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虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究
被引量:
4
1
作者
周原
梅虎
+3 位作者
杨力
周鹏
杨善彬
李志良
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007年第7期1263-1266,共4页
考虑药物与蛋白质受体的3类非键作用模式,利用8类虚拟原子探针和MonteCarlo随机采样技术,得到了一套新的氨基酸侧链表面静电、立体及疏水势能场(ASSPF)参数.在此基础上对苦味二肽和血管舒缓激五肽进行了结构表征和QSAR研究,所建模型复...
考虑药物与蛋白质受体的3类非键作用模式,利用8类虚拟原子探针和MonteCarlo随机采样技术,得到了一套新的氨基酸侧链表面静电、立体及疏水势能场(ASSPF)参数.在此基础上对苦味二肽和血管舒缓激五肽进行了结构表征和QSAR研究,所建模型复相关系数R2和留一法交互检验复相关系数Q2LOOCV分别为0·8457,0·851和0·7688,0·7952,同时分析了肽链不同位置上氨基酸侧链对活性的影响,取得较好的结果.
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关键词
虚拟原子探针
分子表面随机采样法
氨基酸侧链
表面
势能场描述子
苦味二肽
血管舒缓激五肽
定量构效关系
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职称材料
题名
虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究
被引量:
4
1
作者
周原
梅虎
杨力
周鹏
杨善彬
李志良
机构
湖南工程学院化学化工系
重庆大学化学化工学院
重庆大学生物工程学院
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007年第7期1263-1266,共4页
基金
国家'八六三'计划项目(批准号:2006AA02Z312)
生物力学与组织修复工程创新引智基地(国家111计划)项目
+1 种基金
重庆市应用基础研究基金(批准号:01-3-6)
湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室基金(批准号:2005012)资助
文摘
考虑药物与蛋白质受体的3类非键作用模式,利用8类虚拟原子探针和MonteCarlo随机采样技术,得到了一套新的氨基酸侧链表面静电、立体及疏水势能场(ASSPF)参数.在此基础上对苦味二肽和血管舒缓激五肽进行了结构表征和QSAR研究,所建模型复相关系数R2和留一法交互检验复相关系数Q2LOOCV分别为0·8457,0·851和0·7688,0·7952,同时分析了肽链不同位置上氨基酸侧链对活性的影响,取得较好的结果.
关键词
虚拟原子探针
分子表面随机采样法
氨基酸侧链
表面
势能场描述子
苦味二肽
血管舒缓激五肽
定量构效关系
Keywords
Pseudo atomic probe
Random sampling on molecular surface
Amino acid side chain surface potential field descriptors
Bitter tasting dipeptide(BT)
Bradykinin potenfiaing pentapeptide(BPP)
Quantitative structure-activity relationship(QSAR)
分类号
O657 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究
周原
梅虎
杨力
周鹏
杨善彬
李志良
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2007
4
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职称材料
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