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基础科学研究——北京同步辐射装置生物大分子晶体学光束线与实验站建设成功
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《中国科学院院刊》 2004年第2期114-114,共1页
关键词 基础科学研究 同步辐射装置 生物大分子晶体学 光束线 实验站建设
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3WlA光束线和生物大分子晶体学实验站
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作者 刘鹏 董宇辉 《北京同步辐射装置年报》 2002年第1期23-25,共3页
关键词 3WlA光束线 生物大分子晶体学实验站 基因组 蛋白质 探测器 生命科学
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生物大分子晶体学在药物发现中的应用
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作者 徐琴 周欢 +2 位作者 郁峰 汪启胜 何建华 《药物生物技术》 CAS 2021年第5期513-520,共8页
随着结构生物学自动化程度的提高,通过这一学科提供的详细结构信息在药物发现中得到广泛应用。基于同步辐射的生物大分子X射线晶体学已经被证明是一种结构解析的有力工具,结合药物研发模式的发展,尤其是基于片段的药物研发,使得晶体学... 随着结构生物学自动化程度的提高,通过这一学科提供的详细结构信息在药物发现中得到广泛应用。基于同步辐射的生物大分子X射线晶体学已经被证明是一种结构解析的有力工具,结合药物研发模式的发展,尤其是基于片段的药物研发,使得晶体学结构解析也成为一项筛选技术。该技术能够提供靶标蛋白与小分子片段复合物的结构信息,从而为获得更高的研发效率提供结构基础。文章结合研发模式的进展,具体实例综述了生物大分子X射线晶体学在药物研发中的应用进展。同步辐射装置上的大分子晶体学线站是主要的生物大分子晶体数据采集和结构解析的平台,文章简单介绍了上海光源多条晶体学光束线站性能,晶体学实验步骤,并介绍了自行开发的Aquarium自动处理系统,利用该系统不仅可大幅度提高晶体结构解析的速度,而且由于自动化程度高,极大地降低了晶体学结构解析的技术门槛。文章结合近年来的成功案例进一步说明了基于生物大分子晶体学结构研究技术在药物研发中发挥着越来越重要的作用。 展开更多
关键词 生物大分子晶体学 药物发现 上海光源 同步辐射 基于结构的药物发现 Aquarium自动处理系统
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第17届晶体学大会述评
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作者 王煜明 《国际学术动态》 1997年第6期9-11,共3页
第17届国际晶体学联合会大会于1996年8月8日到17日在美国西雅图举行。与会代表2 200余人。大会检阅了1993年以来世界晶体学研究的最新成就,并选举产生了新的国际晶体学联合会的领导机构。下面列出各分组会的内容。 (1)设备和实验技术。
关键词 晶体学 晶体生长 分子晶体学 分子晶体学
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晶体学的最新发展
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作者 于锡玲 《国际学术动态》 2003年第3期9-11,共3页
第19届国际晶体学代表大会(IUCrⅩⅨ)于2002年8月6日至15日在瑞士日内瓦召开。该会是每3年一次的高水平的国际系列学术盛会,由国际晶体学联合组织(IUCr)发起,以色列晶体学会主办,瑞士晶体学会协办(会议地点原计划在以色列、耶路撒冷召开... 第19届国际晶体学代表大会(IUCrⅩⅨ)于2002年8月6日至15日在瑞士日内瓦召开。该会是每3年一次的高水平的国际系列学术盛会,由国际晶体学联合组织(IUCr)发起,以色列晶体学会主办,瑞士晶体学会协办(会议地点原计划在以色列、耶路撒冷召开,由于9·11事件,国际组委会决定将会址移至日内瓦市)。与会代表1 877名分别来自54个国家,大会接受论文1 715篇,其中大会重点报告34篇,其余分别在95个小型会议和平行进行的墙展会议上演示。中国大陆代表20人,台湾17人,大陆论文20篇,台湾论文17篇,分别在小型会议和墙展会议上演示。 展开更多
关键词 晶体学 有机晶体结构 材料设计 分子晶体学 晶体工程 会议 议题
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基于NSGA-Ⅱ的晶体学光束线多目标自动优化 被引量:2
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作者 张丁 吴盈锋 +3 位作者 何迎花 刘科 汪启胜 何建华 《核技术》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期12-19,共8页
由光束线状态决定的光束质量很大程度上影响着生物大分子晶体学的实验结果,目前上海光源晶体学线站的调光工作是由线站工作人员手动完成,费时费力。上海光源衍射线站采用差分进化算法实现了光束线样品点处光通量的单目标自动优化,但该... 由光束线状态决定的光束质量很大程度上影响着生物大分子晶体学的实验结果,目前上海光源晶体学线站的调光工作是由线站工作人员手动完成,费时费力。上海光源衍射线站采用差分进化算法实现了光束线样品点处光通量的单目标自动优化,但该方案仍然存在一定的局限性。为了进一步完善光束线自动优化方案和提高实验用户的束线机时使用效率,使用Python语言设计开发了基于带精英策略的非支配排序的遗传算法(Non Dominated Sorting Genetic Algorithm-Ⅱ,NSGA-Ⅱ)的多目标优化程序,实现了线站调光自动化技术升级。将该技术应用于上海光源BL10U2线站,以其次级光源点的光束位置和光通量为优化目标,可获得Pareto最优解集,并能从解集中根据实验需要自主选取合适的解。测试结果表明:相较于上海光源已有的自动优化方案,该多目标自动优化程序保证了光束线光束位置和光通量优化在30 min以内完成,进一步提高光束线自动优化效率和水平。 展开更多
关键词 生物大分子晶体学 NSGA-Ⅱ 多目标优化 PARETO最优解集
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国际晶体学联合会第十六届大会在北京举行
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作者 刘惠 郭峰 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 1993年第2期169-172,共4页
国际晶体学联合会第十六届学术大会与会员代表大会(XVI Congress and General As-sembly of International Union of Crystallography,简称IUCrXVI)于1993年8月21日至29日在北京国际会议中心举行。出席大会的共有1200多名代表和298名偕... 国际晶体学联合会第十六届学术大会与会员代表大会(XVI Congress and General As-sembly of International Union of Crystallography,简称IUCrXVI)于1993年8月21日至29日在北京国际会议中心举行。出席大会的共有1200多名代表和298名偕行人员。 展开更多
关键词 晶体学基础 晶体结构 分子晶体学 分组报告 非公度调制结构 配位化合物 日至 卫星会议 中国科技界 晶体生长
