目的探究非凋亡调节性细胞死亡基因(non-apoptotic regulatory cell death genes,NARCDs)预测肺腺癌预后的价值及其潜在生物学功能。方法我们下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atla,TCGA)及基因表达综合(Gene Expression Omnibus,G...目的探究非凋亡调节性细胞死亡基因(non-apoptotic regulatory cell death genes,NARCDs)预测肺腺癌预后的价值及其潜在生物学功能。方法我们下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atla,TCGA)及基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中肺腺癌的转录组数据。使用R软件分析在肺腺癌组织和正常组织之间存在差异表达的NARCDs。采用单变量Cox分析和LASSO-Cox回归分析构建NARCDs预后模型。采用生存分析曲线、受试者工作特征曲线、单因素和多因素Cox回归分析评估NARCDs预后模型对肺腺癌预后的预测能力。采用GSVA、GO和KEGG分析NARCDs预后模型的功能富集情况。此外,我们分析了高、低NARCDs评分组间的肿瘤突变负担、肿瘤微环境、肿瘤免疫功能障碍与排斥(Tumor Immune Dysfunction and Exclusion,TIDE)评分和化疗药物敏感性的差异。最后,使用STRING和Cytoscape软件构建NARCDs与免疫相关基因的蛋白-蛋白相互作用网络。结果我们确定了34个与预后相关的差异表达NARCDs,其中16个基因(ATIC、AURKA、CA9、ITGB4、DDIT4、CDK5R1、CAV1、RRM2、GAPDH、SRXN1、NLRC4、GLS2、ADRB2、CX3CL1、GDF15和ADRA1A)被用于构建NARCDs预后模型。NARCDs风险评分是肺腺癌的独立预后因素(P<0.001)。功能分析显示:高NARCDs评分组与低NARCDs评分组间在错配修复、p53信号通路和细胞周期方面存在显著差异(P<0.05)。低NARCD评分组的肿瘤突变负荷较低,免疫评分及TIDE评分较高,对药物的敏感性较低(P<0.05)。此外,蛋白-蛋白相互作用网络的10个关键基因(CXCL5、TLR4、JUN、IL6、CCL2、CXCL2、ILA、IFNG、IL33和GAPDH)均为免疫相关基因。结论基于16个基因构建的NARCDs预后模型是肺腺癌的独立预后因素,其能有效预测患者预后,并为临床治疗提供帮助。展开更多
目的构建p53正向凋亡调节因子重组腺病毒(Ad-PUMA)载体,探讨Ad—PUMA对人体内外胰腺癌的治疗作用。方法利用Ad—Easy系统在大肠杆菌同源重组,构建Ad—PUMA腺病毒载体,在293细胞内成功包装并鉴定后,以Ad-PUMA转染人转移胰腺癌细胞...目的构建p53正向凋亡调节因子重组腺病毒(Ad-PUMA)载体,探讨Ad—PUMA对人体内外胰腺癌的治疗作用。方法利用Ad—Easy系统在大肠杆菌同源重组,构建Ad—PUMA腺病毒载体,在293细胞内成功包装并鉴定后,以Ad-PUMA转染人转移胰腺癌细胞株AsPC-1。用MTT法检测转染前后存活细胞,观察Ad.PUMA的体外抑瘤作用;用Western blot方法鉴定转染前后AsPC-1细胞内PUMA蛋白表达。通过裸鼠皮下胰腺癌移植瘤模型观察Ad-PUMA的体内抑瘤效果;Western blot方法鉴定Ad—PUMA转染后肿瘤组织内PUMA蛋白表达,TUNEL(terminal deoxynucleotidyl transferase biotin—dUTP nick end labeling)法检测肿瘤组织细胞凋亡。结果在体外,随着Ad—PUMA感染剂量增加,细胞内PUMA蛋白表达逐渐增加,细胞存活率逐渐下降;在体内,Ad—PUMA可显著抑制裸鼠皮下肿瘤的生长,其抑瘤率为44.2%,瘤体组织PUMA表达水平及凋亡指数明显升高。结论PUMA抑制体内外胰腺癌细胞增殖,可能是-种潜在的肿瘤生物治疗手段。展开更多
