期刊文献+
共找到15篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
秀丽小杆线虫分泌蛋白组的计算机分析 被引量:6
1
作者 吴红芝 李成云 +1 位作者 朱有勇 毕玉芬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期470-478,共9页
结合计算机技术和生物信息学的方法,采用组合的信号肽分析软件SignalP V3.0、TargetP V1.01、Big-PIPredictor和TMHMM V2.0,预测了秀丽小杆线虫(Caenorthaditis elegansws123)的全基因组19 855个ORF编码蛋白的信号肽,同时系统分析了信... 结合计算机技术和生物信息学的方法,采用组合的信号肽分析软件SignalP V3.0、TargetP V1.01、Big-PIPredictor和TMHMM V2.0,预测了秀丽小杆线虫(Caenorthaditis elegansws123)的全基因组19 855个ORF编码蛋白的信号肽,同时系统分析了信号肽的特征。结果表明,在19 855个秀丽小杆线虫的蛋白中,有1 990条为带有信号肽的分泌型蛋白,其中,1 936条为典型的分泌型信号肽(即信号肽酶Ⅰ型信号肽),53条为信号肽酶Ⅱ型信号肽,1条为信号肽酶Ⅳ型信号肽;在Ⅰ型信号肽中,有41条为RR-motif亚组型信号肽。在1 990条信号肽中,有742条没有典型的N-区,其余1 248条包含典型的3个区。比较了秀丽小杆线虫与原核生物分泌蛋白信号肽中20种氨基酸残基在信号肽酶切位点的使用情况,表明:在Ⅰ型信号肽酶切位点,其信号肽中使用的氨基酸总体趋势与原核生物基本相似,但秀丽小杆线虫选用的氨基酸种类更多,变化更大;在Ⅱ型信号肽酶切位点,秀丽小杆线虫脂蛋白信号肽中使用的氨基酸的种类与原核生物有很大的不同。通过与真核单细胞生物比较,作为真核多细胞生物的秀丽小杆线虫,其分泌蛋白信号肽所占比例更高、种类更多,可知线虫信号肽的组成具有很高的多态性,表明该物种的分泌蛋白具有多种功能。此外,分析结果显示,脂蛋白信号肽在结构上比分泌型信号肽更为保守。在秀丽小杆线虫分泌蛋白中出现了少数氨基酸组成完全一致的信号肽,采用BLAST 2 SEQUENECES对具有相同信号肽的分泌蛋白进行了序列比对,结果表明具有相同信号肽的分泌蛋白同源性非常高,它们的存在是生物进化过程中基因倍加(duplication)及环境选择的结果,信号肽特征的详细描述必将对这些蛋白功能的研究提供重要的帮助。 展开更多
关键词 秀丽小杆线虫 分泌蛋白组 信号肽 分泌途径
下载PDF
用不同蛋白质分析方法鉴定玉米分泌蛋白组的比较研究 被引量:1
2
作者 马玮 Frank Hochholdinger 李春俭 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2010年第10期2762-2766,共5页
玉米根系在生长过程中向根际分泌蛋白质类大分子物质。采用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳-质谱技术,一维液相色谱-质谱联用(LC/MS)和Shotgun三种不同鉴定方法对无菌条件收集的玉米根系分泌蛋白进行了分离、分析与鉴定,对3种鉴定方法在分泌蛋... 玉米根系在生长过程中向根际分泌蛋白质类大分子物质。采用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳-质谱技术,一维液相色谱-质谱联用(LC/MS)和Shotgun三种不同鉴定方法对无菌条件收集的玉米根系分泌蛋白进行了分离、分析与鉴定,对3种鉴定方法在分泌蛋白分析中的应用做了详细阐述和比较。结果表明,双向电泳通过银染可以看到200个蛋白质点,但由于蛋白量少,通过质谱无法对玉米根系分泌蛋白进行鉴定;用LC/MS鉴定得到了152个蛋白;用Shotgun技术鉴定得到了2 848个蛋白。LC/MS鉴定得到的蛋白全部出现在用Shotgun技术鉴定得到的2 848个蛋白中,后2种方法的结果可以互相验证。Shotgun技术具有更高的灵敏性,更适合对蛋白质浓度低、干扰物多的植物根分泌蛋白组进行鉴定,能够获得完整可靠的信息。 展开更多
关键词 玉米根系分泌 分泌蛋白组 双向电泳 LC-MS SHOTGUN MUDPIT
下载PDF
基因组水平预测稻瘟菌分泌蛋白组及富集分析 被引量:2
3
作者 曹继东 刘俊 李遂焰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期129-138,共10页
