长沙地区临床分离碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌的分子流行病学特征

目的:了解长沙地区临床分离鲍曼不动杆菌的耐药性,探讨碳青霉烯类抗生素耐药菌株的分子流行病学特征。方法:收集长沙地区10所综合性医院2010年3月至2010年12月间临床分离的非重复鲍曼不动杆菌株205株;采用K-B法检测药物敏感性,改良双纸片协同试验检测金属β-内酰胺酶(金属酶),改良Hodge试验筛查碳青霉烯酶;PCR扩增OXA-23,OXA-24,OXA-51,OXA-58及IMP-1和VIM-2型碳青霉烯酶基因,并进行测序分析。应用肠杆菌科基因间一致重复序列聚合酶链反应(enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR,ERIC-PCR)对菌株进行DNA分型及同源性分析。结果:在监测的18种药物中,耐药率超过50%的达14种。其中哌拉西林耐药率最高(80.5%),头孢哌酮/舒巴坦耐药率最低(2.5%)。共筛选出耐碳青霉烯类药物鲍曼不动杆菌115株,其金属酶表型及基因检测均为阴性;改良Hodge试验阳性71株,其中64株OXA-23基因扩增阳性。115株菌株OXA-51均阳性,未检出OXA-24,OXA-58基因。115株菌株共分为7个ERIC基因型。其中A型19株,B型72株,为主要的流行克隆。结论:长沙地区临床分离鲍曼不动杆菌多重耐药十分严重;产OXA-23和OXA-51型碳青霉烯酶是鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类药物耐药的重要机制,且碳青霉烯类耐药菌株存在克隆流行。

从化市小儿呼吸道人类偏肺病毒感染的临床与分子流行病学特征

目的了解从化市小儿呼吸道人类偏肺病毒(human metapenumovirus,hMPV)感染的临床与分子流行病学特征。方法收集260例6岁以下呼吸道感染患儿分泌物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测hMPV M基因,采用多重PCR检测呼吸道合胞病毒A、B型(RSV-A、RSV-B)、流感病毒甲、乙型(Flu-A、Flu-B)和副流感病毒1、2、3型(PIV-1、PIV-2、PIV-3)。随机挑选7例hMPV阳性PCR产物进行基因测序。结果 260例标本中hMPV阳性21例(8.1%),其中发生混合感染7例(33.3%),hMPV/RSV-A 1例,hMPV/Flu-B 3例,hMPV/PIV-3 3例。2—5月份hMPV检出阳性率高于其他月份,以4月份阳性率最高。21例hMPV阳性患儿,临床表现以咳嗽、喘息、发热、憋气为主。hMPV感染患儿喘息症状及中性粒细胞百分比(%)与PIV-3感染比较差异有统计学意义(P<0.05)。hMPV阳性患儿全部诊断为下呼吸道感染。7例hMPV阳性PCR产物基因序列与GenBank中的序列比对,与HMPVgz01(基因序列编号:GQ153651.1)序列同源性为97%～99%。结论 hMPV是引起小儿下呼吸道感染的一种重要病原体,2—5月份hMPV阳性检出率较高,以4月份最高,临床表现以咳嗽、喘息、发热、憋气为主。7例hMPV阳性PCR产物核酸序列与HMPVgz01(基因序列编号:GQ153651.1)序列同源性为97%～99%。

泉州市成人尖锐湿疣患者HPV感染的分子流行病学特征分析及临床研究

目的探讨泉州成人尖锐湿疣患者人乳头瘤病毒HPV(human papillomavirus)感染的分子流行病学特征分析及临床研究。方法选取2019年1月—2020年1月到我院门诊进行就诊的成人尖锐湿疣患者,共120例,对患者的HPV感染的分子流行病学特征及感染亚型分布情况、感染类型分布情况、不同性别的HPV感染亚型与感染类型分布情况进行观察。结果在120例患者中,共检测出110例HPV-DNA患者,检出率为91.67%;患者主要为低危型HPV感染,排列在前四位的分别为HPV6、HPV11、HPV16、HPV18;在110例患者中,单一感染率最高,其次为二重感染、三重感染与多重感染;男性低危HPV感染率明显较高,女性高危HPV感染率明显较高,二者相比差异具有统计学意义(P<0.05);女性二重或以上感染率明显较高,二者相比差异具有统计学意义(P<0.05)。结论泉州成人尖锐湿疣患者的HPV感染率较高,并且具有不同的分布特点,需要进行有效的明确,以便能够采取针对性的方式进行治疗。

