互协作。毒力基因常聚集为毒力岛,其中PrfA依赖型毒力基因簇(LIPI-1)与内化素岛(LIPI-2)是致病种最重要的两个毒力岛。李斯特... 李斯特菌属包含6个种,毒力各有差异。在细菌耐受外界环境、黏附侵袭及细胞内感染过程中,毒力因子各司其职又相互协作。毒力基因常聚集为毒力岛,其中PrfA依赖型毒力基因簇(LIPI-1)与内化素岛(LIPI-2)是致病种最重要的两个毒力岛。李斯特菌各个种可能来源于同一个携带有完整毒力岛的祖先,在长期进化过程中,通过基因水平转移或重组、整合等事件,演化为目前流行的6个种。噬菌体、转座子、质粒等可能扮演着毒力进化执行者的角色。一些天然非典型菌株是目前研究的热点,如含有LIPI-1的无害李斯特菌和缺失LIPI-1的塞氏李斯特菌,其演化进程可能尚未达到或已超越目前流行的状态,为李斯特菌毒力进化的研究提供了重要线索。 展开更多
关键词 李斯特 毒力因子 毒力进化 典型菌
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上海市沙门菌和志贺菌腹泻型谱和耐药特征的分析 被引量:11
11
作者 许学斌 袁政安 +4 位作者 顾宝柯 金汇明 林亚萍 陈敏 朱超 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期706-709,713,共5页
目的通过对沙门菌和志贺菌致泻血清型和耐药性研究了解菌型特征及耐药谱。方法收集和鉴定了115株沙门菌和644株志贺菌;以K-B法测试沙门菌和志贺菌对16种抗生素的耐药率,使用E-test定量法确认产超广谱β-内酰酶(ESBLs)菌株。结果肠炎沙... 目的通过对沙门菌和志贺菌致泻血清型和耐药性研究了解菌型特征及耐药谱。方法收集和鉴定了115株沙门菌和644株志贺菌;以K-B法测试沙门菌和志贺菌对16种抗生素的耐药率,使用E-test定量法确认产超广谱β-内酰酶(ESBLs)菌株。结果肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌和福氏志贺菌4c亚型(F4c)、宋内、福氏志贺菌2b亚型(F2b)分别是造成腹泻的优势血清型;比较2年中沙门菌的耐药率有上升趋势,耐四环素-萘啶酸-复方新诺明的R1型志贺菌比例高达79.91%,产ESBLs的分别有1株肠炎沙门菌、44株福氏志贺菌、11株宋内志贺菌。结论试管凝集效价是诊断不典型志贺菌型特异性抗原的定量依据,用E-test法判定的产ESBLs沙门和志贺菌符合复燃的新型肠道病原菌定义,志贺菌的耐药型谱对肠道门诊选用抗菌药物具有重要参考价值。 展开更多
关键词 血清型谱 耐药性 E-TEST ESBLS 典型志贺
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新疆乌鲁木齐市862例成人社区获得性肺炎患者病原菌分析 被引量:1
12
作者 李瑞钊 白文梅 +1 位作者 马艳 杨惠琴 《新疆中医药》 2016年第5期80-82,共3页
目的 通过对我院收治的862例社区获得性肺炎患者的病原菌结果资料分析,为临床抗生素治疗及应用提供一定的依据。方法 回顾性分析我院2013年1月~2015年12月收治的新疆乌鲁木齐市862例社区获得性肺炎患者的临床病原菌检验结果资料。结果 ... 目的 通过对我院收治的862例社区获得性肺炎患者的病原菌结果资料分析,为临床抗生素治疗及应用提供一定的依据。方法 回顾性分析我院2013年1月~2015年12月收治的新疆乌鲁木齐市862例社区获得性肺炎患者的临床病原菌检验结果资料。结果 862例患者中革兰氏阳性菌检出率为19.37%,革兰氏阴性菌检出率为8.12%,非典型菌检出率为33.76%,中青年患者(〈65岁)病原菌检出率38.88%,主要以非典型菌为主,占63.19%;老年患者(〉65岁)中病原菌检出率83.88%,主要以革兰氏阴性菌为主,占48.53%。结论:老年CAP患者病原菌以革兰氏阴性菌为主,故治疗应以对抗革兰氏阴性杆菌为主,而中青年CAP患者病原菌以非典型菌为主,故治疗应以抗非典型菌主。 展开更多
关键词 社区获得性肺炎 病原 典型菌
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疑似食物中毒患者标本一株侵袭性大肠埃希菌O_(29):K?的分离及实验探讨 被引量:1
13
作者 高亚色 梁英 《实用预防医学》 CAS 2007年第1期199-200,共2页
目的对一株分离于疑似食物中毒腹泻患者的EIEC菌株进行生化特征、血清学及致病侵袭力实验探讨。方法参照GB/T4789.6—2003和卫生防疫细菌检验。结果3份标本分离到的同一血清型EIECO_(29)K?菌株,经全面生化反应,血清学及Sereny试验证实... 目的对一株分离于疑似食物中毒腹泻患者的EIEC菌株进行生化特征、血清学及致病侵袭力实验探讨。方法参照GB/T4789.6—2003和卫生防疫细菌检验。结果3份标本分离到的同一血清型EIECO_(29)K?菌株,经全面生化反应,血清学及Sereny试验证实为一株非典型生化特征,丧失侵袭力的EIEC菌株。结论在肠道病原菌的鉴定中,非典型生化特征及丧失侵袭力的EIEC菌株应引起注意。 展开更多
关键词 EIEC 典型菌 侵袭力
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天津地区临床分离株结核分枝杆菌分子流行病学研究 被引量:1
14
作者 李卫民 柴利泉 +8 位作者 李丽 戴宗甲 白大鹏 张立 邵世峰 吴琦 陆伟 孙照刚 李传友 《结核病与胸部肿瘤》 2007年第1期18-25,共8页
