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基于IFC标准的结构动力分析信息扩展框架 被引量:14
1
作者 刘照球 李云贵 +1 位作者 吕西林 张汉义 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第7期122-127,共6页
工程信息交换标准IFC中缺乏对结构动力信息完善的定义和表达.文中通过剖析当前IFC标准的结构信息模型,对其结构分析领域进行评价,分别从几何信息、荷载信息、材料信息、分析结果信息4个方面对结构有限元分析软件SATWE的信息需求和IFC标... 工程信息交换标准IFC中缺乏对结构动力信息完善的定义和表达.文中通过剖析当前IFC标准的结构信息模型,对其结构分析领域进行评价,分别从几何信息、荷载信息、材料信息、分析结果信息4个方面对结构有限元分析软件SATWE的信息需求和IFC标准相应的实体作对比,提出IFC标准结构分析信息模型需要扩展的内容.在遵循IFC标准EXPRESS语言表达规范的情况下全面定义动力荷载(地震作用)信息,描述结构动力分析信息所包含的内容.在EXPRESS-G图中构造和设计结构动力分析信息的基本框架,对IFC标准所支持的结构有限元分析信息进行扩展,为完善IFC标准的结构信息模型提供参考. 展开更多
关键词 IFC标准 SATWE 结构信息模型 动力分析信息 IFC实体扩展
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药物分析信息学的理论研究与实践探索 被引量:2
2
作者 亓云鹏 吴玉田 柴逸峰 《药学服务与研究》 CAS CSCD 2007年第6期408-412,共5页
目的:介绍药物分析信息学的理论和应用。方法:从药物分析信息的解析与挖掘、新型智能化分析仪器的研发、药物分析信息学的最新应用等方面进行阐述。结果:药物分析信息学已取得一定进展,并在分析信息解析、分析仪器智能化、代谢组学研究... 目的:介绍药物分析信息学的理论和应用。方法:从药物分析信息的解析与挖掘、新型智能化分析仪器的研发、药物分析信息学的最新应用等方面进行阐述。结果:药物分析信息学已取得一定进展,并在分析信息解析、分析仪器智能化、代谢组学研究等方面发挥重要作用。结论:药物分析信息学已成为现代药物分析学科中的重要内容。 展开更多
关键词 药物分析信息 分析仪器 代谢组学 综述
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分析信息学的理论基础 被引量:6
3
作者 叶鹰 《情报学报》 CSSCI 北大核心 2000年第4期380-384,共5页
从具体到抽象依次讨论了分析信息学的物理基础、逻辑构成和方法论问题 ,引进了作为分析信息学物理基础的量间概念并由此说明信息物理学必然隐含“对称性破缺” ,推得系统中信息与能量成正比而与温度成反比 ,解释了分析信息学的逻辑构成 。
关键词 分析信息 信息物理学 信息 信息
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基于深度语义分析信息库的“来”用法研究
4
作者 李安然 《文教资料》 2012年第33期162-164,共3页
现代汉语中“来”的使用频率极高,在词类及句法方面也富有特点。由于其特殊的语法地位与灵活的语义用法,对“来”的研究一直是句法语义和对外汉语教学研究的热点。本文基于深度语义分析信息库对“来”的11种不同用法进行了定性分析和... 现代汉语中“来”的使用频率极高,在词类及句法方面也富有特点。由于其特殊的语法地位与灵活的语义用法,对“来”的研究一直是句法语义和对外汉语教学研究的热点。本文基于深度语义分析信息库对“来”的11种不同用法进行了定性分析和定量统计,归纳了“来”在现代汉语中运用时的规律和特点。 展开更多
关键词 现代汉语 “来” 深度语义分析信息 语义句法
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生物高考视野下获取分析信息能力的培养与教学思考 被引量:1
5
作者 商文 《中学生物学》 2018年第11期52-54,共3页
在高中生物教学中,通过充分挖掘教材、适当补充教材相关知识、训练做信息题的程序等方式,以提高学生获取分析信息的能力。
关键词 生物高考 获取信息能力 分析信息能力
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论财务分析信息系统 被引量:1
6
作者 丘林 《枣庄师专学报》 2001年第4期85-87,共3页