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基于LabVIEW的同步辐射生物大分子实验控制系统 被引量:1
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作者 李燕 刘鹏 《工业控制计算机》 2005年第7期76-77,共2页
北京同步福射实验室生物大分子晶体学实验站是我国生命科学研究的重要平台,高效方便的控制系统是其有效运行的重要保证。介绍了根据平台需求开发的基于LabVIEW的实验控制系统。该系统大大简化了各种实验控制操作,提高了实验效率,为实现... 北京同步福射实验室生物大分子晶体学实验站是我国生命科学研究的重要平台,高效方便的控制系统是其有效运行的重要保证。介绍了根据平台需求开发的基于LabVIEW的实验控制系统。该系统大大简化了各种实验控制操作,提高了实验效率,为实现高通量实验需求打下基础。 展开更多
关键词 LABVIEW 同步辐射 生物大分子 控制系统 分子晶体学 异常衍射
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北京同步辐射装置又一重大应用——为生物大分子结构研究提供平台 被引量:3
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作者 刘鹏 《中国科学院院刊》 2004年第1期71-72,共2页
关键词 同步辐射装置 分子结构 生物大分子晶体学 蛋白质结构
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我国重大科学装置“上海光源”完成建设任务
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作者 《化学分析计量》 CAS 2009年第3期64-64,共1页
关键词 大科学装置 上海 光源 生物大分子晶体学 物理研究所 光束线 调试 工程
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科学家破译“组蛋白密码”识别新机制
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《生物学教学》 2014年第8期72-72,共1页
据2014年3月18日《中国科学报》报道,清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组利用上海光源生物大分子晶体学线站,在原子水平上精细阐释了一种肿瘤抑制因子ZMYNDll利用其串联“Bromo-ZnF-PWWP”结构域识别组蛋白变体H3... 据2014年3月18日《中国科学报》报道,清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组利用上海光源生物大分子晶体学线站,在原子水平上精细阐释了一种肿瘤抑制因子ZMYNDll利用其串联“Bromo-ZnF-PWWP”结构域识别组蛋白变体H3.3K36me3修饰的分子机制,其中,ZMYNDll通过识别组蛋白H3.3K36me3修饰,在转录延伸水平抑制肿瘤发生相关基因的过度表达,进而抑制肿瘤发生。相关成果分别在线发表于《自然》和《基因与发育》杂志。 展开更多
关键词 组蛋白密码 分子机制 识别 科学家 生物大分子晶体学 破译 肿瘤发生 相关基因
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Characteristic analysis of photonic crystal resonant cavity in the terahertz region 被引量:1
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作者 ZHOU Rong-mei CHEN He-ming 《Optoelectronics Letters》 EI 2008年第2期99-102,共4页
In this letter, a kind of two-dimensional photonic crystal structure applicable to THz devices is designed, and how to form a microcavity in this structure is discussed. The primary properties of the resonant cavity a... In this letter, a kind of two-dimensional photonic crystal structure applicable to THz devices is designed, and how to form a microcavity in this structure is discussed. The primary properties of the resonant cavity are analyzed, in which plane wave expansion method is used to make the calculation and the simulation. We've studied the variation of the bandgap structure and resonant frequency in THz region by changing the parameters, such as lattice constant, dielectric constant contrast and filling factor. The research results provided theoretical support for manufacturing the THz devices and the application of THz system. 展开更多
关键词 特征分析 光子晶体 空泡 光学
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Molecular Dynamics Simulation of Rutile TiO_2 and Potassium Hexatitanate (K_3Ti_6O_(13)) Crystal 被引量:1
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作者 朱宇 王俊 +2 位作者 陆小华 王延儒 时钧 《Chinese Journal of Chemical Engineering》 SCIE EI CAS CSCD 2003年第2期170-174,共5页
This paper presents the results of molecular dynamics (MD) simulation on the rutile titanium dioxide and potassium hexatitanate (K2O.6TiO2 or K2Ti6O13) crystal. The interaction of atoms is described by two-body centra... This paper presents the results of molecular dynamics (MD) simulation on the rutile titanium dioxide and potassium hexatitanate (K2O.6TiO2 or K2Ti6O13) crystal. The interaction of atoms is described by two-body central force interatomic potential, which includes Coulombic term, Gilbert-type repulsion term, van der Waals term and Morse-type potential. The optimized crystal structure of rutile TiO2 is in very good agreement with the experimental data in the literature. The present MD simulation also gives several physical properties, including volume thermal expansivity and elastic bulk modulus. 展开更多
