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乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系HA1基因的分子进化研究 被引量:5
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作者 金青青 茅海燕 +4 位作者 孙逸 卢亦愚 冯燕 徐昌平 莫世华 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期366-370,共5页
目的探讨乙型流感病毒两大谱系的进化特征和进化规律。方法从GenBank数据库下载1940—2012年乙型流感病毒流行株共126条,采用贝叶斯-马尔科夫链-蒙特卡洛(Bayesian—MCMC)和分子钟方法,对乙型流感病毒的HA1基因进行系统发育学分... 目的探讨乙型流感病毒两大谱系的进化特征和进化规律。方法从GenBank数据库下载1940—2012年乙型流感病毒流行株共126条,采用贝叶斯-马尔科夫链-蒙特卡洛(Bayesian—MCMC)和分子钟方法,对乙型流感病毒的HA1基因进行系统发育学分析,计算乙型流感病毒两大谱系可能的起源时问与分化时间。结果1978—2010年乙型流感病毒Victoria系与Yamagata系的aa平均差异率为5.4%~10.2%,两谱系的aa差异和组间遗传距离随时问推移呈逐渐增大的趋势。与Victoria系毒株相比,Yamagata系全部毒株的163位aa及部分毒株的166位aa缺失,但是这些年来的乙型流感病毒HA1基因除个别位点外,尚未受到明显的正向选择压力。每年乙型流感病毒HA1基因的碱基替换速率为2.138×10^-3(95%HPD:1.833×10^-3~2.437×10^-3)替代/位点,推算乙型流感病毒Victoria系和Yamagata系的最近共同祖先出现在1971年(95%HPD:1969—1972年),两大谱系的分化时间点分别为1973年(95%HPD:1971—1974年)和1977年(95%HPD:1975—1978年)。结论乙型流感Victoria系和Yamagata系均较以往发生大的变异,且两大谱系的差异日趋增大,将来有可能分化为不同的亚型,在流感监测中应密切关注这一变化及其流行病学意义。 展开更多
关键词 乙型流感病毒 HA1基因 贝叶斯-马尔科夫链-蒙特卡洛方法 分子钟方法 进化
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