会计的本质是一个经济信息系统 ,而财务分析作为会计活动的组成部分 ,符合会计本质的基本特征 ,同时 ,财务分析本身符合信息论和系统论的特点 .所以 。
关键词 财务分析信息系统 企业 构成要素 财务报告体系 财务分析方法 创新
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浅谈国企数据统计分析信息化建设 被引量:1
7
作者 宋超 《安徽电子信息职业技术学院学报》 2022年第2期102-106,共5页
快速、精准地挖掘数据,充分发挥数据价值,增强核心竞争力,为管理者决策提供及时、综合、完整和有效的信息数据支撑和依据,已成为现代国企数据统计分析信息化建设的重要任务,信息化程度高的数据统计分析能为科研论证提供数据支撑,能深入... 快速、精准地挖掘数据,充分发挥数据价值,增强核心竞争力,为管理者决策提供及时、综合、完整和有效的信息数据支撑和依据,已成为现代国企数据统计分析信息化建设的重要任务,信息化程度高的数据统计分析能为科研论证提供数据支撑,能深入监测和反馈各个层级执行的成效,并可以在真实全面反馈经营状况、防范经营风险、提质增效等方面发挥作用。结合数据统计分析工作的重要性,分析信息化对其的影响。 展开更多
关键词 数据统计分析信息 信息化建设 相关措施
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“试卷及学生学习情况分析信息系统”的数学模型及设计
8
作者 张卫平 高振寰 +1 位作者 孙萍 郑建芸 《云南电大学报》 2005年第2期22-24,共3页
教学信息反馈是保证远程教育教学质量的一个重要环节。“试卷及学生学习情况分析信息系统”的设计目标是收集学生的答题信息,根据S—P数学模型对答题信息进行多种处理,并将结果报告给教师,教师可获得并及时向学生提供反馈信息,诊断教学... 教学信息反馈是保证远程教育教学质量的一个重要环节。“试卷及学生学习情况分析信息系统”的设计目标是收集学生的答题信息,根据S—P数学模型对答题信息进行多种处理,并将结果报告给教师,教师可获得并及时向学生提供反馈信息,诊断教学问题。系统的基本构成包括3部分:输入、反馈器、数据处理器和接口。 展开更多
关键词 试卷信息分析 学习情况分析 S-P模型
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基于电力大数据分析信息的系统研究
9
作者 周炼 邓春红 《华东科技(综合)》 2020年第8期316-316,共1页
本文针对电力大数据日志分析模块儿的信息系统进行了具体的分析和详细的研究,并相应地得出一种全新的位置攻击识别算法,通过该算法的具体应用,能够有效的确定信息系统服务是否存在相关问题,断定具体文件是否被通过非法手段进行修正和篡... 本文针对电力大数据日志分析模块儿的信息系统进行了具体的分析和详细的研究,并相应地得出一种全新的位置攻击识别算法,通过该算法的具体应用,能够有效的确定信息系统服务是否存在相关问题,断定具体文件是否被通过非法手段进行修正和篡改等关联问题。在这种算法的应用基础上,可以具体实现信息系统运行态势感知和全息智能处理系统,通过具体的实验显示,这种算法在很大程度上能够确保系统在正常情况下运行,并且能够针对日志的具体分析能力提高显著效率。 展开更多
关键词 电力 大数据 分析信息 系统研究
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基于IFC标准的ANSYS结构静力分析信息的表达与扩展机制研究
10
作者 刘彦凯 张光利 《青海大学学报(自然科学版)》 2019年第2期78-84,99,共8页
针对工业基础类(IFC)标准中缺少对结构静力分析信息完善定义和描述的问题,文中对IFC标准中结构信息模型进行了研究,分别从分析环境、材料属性、几何构造、加载求解和分析结果5个方面将ANSYS结构静力分析信息需求和IFC标准中结构分析实... 针对工业基础类(IFC)标准中缺少对结构静力分析信息完善定义和描述的问题,文中对IFC标准中结构信息模型进行了研究,分别从分析环境、材料属性、几何构造、加载求解和分析结果5个方面将ANSYS结构静力分析信息需求和IFC标准中结构分析实体进行对比,总结出结构信息模型需要扩展的内容,并通过自定义实体类型方法在IFC标准中进行信息扩展,构建出一个面向ANSYS的结构静力分析模型,最后,给出具体实例验证其内容的真实性和有效性。本研究实现了在IFC标准中对结构静力分析信息的扩展、存储与表达,所创建的模型可在ANSYS中进行结构静力分析。 展开更多
关键词 建筑信息模型 工业基础类 ANSYS 结构静力分析信息 IFC扩展机制
