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四膜虫功能基因组数据库增量更新2016:生活史和减数分裂转录组及磷酸化蛋白组资源建设
被引量:
2
1
作者
杨文涛
张晶
+5 位作者
闫冠雄
田苗
袁冬霞
缪炜
曾宏辉
熊杰
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期1443-1450,共8页
原生动物嗜热四膜虫是一种优良单细胞真核模式生物,以其作为研究对象在基础生物学领域的研究已经取得了一系列突破性的成果。2006年,其大核基因组测序完成并发表,标志着四膜虫的研究进入了功能基因组时代。2013年基于基因芯片、基因网...
原生动物嗜热四膜虫是一种优良单细胞真核模式生物,以其作为研究对象在基础生物学领域的研究已经取得了一系列突破性的成果。2006年,其大核基因组测序完成并发表,标志着四膜虫的研究进入了功能基因组时代。2013年基于基因芯片、基因网络和转录组数据,我们构建了四膜虫功能基因组数据库,其目前已成为模式生物嗜热四膜虫研究的两个重要数据库之一。在过去几年里,随着对四膜虫功能基因组学研究的深入,相关组学数据也实现了一定积累,对这些数据的整合也非常迫切。基于此,我们对四膜虫功能基因组数据库进行了增量更新。更新内容主要包括三个方面:(1)四膜虫生活史不同时期转录组数据;(2)四膜虫接合生殖减数分裂过程转录组数据;(3)磷酸化蛋白组数据。此次增量更新进一步提升和完善了四膜虫功能基因组数据库的内容和功能,对以四膜虫为对象的相关研究工作具有重要作用。
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关键词
四膜虫
四膜虫功能基因
组
数据库
增量更新
生活史
转录
组
减数分裂转录组
磷酸化蛋白
组
原文传递
题名
四膜虫功能基因组数据库增量更新2016:生活史和减数分裂转录组及磷酸化蛋白组资源建设
被引量:
2
1
作者
杨文涛
张晶
闫冠雄
田苗
袁冬霞
缪炜
曾宏辉
熊杰
机构
中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室
中国科学院大学
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期1443-1450,共8页
基金
国家国际科技合作专项项目(No.2013DFG32390)
中国科学院信息化专项科技数据资源整合与共享工程专业数据库项目(XXH12504-3-14)共同资助
文摘
原生动物嗜热四膜虫是一种优良单细胞真核模式生物,以其作为研究对象在基础生物学领域的研究已经取得了一系列突破性的成果。2006年,其大核基因组测序完成并发表,标志着四膜虫的研究进入了功能基因组时代。2013年基于基因芯片、基因网络和转录组数据,我们构建了四膜虫功能基因组数据库,其目前已成为模式生物嗜热四膜虫研究的两个重要数据库之一。在过去几年里,随着对四膜虫功能基因组学研究的深入,相关组学数据也实现了一定积累,对这些数据的整合也非常迫切。基于此,我们对四膜虫功能基因组数据库进行了增量更新。更新内容主要包括三个方面:(1)四膜虫生活史不同时期转录组数据;(2)四膜虫接合生殖减数分裂过程转录组数据;(3)磷酸化蛋白组数据。此次增量更新进一步提升和完善了四膜虫功能基因组数据库的内容和功能,对以四膜虫为对象的相关研究工作具有重要作用。
关键词
四膜虫
四膜虫功能基因
组
数据库
增量更新
生活史
转录
组
减数分裂转录组
磷酸化蛋白
组
Keywords
Tetrahymena thermophila
Tetrahymena functional genome database
Incremental Update
Life cycle transcriptome
Meiosis transcriptome
Phosphoproteome
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
四膜虫功能基因组数据库增量更新2016:生活史和减数分裂转录组及磷酸化蛋白组资源建设
杨文涛
张晶
闫冠雄
田苗
袁冬霞
缪炜
曾宏辉
熊杰
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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