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禾本科植物抗病基因增长的Logistic模型
被引量:
1
1
作者
金玲
王莉
+2 位作者
金殿川
王金朋
张岚
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第12期5277-5283,共7页
运用生物信息学方法对水稻、高粱、二穗短柄草中抗病基因的数据进行分析,估算禾本科物种基因组对抗病基因的最大容纳量和抗病基因的增长率,建立了禾本科抗病基因的Logistic增长模型,并给出了估算原始抗病基因数量N_0的方法,可以用于预...
运用生物信息学方法对水稻、高粱、二穗短柄草中抗病基因的数据进行分析,估算禾本科物种基因组对抗病基因的最大容纳量和抗病基因的增长率,建立了禾本科抗病基因的Logistic增长模型,并给出了估算原始抗病基因数量N_0的方法,可以用于预测不同禾本科物种中抗病基因的增长趋势。利用该模型预测了禾本科物种玉米中抗病基因的增长趋势,得到玉米抗病基因的Logistic增长模型。Logistic模型预测当k_s=0时玉米中抗病基因数量是99,而玉米中实际的抗病基因数量是97,Logistic模型预测的相对误差是2.06%。从玉米抗病基因家族的Logistic增长模型来看,玉米中抗病基因的增长过程分为四个阶段,分别为起步期、迅速增长期、成熟期、饱和期。目前玉米中抗病基因的增长正处于起步期,增长相对较慢,未来抗病基因的增长速度将不断增大,很快将会进入迅速增长期。
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关键词
抗病基因
同源基因
同义替换率
LOGISTIC模型
出生和死亡进化
原文传递
题名
禾本科植物抗病基因增长的Logistic模型
被引量:
1
1
作者
金玲
王莉
金殿川
王金朋
张岚
机构
华北理工大学
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第12期5277-5283,共7页
基金
河北省自然科学基金(C2014209201)资助
文摘
运用生物信息学方法对水稻、高粱、二穗短柄草中抗病基因的数据进行分析,估算禾本科物种基因组对抗病基因的最大容纳量和抗病基因的增长率,建立了禾本科抗病基因的Logistic增长模型,并给出了估算原始抗病基因数量N_0的方法,可以用于预测不同禾本科物种中抗病基因的增长趋势。利用该模型预测了禾本科物种玉米中抗病基因的增长趋势,得到玉米抗病基因的Logistic增长模型。Logistic模型预测当k_s=0时玉米中抗病基因数量是99,而玉米中实际的抗病基因数量是97,Logistic模型预测的相对误差是2.06%。从玉米抗病基因家族的Logistic增长模型来看,玉米中抗病基因的增长过程分为四个阶段,分别为起步期、迅速增长期、成熟期、饱和期。目前玉米中抗病基因的增长正处于起步期,增长相对较慢,未来抗病基因的增长速度将不断增大,很快将会进入迅速增长期。
关键词
抗病基因
同源基因
同义替换率
LOGISTIC模型
出生和死亡进化
Keywords
Disease resistance genes
Homologous gene
Synonymous substitution rate
Logistic model
Birth-and-death evolution
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S432.23 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
禾本科植物抗病基因增长的Logistic模型
金玲
王莉
金殿川
王金朋
张岚
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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参考文献
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