目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日~11月25日就诊病人痰培养阳性的结核分枝杆菌100株,采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列(VNTR)两... 目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日~11月25日就诊病人痰培养阳性的结核分枝杆菌100株,采用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列(VNTR)两种方法进行基因分型,并运用软件对二者的结果进行分析。依据北京分化支的定义。运用多重和实时定量PCR方法将其区分为W菌/典型北京家族菌株和非典型北京菌株,x^2检验分析两种亚群与患者年龄和耐药性之间的联系。结果排除污染菌株,共对96株结核分枝杆菌临床分离株进行两种方法的基因分型,Spoligotyping结果为91.7%为北京基因型(含3株类北京基因型)结核分枝杆菌(88/96)。VNTR分型可将北京基因型分为60种基因型。在北京分化支结核分枝杆菌中,W菌/典型北京家族菌株占93.2%(82/88)。两种北京分化支亚群与患者年龄和耐药性没有显著性统计学差异(P〉0.05)。结论天津地区结核病患者临床分离的结核分枝杆菌中,北京基因型呈现较为明显的优势。VNTR的分辨率明显高于Spoligotyping。北京分化支的两种亚群在天津地区临床结核病患者中均存在流行,但以W菌/典型北京家族菌株为主。 展开更多
关键词 分枝杆 结核 北京基因型 数目可变串联重复序列 北京分化支 典型北京家族 典型北京
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高毒力肺炎克雷伯菌血流感染的临床特点 被引量:17
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作者 马荣 王晓丹 聂大平 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2018年第1期26-30,共5页
目的了解高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)血流感染(BSI)的微生物学和临床特点。方法收集2013年4月—2016年3月大连医科大学第二临床学院159例肺炎克雷伯菌BSI患者的菌株和临床资料。应用SPSS 19.0统计软件进行分析。结果 hvKP BSI在159例肺炎... 目的了解高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)血流感染(BSI)的微生物学和临床特点。方法收集2013年4月—2016年3月大连医科大学第二临床学院159例肺炎克雷伯菌BSI患者的菌株和临床资料。应用SPSS 19.0统计软件进行分析。结果 hvKP BSI在159例肺炎克雷伯菌BSI患者中占35.22%(56/159),其中K1和K2型分别占51.79%和26.79%。hvKP BSI感染来源主要为肝脓肿(26株,46.43%),经典型肺炎克雷伯菌(cKP)BSI主要是原发性菌血症(41株,39.81%)。两组患者不同感染类型比较,差异有统计学意义(χ2=57.782,P<0.001),hvKP BSI患者以社区获得性为主(89.29%),cKP BSI患者以医院获得性为主(73.79%)。两组患者不同基础疾病构成比较,差异有统计学意义(χ2=36.532,P<0.001),hvKP BSI患者主要为糖尿病(50.00%),cKP BSI患者主要为恶性肿瘤(45.63%)。hvKP BSI患者感染性休克发生率高于cKP BSI患者(32.14%vs 8.74%),差异有统计学意义(χ2=14.096,P<0.001)。hvKP产ESBLs的比率为5.36%(3/56),cKP产ESBLs的比率为47.57%(49/103),二者差异有统计学意义(χ2=29.375,P<0.001)。未发现产KPC的hvKP。hvKP对头孢他啶、头孢曲松、头孢吡肟、氨曲南、庆大霉素、左氧氟沙星及复方磺胺甲口恶唑的耐药率均低于cKP,差异有统计学意义(均P<0.05)。结论 hvKP BSI多见于社区感染,感染来源和基础疾病不同于cKP BSI,易产生感染性休克。实验室和临床医生都应重视hvKP感染并密切关注其耐药趋势的演变。 展开更多
关键词 高毒力肺炎克雷伯 典型肺炎克雷伯 肺炎克雷伯 血流感染 社区感染 医院感染
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一例混合诺如病毒感染的非典型肠致病性大肠埃希菌鉴定与分析
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作者 胡凤清 饶晓虹 +1 位作者 刘承毅 林倩倩 《海峡预防医学杂志》 CAS 2024年第3期48-51,共4页
目的对1例混合感染诺如病毒食源性急性胃肠炎患者的非典型肠致病性大肠埃希菌(aEPEC)进行病原检测分析,为疾病防治提供基础资料。方法对患者粪便标本开展诺如病毒核酸检测,并进行沙门菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌和志贺菌的分离培... 目的对1例混合感染诺如病毒食源性急性胃肠炎患者的非典型肠致病性大肠埃希菌(aEPEC)进行病原检测分析,为疾病防治提供基础资料。方法对患者粪便标本开展诺如病毒核酸检测,并进行沙门菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌和志贺菌的分离培养和鉴定,对分离到的菌株进行毒力基因分型鉴定、药敏试验及全基因组测序分析。结果该患者检测到aEPEC和GⅡ型诺如病毒,药敏试验显示该菌株对氨苄西林、氨苄西林-舒巴坦、四环素、链霉素均耐药。菌株染色体大小为4.13 Mbp,GC含量50.7%,N50为187 kb,contig 77个。预测编码蛋白质基因4540个、tRNAs 69个、rRNAs 3个、tmRNAs 1个,为ST4119型。经数据库比对,该菌株存在197个毒力基因、55个耐药基因,β内酰胺类、四环素类和氨基糖苷类的耐药表型与耐药基因携带情况一致。并与挪威GCF_002951855.1株具有较高的序列相似性。结论该患者可能由于aEPEC和诺如病毒混合感染导致腹泻,且aEPEC的基因分析和药敏实验均提示存在多种抗生素耐药,建议在食源性疾病监测中开展多病原筛查技术以提高检测的精确度和可靠性。 展开更多
关键词 典型肠致病性大肠埃希(aEPEC) 诺如病毒 食源性疾病 药敏试验 毒力基因 全基因组测序
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反硝化微生物在污水脱氮中的研究及应用进展 被引量:75