南京市部分地区医院感染鲍曼不动杆菌的耐药基因和分子流行病学研究

目的了解南京市部分地区医院鲍曼不动杆菌的耐药性及基因分型,探讨不同抗菌药物耐药菌株的分子流行病学特征。方法收集南京市部分地区三级甲等医院2015年5月至2016年5月临床分离的75株鲍曼不动杆菌,通过微生物鉴定系统进行鉴定,采用KB法测定菌株的耐药性,通过脉冲场凝胶电泳判断菌株的基因分型,PCR法测定菌株中的耐药基因,并进行流行病学研究。结果 75株鲍曼不动杆菌在检测的16种抗菌药物中,除替加环素、多黏菌素外,对其他抗菌药物的耐药率均较高,其中对头孢吡肟、头孢他啶、头孢噻肟、头孢泊肟、环丙沙星、四环素的耐性率均达到90%以上;菌株主要分为5型,其中A型和B型所占比例分别为42.67%、37.33%;菌株中基因OXA-23、OXA-24、TEM、SHV、CTX-M、IMP-1、IMP-2、VIM-2的阳性携带率分别为81.33%、9.33%、66.67%、10.67%、42.67%、26.67%、16.00%、21.33%。结论南京部分地区医院鲍曼不动杆菌以A、B型株最为流行,且多为多重耐药菌;菌株中携带的主要耐药基因为OXA-23和TEM,可能是导致该菌对碳青霉烯抗菌药物和β-内酰胺类抗菌药物耐药性高的主要机制。

5-脂氧合酶激活蛋白及磷酸二酯酶4D基因多态性与脑梗死易患性的分子流行病学研究

目的:分析5-脂氧合酶激活蛋白(ALOX5AP)及磷酸二酯酶4D(PDE4D)基因多态性与脑梗死(CI)易患性的分子流行病学特征。方法:收集CI患者396例作为病例组,另选取300名健康体检者作为对照组,运用PCR检测技术和基质辅助激光解析分析2组受检者ALOX5AP基因中SG13S89、SG13S114和PDE4D基因中SNP83的多态性,分析ALOX5AP及PDE4D基因多态性与CI的关系。结果:病例组SG13S89中AG基因型、A等位基因频率均高于对照组(P<0.05)。多元logistic逐步回归分析显示,调整年龄、高血压及糖尿病等因素的影响后,SG13S89中AG基因型是增加CI发生的危险性因素(P<0.05);AT型及SAD型CI患者SG13S89基因中的基因型及基因频率差异均无统计学意义(P>0.05);年龄分层后分析发现,女性是增加SG13S89基因中的AG基因型发生脑卒中的危险因素(P<0.05)。结论:SG13S89中的AG基因型和A等位基因使得CI的频率高于其他等位基因,可能的机制是通过介导的血管炎性反应实现,而未发现SG13S114及SNP83基因的多态性与CI有关。

2010-2022年上海市犬狂犬病病毒分子流行病学特征

目的了解上海地区犬狂犬病病毒分子流行病学特征。方法应用狂犬病病毒(RABV)直接免疫荧光法(DFA)对2010—2022年上海市送检的44份犬脑组织标本进行检测,对检测阳性标本进行核蛋白基因序列测定和种系发生分析。结果25份被动监测的样本中RABV阳性率为92.00%(23/25),18份“一犬伤多人”样本阳性率达到94.44%(17/18);23株RABV上海市分离株均属于ChinaⅠ群,分布在全市北部、中部地区,可以分为4个分支,不同分支流行时间相对集中。结论“一犬伤多人”事件的积极监测能有效获得RABV阳性病例,2010—2022年上海市犬狂犬病的流行是ChinaⅠ传播扩散的结果。

