海豚链球菌兼职蛋白FBA的克隆表达、抗原性检测及免疫效果评价

为检测斑点叉尾鮰源海豚链球菌兼职蛋白(fructose-1,6-bisphosphate aldolases,FBA)的抗原性和潜在的疫苗价值,本实验克隆得到斑点叉尾鮰源海豚链球菌DX09(基因组登陆号LXQF01)的fba基因序列(基因登录号A7N10_RS06935),对克隆序列进行生物信息学分析,并通过原核表达得到重组FBA蛋白(r FBA),制备了兔抗r FBA血清用于FBA蛋白抗原性检测,同时通过免疫保护实验评估重组蛋白的免疫保护效果。结果显示,海豚链球菌DX09 fba基因有1个882 bp的开放阅读框(ORF),编码293个氨基酸。生物信息学分析显示,其分子式为C_(1378)H_(2172)N_(368)O_(422)S_8,分子质量为30.9 ku,理论等电点为5.01,不具有信号肽和跨膜区域;具有保守的裂解酶结构域,且与其他来源的FBA蛋白同源性达100%;具有较高的抗原指数,表明其可形成多个抗原表位。SDS-PAGE检测发现,诱导表达的重组蛋白以包涵体的形式出现在沉淀中,大小约为47 ku。Western blot分析表明,兔抗r FBA血清能特异性结合菌体蛋白。同时免疫保护实验显示,重组蛋白对斑点叉尾鮰的相对保护率可达55%,免疫后鱼体抗体水平相对对照组显著升高。本研究表明,原核表达的斑点叉尾鮰源海豚链球菌DX09 rFBA具备较好的抗原性和免疫保护作用,具有研发斑点叉尾鮰海豚链球菌亚单位疫苗的潜在价值。

兼职蛋白质及其哲学思考

在蛋白质组学研究中 ,新近提出的兼职蛋白质概念正越来越受到人们的关注。研究发现 ,某些蛋白质因其细胞定位、细胞类型、寡聚状态的不同及其配体、底物、辅因子和产物在细胞内浓度的变化而表现出不同的功能 ,从而对细胞和机体产生诸多有益作用 ,并使其发展出一系列完善机制以实现不同功能间的转换。兼职蛋白质概念的提出不仅改变了一个基因—一种蛋白质—一种功能的传统观念 ,也为大分子间相互作用、细胞复杂性及生物多样性研究提供了广阔领域 ,同时也预示在完成基因组计划后生命科学将面临更为艰巨的任务。

兼职蛋白热休克蛋白70与α-烯醇酶的人B细胞表位肽预测及其瓜氨酸化的血清学检定

目的筛选与自身免疫病相关兼职蛋白的B细胞优势表位肽并进行血清学检定。方法利用DNAMAN软件分析不同物种热休克蛋白70(heat shock protein 70, HSP70)和α-烯醇酶氨基酸序列同源性,IEDB数据库和瓜氨酸化在线平台预测线性B细胞表位和瓜氨酸化修饰位点;间接ELISA检测抗HSP70和α-烯醇酶蛋白瓜氨酸化前后表位肽抗体。结果同源性分析和IEDB数据库预测得到兼职蛋白HSP70和α-烯醇酶各10个B细胞优势表位肽;瓜氨酸化位点预测显示,其分别有9个和4个位点可能会发生瓜氨酸化修饰,其中5个瓜氨酸化修饰位点与预测表位肽重合。与正常人相比,抗环瓜氨酸肽抗体阳性患者血清抗瓜氨酸化修饰表位肽的抗体滴度明显增高(P<0.05)。结论采用生物信息学分析和ELISA初步验证的方法有助于筛选自身抗原相关的B细胞优势表位肽。

兼职功能蛋白

兼职功能蛋白(moonlighting proteins)是指一类具有两种或两种以上功能的蛋白,且这些功能间没有直接相关性,此类蛋白能够通过多种形式转换其功能.随着科学研究的深入,越来越多的已知功能的蛋白被发现具有新型兼职功能,其兼职功能对生物体的意义绝不亚于其所谓本职功能.兼职功能蛋白的发现大大拓展了基因、蛋白质与生理功能一一对应的传统观念;特别是最近研究发现一类叫做无固有结构蛋白(intrinsically unstructured proteins,IUPs)表现出多功能性,向"蛋白质的功能等视于确定的三维结构"的经典定律发起了挑战.本文综述了兼职功能蛋白的功能转换机制、进化历程、研究方法等方面的最新研究进展,同时对兼职功能蛋白给生命科学研究带来的新思路和新挑战进行了深入的讨论.

水稻内生成团泛菌YS19共质体形成差异表达蛋白MalE及其兼职功能

成团泛菌YS19是从水稻"越富"品种中分离的一种优势内生细菌,与宿主水稻互作时具有多种促生作用,其形成的共质体(symplasmata)结构与菌体抗逆及与宿主互作有重要意义.研究发现了一种在YS19共质体形成阶段高表达的差异蛋白,对其用肽指纹图谱进行鉴定,发现其属于周质空间麦芽糖结合蛋白家族.克隆了该蛋白质的基因,重组表达并分离纯化了该蛋白质,发现它是一种兼职功能蛋白,其不仅参与麦芽糖的ABC运输系统,而且在强酸环境下不易发生变性沉淀,并可通过疏水面的显著暴露结合底物蛋白来发挥分子伴侣活性,这些兼职功能构成了菌体抗逆生存适应性的重要分子基础.