目的观察人脑出血后血肿周围皮质内神经元血红素氧合酶-1(HO-1)与凋亡调节蛋白 Bcl-2的表达规律。方法剖解39例脑出血后不同时间死亡患者的脑组织,自出血灶边缘向外1~3 cm 及出血灶对侧相应部位的脑皮质组织进行取材,出血灶对侧设为对...目的观察人脑出血后血肿周围皮质内神经元血红素氧合酶-1(HO-1)与凋亡调节蛋白 Bcl-2的表达规律。方法剖解39例脑出血后不同时间死亡患者的脑组织,自出血灶边缘向外1~3 cm 及出血灶对侧相应部位的脑皮质组织进行取材,出血灶对侧设为对照组。采用免疫组化技术观察不同时间点出血灶周围 HO-1与 Bel-2的表达和变化规律,实验结果应用 SPSS 11.5软件进行统计学分析。结果 (1)人脑出血2 h 后就有 HO-1的表达,2~10 h 血肿周围神经元 HO-1阳性细胞数开始增加[(5.1±2.0)个/高倍视野],17~30 h 达到高峰[(11.3±0.9)个/高倍视野],120~216 h 后逐渐减弱[(8.6±0.8)个/高倍视野],240~408 h 时仍有 HO-1阳性神经元[(6.4±0.6)个/高倍视野](F=42.80,P<0.001)。对照组没有 HO-1表达。(2)Bcl-2阳性神经元在脑出血2~10 h 后就有表达[(4.2±1.7)个/高倍视野],17~30 h 血肿周围神经元 Bcl-2阳性细胞数开始增加[(6.6±0.5)个/高倍视野],36~96 h 达到高峰[(8.9±1.1)个/高倍视野],240~408 h 后逐渐减弱[(4.7±0.6)个/高倍视野](F=29.59,P<0.001)。对照组没有 Bcl-2阳性神经元的表达。(3)HO-1和 Bcl-2变化规律存在一定相关性(r=0.66,P<0.001)。结论人脑出血后出血灶周围皮质神经元内 HO-1与Bcl-2的表达增加,参与了脑出血后脑保护与脑损伤的作用机制。展开更多
文摘目的探究非凋亡调节性细胞死亡基因(non-apoptotic regulatory cell death genes,NARCDs)预测肺腺癌预后的价值及其潜在生物学功能。方法我们下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atla,TCGA)及基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中肺腺癌的转录组数据。使用R软件分析在肺腺癌组织和正常组织之间存在差异表达的NARCDs。采用单变量Cox分析和LASSO-Cox回归分析构建NARCDs预后模型。采用生存分析曲线、受试者工作特征曲线、单因素和多因素Cox回归分析评估NARCDs预后模型对肺腺癌预后的预测能力。采用GSVA、GO和KEGG分析NARCDs预后模型的功能富集情况。此外,我们分析了高、低NARCDs评分组间的肿瘤突变负担、肿瘤微环境、肿瘤免疫功能障碍与排斥(Tumor Immune Dysfunction and Exclusion,TIDE)评分和化疗药物敏感性的差异。最后,使用STRING和Cytoscape软件构建NARCDs与免疫相关基因的蛋白-蛋白相互作用网络。