两起诺如病毒感染疫情的分子流行病学特征分析

目的了解广州市海珠区2014年5月和2015年3月发生的两起诺如病毒感染性腹泻疫情的分子流行病学特征。方法采用实时荧光RT-PCR检测肛拭子标本中诺如病毒RNA,选取部分阳性标本进行核酸序列测定并进行同源性分析。结果在这两起疫情采集的61份肛拭子标本中,诺如病毒GⅡ型阳性38份。经测序比对后,2014年5月的流感疫情中检测出1株GⅡ-6型和1株GⅡ-9型;2015年3月的流感疫情中检测出2株GⅡ-6型和1株GⅡ-5型。结论广州市海珠区两起疫情存在两种基因型诺如病毒的混合感染。

2009-2012年河北鼠型斑疹伤寒流行概况及实验室调查分析

目的对2009-2012年河北省斑疹伤寒高发地区临床报告病例进行实验室调查分析。方法按我国卫生部《流行性和地方性斑疹伤寒诊断标准》(WS 215-2008)在临床可疑病例高发地区设立哨点监测医院并收集病例。临床病例进行个案登记并进行发病急性期及恢复期血液标本的收集。实验室检测按WHO推荐的立克次体血清学诊断方法-间接免疫荧光法检测病人血清IgM和IgG特异抗体。以急性期血液DNA为模板,采用巢氏PCR扩增斑疹伤寒群立克次体热休克蛋白基因groEL基因并测序。通过NCBI Blast平台同源比较序列并使用DNASTAR软件进行遗传进化分析。结果本次调查在辛集市、定州市和迁安市共收集877例临床报告病例,2009年报告病例数最多(441例),迁安市病例数最多(510例)。急性期血清莫氏立克次体IgM抗体阳性率为72.8%(73/101),IgG阳性率为78.2%(79/101)。12人通过血清IgG抗体4倍升高或降低明确诊断。PCR扩增阳性率为21.7%(22/101),成功测序的17人groEL(209bp)基因100%同源,与其他地区序列存在较大变异,与标准株R.typhi Wilmington(AY191590)核苷酸97.0%,氨基酸只有93.9%同源,进化分析与其他菌株遗传关系较远。结论河北省辛集、定州和迁安地区存在鼠型斑疹伤寒流行。进一步调查传播媒介及宿主对该病的预防控制具有重要公共卫生意义。加强该病临床诊断及鉴别诊断十分必要。

黑龙江省2019年肠炎沙门菌分子流行病学特征分析

目的对2019年黑龙江省食源性疾病监测哨点医院分离的肠炎沙门菌菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)试验,并对其分子流行病学特征进行分析,查找可疑危险因素,为相关部门制定政策和采取防控措施提供参考依据。方法参照《2019年国家食源性疾病监测工作手册》,采用限制性内切酶XbaⅠ对40株肠炎沙门菌开展PFGE分子溯源分析,最后利用BioNumerics软件对PFGE图谱进行聚类分析。结果2019年黑龙江省食源性疾病监测分离的肠炎沙门菌指纹图谱型别相对集中,哈尔滨市、齐齐哈尔市、大庆市、双鸭山市、鹤岗市、大兴安岭地区的菌株谱型相似度较高,均呈现出2019年黑龙江省的肠炎沙门菌优势图谱。结论需要继续对食源性疾病来源的肠炎沙门菌进行监测,重点关注优势谱型肠炎沙门菌的变化趋势,识别和分析肠炎沙门菌的跨区域传播,有效控制暴发,为食源性疾病的防控工作指明方向。

