1株牛蛙源贝莱斯芽孢杆菌的分离、鉴定及其生物学特性分析

试验从健康牛蛙(Rana catesbiana)肠道内容物中分离出12株内源菌,筛选对牛蛙病源性嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)、铜绿假单胞菌(seudomonas aeruginosa)的拮抗菌株后对其生物学特性进行分析,发现其中1株菌对蛙源嗜水气单胞菌、铜绿假单胞抑制效果最好,抑菌圈直径分别为12 mm和14 mm。通过革兰氏染色镜检、生理生化、16S rRNA鉴定、药物敏感性、生物学特性如菌液接种量、培养温度、转速、初始pH、生长特性等生物学特性进行分析。确定该菌株为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis),并取名为G1。此菌株在LB培养基上菌落呈乳白色,向上凸起,表面湿润、光滑、不透明、有黏液性,是革兰氏阳性菌。菌液最适接种量为3%、培养温度为30℃、培养转速为180 r/min、初始pH为7和培养时间为18 h。

一株裂解耐氨苄西林金黄色葡萄球菌的噬菌体及其生物学特性与全基因组分析

本研究旨在分离能够高效裂解耐药金黄色葡萄球菌的噬菌体,为噬菌体生物制品的研制提供候选材料。以耐氨苄西林金黄色葡萄球菌为宿主菌,用双层平板法分离噬菌体,通过透射电子显微镜观察噬菌体形态,并对其进行生物学特性分析及全基因组测序分析。结果分离得到一株金黄色葡萄球菌噬菌体,效价达2.75×10^(10)PFU/mL,命名为SP688。该噬菌体具有长的不收缩尾巴,属长尾噬菌体科,对7株耐氨苄西林金葡菌均有裂解效果,最佳感染复数为1,可在10 h内抑制细菌生长,在温度-20~54℃范围和pH值3~11之间活性稳定,对紫外线敏感。全基因组分析显示,SP688基因组为环状DNA,全长45499 kb,GC含量为34.1%;预测到64个开放阅读框(ORFs),其中19个(29.69%)被预测功能。该噬菌体是一株新型裂解耐氨苄西林金黄色葡萄球菌的广谱噬菌体,可为噬菌体治疗提供材料。

猫1型疱疹病毒分离鉴定及部分生物学特性分析

本试验旨在从临床样品中得到猫1型疱疹病毒(feline herpesvirus-1,FHV-1)分离株,为FHV-1疫苗候选毒株的研究奠定基础。从宠物医院采集疑似感染FHV-1的猫的眼鼻拭子,用猫肾细胞(Crandell reese feline kidney,CRFK)进行病毒分离,并进行分离株的遗传进化分析、形态学电镜观察以及动物回归试验等系统评价。结果显示:用CRFK细胞对临床样品进行分离培养,经PCR和间接免疫荧光方法鉴定为FHV-1,并命名为“FHV-ZH2202”株。经高通量测序以及基因参考组装拼接获得病毒的全基因组序列后,将其与国内流行毒株进行SNP分析,发现非同义突变SNP主要集中分布在UL22和US7基因。通过构建系统发育树对FHV-ZH2202与国内外流行株进行分析,FHV-ZH2202株与国内外流行株在UL22基因的同源性较高,但对于US7基因具有相对较远的亲缘性。动物回归试验结果表明,FHV-ZH2202株感染组猫全部发病,出现打喷嚏、眼鼻分泌物等典型症状,但无死亡病例出现。感染后第2天开始,感染组猫通过眼鼻向外界排毒,持续6~8 d。本研究成功分离到1株FHV-1病毒,并对其部分生物学特性进行了鉴定,证明FHV-ZH2202株具有一定的致病性,为FHV-1疫苗候选毒株的研究提供一定的参考。