稻瘟菌分泌蛋白在稻瘟菌入侵植物过程中发挥着重要的作用。这些分泌蛋白中有很多是效应蛋白,这些效应蛋白可以干扰寄主的抗性、抑制寄主免疫反应。因此,对稻瘟菌分泌蛋白组的预测及功能分析就显得十分必要,也是目前植物和微生物分子互... 稻瘟菌分泌蛋白在稻瘟菌入侵植物过程中发挥着重要的作用。这些分泌蛋白中有很多是效应蛋白,这些效应蛋白可以干扰寄主的抗性、抑制寄主免疫反应。因此,对稻瘟菌分泌蛋白组的预测及功能分析就显得十分必要,也是目前植物和微生物分子互作研究领域的热点。使用SignalP、TMHMM及SecretomeP等软件,完成稻瘟菌分泌蛋白组的预测。同时,对含信号肽的经典分泌蛋白进行了GO功能富集、KEGG通路分析、结构域统计以及可降解植物成分的经典分泌蛋白预测等分析。结果显示,稻瘟菌含有约789个分泌蛋白,其长度多集中在100-500 aa;GO功能分析发现,这些分泌蛋白多富集在分泌途径及宿主互作中;KEGG分析显示,分泌蛋白在糖代谢途径中发挥着重要作用;大规模筛选预测到156个分泌蛋白具有降解植物细胞壁等成分的功能;同时还发现稻瘟菌中有可能存在大量不含信号肽的非经典分泌蛋白。通过设计的生物信息学流程,实现了稻瘟菌分泌蛋白组的预测;预测出经典分泌蛋白具有可降解植物细胞壁等成分以及参与糖代谢途径的功能;稻瘟菌中存在大量的无信号肽的非经典分泌蛋白。 展开更多
关键词 稻瘟菌 分泌蛋白组 分泌蛋白 糖代谢
下载PDF
稻瘟病菌分泌蛋白组学研究 被引量:2
4
作者 崔书建 王教瑜 +1 位作者 姜华 梁建生 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第11期1899-1906,共8页
稻瘟病菌分泌蛋白在稻瘟病菌入侵水稻过程中发挥重要作用。收集稻瘟病菌(Guy11菌株)液体培养的上清液,富集蛋白,经过烷基、还原处理和酶解后,采用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)对酶解肽段进行分离及鉴定,利用信号肽预测工具Signal P和蛋... 稻瘟病菌分泌蛋白在稻瘟病菌入侵水稻过程中发挥重要作用。收集稻瘟病菌(Guy11菌株)液体培养的上清液,富集蛋白,经过烷基、还原处理和酶解后,采用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)对酶解肽段进行分离及鉴定,利用信号肽预测工具Signal P和蛋白质亚细胞定位软件Protcomp对鉴定到的蛋白进行生物信息学预测验证。结果显示,共鉴定出30个稻瘟病菌的分泌蛋白,其中:24个蛋白具有N端信号肽,26个蛋白可分泌到胞外,3个蛋白定位在细胞膜上。对其功能进行分类,发现多数为酶类,参与水解及能量代谢。这些酶类和蛋白的发现与进一步研究,将为揭示稻瘟病菌侵染的机理提供帮助。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 分泌蛋白组 生物信息学
下载PDF
豆酱生产菌株米曲霉ZJGS-LZ-12的分泌蛋白组学研究 被引量:3
5
作者 刘晔 朱媛媛 +2 位作者 冯纬 周利南 梁新乐 《中国酿造》 CAS 北大核心 2019年第10期143-148,共6页
该研究以米曲霉(Aspergillus oryzae)ZJGS-LZ-12为研究对象,米曲霉3.042为对照,通过双向电泳结合生物质谱检测,对其胞外分泌蛋白差异进行比较分析。结果表明,与米曲霉3.042相比,米曲霉ZJGS-LZ-12胞外蛋白的分泌能力相当,但胞外分泌蛋白... 该研究以米曲霉(Aspergillus oryzae)ZJGS-LZ-12为研究对象,米曲霉3.042为对照,通过双向电泳结合生物质谱检测,对其胞外分泌蛋白差异进行比较分析。结果表明,与米曲霉3.042相比,米曲霉ZJGS-LZ-12胞外蛋白的分泌能力相当,但胞外分泌蛋白组存在显著差异(P<0.05)。差异表达蛋白点共169个,其中80个蛋白点分泌表达量下调,89个蛋白点分泌表达量上调。差异蛋白质主要参与糖类和蛋白质水解过程,主要是水解淀粉、纤维素、半纤维素及蛋白质的酶。其中,淀粉水解酶、半纤维素酶活性显著增强,β-1,4-内切木聚糖酶F3、β-半乳糖苷酶A和阿拉伯半乳聚糖-β-内切半乳聚糖酶A分泌表达量分别上调292、1 156和2 569倍,蛋白酶Pep1和Alp1分泌表达量分别上调100和1 300倍,充分表明运用此菌株发酵有利于改善豆酱的风味和品质。 展开更多
关键词 豆酱 米曲霉ZJGS-LZ-12 分泌蛋白组
下载PDF
植物病原真菌寄生性与分泌蛋白组CAZymes的比较分析 被引量:33
6