福建省男男同性性行为人群HIV感染状况及分子流行特征研究

目的了解福建省男男同性性行为(men who have sex with men,MSM)人群中人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)HIV-1感染状况,探究其影响因素及分子流行病学特征,为高危人群艾滋病精准防控提供科学依据。方法2021年10月—2023年3月通过福建省某社会组织招募MSM人群,并采集其外周血样本。采用问卷调查MSM主要人口学特征及性行为特征。通过反转录巢式聚合酶链反应(reverse transcription nested polymerase chain reaction,RT-nested PCR)特异性扩增HIV目的基因片段,使用HIV BLAST工具和系统进化树判定病毒亚型,运用美国斯坦福大学艾滋病毒耐药性数据库进行耐药分析。运用卡方检验和多因素logistic回归对MSM人群HIV感染的相关影响因素进行统计分析。结果招募的2077名MSM人群中HIV抗体阳性率为7.75%(161/2077);多因素logistic回归分析显示:年龄>60岁(OR=5.585,95%CI:1.192~26.175)、在本地居住<3个月(OR=2.120,95%CI:1.235~3.637)、最近6个月有与同性发生过肛交性行为(OR=1.849,95%CI:1.141~2.996)、梅毒快检结果阳性(OR=4.444,95%CI:2.779~7.108)是该人群HIV感染的影响因素;HIV-1基因亚型主要以CRF07_BC(50.33%)和CRF01_AE(30.46%)为主,另外检出gag,pol,env 3区亚型分析不完全一致的可疑独特重组亚型(unique recombinant forms,URFs)(19/151,12.58%);传播性耐药率为4.35%(6/138)。结论调查期间福建省MSM人群HIV抗体阳性率较往年数据有下降,传播性耐药率仍呈现低流行水平;但亚型分布情况仍然复杂,并发现传播性耐药株。应进一步加强对MSM人群的HIV-1分子流行病学特征监测,采取精准措施控制HIV-1在MSM人群中传播流行。

水产品中单增李斯特菌的分子流行病学特征与致病力研究

单增李斯特菌是重要的人兽鱼共患食源性病原菌,其中血清型4b最常引起发病。本研究拟探明该菌在国产与进口水产品中的分子流行病学特点与致病力。在3 170份国内水产品中,李斯特菌污染率为2.7%,其中22.2%为单增李斯特菌:血清型1/2a占主导(42.1%),1/2b(31.6%)、4b(15.8%)与1/2c(10.5%)次之。在从5个洲28个国家进口的1 275批水产品中,李斯特菌在8个国家共36批次中被检出,污染率达2.8%,与国内水产品相近;其中单增李斯特菌高达91.7%,4b占主导(65.2%),且有流行克隆Ⅰ和Ⅱ检出;1/2b(17.4%)、1/2a(13.0%)与1/2c(4.4%)次之。智利(31.3%,主要为鱿鱼)、阿根廷(11.5%,主要为鱿鱼)、美国(11.1%,主要为三文鱼与沙丁鱼)的检出率显著高于其他国家(p<0.05)。这些单增李斯特菌水产品分离株均含有较完整的感染相关基因构成,并表现与参考强毒株相当的细胞空斑形成能力与小鼠致病力。由此可见,我国消费者存在因食用水产品而感染李斯特菌的风险,其中进口水产品中李斯特菌的危害风险性更高一筹。

亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌分子流行病学及耐药基因研究

目的探讨岳阳市第一人民医院耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)的分子流行病学特征,以及碳青霉烯酶基因在介导CRAB对碳青霉烯类药物耐药性形成中的作用。方法收集岳阳市第一人民医院分离的CRAB共65株,其中对亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌(IRAB)38株,亚胺培南敏感鲍曼不动杆菌(ISAB)27株。采用琼脂稀释法检测上述细菌对15种抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC),改良Hodge试验筛查碳青霉烯酶;PCR扩增碳青霉烯酶基因;脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析菌株同源性。结果在检测的15种药物中,敏感性最高的药物为多黏菌素B。IRAB与ISAB组除对头孢西丁、多黏菌素B耐药性较一致外,对其他抗菌药物耐药性差异均有统计学意义(P<0.05);改良Hodge试验阳性率为66%(43/65),其中38株IRAB中,阳性36株,27株ISAB中,阳性4株;38株IRAB有32株携带OXA-23基因,ISAB组菌株中均未检测到OXA-23基因;65株菌主要分为6型,A型52株,是主要的流行克隆。结论本院存在CRAB的流行,主要为A型株。OXA-23基因的产生在介导CRAB碳青霉烯药物耐药中发挥作用。

