中鲤亚属的分支系统学分析(英文)

基于外部形态特征和内部骨骼特征对鲤科鲤属中鲤亚属进行了分支系统学分析。内群包括中鲤亚属的全部 5种和鲤亚属的 2种鱼类 ,外群采用乌原鲤。在鲤属鱼类和外群间共有 4 8个性状存在变化。系统发育分析采用PAUP 软件的Parsimony和Bootstrap两种方式的Branch and Bound算法。排除不能极化的特征和特有离征之后 ,还有 2 8个特征可用 ,由这 2 8个特征可得到唯一的系统树 ,树长 6 9,一致性系数 0 72 4 6 ,排除无用特征的一致性系数 0 6 12 2 ,保留系数 0 6 346。由 5种中鲤组成的中鲤亚属明显不构成一个单系群。结果表明 :中鲤亚属是一个复系群 ,该类元应该被撤销。

石蒜属植物分支系统学分析

基于37个形态学、解剖学、孢粉学和细胞学性状及解剖学性状之外的28个形态学、孢粉学和细胞学性状,分别对石蒜属进行分支系统学分析,试图建立石蒜属种间的系统发育关系。利用PAUP*软件分别构建了最大简约树(MP),所得树的拓扑结构是一致的。同时,基于解剖学9个性状,对石蒜、换锦花、忽地笑、江苏石蒜、长筒石蒜、乳白石蒜、夏水仙、红兰石蒜、安徽石蒜、短蕊石蒜、中国石蒜11个种进行系统发育树构建,其结果也是支持上述系统发育树的。系统发育树结构结果表明,石蒜属16种明显聚为两大类:石蒜、玫瑰石蒜、稻草石蒜和江苏石蒜;广西石蒜、红兰石蒜、换锦花、香石蒜、夏水仙、长筒石蒜、安徽石蒜、中国石蒜、忽地笑、乳白石蒜、短蕊石蒜和陕西石蒜。除换锦花、红兰石蒜及江苏石蒜系统发育位置不同之外,大类群的划分与RAPD指纹图谱基本一致。类群一均属于石蒜亚属(Lycoris亚属)。类群二又可以聚为两小类:广西石蒜、红兰石蒜、换锦花、香石蒜、夏水仙归为一类;长筒石蒜、安徽石蒜、中国石蒜、忽地笑、乳白石蒜、短蕊石蒜和陕西石蒜归为一类。前一子类群除广西石蒜外,都属于整齐花亚属(Symmanthus亚属)。后一子类群除长筒石蒜与安徽石蒜外,均属于石蒜亚属(Lycoris亚属)。因此,花冠整齐与否是一个重要的分类特征,但作为石蒜属植物亚属的划分依据,没有得到本研究支持。而在本文中,雄蕊与花被片的位置关系可以作为大分类群划分依据,能否依此来对石蒜属植物亚属进行划分,仍需探讨。另外研究表明叶微形态特征在研究种间亲缘关系时,具有一定的作用。而在种间亲缘关系鉴定时,出叶期不应成为重要的依据。同时研究还表明中国石蒜与忽地笑具有非常近的亲缘关系,与形态学研究一致。

柳属的分支系统学分析

基于61个广义的形态学性状,以杨属为外类群对柳属进行了分支系统学分析。经简约性分析,得到了21个同等简约的分支树,其严格一致树支持柳属为一个自然的分类群,但不支持将钻天柳属和心叶柳属从柳属中划分出去独立成属,也不支持对柳属进行属级水平上的细分,后两个结果得到孢粉学和分子系统学研究的支持。柳亚属为一个单系分支,皱纹柳亚属和黄花柳亚属也形成了一个单系分支。根据本研究的结果,建议将柳属划分为钻天柳亚属、柳亚属及黄花柳亚属3个亚属。由于较低的靴带支持率,其系统发育关系难于探讨。鉴于分支分析的一致性指数、保持性指数、各分支内部的支持率均不高,柳属的属下分类系统的划分有待进一步的研究。

亚鳞木属及其相关属的分支系统学研究

亚鳞木属被视为中国晚泥盆世的标志性植物大化石之一。分支系统学研究表明 ,亚鳞木属不宜归入传统所认为的原始鳞木目 ,因为它与系统发育上进化的封印木科、鳞木科和奇木科中成员的近共裔性状相似。作者提出该属的新分类系统 :亚鳞木属隶属于亚鳞木科 ,归入广义的水韭目。在当前的分支图中 ,亚鳞木科的系统发育位置处于封印木科和薄皮木科之间 ,这种分支式样表明系统发育上比较进化的木本石松植物并不是在石炭纪突然出现的 ,而是在晚泥盆世 (法门期 )就已经演化。亚鳞木属可能代表了系统发育上比较高级的木本石松的成员或鳞木科 (或奇木科 )的祖先类群之一。