作者 陈相永 陈捷胤 +3 位作者 肖红利 桂月靖 李蕾 戴小枫 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期163-172,共10页
通过信息学方法对植物病原真菌分泌蛋白组进行预测以及对碳水化合物酶类CAZymes注释和比较,分析病原真菌寄生性与CAZymes家族功能的关系。结果显示非专性寄生(半活体营养型和死体营养型)真菌编码的分泌蛋白占基因组编码基因的比例较专... 通过信息学方法对植物病原真菌分泌蛋白组进行预测以及对碳水化合物酶类CAZymes注释和比较,分析病原真菌寄生性与CAZymes家族功能的关系。结果显示非专性寄生(半活体营养型和死体营养型)真菌编码的分泌蛋白占基因组编码基因的比例较专性寄生真菌(活体营养型)的偏高;CAZymes家族中,非专性寄生真菌的糖基水解酶家族GH和多糖裂解酶家族PL较专性寄生真菌显著扩增;功能聚类分析发现,非专性寄生真菌参与纤维素、果胶、木聚糖等植物细胞壁组分降解相关的基因较专性寄生真菌明显增多。结果表明了CAZymes与寄生类型的高度关联性,揭示了其在非专性寄生真菌致病过程中可能的关键作用。 展开更多
关键词 植物病原真菌 寄生性 分泌蛋白组 碳水化合物酶类 植物细胞壁降解
原文传递
基于组学研究的细粒棘球绦虫分泌蛋白组预测与分析 被引量:2
7
作者 贾利芳 沈海默 +2 位作者 徐斌 张颋 胡薇 《国际医学寄生虫病杂志》 CAS 2014年第3期133-138,共6页
目的 在组学水平高通量、系统地预测及筛选细粒棘球绦虫的分泌蛋白组,研究分泌蛋白及其信号肽特征,为后续诊断和疫苗相关抗原(簇)研究奠定基础. 方法 利用SignalP4.1对细粒棘球绦虫全基因组蛋白序列进行信号肽预测,对含有信号肽的蛋... 目的 在组学水平高通量、系统地预测及筛选细粒棘球绦虫的分泌蛋白组,研究分泌蛋白及其信号肽特征,为后续诊断和疫苗相关抗原(簇)研究奠定基础. 方法 利用SignalP4.1对细粒棘球绦虫全基因组蛋白序列进行信号肽预测,对含有信号肽的蛋白依次应用生物信息学软件TMHMMv2.0、Phobius、Big-PI predictor及TargetP1.1进行细粒棘球绦虫经典分泌蛋白质组筛选.随后利用LipoP1.0和TatP1.0分析分泌蛋白信号肽酶切位点类型,用SPSS19.0统计归纳信号肽和分泌蛋白的氨基酸序列特征,Blast2GO对分泌蛋白质组进行基因本体(gene ontology,GO)注释与聚类. 结果 在细粒棘球绦虫14 235条全基因组序列所编码的蛋白中,共发现984条含有信号肽的蛋白序列;其中有363条属于膜结合蛋白,另有25条定位于亚细胞器;最终筛选到596条经典分泌蛋白序列.分泌蛋白质组的信号肽长度集中于15~ 31个氨基酸残基,其中疏水性氨基酸含量为62%,主要被Ⅰ型信号肽酶所识别,且酶切位点在-3及-1位相对保守;分泌蛋白氨基酸含量集中于50~ 700个氨基酸残基,小于非分泌蛋白氨基酸含量(t=3.06,P<0.01);GO分析显示分泌蛋白主要参与新陈代谢、细胞过程、调节和发育等生物过程,并行使催化、结合、抗氧化和酶调节功能. 结论 本研究预测筛选到含有596条蛋白序列的细粒棘球绦虫分泌蛋白组,可用于后续的诊断和疫苗相关抗原筛选研究. 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 囊型棘球蚴病 分泌蛋白组 信号肽 生物信息学
原文传递
分泌蛋白组学在生殖领域中的研究进展 被引量:1
8
作者 谈雨 张轶乐 《中华生殖与避孕杂志》 CSCD 北大核心 2020年第12期1043-1046,共4页
“分泌蛋白”是指由活细胞所分泌的丰富的、具有复杂生理功能的一系列蛋白,包括细胞因子、趋化因子、激素、消化酶、抗体、胞外蛋白酶和毒素等,这些蛋白参与细胞信号转导、粘连、迁移和免疫防御等多种生物过程,发挥重要的生理作用。近年... “分泌蛋白”是指由活细胞所分泌的丰富的、具有复杂生理功能的一系列蛋白,包括细胞因子、趋化因子、激素、消化酶、抗体、胞外蛋白酶和毒素等,这些蛋白参与细胞信号转导、粘连、迁移和免疫防御等多种生物过程,发挥重要的生理作用。近年来,蛋白组学技术飞速发展,极大地促进了分泌蛋白组学的研究和发展。分泌蛋白组学已经被广泛应用于人类生殖领域的探索,并鉴定了许多蛋白质,这些蛋白质可能是人类辅助生殖技术成功妊娠的潜在生物标志物或治疗目标。本文综述了分泌蛋白组学在人卵泡液、胚胎发育及子宫内膜分泌物中的研究进展,为分泌蛋白组学在人类生殖领域研究中的深入应用提供借鉴。 展开更多
关键词 生殖技术 辅助 分泌蛋白组 卵泡液 胚胎发育 子宫内膜分泌
原文传递
OFFGEL和LC-MS联用分析SH-SY5Y细胞分泌蛋白质组 被引量:1
9
