HCV-1b型NS5A区准种变异与干扰素疗效关系的研究

目的：研究丙型肝炎病毒基因1b（HCV－1b）NS5A区准种变异与干扰素疗效的关系。方法：选取HCV一1b型慢性丙型肝炎患者20例，在干扰素治疗前作NS5A区准种变异等测定，并比较其与干扰素疗效的关系。结果：10例干扰素治疗有效组的单链构象多肽性（SSCP）大部分表现为2带（6例），少部分为3带（4例），平均为2．4带；而10例干扰素治疗无效组的SSCP大部分表现为3带（6例），少部分为4带（4例），平均为3．4带。两者比较有极显著差异。结论：干扰素的疗效与NS5A准种变异密切相关，有效组准种变异的程度明显低于无效组，即病人治疗前HCV准种变异较少者，HCV病毒易于被清除。采用SSCP检测HCV－NS5A准种变异以预测丙型肝炎干扰素疗效有一定的实用价值。

HCV-1b型HVR1区准种变异与干扰素疗效的关系

目的研究丙型肝炎病毒基因1b(HCV-1b)HVR1区准种变异与干扰素疗效的关系。方法选取HCV-1b型慢性丙型肝炎患者20例,在干扰素治疗前作HVR1区准种变异测定,同时进行HCV RNA定量分析,比较其与干扰素疗效的关系。结果7例干扰素治疗有效者的异源双链杂交电泳分析大部分<3带,平均为(2.37±0.89)带;而13例干扰素治疗无效者的结果均>3带,平均(4.75±0.92)带;两者比较差异有非常显著性(P<0.01);且准种数量与治疗前HCV RNA水平呈显著正相关(r=0.35,P<0.01)。结论干扰素的疗效与HVR1准种变异密切相关,有效者准种变异的程度明显低于无效者,即患者治疗前HCV准种变异较少者,HCV病毒易于被清除;采用异源双链杂交电泳法(HMA)检测HVR1区准种变异,对预测慢性丙型肝炎干扰素疗效有一定的实用价值。

阿德福韦酯抗乙肝病毒治疗对HBV准种变异的影响分析

目的分析阿德福韦酯抗乙肝病毒治疗对HBV准种变异的影响。方法选取慢性乙型肝炎患者61例,给予阿德福韦酯,分析治疗前后HBV准种变异情况。结果 HBV P区病毒学应答、部分应答、无应答治疗前后波峰数变化不显著;病毒学突破治疗后波峰数明显减少(P<0.05);病毒学应答与病毒学突破治疗前波峰数比较差异显著(P<0.05);病毒学应答与部分应答和无应答治疗前波峰数比较差异显著(P<0.05)。HBV C区病毒学应答、部分应答、无应答和病毒学突破治疗前后波峰数变化均不显著(P>0.05)。结论阿德福韦酯抗乙肝病毒治疗能使HBV准种变异,其中服用阿德福韦酯对P区准种变异的数量影响较大,但阿德福韦酯对其C区的作用效果并不明显。

单基因组扩增法分析HIV-1 CRF103_01B3′半长基因组准种变异特征

目的运用单基因组扩增法(single genome amplification,SGA)分析北京报告的HIV-1 CRF103_01B感染者体内3′半长基因组准种变异特征。方法选择2017—2020年北京新诊断或初始抗病毒治疗病例耐药监测中发现的6例CRF103_01B感染者,提取血浆RNA。采用系列倍比稀释法稀释3′端cDNA,巢式PCR扩增CRF103_01B准种病毒3′半长基因组序列。MEGA 11构建Neighbor-Joining(NJ)系统进化树,计算准种病毒基因距离,Highlighter工具可视化准种病毒遗传变异。利用Simplot 3.5软件对准种序列进行BootScan分析,以分析病毒准种间重组。经Geno2pheno在线工具预测病毒嗜性。结果6例CRF103_01B感染者中有5例经男男性行为感染,共获得144条3′半长基因组SGA序列(19~36条/例)。NJ进化树显示6例感染者3′半长基因组准种变异复杂程度不一。急性期HIV-1感染病例BL4748-00准种病毒变异较小,组内基因距离为0.002±0.000,表现出遗传同质性。BL4981-00、BL3150-00和BL3558-00病例准种病毒分别形成至少3个次级进化簇呈现不同的进化方向,其组内基因距离0.031±0.004≥BL3150-00>BL3558-00>BL4981-00≥0.016±0.002。夫妻BL3022-00(女)和BL3023-00准种病毒序列聚集成大单系进化簇(bootstrap值为100%),后者组内基因距离(0.025±0.003)高于前者(0.019±0.002)。BL3558-00病例存在准种病毒间重组现象。6例感染者的准种病毒均为CCR5嗜性。结论CRF103_01B感染者体内准种变异复杂程度与疾病进展有关,急性期病例表现遗传同质性,慢性期感染病例呈现多个进化方向。未发现共感染或超感染现象,但是部分病例存在准种间重组事件。