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作者 肖晶晶 郭萍 +2 位作者 霍炜洁 于江 朱昌雄 《环境科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期97-102,共6页
农药和化肥流失、养殖废水、生活污水等均会引起水体的氮污染。反硝化微生物在污染水体脱氮修复中起重要作用,它可将水体中的亚硝酸盐氮或硝酸盐氮还原为N2,排入大气,从而降低污染水体中含氮污染物的浓度,改善水质。因此,对反硝化微生... 农药和化肥流失、养殖废水、生活污水等均会引起水体的氮污染。反硝化微生物在污染水体脱氮修复中起重要作用,它可将水体中的亚硝酸盐氮或硝酸盐氮还原为N2,排入大气,从而降低污染水体中含氮污染物的浓度,改善水质。因此,对反硝化微生物进行研究有重要的意义。文章从功能特性、典型菌株、反硝化酶系等方面对反硝化微生物及其作用机制进行了论述,对其在污水脱氮方面的研究及应用进展做了较为详细的介绍,最后阐明了目前存在的问题和发展趋势。 展开更多
关键词 反硝化微生物 功能特性 典型菌 反硝化酶系 存在问题
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福建省非典型肠致病性大肠埃希菌的分子特征研究
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作者 陈爱平 李曲文 +4 位作者 林杰 陈建辉 杨劲松 王灵岚 严延生 《中国预防医学杂志》 CAS 2014年第3期216-220,共5页
目的研究福建省非典型肠致病性大肠埃希菌(aEPEC)菌株的毒力基因特征和菌株间的遗传相似度;结合菌株的背景资料分析不同的分子特征对aEPEC流行的影响。方法运用PCR技术进行系列的相关毒力基因扩增;同时运用脉冲场凝胶电泳分子分型技术,... 目的研究福建省非典型肠致病性大肠埃希菌(aEPEC)菌株的毒力基因特征和菌株间的遗传相似度;结合菌株的背景资料分析不同的分子特征对aEPEC流行的影响。方法运用PCR技术进行系列的相关毒力基因扩增;同时运用脉冲场凝胶电泳分子分型技术,对福建省2010-2012年分离的aEPEC菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。结果分离30株实验菌株毒力基因的检测呈阳性的分别为:b112153.3%(16),yiaA36.7%(11),set/ent、nleB、nleE均为30%(9),lpfAR141 23.3%(7),efa/lifA20%(6),ehxA3.33%(1);其余毒力基因均未检出;93.3%(28)菌株不同程度地携带有相关的毒力因子。29株菌按照100%的相似度分为15个PFGE型别(P1-P15);其中存在4组不同的PFGE簇(I-Ⅳ),相同PFGE簇的病例在发病的时间和地区上有聚集性,同时相同簇内菌株的毒力基因谱也表现相同。结论 b1121、yiaA和EHEC毒力岛OI-122相关基因(efa1/lifA,nleB,nleE,set/ent)在福建省aEPEC菌株中携带率较高。非典型肠致病性大肠埃希菌的毒力谱表现为多样性,基因组也呈现遗传多态性;同时PFGE分析发现福建省存在由aEPEC新发病原菌引起的聚集性病例。 展开更多
关键词 典型肠致病性大肠埃希 毒力基因 PFGE
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Receptor-binding domain of SARS-Cov spike protein: Soluble expression in E.coli, purification and functional characterization 被引量:2
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作者 Jing Chen Lin Miao +5 位作者 Jia-Ming Li Yan-Ying Li Qing-Yu Zhu Chang-Lin Zhou Hong-Qing Fang Hui-Peng Chen 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第39期6159-6164,共6页
AIM: To find a soluble and functional recombinant receptor-binding domain of severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus (SARS-Cov), and to analyze its receptor binding ability. METHODS: Three fusion ... AIM: To find a soluble and functional recombinant receptor-binding domain of severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus (SARS-Cov), and to analyze its receptor binding ability. METHODS: Three fusion tags (glutathione S-transferase, GST; thioredoxin, Trx; maltose-binding protein, MBP), which preferably contributes to increasing solubility and to facilitating the proper folding of heteroprotein, were used to acquire the soluble and functional expression of RBD protein in Escherichia coli (BL21(DE3) and Rosetta-gamiB (DE3) strains). The receptor binding ability of the purified soluble RBD protein was then detected by ELISA and flow cytometry assay. RESULTS: RBD of