作者 张永谦 来成俊 +2 位作者 李琰 卡里姆 邓玉林 《北京理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1252-1255,共4页
建立了游离胶分馏器(OFFGEL)和反相液相色谱质谱(LC-MS)联用分析SH-SY5Y细胞分泌蛋白质组的新方法.收集SH-SY5Y胞外蛋白用胰酶酶切成肽段后,用OFFGEL进行预分离并用LC-MS进行检测.用Mascot检索出88个蛋白,再通过生物信息学软件SignalP对... 建立了游离胶分馏器(OFFGEL)和反相液相色谱质谱(LC-MS)联用分析SH-SY5Y细胞分泌蛋白质组的新方法.收集SH-SY5Y胞外蛋白用胰酶酶切成肽段后,用OFFGEL进行预分离并用LC-MS进行检测.用Mascot检索出88个蛋白,再通过生物信息学软件SignalP对Mascot检索的蛋白进行预测和筛选,共得到31种蛋白,用SingalP中的神经网络法和隐马可夫模型对其中的CERU_HUMAN进行分析,发现该蛋白是分泌蛋白,且信号肽的剪切位点在第19和第20氨基酸之间,软件SingalP提升了鉴定分泌蛋白的可靠性. 展开更多
关键词 分泌蛋白组 游离胶分馏器 液相色谱质谱 生物信息学
下载PDF
结膜吸吮线虫基因组中分泌蛋白的规模预测及分析 被引量:6
10
作者 郑明辉 叶昌林 +3 位作者 张露菲 江楠 贺莉芳 刘晖 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期12-17,22,共7页
目的在对结膜吸吮线虫基因组数据进行注释的基础上对其中分泌蛋白进行规模预测及分析。方法联合应用SignalP、TMHMM、MEME、Protcomp、big-PI Predictor和SecretomeP等多种生物信息学软件进行分析,完成了结膜吸吮线虫分泌蛋白组的预测,... 目的在对结膜吸吮线虫基因组数据进行注释的基础上对其中分泌蛋白进行规模预测及分析。方法联合应用SignalP、TMHMM、MEME、Protcomp、big-PI Predictor和SecretomeP等多种生物信息学软件进行分析,完成了结膜吸吮线虫分泌蛋白组的预测,对其进行GO功能富集、KEGG通路分析、结构域统计以及具有抗原性分泌蛋白预测等分析。结果结膜吸吮线虫含有约259个分泌蛋白,其长度多集中在100-700aa;GO功能分析发现这些分泌蛋白多富集在分泌途径及宿主互作中;KEGG分析显示分泌蛋白在药物及谷胱甘肽代谢中发挥着重要作用;候选分泌蛋白的结构域分析发现存在最多为糖水解酶结构域;大规模筛选预测到126个分泌蛋白具有B细胞表位抗原性的功能。结论结膜吸吮线虫分泌蛋白多为小型蛋白,推测这些蛋白可能参与糖代谢、抗氧化活性,协助虫体的入侵及其在宿主体内的寄生。 展开更多
关键词 结膜吸吮线虫 分泌蛋白组 分泌蛋白 糖代谢
下载PDF
葡萄灰霉病菌胞外分泌蛋白质组的功能预测分析 被引量:2
11
作者 王海霖 葛文谦 +2 位作者 郭瑞 索一平 程凡升 《青岛农业大学学报(自然科学版)》 2015年第3期174-179,188,共7页
由灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)引起的灰霉病是一种危害极大的植物病害,每年都会造成作物的严重的损失。但B.cinerea也是贵腐葡萄酒品质的主要重要成因。试验采用生物信息学的方法,对B.cinerea的胞外分泌蛋白进行分析。综合利用信号肽... 由灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)引起的灰霉病是一种危害极大的植物病害,每年都会造成作物的严重的损失。但B.cinerea也是贵腐葡萄酒品质的主要重要成因。试验采用生物信息学的方法,对B.cinerea的胞外分泌蛋白进行分析。综合利用信号肽分析软件SignalP 4.1、跨膜结构预测软件TMHMM v2.0和THUMBUP、GPI锚定位点预测软件big-Pi Predictor、亚细胞蛋白定位软件TargetP 1.1等软件,对B.cinerea全基因组中的16448个氨基酸序列进行预测。共发现有628个分泌蛋白,编码这些蛋白的ORF最短333bp,最长4476bp,平均1055bp。367个蛋白质有功能描述,其中包括214个酶类。这些酶主要包括各种糖苷水解酶、酯酶、蛋白酶、多糖聚合酶、氧化还原酶、角质酶等。本文对研究B.cinerea的侵染机制和解释贵腐酒特殊香气的原因有重要意义。 展开更多
关键词 葡萄灰霉病菌 胞外分泌蛋白组 蛋白质功能预测
下载PDF
基于组学的多房棘球绦虫分泌蛋白预测与分析
12