胃癌转移相关miRNA的差异表达谱及miR-218的生物学分析

目的探讨胃癌转移相关微小RNA(miRNA)的差异表达情况并进行miR-218的生物学分析。方法采用实时荧光定量PCR(q PCR)及miRNA芯片法检测低转移潜能的胃癌细胞亚系(SGC7901-NM、MKN28-NM)与高转移潜能的胃癌细胞亚系(SGC7901-M、MKN28-M)间miRNA的差异表达。提取不同转移潜能胃癌细胞系和10例胃癌冰冻组织及相应的转移淋巴结中的总RNA,利用q PCR检测miR-218在不同细胞及组织中的表达情况。结果对不同转移潜能的胃癌细胞亚系进行芯片检测发现,与SGC7901-NM细胞比较,SGC7901-M细胞有47个分子表达下调,15个分子表达上调。与MKN28-NM细胞比较,MKN28-M细胞有41个分子表达下调,83个分子表达上调。在SGC7901-M及MKN28-M细胞中,34个分子表达均出现下降,11个分子表达均出现上升。对不同转移潜能的胃癌细胞亚系以及人永生化正常胃黏膜细胞系GES进行检测可以发现,4种不同转移潜能的胃癌细胞亚系中miR-218的表达均低于正常胃黏膜细胞系GES,差异有统计学意义(P<0.05),且在高转移潜能胃癌细胞亚系中miR-218的表达均低于低转移潜能胃癌细胞系,差异有统计学意义(P<0.05)。胃癌转移淋巴结中miR-218的表达水平为0.23±0.02,低于胃癌原发灶的1.09±0.05,差异有统计学意义(P<0.05)。结论胃癌转移相关miRNA会出现差异表达情况,高转移潜能胃癌细胞中的miR-218表达水平上调可能与胃癌转移存在一定关系。

基于系统生物学分析探究热应激诱导鸡肠道损伤的作用机制

【目的】利用系统生物学分析和鸡胚十二指肠上皮细胞模型探究热应激诱导肠道损伤的作用机制,筛选出家禽热应激诱导肠道损伤的作用靶标,为缓解热应激诱导的肠细胞氧化应激提供理论支撑。【方法】基于NCBI数据库筛选热应激诱导肠道损伤的作用靶标,通过GO功能注释和KEGG信号通路富集分析获得相关代谢通路;分离鸡胚十二指肠上皮细胞构建42℃热应激模型,通过检测细胞损伤病理、细胞活性、乳酸脱氢酶(LDH)活性、抗氧化酶活性、丙二醛(MDA)含量及关键基因(Nrf2和HSP70)表达情况等,进一步确认热应激对肠细胞的损伤作用。【结果】将热应激作用靶标与肠道损伤作用靶标取交集,共获得23个热应激诱导肠道损伤的作用靶标,分别是BCL2、CD4、CFTR、ERN1、FOXM1、FOXP3、HMOX1、HSF1、HSP90AA1、HSP70、HSPA4、HSPA8、JUN、MAPK1、MTOR、NFKB1、NLRP3、PLK1、RHOB、SIRT1、SUMO_(2)、TP53和YAP1。KEGG信号通路富集分析发现热应激诱导肠道损伤与NOD-样受体信号通路、沙门氏菌感染、凋亡、细胞衰老及内质网内蛋白加工等有关;GO功能注释分析发现热应激诱导肠损伤与细胞缺氧反应、细胞对镉离子反应、细胞对热反应及热休克蛋白结合等有关。鸡胚十二指肠上皮细胞体外热应激模型验证发现,热应激能导致鸡胚十二指肠上皮细胞空泡变性,严重时则导致细胞核浓缩深染的变性坏死;热应激还会引起鸡胚十二指肠上皮细胞的活性降低,而细胞上清液中的LDH含量升高;此外,随着热应激时间的延长,鸡胚十二指肠上皮细胞内的MDA含量不断上升,而超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)和过氧化氢酶(CAT)的活性均呈下降趋势;热应激导致鸡胚十二指肠上皮细胞内Nrf2基因表达下调、HSP70基因表达上调。【结论】细胞内氧化—抗氧化失衡是热应激诱导肠道损伤的重要因素,而热休克蛋白是机体激活细胞抵御热应激损伤的重要保护机制。

山羊TGFB3基因的多态性及生物学信息分析

为了解山羊TGFB3基因的多态性,并为优秀山羊品种的选育提供理论依据,选择牛TGFB3基因组序列(NM_001101183)设计1对特异性引物,采用DNA池PCR直接测序法快速检测黔北麻羊、内蒙古白绒山羊和关中奶山羊3个山羊品种的TGFB3基因的多态性。结果表明,只在黔北麻羊TGFB3基因第1外显子212bp处发现1个多态性(SNP)位点(G-212-A)。利用生物信息学分析TGFB3基因5’侧翼调控序列,转录因子结合位点96分以上的有28个(CdxA有2个,HSF有18个,ADR1有2个,AML1a有1个,GCR11有3个,cap有1个,RY有1个),在TGFB3基因5’调控区没有发现CpG island。

