非典-SARS-冠状病毒

2002年11月,一种神秘不明的疾病出现在我国广东省继页肆虐全球,世界上有27个国家和地区相继报道出现这种疫情.

嗜蓝孢孔菌属(Fomitiporia)一新种

【目的】在山西雁北地区沙棘树腐木上采集到了野生嗜蓝孢孔菌属一新菌,研究其新菌的形态学特征、分子系统发育并确定新种。【方法】形态学观察采用肉眼观察标本以及制作Melzer、棉蓝和5%KOH 3种试剂的浮载切片,在显微镜下观察标本形态,分子系统发育分析采用将新种的ITS序列与其他已经报道的20种真菌ITS进行同源聚类分析,构建基于ITS的分子系统发育树。【结果】形态学特征为具有马蹄形担子果,盖状无柄,有时平伏反卷生长,单系菌丝系统;骨架菌丝在Melzer试剂和棉蓝试剂中呈负反应;担孢子近球形或球形,无色,厚壁等。分子系统发育分析结果表明新种与嗜蓝孢孔菌属亲缘关系较近,聚在一个分支中,并在系统发育树中形成了一个独立的亚分枝。【结论】根据研究确认为嗜蓝孢孔菌属新种,定名为Fomitiporia yanbeiensis S.Guo&L.Zhou(登陆号GenBank:KT861405,Fungal name:FN570360)。

石蒜属植物分支系统学分析

基于37个形态学、解剖学、孢粉学和细胞学性状及解剖学性状之外的28个形态学、孢粉学和细胞学性状,分别对石蒜属进行分支系统学分析,试图建立石蒜属种间的系统发育关系。利用PAUP*软件分别构建了最大简约树(MP),所得树的拓扑结构是一致的。同时,基于解剖学9个性状,对石蒜、换锦花、忽地笑、江苏石蒜、长筒石蒜、乳白石蒜、夏水仙、红兰石蒜、安徽石蒜、短蕊石蒜、中国石蒜11个种进行系统发育树构建,其结果也是支持上述系统发育树的。系统发育树结构结果表明,石蒜属16种明显聚为两大类:石蒜、玫瑰石蒜、稻草石蒜和江苏石蒜;广西石蒜、红兰石蒜、换锦花、香石蒜、夏水仙、长筒石蒜、安徽石蒜、中国石蒜、忽地笑、乳白石蒜、短蕊石蒜和陕西石蒜。除换锦花、红兰石蒜及江苏石蒜系统发育位置不同之外,大类群的划分与RAPD指纹图谱基本一致。类群一均属于石蒜亚属(Lycoris亚属)。类群二又可以聚为两小类:广西石蒜、红兰石蒜、换锦花、香石蒜、夏水仙归为一类;长筒石蒜、安徽石蒜、中国石蒜、忽地笑、乳白石蒜、短蕊石蒜和陕西石蒜归为一类。前一子类群除广西石蒜外,都属于整齐花亚属(Symmanthus亚属)。后一子类群除长筒石蒜与安徽石蒜外,均属于石蒜亚属(Lycoris亚属)。因此,花冠整齐与否是一个重要的分类特征,但作为石蒜属植物亚属的划分依据,没有得到本研究支持。而在本文中,雄蕊与花被片的位置关系可以作为大分类群划分依据,能否依此来对石蒜属植物亚属进行划分,仍需探讨。另外研究表明叶微形态特征在研究种间亲缘关系时,具有一定的作用。而在种间亲缘关系鉴定时,出叶期不应成为重要的依据。同时研究还表明中国石蒜与忽地笑具有非常近的亲缘关系,与形态学研究一致。

台湾竹叶青蛇的分类学研究

[目的]研究台湾竹叶青蛇的分类地位。[方法]从GenBank数据库中获得竹叶青蛇属及外群32个个体的400 bp左右的线粒体12S基因序列,并进行同源性分析。在形态学和亲缘地理学分析的基础上,通过构建分子系统发育树,确定台湾竹叶青蛇的分类地位。[结果]从形态学上来看,台湾竹叶青蛇与其他竹叶青属蛇类存在显著差异;从分子系统发育树上来看,台湾竹叶蛇青从竹叶青属独立出来,独成一支;台湾岛与大陆地理上充分隔离,台湾竹叶青蛇独立进化。[结论]台湾竹叶青蛇可能独立成属。

拟盘多毛孢属真菌侵染蓝莓的一个新纪录种:Pestalotiopsis kenyana

实验室前期对来自不同产区的蓝莓病样进行了病原菌的分离及其致病性测定,并根据其形态学特征及ITS序列进行了初步的属水平鉴定。其中,有5株拟盘多毛孢属的真菌在与已报道为害蓝莓的拟盘多毛孢种群进行系统发育树对比分析时,单独形成一个分支。为确定这5株菌的分类地位,采用形态学及分子系统发育法对供试菌株进行了鉴定。结果表明,这5株病原菌均为Pestalotiopsis kenyana,分生孢子大小为(20.7~28.8)μm×(4.7~7.2)μm,中间三色细胞同色,长为13.2~18.0μm,具2~3根顶端附属丝,1根基部附属丝。本研究是P.kenyana为害蓝莓在国内外的首次报道。

Insights into the phylogeny of sporadotrichid ciliates (Protozoa, Ciliophora: Hypotricha) based on genealogical analyses of multiple molecular markers

The sporadotrichid ciliates are an especially diverse group. A number of investigators have studied the morphological, morphogenetic, and molecular relationships among members of this group. Despite this, a consistent classification is still lacking and several important questions about the phylogenetic relationships within this group remain unsolved. To improve our understanding of these relationships, we constructed phylogenetic trees using the nucleotide sequences of the small-subunit rRNA (SSrRNA) gene and amino acid sequences of actin I and α-tubulin. Analyses of SSrRNA gene sequences indicated that: 1) the Sporadotrichida sensu Lynn (2008) and the Oxytrichidae are polyphyletic; 2) the Uroleptus species, which are classified to urostylids, formed a sister group with the oxytrichids; 3) Halteria grandinella, which is grouped morphologically with oligotrich species, clustered within the oxytrichids. These results are congruent with previous studies based on SSrRNA gene sequences. However, the amino acid sequences of actin I and α-tubulin yielded different topologies. The main results are: 1) in all phylogenetic trees, the genus Oxytricha was paraphyletic; 2) Uroleptus was sister to a subset of Urostyla and Holosticha, albeit with low supporting values; 3) Halteria grandinella was separated distantly from the Oxytrichidae in trees inferred from actin I amino acid sequences but clustered with oligotrichids in the α-tubulin analysis. The inconsistency among the trees inferred from these different molecular markers may be caused by rapidly accumulated genetic characterizations of ciliates. Further studies with additional molecular markers and sampling of more taxa are expected to better address the relationships among sporadotrichids.

分离自蔬菜地的腐霉一新种及其rDNAITS序列分析(英文)

从广西南宁收集的蔬菜地土壤样本中,分离得到一个新的腐霉种,命名为广西腐霉Pythium guangxiense。不同于其近似种,广西腐霉的孢子囊球形或亚球形;藏卵器球形、亚球形、椭圆形或囊形;雄器同丝生或异丝生,柄常分枝且缠绕藏卵器。对构成广西腐霉rDNAITS区段的772个碱基进行扩增和测序。在根据ITS序列建立的分子系统发育树中,广西腐霉与禾生腐霉Pythium graminicola、周雄腐霉P.periilum和肿囊腐霉P.inflatum等产生瓣状孢子囊的腐霉种关系密切。对广西腐霉进行了分类描述和其与近似种的比较。