作者 张颋 陈英 +4 位作者 贾利芳 沈海默 胡薇 刘杰 奥·乌力吉 《国际医学寄生虫病杂志》 CAS 2014年第6期328-333,共6页
目的预测多房棘球绦虫的分泌蛋白组,分析分泌蛋白及其信号肽特征,为发展多房棘球蚴病的诊断和治疗方法奠定基础。方法采用SignalP4.1对多房棘球绦虫全基因组蛋白序列信号肽进行预测,并依次采用生物信息学软件TMHMMv2.0、Phobius、... 目的预测多房棘球绦虫的分泌蛋白组,分析分泌蛋白及其信号肽特征,为发展多房棘球蚴病的诊断和治疗方法奠定基础。方法采用SignalP4.1对多房棘球绦虫全基因组蛋白序列信号肽进行预测,并依次采用生物信息学软件TMHMMv2.0、Phobius、Big.PI predictor及TargetPl.1筛选去除假阳性的预测蛋白。随后采用Excel统计信号肽和分泌蛋白的氨基酸序列特征,SPSS19.0对分泌蛋白及非分泌蛋白的氨基酸含量进行科尔莫哥罗夫.斯米尔诺夫检验(kolmogorov-smimovtest,KStest)和t检验。最后利用京都基因和基因组-百科全书自动注释工具(KEGGAutomatic Annotation Sever,KAAS)进行分泌蛋白的注释和分析。结果在多房棘球绦虫10~780条全基因组序列所编码的蛋白中,共发现875条含有信号肽的蛋白序列,其中307条属于膜结合蛋白;38条含糖基磷脂酰肌醇(glycosylphosphatidylinositol,GPI)锚定位点;12条定位于线粒体。最终获得了含518条序列的多房棘球绦虫分泌蛋白组。SPSS统计分泌蛋白的信号肽长度集中于11~53个氨基酸,其中疏水性氨基酸含量占61%;且分泌蛋白的氨基酸含量(38—7809个)显著小于(t=0.203,P〈0.01)非分泌蛋白氨基酸的含量(11—11194个);KAAS分析显示获得注释的分泌蛋白主要出现在人类疾病、新陈代谢过程、环境信息处理、有机系统、细胞过程和遗传信息处理通路上.其中有6条序列已知和寄生虫感染直接相关。结论本研究获得了518条蛋白序列多房棘球绦虫分泌蛋白组,为后续的诊断、疫苗和药物靶点等相关研究提供了生物信息学数据。 展开更多
关键词 多房棘球绦虫 分泌蛋白组 信号肽 生物信息学
原文传递
基于蛋白组学的子宫内膜容受性研究进展 被引量:3
13
作者 王静 王凤伟 徐键 《生殖与避孕》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期121-125,136,共6页
目前评价子宫内膜容受性手段很多,但价值有限。蛋白组学作为一门高通量的新技术,已经被很多学者用于筛查子宫内膜容受性的分子生物学标志。通过比较子宫内膜蛋白谱从增生期到分泌期、从种植前期到种植窗期动态变化过程,学者们鉴定出了... 目前评价子宫内膜容受性手段很多,但价值有限。蛋白组学作为一门高通量的新技术,已经被很多学者用于筛查子宫内膜容受性的分子生物学标志。通过比较子宫内膜蛋白谱从增生期到分泌期、从种植前期到种植窗期动态变化过程,学者们鉴定出了一系列与子宫内膜容受性相关的蛋白。内膜分泌蛋白组学作为一种崭新的无创性评估内膜容受性的方法,在未来子宫内膜容受性标志分子筛选中具有强大的应用价值。 展开更多
关键词 子宫内膜容受性 蛋白组 内膜活检组织 分泌蛋白组
原文传递
Modification in Media Composition to Obtain Secretory Production of STxB-based Vaccines using Escherichia coli 被引量:7
14
作者 Mohammad Sadraeian Mohammad Bagher Ghoshoon +3 位作者 Milad Mohkam Zeinab Karimi SaraRasoul-Amini Younes Ghasemi 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2013年第1期43-48,共6页
Shiga toxin B-subunit (STxB) from Shigella dysenteriae targets in vivo antigen to cancer cells, dendritic cells (DC) and B cells, which preferentially express the globotriaosylceramide (Gb3) receptor. This pivot... Shiga toxin B-subunit (STxB) from Shigella dysenteriae targets in vivo antigen to cancer cells, dendritic