铁线莲属尾叶铁线莲组(毛茛科)基于形态学证据的分支系统学

选取铁线莲属(Clematis)尾叶铁线莲组(sect.Campanella)中37个种以及西南铁线莲组(sect.Bebaeanthera)中的2个种为内类群,以Clematisalternata作为外类群,通过对全世界10个标本馆的近2000份腊叶标本的形态学特征统计,选取了35个性状进行编码,利用PAUP4.0beta10软件进行系统发育重建。通过最简约法(maximumparsimony)分析共得到182棵最简约分支树,树长为182步,一致性指数(CI)=0.385,保持性指数(RI)=0.685。结果表明:(1)尾叶铁线莲组并非是一个单系类群;(2)以花序发生位置这一性状建立的sect.Bebaeanthera不能成立,应并入尾叶铁线莲组;(3)本研究结果不支持在尾叶铁线莲组中建立subsect.Henryianae或ser.Henryianae;(4)C.ranunculoides等萼片外面具纵翅的一群植物与本组中萼片红色的种类C.lasiandra和C.dasyandra有较近的亲缘关系;(5)C.otophora、C.pogonandra、C.repens和C.barbellata等几个种聚为一支,且支持率很高,它们具有一系列的共衍征,即萼片质地较厚,花丝扁平,宽条形,被短柔毛,花药被黄色短毛,药隔先端凸起,因此不支持建立Ser.Pogonandrae;(6)本组中非洲分布的2个种无论从形态上还是从地理分布和生境上都十分特殊,是本组植物的特化类群。

木犀属的分支系统学分析

基于22个广义的形态学性状,对木犀属进行了分支系统学分析,利用PAUP*计算机程序分别构建了最大简约树(MP)和距离树(NJ、UPGMA),所得树的拓扑结构基本一致.基本上支持P.S.Green的经典分类,圆锥花序组聚为一类,管花木犀组、离瓣木犀组和木犀组聚为一类.木犀组又可以分为2个分支:蒙自桂花、毛木犀、齿叶木犀、岛屿木犀、柊树、坛花木犀、毛柄木犀、狭叶木犀、宁波木犀聚为一个分支;野桂花、桂花、网脉木犀、短丝木犀、显脉木犀、细脉木犀、石山桂、高氏锐叶木犀、红柄木犀和锐叶木犀聚为另外一个分支.除了红柄木犀和无脉木犀外,其结果与经典分类完全相同.不过,管花木犀组、离瓣木犀组和木犀组之间的亲缘关系,在本研究中无法确定,需要分子手段进一步研究.

中国大陆白腹鼠属的分支系统发育研究

运用Hennig的分支系统学原理和方法,对分布于中国大陆的白腹鼠属7个种的部分外部及头骨形态学特征进行性状数据分析,结合应用Paup和Hennig 86两种分支系统学软件对它们之间的系统发育关系进行研究。结果表明:安氏白腹鼠N .andersoni和川西白腹鼠N .excelsior亲缘关系较近,二者聚在一起,组成了Musser (1981)的安氏白腹鼠种组N .andersoni Division ;另外刺毛鼠N .fulvescens和褐尾鼠N .cremoriventer的亲缘关系最近,二者先聚在一起,再与社鼠N .confucianus聚在一起,形成了安氏白腹鼠种组的姐妹群;而梵鼠N .brahma是上述5种白腹鼠组成类群的姐妹群,灰腹鼠N .eha则与前6种白腹鼠组成类群互为姐妹群。

分支系统学当前的理论和方法概述及华东地区山胡椒属十二个种的分支系统学研究

本文概述了当前分支系统学研究中涉及的主要理论和方法,包括性状的选取、性状状态和极性的确定、数据矩阵的分析计算、结果分支图的处理、分支图可靠性的评价及分支图的应用。本文同时以华东地区樟科山胡椒属Lindera12个种的分支系统学研究为例,讨论了用形态性状进行分支系统学研究中可能遇到的问题,也揭示了一些分支系统学与传统的系统学在应用性状推导进化关系上的不同点。对这12个种的分支系统学研究得出了一些不同于传统系统学方法所推测的山胡椒属内的系统发育关系,如分支系统学研究显示山胡椒组和球果组很近缘。在严格一致性分支图上,杯托组的黑壳楠和江浙山胡椒分别位于最原始和最进化的分支,表明这个组是复系类群。分支图也显示山胡椒组可能是复系类群。

