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生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理
被引量:
9
1
作者
杨涛
贾安宝
+2 位作者
阮华斌
王亚坤
刘燕
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2017年第2期227-230,234,共5页
以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切...
以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切实有效地为科研和教学服务,为建立高效有序的实验管理提供理论依据。
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关键词
生物科学计算平台
冷冻电镜结构解析
实验室
实验室管理及运行
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职称材料
基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
2
作者
赵明洁
曹端方
章新政
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期2418-2429,共12页
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接...
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接在细胞内解析蛋白质复合物的三维结构也被称为蛋白质的细胞原位结构解析,而冷冻电镜电子断层重构技术是原位结构解析的关键技术,但是电子断层重构技术的序列倾转数据采集通量低、数据处理较为繁琐,并且达到准原子分辨率对样品有特殊要求,这些问题成为了限制原位结构解析分辨率和实际应用的瓶颈。近年来,一种基于单张无倾转数据的蛋白质原位结构解析方法发展迅速,可以高通量地对细胞中的蛋白质复合物进行高分辨率结构解析,本综述将分析这类方法的原理,讨论这个方法相较于传统断层重构方法的优缺点,并对蛋白质的细胞原位结构解析进行展望。希望可以通过这篇综述,帮助结构生物学科研人员更好地选择合适的工具。
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关键词
蛋白质原位重构
冷冻
电镜
原位
结构
解析
isSPA滤波
无倾转数据
高通量
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职称材料
膜骨架研究进展
3
作者
陈思伊
李宁宁
高宁
《中国基础科学》
2023年第5期22-31,40,共11页
膜骨架是细胞膜内侧分布的一种具有重复性规律排布的结构,帮助维持和稳定细胞膜形态,并参与调控多种细胞内生理过程。膜骨架最初在红细胞中被发现,赋予红细胞卓越的膜机械稳定性,是红细胞维持正常双凹圆盘形状和生理功能的重要因素。以...
膜骨架是细胞膜内侧分布的一种具有重复性规律排布的结构,帮助维持和稳定细胞膜形态,并参与调控多种细胞内生理过程。膜骨架最初在红细胞中被发现,赋予红细胞卓越的膜机械稳定性,是红细胞维持正常双凹圆盘形状和生理功能的重要因素。以红细胞膜骨架为代表,对膜骨架的相关研究进行综述,详细阐述红细胞膜骨架的蛋白质组成和复合物结构,简述神经细胞膜骨架的相关研究,探讨膜骨架研究领域中待解决的科学问题,并对未来的发展前景进行展望。
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关键词
膜骨架
红细胞
冷冻电镜结构解析
血液疾病
神经细胞
原文传递
题名
生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理
被引量:
9
1
作者
杨涛
贾安宝
阮华斌
王亚坤
刘燕
机构
清华大学生命科学学院
清华大学蛋白质研究技术中心
出处
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2017年第2期227-230,234,共5页
文摘
以清华大学生命科学院生物计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理为案例,介绍了实验室现状、制度体系、平台运行和成果4个部分,阐述了实验室管理和运行过程中经常出现的问题,提出了有效的改进措施,以便进一步提高设备的完好率和利用率,切实有效地为科研和教学服务,为建立高效有序的实验管理提供理论依据。
关键词
生物科学计算平台
冷冻电镜结构解析
实验室
实验室管理及运行
Keywords
biological computing platform
Freezing EM(Electron Microscope) Structure Analysis Laboratory
laboratory management and operation
分类号
G642.0 [文化科学—高等教育学]
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职称材料
题名
基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
2
作者
赵明洁
曹端方
章新政
机构
中国科学院生物物理研究所生物大分子重点实验室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期2418-2429,共12页
基金
国家自然科学基金(32150010)资助项目。
文摘
与体外纯化的蛋白质复合物相比,细胞内处于工作状态的蛋白质复合物往往更为完整,并且其三维结构处于完全生理的构象,这对于理解蛋白质复合物在生命活动中发挥重要功能的结构基础尤为关键,也可以为药物设计等提供更精确的靶点信息。直接在细胞内解析蛋白质复合物的三维结构也被称为蛋白质的细胞原位结构解析,而冷冻电镜电子断层重构技术是原位结构解析的关键技术,但是电子断层重构技术的序列倾转数据采集通量低、数据处理较为繁琐,并且达到准原子分辨率对样品有特殊要求,这些问题成为了限制原位结构解析分辨率和实际应用的瓶颈。近年来,一种基于单张无倾转数据的蛋白质原位结构解析方法发展迅速,可以高通量地对细胞中的蛋白质复合物进行高分辨率结构解析,本综述将分析这类方法的原理,讨论这个方法相较于传统断层重构方法的优缺点,并对蛋白质的细胞原位结构解析进行展望。希望可以通过这篇综述,帮助结构生物学科研人员更好地选择合适的工具。
关键词
蛋白质原位重构
冷冻
电镜
原位
结构
解析
isSPA滤波
无倾转数据
高通量
Keywords
in situ protein reconstruction
in situ structural analysis of cryoEM
isSPA(in situ single particle like analysis)filtering
non-tilting imaging data
high throughput
分类号
Q615 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
膜骨架研究进展
3
作者
陈思伊
李宁宁
高宁
机构
北京大学前沿交叉学科研究院
北京大学生命科学学院
出处
《中国基础科学》
2023年第5期22-31,40,共11页
文摘
膜骨架是细胞膜内侧分布的一种具有重复性规律排布的结构,帮助维持和稳定细胞膜形态,并参与调控多种细胞内生理过程。膜骨架最初在红细胞中被发现,赋予红细胞卓越的膜机械稳定性,是红细胞维持正常双凹圆盘形状和生理功能的重要因素。以红细胞膜骨架为代表,对膜骨架的相关研究进行综述,详细阐述红细胞膜骨架的蛋白质组成和复合物结构,简述神经细胞膜骨架的相关研究,探讨膜骨架研究领域中待解决的科学问题,并对未来的发展前景进行展望。
关键词
膜骨架
红细胞
冷冻电镜结构解析
血液疾病
神经细胞
Keywords
membrane skeleton
red blood cell
structure analysis by cryo-electron microscopy
blood disease
nerve cell
分类号
R552 [医药卫生—血液循环系统疾病]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
生物科学计算平台冷冻电镜结构解析实验室管理
杨涛
贾安宝
阮华斌
王亚坤
刘燕
《实验技术与管理》
CAS
北大核心
2017
9
下载PDF
职称材料
2
基于冷冻电镜无倾转成像数据的新型蛋白质原位结构解析方法
赵明洁
曹端方
章新政
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
3
膜骨架研究进展
陈思伊
李宁宁
高宁
《中国基础科学》
2023
0
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