cells (DC) and B cells, which preferentially express the globotriaosylceramide (Gb3) receptor. This pivotal role has encouraged scientists to investigate fusing STxB with other clinical antigens. Due to the challenges of obtaining a functional soluble form of the recombinant STxB, such as formation of inclusion bodies during protein expression, scientists tend to combine STxB with vaccine candidates rather than using their genetically fused forms. In this work, we fused HPV16 E7 as a vaccine candidate to the recombinantly-produced STxB. To minimize the formation of inclusion bodies, we investigated a number of conditions during the expression procedure. Then various strategies were used in order to obtain high yield of soluble recombinant protein from E. coli which included the use of different host strains, reduction of cultivation temperature, as well as using different concentrations of IPTG and different additives (Glycin, Triton X-100, ZnC12). Our study demonstrated the importance of optimizing incubation parameters for recombinant protein expression in E. coli; also showed that the secretion production can be achieved over the course of a few hours when using additives such as glycine and Triton X-100. Interestingly, it was shown that when the culture mediums were supplemented by additives, there was an inverse ratio between time of induction (TOI) and the level of secreted protein at lower temperatures. This study determines the optimal conditions for high yield soluble E7-STxB expression and subsequently facilitates reaching a functionally soluble form of STxB-based vaccines, which can be considered as a potent vaccine candidate for cervical cancer. 展开更多
关键词 Protein vaccine STxB Soluble expression Triton X- 1 O0
下载PDF
Functional mechanism of Pingchuanning Decoction on adjustment of clara cell secretory protein in airway remodeling of asthmatic rats 被引量:5
15
作者 方向明 李俊 +1 位作者 李泽庚 董小波 《Journal of Traditional Chinese Medicine》 SCIE CAS CSCD 2012年第2期215-221,共7页