鼠胚生物学分析在IVF实验室质量控制中的应用

IVF初期使用鼠胚破译了人胚胎培养的最佳条件,在建立良好的实验室和临床质量控制方面具有重要地位。但是鼠胚检测毒性物质和工作条件的灵敏度低、重现性差。精子活力分析和细胞系作为IVF实验室质控可能对选择的物质更灵敏、时间效率更明确,但是某个精子细胞(或细胞系)不能象胚胎一样对培养成分和条件作出可靠的响应。选择合适阶段、系和形态的鼠胚可以优化生物学分析,用精子活力分析和仓鼠彗星试验确认鼠胚对测试对象(培养基、培养条件等)的响应,可提高鼠胚分析的灵敏度和重现性。

传统酱类自然发酵的微生物学分析

以传统酱类的发酵过程为考察对象,研究传统酱类自然发酵过程中的菌相变化规律,测定不同发酵阶段的菌相种类及比例,为研制合适的酱类人工接种发酵剂打基础。

现代100米跑技术的生物学分析及放松技术再探析

从生物学角度对 10 0米跑的技术与训练进行了分析研究 ,指出要从整体上理解和把握短跑的技术特点和发展趋势 ,更新观念 ,改革短跑教学与训练 ,从而为进行科学化训练提高我国短跑运动成绩与技术水平提供一些参考。

神经外科手术后留置导管的微生物学分析

目的 研究神经外科术后留置导管微生物生长情况 ,并研究其与医院感染的关系 ,为神经外科手术后引流管的留置和抗生素的选择提供依据。方法 对神经外科手术后 168例留置导管的患者进行前瞻性调查研究 ,并对留置导管进行微生物培养分析和药敏试验。结果 14 7例创腔管引流的患者中发生颅内感染 10例 ,感染率为 6.8% ;2 1例脑室引流管引流的患者中发生颅内感染 7例 ,感染率高达 3 3 .3 % ,二者有显著性差异 (P <0 0 1)。引流管留置 1～ 2天感染率与 3～ 4天感染率无明显统计学差异 ,但与引流管留置时间≥ 5天的感染率有显著统计学差异 (P <0 0 1)。结论 导管细菌培养阳性和颅内感染率并不呈现一致性 ,但颅内留置导管是一种侵入性操作 ,达到引流目的后应尽早拔除引流管 。

乳腺癌相关生物学指标对紫杉类药物治疗晚期乳腺癌疗效预测作用分析

目的:回顾性研究雌激素受体(ER)、p53、bcl-2和mdr-1对乳腺癌应用紫杉类药物化疗疗效的预测作用。方法:182例晚期乳腺癌患者应用紫杉类化疗,其中单药紫杉醇组37例,单药泰索帝组22例,紫杉醇联合组78例,泰索帝联合组45例。应用免疫组化的方法对所有患者的ER、p53、bcl-2和mdr-1生物学指标在蛋白水平进行检测。结果:KPS评分、解救情况以及既往蒽环类及转移部位多少对紫杉类药物疗效均无预测作用。ER阳性患者有效率为33.01%(34/103),ER阴性患者有效率为50·63%(40/79),两组相比差异有统计学意义,χ2=5·755,P=0·022;而p53、bcl-2、mdr-1等阳性组与阴性组有效率之间相比,差异无统计学意义(p53χ2=0·004,P=0·950;bcl-2χ2=0·651,P=0·451;mdr-1χ2=0·177,P=0·751;)。多因素分析显示,ER阳性差异仍有统计学意义,P=0·027。而KPS评分、既往应用蒽环类药物、转移部位数目、差异均无统计学意义。结论:ER阴性对紫杉类药物的疗效可能有预测作用,而p53、bcl-2和mdr-1对紫杉类药物无预测作用。

木薯可溶性淀粉合成酶基因SSII克隆及生物学分析

以木薯品种SC124为试材，采用RT-PCR的方法，克隆了木薯可溶性淀粉合成酶基因SSII的全长，并对其进行生物学分析。结果表明：克隆的基因全长包含完整的开放阅读框2256bp，编码751个氨基酸，通过核苷酸序列同源性分析，该cDNA与基因库中登录的木薯SSII（登录号为：EF667961．1）序列同源性达到99％，但与其它植物的同源性较低，为77％～84Yd。对木薯SSII多态性分析可知，在木薯基因组内存在等位基因及旁系同源基因。

白细胞介素-6相关新基因的生物学分析

目的通过白细胞介素-6(IL-6)相关新基因的生物学分析,研究IL-6的作用机制。方法利用IL-6相关表达序列标签(EST)进行电子克隆获得924 bp全长新基因,后采用RT-PCR方法从IL-6激活的人U937细胞所提的总RNA中钓取,此片断连到pGEM-Teasy质粒上并测序。结果成功钓取了IL-6相关EST电子克隆的全长cDNA基因。结论使用电子克隆技术对于发现新基因有重要的指导意义。