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科技评价中因子分析信息损失的改进 被引量:6
11
作者 俞立平 郭强华 张再杰 《统计与决策》 CSSCI 北大核心 2019年第5期5-10,共6页
在科技评价中,因子分析是非常重要的评价方法之一,但是存在着牺牲原始数据信息的缺陷。文章提出了采用全部公共因子评价的完全信息因子分析法,以及采用可解释公共因子的最大信息因子分析方法。基于JCR2015经济学期刊的研究表明:因子分... 在科技评价中,因子分析是非常重要的评价方法之一,但是存在着牺牲原始数据信息的缺陷。文章提出了采用全部公共因子评价的完全信息因子分析法,以及采用可解释公共因子的最大信息因子分析方法。基于JCR2015经济学期刊的研究表明:因子分析法评价会损失原始数据的大量信息;完全信息因子分析评价弥补了因子分析评价的不足;因子分析评价与完全信息因子分析评价相比虽然相关度较高但排序相差较大;最大信息因子分析最大限度保留了原始数据中的信息,评价结果与完全信息因子分析高度相关并且基本一致,而且方便主观赋权,克服了完全信息因子分析完全进行客观赋权的不足,可根据需要灵活选择完全信息因子分析方法或最大信息因子分析方法进行评价;在使用传统因子分析时应该重分析轻评价,以分析为主。 展开更多
关键词 科技评价 因子分析 完全信息因子分析评价 最大信息因子分析评价
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国库统计分析信息质量特征研究
12
作者 杨重阳 刘莉莉 祝力 《金融与经济》 北大核心 2012年第11期87-89,共3页
国库统计分析是人民银行经理国库职能的重要组成部分,其作用的发挥有赖于提供信息的质量高低,本文运用基本会计理论,从更好地履行人民银行经理国库责任出发,站在有利于满足信息需求者的视角,提出了国库统计分析信息质量特征体系。
关键词 国库统计 信息分析 研究
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数智时代的信息分析方法:数据驱动、知识驱动及融合驱动 被引量:6
13
作者 卢小宾 霍帆帆 +1 位作者 王壮 霍朝光 《中国图书馆学报》 北大核心 2024年第1期29-44,共16页
数智时代,面对大数据、大知识所带来的挑战,如何创新发展信息分析方法,关乎新时代信息分析工作的开展,关乎数据资源的开发利用。本文在梳理现有信息分析方法的基础上,提出数据驱动、知识驱动,以及数据与知识融合驱动的三种数智型方法思... 数智时代,面对大数据、大知识所带来的挑战,如何创新发展信息分析方法,关乎新时代信息分析工作的开展,关乎数据资源的开发利用。本文在梳理现有信息分析方法的基础上,提出数据驱动、知识驱动,以及数据与知识融合驱动的三种数智型方法思路。首先,提出基于文本、网络、音频、图像等的数据驱动以及与之相应的文本挖掘、图挖掘、音频挖掘、图像挖掘等信息分析模式;其次,提出基于专家知识库、通用知识库、领域知识图谱、通用知识图谱等的知识驱动信息分析模式;最后,提出基于特征、模型、决策三种层面的数据与知识融合驱动的信息分析模式。通过以上三种方法,构建能够系统融合大数据、大知识的信息分析方法,实现数智融合型信息分析,促进图书情报学科方法论发展,赋能国家决策和社会治理。图3。表1。参考文献59。 展开更多
关键词 信息分析 数智时代 数据驱动 知识驱动 融合驱动
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基于专利信息的全球生物质制氢技术情报分析及我国发展对策研究 被引量:1
14
作者 叶春蕾 王丹 《中国发明与专利》 2024年第4期43-48,80,共7页
为对全球生物质制氢技术领域专利信息进行全面、深入的分析,探究该领域的研究热点,本文基于incoPat全球专利数据库,对2023年之前收录的生物质制氢领域相关专利数据进行系统性分析,总结全球生物质制氢研究总体发展趋势、主要研发机构及... 为对全球生物质制氢技术领域专利信息进行全面、深入的分析,探究该领域的研究热点,本文基于incoPat全球专利数据库,对2023年之前收录的生物质制氢领域相关专利数据进行系统性分析,总结全球生物质制氢研究总体发展趋势、主要研发机构及技术研发热点,对国内外主要研发机构进行竞争力分析,并对我国生物质制氢技术研究的发展提出一定的展望。 展开更多
关键词 生物质制氢 专利信息分析 incoPat
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血管样本生物信息学分析鉴定烟雾病相关的潜在关键基因