OBJECTIVE:To study the functional mechanism of Pingchuanning Decoction in treatment of airway remodeling in asthmatic rats.METHODS:Eighty healthy Wistar male rats were randomized into eight groups(n=10 rats each):Norm... OBJECTIVE:To study the functional mechanism of Pingchuanning Decoction in treatment of airway remodeling in asthmatic rats.METHODS:Eighty healthy Wistar male rats were randomized into eight groups(n=10 rats each):Normal group,Asthma model group,Dexamethasone group,Guilong Kechuanning group,Xiaoqinglong Decoction group,and Pingchuanning Decoction low-,middle-,and high-dose groups.The rats of all but the Normal group were made into asthma models through intraperitoneal injection and aerosol inhalation of ovalbumin.All treatments were administered at the first stimulation of asthma onset(third week of modeling),and the rats were killed after stimulating asthma attacks for 4 weeks.The general conditions of rats and pathomorphological changes of the lung tissues were observed.The expression of nerve growth factor(NGF) of the lung tissues was measured with immunohistochemical methods,and the content of Clara cell secretory protein(CCSP) mRNA was determined with RT-PCR.RESULTS:Compared with the Normal group,the contents of NGF and CCSP mRNA in the lung tissues of the Model group were significantly changed(P<0.01).Compared with the Model group,the indices of Pingchuanning Decoction and other treatment groups were improved to some extent(P<0.05 or P<0.01).CONCLUSIONS:Pathological changes of airway inflammation and remodeling were present in these rat asthma models.Pingchuanning Decoction had an intervention effect on these experimental models.Its functional mechanism may be related to multiple factors,including alleviation of airway inflammation,relief of bronchial smooth muscle spasm,and inhibition of airway remodeling. 展开更多
关键词 Pingchuanning decoction Asthma Nerve growth factor Clara cell secretory protein Functional mechanism
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部