关键词 molecular dynamics molecular simulation titanium dioxide RUTILE potassium hexatitanate
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Glow Discharge Plasma-Assisted Preparation of Nickel-Based Catalyst for Carbon Dioxide Reforming of Methane
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作者 Fang Guo Wei Chu +1 位作者 Jun-qiang Xu Lin Zhong 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第5期481-486,共6页
A plasma-assisted method was employed to prepare Ni/γ-All2O3 catalyst for carbon dioxide reforming of methane reaction. The novel catalyst possessed higher activity and better coke-suppression performance than those ... A plasma-assisted method was employed to prepare Ni/γ-All2O3 catalyst for carbon dioxide reforming of methane reaction. The novel catalyst possessed higher activity and better coke-suppression performance than those of the conventional calcination catalyst. To achieve the same CH4 conversion, the conventional catalyst needed higher reaction temperature, about 50 ℃ higher than that of the N2 plasma-treated catalyst. After the evaluation test, the deactivation rate of the novel catalyst was 1.7%, compared with 15.2% for the conventional catalyst. Different from the characterization results of the calcined catalyst, a smaller average pore diameter and a higher specific surface area were obtained for the plasma-treated catalyst. The variations of the reduction peak temperatures and areas indicated that the catalyst reducibility was promoted by plasma assistance. The dispersion of nickel was also remarkably improved, which was helpful for controlling the ensemble size of metal atoms on the catalyst surface. The modification effect of plasma- assisted preparation on the surface property of alumina supported catalyst was speculated to account for the concentration increase of absorbed CO2. An enhancement of CO2 adsorption was propitious to the inhibition of carbon formation. The coke amount deposited on plasma treated catalyst was much smaller than that on the conventional catalyst. 展开更多
关键词 Nickel-based catalyst PLASMA CO2 reforming of CH4 COKE Adsorption of CO2
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FABRICATION OF PHOTONIC CRYSTAL WITH SUPERLATTICES
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作者 SUN Cheng Chen Haihua +2 位作者 Zhang Jizhong Wei Hongmei Gu Zhongze 《Chinese Journal of Reactive Polymers》 2006年第2期97-102,共6页
A novel technique was used to fabricate three-dimensional photonic crystals with superlattices. The super structure was fabricated by assembling monodispersed microspheres in the grooves of the scales of morpho butter... A novel technique was used to fabricate three-dimensional photonic crystals with superlattices. The super structure was fabricated by assembling monodispersed microspheres in the grooves of the scales of morpho butterfly, which makes the photonic crystal being composed of two kinds of different photonic structures (natural groove structure of butterfly wing and artificial microspherical colloids arrangement). The superstructural photonic crystal exhibits some unique optical properties different from both the butterfly wing and the colloidal crystal. The approach exhibited here provides a new way for fabricate photonic crystals with superlattices. 展开更多