15
作者 刘洋 杨俊华 +1 位作者 吴俊 王硕 《中国卒中杂志》 北大核心 2024年第4期431-439,共9页
目的本研究对烟雾病患者血管样本的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学鉴定和分析,旨在探讨烟雾病的潜在发病机制。方法本研究以烟雾病和颈内动脉瘤患者大脑血管样本为研究对象。利用R语言线性模型微阵... 目的本研究对烟雾病患者血管样本的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学鉴定和分析,旨在探讨烟雾病的潜在发病机制。方法本研究以烟雾病和颈内动脉瘤患者大脑血管样本为研究对象。利用R语言线性模型微阵列数据(linear models for microarray data,limma)分析包对基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中的GSE141025数据集进行分析,该数据集涵盖4例烟雾病患者和4例颈内动脉瘤患者的大脑中动脉和颞浅动脉样本各1个,共计16个样本。选择烟雾病患者的大脑中动脉、颞浅动脉及颈内动脉瘤患者的颞浅动脉共12个样本进行DEGs筛选。通过R语言功能富集分析工具包clusterProfiler,对筛选出的DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(proteinprotein interaction,PPI)网络,并使用网络可视化软件Cytoscape进行蛋白质网络的可视化和枢纽基因筛选。结果本研究在烟雾病患者的大脑中动脉与颞浅动脉样本间鉴定出138个DEGs,包括18个上调基因和120个下调基因。GO富集分析显示,以上DEGs在细胞外基质、受体配体活性和生长因子活性等方面显著富集,可能与烟雾病相关的血管病变和神经保护机制有关。KEGG通路分析提示,DEGs主要在酪氨酸代谢通路中富集。通过PPI网络分析,共筛选出9个枢纽基因,包括骨膜蛋白(periostin,POSTN)、脑源性神经营养因子(brain derived neurotrophic factor,BDNF)、血小板衍生生长因子受体α(platelet derived growth factor receptor alpha,PDGFRA)、Thy-1细胞表面抗原(Thy-1 cell surface antigen,THY1)、ⅩⅤ型胶原蛋白α1链(collagen typeⅩⅤalpha 1 chain,COL15A1)、成纤维细胞生长因子7(fibroblast growth factor 7,FGF7)、光蛋白聚糖(l umi can,LUM)、层粘连蛋白α2亚基(laminin subunit alpha 2,LAMA2)和RELN(reelin)。此外,上调基因delta样典型Notch配体4(delta like canonical Notch ligand 4,DLL4)在本研究中首次被发现可能在烟雾病中扮演重要角色,或与烟雾病的病理性血管生成有关。结论细胞外基质、生长因子及其受体的表达失调等可能参与烟雾病的发病过程。DEGs分析筛选出的枢纽基因(POSTN、BDNF、PDGFRA、THY1、COL15A1、FGF7、LUM、LAMA2、RELN)以及DLL4可能在烟雾病的病理形成过程中发挥作用。 展开更多
关键词 烟雾病 生物信息分析 基因表达数据 枢纽基因
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穿心莲糖苷水解酶基因ApGH的克隆、生物信息学分析及表达研究
16
作者 李媛 任广喜 +4 位作者 康颖泉 王迷娜 范勇 姜丹 刘春生 《中国现代中药》 CAS 2024年第7期1141-1149,共9页
目的:对穿心莲糖苷水解酶(ApGH)基因进行克隆、生物信息学分析、原核表达和相对表达量分析。方法:取穿心莲新鲜叶片,提取RNA并反转录为互补脱氧核糖核酸(cDNA)作为模板,以穿心莲转录组中筛选到的糖苷水解酶ApGH基因开放阅读框(ORF)设计... 目的:对穿心莲糖苷水解酶(ApGH)基因进行克隆、生物信息学分析、原核表达和相对表达量分析。方法:取穿心莲新鲜叶片,提取RNA并反转录为互补脱氧核糖核酸(cDNA)作为模板,以穿心莲转录组中筛选到的糖苷水解酶ApGH基因开放阅读框(ORF)设计特异性引物,进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,经测序后获得的基因序列利用生物信息学软件预测基因编码蛋白特征,构建原核表达载体在大肠埃希菌中诱导表达目的蛋白质,并利用实时荧光定量PCR分析ApGH基因的表达模式。