赖草属植物的表型分支系统学分析

基于21个形态性状,对34个赖草属类群进行了表型分支分析。经简约分析,得到了70颗同等最大简约分支树,其严格一致树显示:①赖草属在形态上为高水平的分化,在组间及种间均存在着广泛的变异,不支持现有的赖草属分组;②北美的赖草属植物与欧亚大陆赖草属植物亲缘关系较远;③L.duthiei、L.duthieivar.longearistatus和L.coreanus与其他赖草植物的亲缘关系较近,支持将其从猬草组合到赖草属中。鉴于性状状态间存在着较多的平行和逆转进化,同时性状状态间的演化可能平行的、多次的或者是特化的,这样复杂的演化关系很难通过简约化的分支分析来重建,结合细胞学和DNA序列分析很可能是必需的。

分支系统学软件PHYLIP系统及其使用

PHYLIP是一个系统发育推断软件。PHYLIP软件由 30个程序组成 ,针对不同的数据 ,采用不同的程序。本文对 PHYLIP软件的输入与输出文件的格式、输入文件的选项、应答选项、建树的策略都作了详细论述。为便于理解 ,文中给出了丰富的例子阐述

基于广义形态学性状对木通科的分支系统学分析

基于 4 3个广义的形态学性状 ,对木通科进行了分支系统学分析。经过简约性分析 ,得到了 6 8个同等简约的分支树。 5 0 %多数规则一致树的分支结构与以前建立的族划分系统基本一致。外类群大血藤属与木通科的勃奎拉藤属形成姐妹群 ,与以前的分支分析结果一致 ,但在分子系统发育树中 ,大血藤属却是整个木通科的姐妹群 ;除此之外 ,形态分支树的结构与分子树的结构差别不大 ,但一致性指数、保持性指数和各分支内部支持率均较低。单型的猫儿屎族和串果藤族位于分支树的基部 ,拉氏藤族与木通族是姐妹群 ,在木通族内 ,长萼木通属和木通属是姐妹群 ,作为一个分支 ;另一分支是PHS (牛藤果属、八月瓜属和野木瓜属 )复合群 ,牛藤果属位于八月瓜属和野木瓜属各类群的基部。但八月瓜属和野木瓜属的属内系统发育关系仍有待进一步研究。

泥盆纪枝蕨纲的分支系统学研究

枝蕨纲是中泥盆世至早石炭世的一个重要的植物类群。作者对枝蕨纲代表植物进行了尝试性的分支系统学研究。枝蕨纲中可识别出伊瑞蕨目、瘤指蕨目和其他一些过渡类型。伊瑞蕨目和瘤指蕨目演化关系密切,二者分别以营养性末级附枝的顶端回弯和具瘤指蕨型的植物体组构为近裔共性。中国中上泥盆统的Metacladophyton和Polypetalophyton比伊瑞蕨目和瘤指蕨目进化程度要高,可能代表枝蕨纲内的一个新的高级分类单元,以具片化的末级附枝及次生生长为特征。伊瑞蕨目和瘤指蕨目出现在中泥盆世,而以Metacladophyton和Polypetalophyton为代表的进化类型出现在中泥盆世晚期至晚泥盆世早期。从伊瑞蕨目、瘤指蕨目到Metacladophyton和Polypetalophyton,侧生分枝系统显示了从三维的枝系统向似羽片状系统逐渐演化的趋势。

分支系统学的外群分析方法中外群性状状态确定的探讨

分支系统学(cladistics)在生物系统学(“分类学”)中已得到广泛的应用,它引起了整个生物系统学理论和方法的巨大变革,且在不断的运用中,其理论和力法得到不断的发展和完善。 Hennig在1953年研究昆虫系统发育的文章中,仍没有讨论性状极性(character polarity)的确定方法,虽然他已明确地认识到单系(monophyly)的确定只能依据离征(apomorphy),只有基于离征建立的系统关系才是真正的系统发育关系(phylogeny)。那么正确地判定祖征(plesiomorphy)和离征就是一个至关重要的问题,也即关系到正确地判定性状极向的问题。极向判定错误,必然导致系统发育关系分析的错误。

分支系统学简评

分支系统学简评冷琴（中国科学院南京地质古生物研究所，南京２１０００８）周巍（南京市玄武区花园路，南京２１００３７）１前言分支（支序）系统学（Ｃｌａｄｉｓｔｉｃｓ，Ｃｌａｄｉｓｔｉｃｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ），又称系统发育分类学（ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ...