SARS-Cov spike protein was expressed as inclusion body when fused as TrxA tag form in both BL21 (DE3) and Rosetta-gamiB (DE3) under many different cultures and induction conditions. And there was no visible expression band on SDS-PAGE when RBD was expressed as MBP tagged form. Only GST tagged RBD was soluble expressed in BL21(DE3), and the protein was purified by AKTA Prime Chromatography system. The ELISA data showed that GST.RBD antigen had positive reaction with anti-RBD mouse monoclonal antibody 1A5. Further flow cytometry assay demonstrated the high efficiency of RBD's binding ability to ACE2 (angiotensin-converting enzyme 2) positive Vero E6 cell. And ACE2 was proved as a cellular receptor that meditated an initial-affinity interaction with SARS-Cov spike protein. The geometrical mean of GST and GST.RBD binding to Vero E6 cells were 77.08 and 352.73 respectively. CONCLUSION: In this paper, we get sufficient soluble N terminal GST tagged RBD protein expressed in EcoliBL21 (DE3); data from ELISA and flow cytometry assay demonstrate that the recombinant protein is functional and binding to ACE2 positive Vero E6 cell efficiently. And the recombinant RBD derived from E.coli can be used to developing subunit vaccine to block S protein binding with receptor and to neutralizing SARS-Cov infection. 展开更多
关键词 Receptor-binding domain SARS-COV Spike protein expression E.COLI
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Isolation and characterization of Acidithiobacillus caldus from several typical environments in China 被引量:8
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作者 周洪波 刘晰 +5 位作者 符波 邱冠周 霍强 曾伟民 柳建设 陈新华 《Journal of Central South University of Technology》 EI 2007年第2期163-169,共7页
Six strains of moderately thermophilic sulfur-oxidizing bacteria were isolated from several different typical environments in China. The identities of the isolates were confirmed by analyses of their 16S rRNA genes, a... Six strains of moderately thermophilic sulfur-oxidizing bacteria were isolated from several different typical environments in China. The identities of the isolates were confirmed by analyses of their 16S rRNA genes, and some key physiological traits. The isolates are Gram negative, rod-shaped bacteria, their optimal temperature and pH value for growth are 45-50℃ and 2.5-3.5 respectively. They are autotrophic and used elemental sulfur, sodium thiosulfate and potassium tetrathionate as electron donor, while a little glucose stimulated their growth. 16S rDNA sequences analysis reveals that the strains are phylogenetically clustered to Acidithiobacillus caldus. 展开更多
关键词 acidothermophile biochemical traits 16S rDNA sequence Acidithiobacillus caldus
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