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植物乳杆菌CGMCC8198 β-羟脂酰-ACP脱水酶启动子的克隆及其冷激调节作用分析
1
作者
周成慧
赵阳
+2 位作者
王德行
席茂盛
罗学刚
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第15期9-14,共6页
温度对乳酸菌储存和应用有重要影响,为挖掘乳酸菌温控启动子以及探索冷激反应的分子机制,对植物乳杆菌CGMCC8198经4和37℃处理后的转录组测序数据进行了分析,并对其中的差异基因β-羟脂酰-ACP脱水酶编码的fabZ基因表达情况进行验证,进...
温度对乳酸菌储存和应用有重要影响,为挖掘乳酸菌温控启动子以及探索冷激反应的分子机制,对植物乳杆菌CGMCC8198经4和37℃处理后的转录组测序数据进行了分析,并对其中的差异基因β-羟脂酰-ACP脱水酶编码的fabZ基因表达情况进行验证,进一步应用MEGA 7.0软件分析其进化亲缘关系。再通过BPROM、BDGP、IPSW以及WebLogo 3.0对基因上游区域进行预测,最后克隆启动子,构建绿色荧光蛋白启动子报告分析质粒,并转化大肠杆菌进行低温诱导分析。结果发现fabZ基因低温刺激后上调,生物信息学结果也显示此基因与低温应答有关系;在基因上游500 bp区域有强启动子,且启动子中的-10区(TGTAAC)和-35区(TTACCG)6个核苷酸的位置与经典的-10区、-35区相似;大肠杆菌低温诱导实验表明在14℃刺激20、40、60 min后,含fabZ启动子菌株的荧光相对强度分别是37℃时的1.30、2.38和1.42倍。该研究发现植物乳杆菌的fabZ基因具有低温上调特性,为探究乳酸菌冷激应答与fabZ基因功能机理,以及构建乳酸菌低温诱导表达载体奠定一定的基础。
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关键词
乳酸菌
生物信息学分析
启动子
增强绿色荧光蛋白
冷激应答
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职称材料
题名
植物乳杆菌CGMCC8198 β-羟脂酰-ACP脱水酶启动子的克隆及其冷激调节作用分析
1
作者
周成慧
赵阳
王德行
席茂盛
罗学刚
机构
天津科技大学生物工程学院
天津市微生物代谢与发酵过程控制技术工程中心
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第15期9-14,共6页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0400303)
天津市自然科学基金重点项目(18JCZDJC33800)
+2 种基金
工业微生物优良菌种选育与发酵技术公共服务平台项目(17PTGCCX00190)
天津科技大学青年教师创新基金项目(2016LG06)
天津市高等学校创新团队培养计划资助项目(TD13-5015)。
文摘
温度对乳酸菌储存和应用有重要影响,为挖掘乳酸菌温控启动子以及探索冷激反应的分子机制,对植物乳杆菌CGMCC8198经4和37℃处理后的转录组测序数据进行了分析,并对其中的差异基因β-羟脂酰-ACP脱水酶编码的fabZ基因表达情况进行验证,进一步应用MEGA 7.0软件分析其进化亲缘关系。再通过BPROM、BDGP、IPSW以及WebLogo 3.0对基因上游区域进行预测,最后克隆启动子,构建绿色荧光蛋白启动子报告分析质粒,并转化大肠杆菌进行低温诱导分析。结果发现fabZ基因低温刺激后上调,生物信息学结果也显示此基因与低温应答有关系;在基因上游500 bp区域有强启动子,且启动子中的-10区(TGTAAC)和-35区(TTACCG)6个核苷酸的位置与经典的-10区、-35区相似;大肠杆菌低温诱导实验表明在14℃刺激20、40、60 min后,含fabZ启动子菌株的荧光相对强度分别是37℃时的1.30、2.38和1.42倍。该研究发现植物乳杆菌的fabZ基因具有低温上调特性,为探究乳酸菌冷激应答与fabZ基因功能机理,以及构建乳酸菌低温诱导表达载体奠定一定的基础。
关键词
乳酸菌
生物信息学分析
启动子
增强绿色荧光蛋白
冷激应答
Keywords
lactic acid bacteria
bioinformatics analysis
promoter
enhanced green fluorescent protein
cold shock response
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
Q936 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
植物乳杆菌CGMCC8198 β-羟脂酰-ACP脱水酶启动子的克隆及其冷激调节作用分析
周成慧
赵阳
王德行
席茂盛
罗学刚
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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