新形势下病毒性胃肠炎的再认识

病毒性胃肠炎(viral gastroenteritis,VG)又称病毒性腹泻,是世界范围内婴幼儿发病和死亡的重要原因.目前,全球VG预防控制的首要目标是减少婴幼儿重症腹泻的发生,降低婴幼儿腹泻死亡率,有效遏制VG在人群中的暴发流行.引起VG的病原有多种,其中两种重要的病原体是轮状病毒(Rotavirus,RV)和诺如病毒(Norovirus,NV).RV是婴幼儿重型腹泻的首要病原,也是VG防控的重点.然而,中国近几年腹泻暴发疫情明显增多,NV作为暴发疫情的首要病原,具有变异快、环境抵抗力强、低剂量感染及传播途径多样性等特点,引起各级政府和群众的普遍关注,成为影响广大人群公共卫生安全的重要问题之一.由于卫生状况的改善对于病毒性腹泻的控制效果甚微,其重要性越发突出.本文就腹泻病毒的病原学和流行特征进行概述,对引起腹泻暴发疫情NV的分子流行病学特征及变异规律进行简要综述,探讨VG防控中面临的主要问题,为VG的防控、临床治疗和疫苗的研究提供启发.

裂谷热研究进展及防制

裂谷热是由裂谷热病毒(Rift Valley Fever Virus,RVFV)引起的一种重要的人兽共患病,对人和动物健康危害巨大。目前RVFV主要在非洲和阿拉伯半岛地区流行,随着我国改革开放的深入,"一带一路"国际合作的推进,与疫区国家间的经贸和交往越来越频繁,RVFV传入我国的风险在加大,需给予特别关注。本文对FVFV的生物学特性、致病机理和分子流行病学特征进行综述,并提出预防和控制建议措施。

Serological and molecular study of hepatitis E virus among illegal blood donors

AIM： To investigate the seroprevalence and molecular characteristics of hepatitis E virus （HEV） in the illegal blood donors （IBDs） of central China in the early 1990s.

广州地区产青霉素酶淋球菌质粒的流行特征

淋病是由淋球菌感染引起的性传播疾病之一,由于其高发病率和高流行率,以及淋球菌对抗菌药物耐药性的持续增加,淋病的流行已成为全球性重大公共卫生问题。2019年中国疾病预防控制信息系统报告淋病病例117938例,位于全国甲乙类传染病报病第4位。质粒介导的产青霉素酶淋球菌(PPNG)因青霉素酶能够催化水解青霉素的β-内酰环产生青霉噻唑酸,导致对该酶不稳定的青霉素类抗菌药物失活。我国各地淋球菌PPNG阳性率为41%~51.79%,为了解广州地区PPNG流行情况及质粒分型特征,更好地监测淋球菌耐药情况,本研究采用多重PCR法和纸片酸度法检测淋球菌临床分离株并进行PPNG基因分型,现报告如下。

副溶血性弧菌Vibrio parahaemolyticus O3:K6大流行克隆的溯源

副溶血性弧菌(Vibrio Parahaemolyticus)是一种革兰氏阴性嗜盐性海洋细菌。1950年从日本一次暴发性食物中毒中首次分离发现。作为一种食源性人鱼共患致病菌,副溶血性弧菌在全球的河口、海洋和沿海广泛传播,由其引起的食物中毒已跃居其它病原菌之首。副溶血性弧菌在进化过程中通过基因重组和基因水平转移逐渐改善其对环境的适应性,因而与其它所有致病微生物相比,副溶血性弧菌的基因型和血清型都具有高度的多样性。本文就副溶血性弧菌,特别是1996年后在世界范围内出现的O3:K6新血清型流行株(形成所谓的O3:K6大流行克隆Pandemic clone)的发现及流行特征、变异分子流行病学特征、在我国的分布及研究进展进行综述,以期为O3:K6大流行克隆的溯源提供更多依据。

承德市2006年麻疹野病毒株的基因分型及流行特点分析

目的研究麻疹病毒分离及其分子流行病学特征。方法对承德市2006年采集的麻疹疑似病例咽拭子标本检测结果和个案资料进行分析。结果2006年河北省疾病预防控制中心麻疹实验室在承德市分离到16株麻疹野病毒,均属H1a基因亚型,16例患者15例采集了血标本,其中11例麻疹IgM抗体阳性(73.33%)。16株病毒来自30～45岁、1～6岁和4～10月龄患者;分布于6个县(区);2例为爆发病例,14例为散发病例;15例为出疹3d内采集的标本。结论承德市2006年流行的麻疹病毒均为H1a基因亚型,与国内流行的麻疹病毒优势基因型一致,为消除麻疹提供了科学依据。