山东农业大学揭示内含子miRNA作为“信号转换器”调控植物抗逆的新机制

2023年8月,《New Phytologist》在线发表了山东农业大学生命科学学院郑成超课题组题为“Intronic microRNA-directed regulation of mitochondrial reactive oxygen species enhances plant stress tolerance in Arabidopsis”的研究论文。该研究阐明了内含子剪切是调控内含子miRNA加工的关键步骤,内含子miRNA可以作为“信号转换器”在增强植物抗逆性中发挥重要作用。

基于集成特征选择策略的基因共表达模式识别

为有效识别内含子miRNA及其宿主基因共表达模式,提出了一种基于集成特征选择的识别方法。首先使用基于支持度的集成特征选择算法,获取相关性和稳定性较高的特征子集,再使用封装式特征选择方法结合FCBF(Fast Correlation-Based Filter)搜索策略进一步去除冗余特征和弱相关的特征,获得最优的特征子集。实验结果表明,该方法融合了多个特征选择方法的优点,能提高学习模型的泛化能力并能有效识别内含子miRNA及其宿主基因的共表达模式。