关键词 Photonic crystal SUPERLATTICE ASSEMBLY Optical properties
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A semi-custom design methodology for design performance optimization
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作者 Dong-ming LV Pei-yong ZHANG +3 位作者 Dan-dan ZHENG Xiao-lang YAN Bo ZHANG Li QUAN 《Journal of Zhejiang University-Science A(Applied Physics & Engineering)》 SCIE EI CAS CSCD 2008年第4期510-516,共7页
We present a semi-custom design methodology based on transistor tuning to optimize the design performance. Compared with other transistor tuning approaches, our tuning process takes the cross-talk effect into account ... We present a semi-custom design methodology based on transistor tuning to optimize the design performance. Compared with other transistor tuning approaches, our tuning process takes the cross-talk effect into account and prominently reduces the complexity for circuit simulation and analysis by decomposing the circuit network utilizing graph theory. Furthermore, the incremental placement and routing for the corresponding transistor tuning in conventional approaches is not required in our methodology, which might induce timing graph variation and additional iterations for design convergence. This methodology combines the flexible automated circuit tuning and physical design tools to provide more opportunities for design optimization throughout the design cycle. 展开更多
关键词 Transistor tuning CROSS-TALK Circuit decomposing
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《自然》《基因与发育》:科学家破译"组蛋白密码"识别新机制
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《现代生物医学进展》 CAS 2014年第16期I0003-I0004,共2页
清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组利用上海光源生物大分子晶体学线站,从结构生物学角度解析组蛋白甲基化修饰识别新机制,进一步揭开了错综复杂的表观遗传调控的神秘面纱。相关成果近期分别在线发表于《自然》和... 清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组利用上海光源生物大分子晶体学线站,从结构生物学角度解析组蛋白甲基化修饰识别新机制,进一步揭开了错综复杂的表观遗传调控的神秘面纱。相关成果近期分别在线发表于《自然》和《基因与发育》杂志。 展开更多
关键词 《自然》 组蛋白密码 机制 识别 发育 基因 科学家 生物大分子晶体学
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上海光源用户发现肌动蛋白7a突变如何导致先天性失聪失明
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《中国科学院院刊》 2011年第2期222-222,共1页
上海光源用户香港科技大学生命科学部讲座教授张明杰及他的研究团队对肌动蛋白7a的突变如何导致先天性失聪失明进行了研究。他们利用在上海光源生物大分子晶体学线站BL17U采集的晶体X光衍射数据,
关键词 肌动蛋白 先天性 光源 上海 失明 突变 用户 生物大分子晶体学
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上海光源用户发现蛋白质复合物催化RNA核糖甲基化的结构机理
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《中国科学院院刊》 2011年第2期223-224,共2页
北京生命科学所叶克穷实验室利用在上海光源生物大分子晶体学线站(BL17U)采集的晶体X光衍射数据.解析了一个加载了底物的完整C/DRNA蛋白质复合物的3.15埃晶体结构。该结构首次显示了这个复杂分子机器的整体组装方式,为“单体”模... 北京生命科学所叶克穷实验室利用在上海光源生物大分子晶体学线站(BL17U)采集的晶体X光衍射数据.解析了一个加载了底物的完整C/DRNA蛋白质复合物的3.15埃晶体结构。该结构首次显示了这个复杂分子机器的整体组装方式,为“单体”模型提供了直接的证据。 展开更多
关键词 蛋白质复合物 结构机理 光源 上海 甲基化 RNA 生物大分子晶体学 核糖
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清华大学李海涛研究团队发现新型乙酰化组蛋白“阅读器”
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《科技成果管理与研究》 2015年第1期11-11,共1页
发现新型组蛋白修饰阅读器一直是表观遗传学领域的研究热点。清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛研究团队利用上海光源生物大分子晶体学线站,解析了2.3埃分辨率的AF9蛋白YEATS结构域与组蛋白H3K9ac修饰多肽复合物的晶体... 发现新型组蛋白修饰阅读器一直是表观遗传学领域的研究热点。清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛研究团队利用上海光源生物大分子晶体学线站,解析了2.3埃分辨率的AF9蛋白YEATS结构域与组蛋白H3K9ac修饰多肽复合物的晶体结构,阐释了该结构域特异识别组蛋白乙酰化修饰的分子机制。研究发现,该结构代表了一种全新折叠类型的组蛋白阅读器。相关研究成果已在国际学术期刊《细胞》上发表。 展开更多
关键词 组蛋白修饰 组蛋白乙酰化 清华大学 阅读器 生物大分子晶体学 结构生物学 国际学术期刊 表观遗传学
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