表达AMV、WCMV外壳蛋白基因红三叶T1、T2代植株的分子生物学分析

随着生物技术的发展,转基因技术已经越来越多的应用到植物育种领域并发挥着重要的作用,将传统育种技术与转基因技术相结合,既可以缩短育种时间,并具有良好的经济效益。为最终获得能稳定遗传且性状优良的转基因植株,对其后代进行鉴定及筛选是非常重要的。本研究以抗苜蓿花叶病毒(AMV)转基因红三叶和抗白三叶花叶病毒(WCMV)的转基因红三叶人工杂交后代T1,T2代植株为研究对象,通过PCR及RT-PCR等分子生物学手段,对T1代34株植株进行PCR检测,筛选出12株阳性植株,其中兼有两种抗病基因的植株5株,各有一个抗病基因的植株7株,在这些植株中进行杂交组合,大部分杂交组合都结了种子,最终得到30株性状优良的T2代植株,对其进行PCR及RT-PCR检测,结果表明AMV与WCMV外壳蛋白基因能够在大部分T2代转基因植株中整合并表达,并且通过人工杂交,得到9株兼有两个抗病基因的杂交后代,外源基因稳定地从T0传至T2。同时也表明人工杂交是转基因植株基因累积的一种有效方法。

北太平洋海区柔鱼生物学特征分析

本文根据1997年6～11月北太平洋柔鱼生物学特征分析:中部海区渔获胴体组成明显大于西部海区且主要由雌性柔鱼组成;不同月份钓获的雌、雄性柔鱼群体组成有较大的差异;两海区随着生产月份的延续,所渔获的柔鱼胴体范围有扩大的趋势;平均纯体重,雌性柔鱼占平均体重的82.51～84.79％,而雄性柔鱼占平均体重的83.88～85.60％;柔鱼的性腺发育程度随着生产月份的推迟,发育程度也越高,而在相同的月份雄性柔鱼发育程度较雌性柔鱼为高;柔鱼的摄食等级不论是雌鱼还是雄鱼,基本以1、2级为主,较高摄食等级的比例似有逐月下降的趋势;柔鱼的胃含物以鱼的鳞片等鱼的残余物出现率较高,头足类次之,尤其是摄食等级高的胃含物中头足类的比例较高。

老年人科学健身运动的生物学分析

进入新世纪,我国迈入了老龄化人口的国家,作为人口比重越来越大的老年人理应受到进一步的重视。从生物学上分析老年人的生理机能变化的特点,并提出适合老年人科学健身的运动处方和评价方法。

一起由肠炎沙门氏菌引起食物中毒的微生物学分析

沙门氏菌是引起细菌性食物中毒的常见病原菌之一,全年都有可能发生,夏秋季节尤其多见,多为动物性肉类食品引起。本文就一起由肠炎沙门氏菌引起食物中毒事件做微生物学分析。

《俗语大词典》中植物相关俗语的类型及生物学归类分析

植物名称或植物学名词是我国俗语的重要组成部分。本文以《俗语大词典》中的21356条俗语为例,从谚语、惯用语和歇后语3个类型分别统计分析了植物相关的俗语出现的频率,并运用现代植物学知识对与植物相关的476个俗语进行了生物学归类分析,旨在推动植物相关俗语的释义考证和正确运用。

牛瘤胃植物乳杆菌的分离鉴定与生物学特性分析

牛瘤胃中栖息着复杂多样的微生物,这些微生物种群一般会受饲粮、宿主基因型、健康状况、生活环境以及环境中的共生微生物之间的群体效应等的影响,进而又影响着饲料的利用率和牛群的健康,因此弄清牛瘤胃微生物群是十分必要的。利用厌养分离技术从成年牛瘤胃中分离出一株细菌,命名为Y-A-1。结合细菌形态学、生理生化特性和16Sr RNA序列同源性分析鉴定,结果表明Y-A-1菌株为植物乳杆菌。对该菌的生长特性包括最适生长温度、生长曲线、耐酸能力、耐盐等进行测定,结果表明菌株在30℃,pH 5.5~7.5范围内,盐离子浓度在7.5以下的环境中生长最好,该菌株的分离和生物特性研究对牛瘤胃微生物生存状态有了初步的了解,为进一步了解牛瘤胃微生物群奠定了一定的基础。