结果:克隆所得ApGH基因的ORF全长1734 bp,编码577个氨基酸(GenBank登录号:OR887606)。ApGH为稳定亲水蛋白质,无信号肽和跨膜结构域,属于糖苷水解酶家族;系统进化分析表明,ApGH归属于GH1家族。将ApGH基因构建到原核表达载体HIS-MBP-pET28a上,在大肠埃希菌Transetta(DE3)中成功表达出重组蛋白质。实时荧光定量PCR检测结果表明,ApGH基因在叶中表达量最高,茎和根中表达量较低。结论:克隆得到穿心莲ApGH基因并对其蛋白质序列特征进行了系统分析,证明其在大肠埃希菌中成功表达重组蛋白质,且主要在穿心莲叶中表达。研究结果为进一步探索穿心莲糖苷水解酶的催化功能提供了依据。 展开更多
关键词 穿心莲 糖苷水解酶 基因克隆 生物信息分析 基因表达
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荔枝蒂蛀虫海藻糖酶基因克隆及生物信息学分析
17
作者 姚琼 梁展图 +3 位作者 段双刚 董易之 徐淑 李文景 《广东农业科学》 CAS 2024年第6期13-21,共9页
【目的】海藻糖酶(Trehalase,Tre)是昆虫体内海藻糖代谢的关键酶,通过专一性地将海藻糖分解为葡萄糖,在昆虫能量代谢和生长发育中发挥着重要的作用。旨在克隆荔枝蒂蛀虫(Conopomorpha sinensis Bradley)可溶型海藻糖酶基因(CsTre1)和膜... 【目的】海藻糖酶(Trehalase,Tre)是昆虫体内海藻糖代谢的关键酶,通过专一性地将海藻糖分解为葡萄糖,在昆虫能量代谢和生长发育中发挥着重要的作用。旨在克隆荔枝蒂蛀虫(Conopomorpha sinensis Bradley)可溶型海藻糖酶基因(CsTre1)和膜结合型海藻糖酶基因(CsTre2),探讨其在荔枝蒂蛀虫不同发育阶段和不同组织中的表达模式,解析这2个基因及其酶蛋白的分子特征。【方法】利用荔枝蒂蛀虫转录组数据和RACE技术,克隆CsTre1和CsTre2的全长cDNA序列,并应用ORF Finder、ProtParam、SignalP 4.1、ProtScale、NetPhos2.0 Server和IQ-TREE等软件对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析CsTre1和CsTre2在荔枝蒂蛀虫不同发育阶段及成虫不同组织的mRNA表达模式。【结果】CsTre1的开放阅读框(ORF)长1701 bp,编码566个氨基酸,蛋白分子量为64.53 kD。CsTre2的ORF长1821 bp,编码606个氨基酸,蛋白分子量为69.08 kD。信号肽预测分析表明,CsTre1和CsTre2前端均有1个信号肽,其位置分别为1-16和1-17。蛋白二级结构分析结果显示,二者均主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,CsTre1有24个Ser、15个Tyr、10个Thr可能成为蛋白激酶的结合位点,而CsTre2有27个Ser、10个Tyr、13个Thr可能成为蛋白激酶的结合位点。RT-qPCR结果显示,CsTre在荔枝蒂蛀虫的蛹和成虫期均有表达。在成虫期中,CsTre1的表达水平远高于CsTre2,且CsTre1在雄成虫第2 d和第5 d的表达水平陡然下降,在雌成虫中则保持稳定高表达。【结论】该研究成功克隆了荔枝蒂蛀虫的2个海藻糖酶基因,其分子特征及表达模式结果表明,CsTre1可能是荔枝蒂蛀虫主要调控海藻糖代谢的基因。研究结果可为阐明海藻糖酶基因的功能提供重要线索,为开展害虫防治策略的研究奠定基础。 展开更多
关键词 海藻糖酶 基因克隆 生物信息分析 荔枝蒂蛀虫 表达模式
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高邮鸭Akt1基因克隆及生物信息学分析
18
作者 李小芬 朱睿 +2 位作者 宋易霖 田维婷 张蕾 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第10期1-7,共7页