结果我们确定了34个与预后相关的差异表达NARCDs,其中16个基因(ATIC、AURKA、CA9、ITGB4、DDIT4、CDK5R1、CAV1、RRM2、GAPDH、SRXN1、NLRC4、GLS2、ADRB2、CX3CL1、GDF15和ADRA1A)被用于构建NARCDs预后模型。NARCDs风险评分是肺腺癌的独立预后因素(P<0.001)。功能分析显示:高NARCDs评分组与低NARCDs评分组间在错配修复、p53信号通路和细胞周期方面存在显著差异(P<0.05)。低NARCD评分组的肿瘤突变负荷较低,免疫评分及TIDE评分较高,对药物的敏感性较低(P<0.05)。此外,蛋白-蛋白相互作用网络的10个关键基因(CXCL5、TLR4、JUN、IL6、CCL2、CXCL2、ILA、IFNG、IL33和GAPDH)均为免疫相关基因。结论基于16个基因构建的NARCDs预后模型是肺腺癌的独立预后因素,其能有效预测患者预后,并为临床治疗提供帮助。
文摘目的构建p53正向凋亡调节因子重组腺病毒(Ad-PUMA)载体,探讨Ad—PUMA对人体内外胰腺癌的治疗作用。方法利用Ad—Easy系统在大肠杆菌同源重组,构建Ad—PUMA腺病毒载体,在293细胞内成功包装并鉴定后,以Ad-PUMA转染人转移胰腺癌细胞株AsPC-1。用MTT法检测转染前后存活细胞,观察Ad.PUMA的体外抑瘤作用;用Western blot方法鉴定转染前后AsPC-1细胞内PUMA蛋白表达。通过裸鼠皮下胰腺癌移植瘤模型观察Ad-PUMA的体内抑瘤效果;Western blot方法鉴定Ad—PUMA转染后肿瘤组织内PUMA蛋白表达,TUNEL(terminal deoxynucleotidyl transferase biotin—dUTP nick end labeling)法检测肿瘤组织细胞凋亡。结果在体外,随着Ad—PUMA感染剂量增加,细胞内PUMA蛋白表达逐渐增加,细胞存活率逐渐下降;在体内,Ad—PUMA可显著抑制裸鼠皮下肿瘤的生长,其抑瘤率为44.2%,瘤体组织PUMA表达水平及凋亡指数明显升高。结论PUMA抑制体内外胰腺癌细胞增殖,可能是-种潜在的肿瘤生物治疗手段。
文摘目的观察人脑出血后血肿周围皮质内神经元血红素氧合酶-1(HO-1)与凋亡调节蛋白 Bcl-2的表达规律。方法剖解39例脑出血后不同时间死亡患者的脑组织,自出血灶边缘向外1~3 cm 及出血灶对侧相应部位的脑皮质组织进行取材,出血灶对侧设为对照组。采用免疫组化技术观察不同时间点出血灶周围 HO-1与 Bel-2的表达和变化规律,实验结果应用 SPSS 11.5软件进行统计学分析。结果 (1)人脑出血2 h 后就有 HO-1的表达,2~10 h 血肿周围神经元 HO-1阳性细胞数开始增加[(5.1±2.0)个/高倍视野],17~30 h 达到高峰[(11.3±0.9)个/高倍视野],120~216 h 后逐渐减弱[(8.6±0.8)个/高倍视野],240~408 h 时仍有 HO-1阳性神经元[(6.4±0.6)个/高倍视野](F=42.80,P<0.001)。对照组没有 HO-1表达。(2)Bcl-2阳性神经元在脑出血2~10 h 后就有表达[(4.2±1.7)个/高倍视野],17~30 h 血肿周围神经元 Bcl-2阳性细胞数开始增加[(6.6±0.5)个/高倍视野],36~96 h 达到高峰[(8.9±1.1)个/高倍视野],240~408 h 后逐渐减弱[(4.7±0.6)个/高倍视野](F=29.59,P<0.001)。对照组没有 Bcl-2阳性神经元的表达。(3)HO-1和 Bcl-2变化规律存在一定相关性(r=0.66,P<0.001)。结论人脑出血后出血灶周围皮质神经元内 HO-1与Bcl-2的表达增加,参与了脑出血后脑保护与脑损伤的作用机制。