运用分支系统学方法对逆珊瑚亚科的修订

运用分支系统学方法，考察有可能归入Ａｎｔｉｐｈｙｌｌｉｎａｅ亚科的各属。根据个体发育极向标准对选取的７个性状进行分析，这７个性状为：主隔壁的长短，主内沟的形状和大小，对隔壁的长短和加厚程度，侧隔壁的长度，一级隔壁的排列，一级隔壁从轴部退缩程度，轴部构造等。据以上各性状在每个属中的表现编制出性状极向数据矩阵，输入计算机运算，得到分支图。并得到以下结果：ＡｎｔｉｐｈｙｌｌｉｎａｅＩｌｉｎａ应包括下列１０属：ＡｃｔｉｎｏｐｈｒｅｎｔｉｓＩｖａｎｏｗｓｋｉ，１９６７；ＦａｌｓｉａｍｐｌｅｘｕｓＦｅｄｏｒｏｗｓｋｉ，１９８７；ＬｏｎｇｉｃｌａｖａＥａｓｔｏｎ，１９６２；ＬｙｔｖｏｌａｓｍａＳｏｓｈｋｉｎａ，１９２５：ＮｅｏｚａｐｈｒｅｎｌｉｓＧｒｏｖｅ，１９３５；ＭｏｎｏｐｈｙｌｌｕｍＦｏｍｉｃｈｅｖ，１９５３：ＦａｓｃｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌｕｍＴｈｏｍｓｏｎ．１８８３：ＢｒａｄｙｐｈｙｌｌｕｍＧｒａｂａｕ．１９２８：ＲｏｔｉｐｈｙｌｌｕｍＨｕｄｓｏｎ，１９４２；ＣｌａｖｉｐｈｙｌｌｕｍＨｕｄｓｏｎ，１９４２。

近代分支系统学的回顾与展望

本文简要介绍分支学近２０年的存在和发展。生物系统学界对求得树系所用方法的讨论由于分支学的出现而变得活跃。广泛的辩论促进了系统学方法的严谨化。分支学已被越来越多的生物系统学家所接受。近年分支学界讨论的内容包括化石在系统学中的作用，简约法则的应用，衡量树系的统计方法，以及如何将分子与形态数据结合等问题。

分支系统学简介

分支系统学是本世纪70年代以来发展起来的一个新的系统学派。本文扼要地介绍了分支系统学的创立、历史和发展,分支系统学的基本概念、特征分析法以及分支系统学的广泛应用给现代生物系统学所带来的广泛影响和冲击。

分支系统固有频率分布规律的探讨

为了快速、简捷地确定固有频率、主振型与结构参数的关系,采用理论分析方法,对分支扭转系统的固有频率分布规律进行了研究。结果表明,固有频率、主振型与结构参数具有简明的关系,可根据结构参数快速、简捷、直观地确定固有频率、主振型。给出了固有频率、主振型计算式和系统具有相同固有频率的条件。算例表明了该计算式的正确性和简捷性。

裸藻类植物的分支系统学研究

本文选取了裸藻类的33个属级分类单位,以及它们的35个性状,利用分支系统学的原理和方法,对性状的演化极性进行了分析,同时对性状间的极性关系进行了和谐性分析,使性状间极性关系处在较为合理的状态,然后建立了分支分析的数据矩阵。应用徐克学建立的“演化极端结合法”进行微机运算,得简约系数远小于1(0.2159)的分支谱系图。根据分支谱系图对裸藻类的系统发育关系进行了探讨,并与已有的关于裸藻类分类系统和演化假设进行了比较。在此基础上按照裸藻类的亲缘关系及单系原则,对裸藻类的分类等级进行了划分,初步提出了建立1门1纲5目的分类系统。按照在分支谱系中的演化地位,认为裸藻属的5个亚属,明显地都应是独立的属。同时对裸藻类的共生起源与演化的关系也进行了讨论。

分支系统学简介

分支系统学简介樊晋江（浙江省医学科学院寄生虫病研究所杭州３１００１３），关键词分支系统学，分支分类，系统发育１９５０年诞生的分支系统学，现在已经发展成为探索生物系统发育的有效工具之一。分支系统学与现代计算机技术的结合形成了新的分支学科─—数值分支系统...