Akt1是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族基因,通过响应生长因子刺激磷酸化一系列下游底物来调节许多过程,包括代谢、增殖、细胞存活、生长和血管生成等。实验室前期对全转录组差异分析获得了与高邮鸭双黄蛋率显著相关的候选关键基因Akt1,并且A... Akt1是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族基因,通过响应生长因子刺激磷酸化一系列下游底物来调节许多过程,包括代谢、增殖、细胞存活、生长和血管生成等。实验室前期对全转录组差异分析获得了与高邮鸭双黄蛋率显著相关的候选关键基因Akt1,并且Akt1显著富集于差异表达信号通路——PI3K-AKT信号通路。为了对高邮鸭双黄蛋候选基因Akt1进行系统的功能研究,本研究通过PCR技术克隆高邮鸭卵巢组织Akt1全长,构建了Akt1-EGFP融合表达载体,结合生物信息学技术对AKT1蛋白的理化性质进行系统分析。结果:AKT1为种间保守型非分泌蛋白,表达于质膜,具有丰富的丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点,可与10种蛋白(TSC1、MAPK1、PIK3R1、PIK3CA、TSC2、CDKN1A、IKBKB、PIK3CD、PDPK1和ILK)发生互相作用。研究结果为揭示Akt1基因编码的蛋白在调控高邮鸭双黄蛋形成过程中的功能和分子机制提供理论基础。 展开更多
关键词 高邮鸭 双黄蛋 Akt1基因 克隆 生物信息分析
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双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析
19
作者 刘翔 赵紫璇 +5 位作者 赵月盈 赵诗睿 贾子怡 姜含越 袁帅 孟德梅 《食品研究与开发》 CAS 2024年第2期185-194,共10页
MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)... MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)MYB转录因子的基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明,该基因编码区长1209 bp,翻译402个氨基酸;编码的蛋白分子量为45.95 kDa,等电点9.17,是一种不存在跨膜结构、不含信号肽的亲水性蛋白,具有4个高度保守的SANT结构域,属于4R型MYB转录因子,与白环蘑(Leucoagaricus)中的4RMYB转录因子亲缘关系最近;二级结构预测显示以无规则卷曲和α-螺旋结构为主;亚细胞定位分析显示该转录因子位于细胞核中;此外启动子序列分析表明,该基因启动子区域含有多个与生物抗逆应答、激素响应等相关的顺式作用元件。 展开更多
关键词 双孢蘑菇 MYB转录因子 基因克隆 生物信息分析 保守结构域
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辣椒蔗糖转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析
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作者 李宁 尹延旭 +3 位作者 王畅 王飞 姚明华 范书云 《辣椒杂志》 2024年第2期13-21,共9页
蔗糖转运蛋白(sucrose uptake transporters,SUTs)调控蔗糖的运输和分配,在植物的发育和胁迫响应方面发挥作用。为探究辣椒中CaSUTs基因家族成员的功能,利用同源性搜索在辣椒基因组中鉴定到4个蔗糖转运蛋白基因。通过生物信息学手段分... 蔗糖转运蛋白(sucrose uptake transporters,SUTs)调控蔗糖的运输和分配,在植物的发育和胁迫响应方面发挥作用。为探究辣椒中CaSUTs基因家族成员的功能,利用同源性搜索在辣椒基因组中鉴定到4个蔗糖转运蛋白基因。通过生物信息学手段分析研究了CaSUTs基因结构、系统发育关系和基因表达等。研究发现,CaSUTs蛋白分子量在12.47~65.56 kDa之间,理论等电点在6.00~9.32之间,均被定位在细胞膜上。根据系统发育将辣椒、番茄和拟南芥SUTs蛋白划分为4个进化分支。辣椒表达谱分析表明,CaSUTs基因在不同组织和不同处理下存在差异表达,说明CaSUTs基因具有组织特异性,在激素和胁迫处理中发挥重要作用。对辣椒材料‘XWHJ-M’的qPCR分析表明,CaSUTs基因显著受低温和盐胁迫诱导,推测CaSUTs基因家族成员可能在响应非生物胁迫中发挥作用。 展开更多
关键词 辣椒 SUTs家族 生物信息分析
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