高温放线菌属分类学地位及功能研究进展

高温放线菌属广泛分布于自然界的高温环境中,是一类具有巨大工业应用潜力的微生物类群。对于其分类学地位的确定一直是学界研究的难点,研究进程持续了一个多世纪,分类学关系也历经多次调整,最终将其划分到厚壁菌门(Firmicutes)下高温放线菌科(Thermoactinomycetaceae)范围内。近年来,随着分离筛选手段的提升及其应用价值的发掘,针对高温放线菌属的研究逐渐成为热点。本文从高温放线菌属分类学方法的发展入手,介绍了该类群在分类水平上不断完善的过程及其目前所处的分类学地位,同时也简要概述了高温放线菌属的功能性研究进展,以期为日后高温放线菌属应用潜力的发掘提供指导。

牦牛的分类学地位及起源研究:mtDNAD-loop序列的分析

牦牛的起源与属级分类学地位至今仍然存在一定的争议。我们测定了家养牦牛和野生牦牛线粒体控制区(D-loop)序列,并以此构建牦牛和牛属、野牛属、水牛属以及非洲水牛属相关种的系统发育树。研究结果表明线粒体D-loop区与Cytb基因序列在构建牛族的系统发育具有同样重要的价值。系统发育关系显示野牛属的灭绝种草原野牛与现存种美洲野牛先聚合为一单系群,然后再和牦牛形成一单系分支,表明牦牛与野牛属的草原野牛、美洲野牛亲缘关系最近,具有最近的共同祖先,而与牛属的其它亚洲物种亲缘关系较远。因此,本研究不支持将牦牛独立为牦牛属———Poephagus,牛属与野牛属在分类上也应合并为一个属。基于上述研究结果和化石证据,我们进一步对牦牛起源的历史背景进行了讨论,认为牦牛与野牛属的分化是由于第四纪气候变化在欧亚大陆发生的,野牛通过白令陆桥进入北美;冰期结束后,由于欧亚大陆其它地区温度升高,牦牛只能局限分布在较为寒冷的青藏高原;而野牛属在北美先后分化为草原野牛和美洲野牛,前者可能是后者的直接祖先。

从细胞色素b基因全序列研究鞍带石斑鱼的分类学地位

通过对鞍带石斑鱼Epinephelus lanceolatus、棕点石斑鱼E.fuscoguttatus、斜带石斑鱼E.coioides、鲑点石斑鱼E.fario的线粒体细胞色素b基因全序列扩增、克隆及测序,得到1141bp序列,并结合GenBank其他7种石斑鱼同源序列进行比较分析,共发现429个核苷酸位点存在变异(37.6%)。序列中的转换大于颠换,碱基替换多发生于密码子第3位。以4种鲈形目鱼类为外群,用MEGA3.0软件中的NJ、ME、MP等3种方法构建分子进化树,结果显示,鞍带石斑鱼与石斑鱼属鱼类有较近的亲缘关系,支持鞍带石斑鱼归入石斑鱼属。

桑蚕来源致病性微孢子虫的分类学地位

综述了桑蚕来源微孢子虫微粒子虫属 (Nosema bombycis)、具褶孢虫属 (Pleistophora)、泰罗汉孢虫属 (Thelohania)、变形孢虫属 (Vairimorpha)和内网虫属 (Endoreticulatus)对桑蚕的病原性以及这些微孢子虫的分类学特征和地位 .

陕南南郑巴山松分类学地位的研究

以兴山巴山松作为对照，对陕西南郑巴山松及相邻分布的油松和马尾松的６个产地针叶、球果和种子１２个形态特征，叶绿素含量、核酸含量７个生理生化特性进行测定，借助于多变量分析技术，研究了陕西南郑巴山松的分类学地位。结果表明：南郑巴山松与对照巴山松差异较小，明显不同于油松和马尾松，将其作为油松或油松的一个变种是不合适的，应将其视为巴山松为宜。

长柄山蚂蝗属分类学地位的研究

豆科植物的长柄山蚂蝗属Podocarpium(Benth)Yang et Huang于1979年确立,以前一直作为山蚂蝗属DesmodiumDesv.下的一个组或亚属.作为新属的确立,单靠形态学的证据存在一定的局限性,作者对山蚂蝗属和长柄山蚂蝗属的部分代表种作了叶子的过氧化物酶同工酶的酶谱比较、种子蛋白的SDS-聚丙酰胺凝胶电泳及植物血清学的研究,其结果肯定了Podocarpium新属的成立.

利用DNA条形编码探讨柞蚕饰腹寄蝇的分类学地位

柞蚕饰腹寄蝇(Blepharipa tibialis Chao)是柞蚕的主要寄生性害虫之一。测定了柞蚕饰腹寄蝇的线粒体细胞色素酶C亚基I(COI)基因5′端的部分片段(657bp,GenBank登录号EU433559),并利用该DNA条形编码探讨了其分类学地位。将GenBank数据库登载的寄蝇科11个属的15个代表种的序列组成数据集,基于Kimura-2-Parameter计算了序列间的遗传距离,采用邻近距离法(Neighbour-Joining)构建了系统树。Blast检索表明这段序列可以作为DNA条形编码用于柞蚕饰腹寄蝇的鉴定。柞蚕饰腹寄蝇与饰腹寄蝇属内5个种间的平均遗传距离(0.122)是饰腹寄蝇属内种间平均遗传距离(0.063)的2倍,而11个形态学属间的平均遗传距离(0.122)则与柞蚕饰腹寄蝇和这11个形态学属之间的平均遗传距离(0.124)基本一致;柞蚕饰腹寄蝇在构建的NJ树中也没有与饰腹寄蝇属的种类聚在一起。基于上述结果,建议将柞蚕饰腹寄蝇从饰腹寄蝇属划分出来,单独作为一个新的属。

艾的分类学地位及其人工驯化栽培技术研究

艾叶为我国传统中药材,具有广泛的应用价值。对药用植物艾的分类学地位以及野生药材艾叶的品种选择、育种移栽、田间管理、采收加工等关键环节进行简明扼要总结,对于促进艾产业发展具有重要意义。

中甸牦牛线粒体DNA分析及其分类学地位研究

为研究中甸牦牛线粒体结构及其系统发育位置,应用Sanger测序技术对中甸牦牛完整的线粒体DNA进行测序,并对测序数据进行拼接、组装和注释。结果表明,中甸牦牛线粒体基因组全长16323 bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNAs、2个rRNAs及1个D-loop区,其碱基A、T、C、G含量分别为33.72%、27.28%、25.81%和13.21%,其中A+T含量61%,具有明显的A+T碱基偏向性。对中甸牦牛与牛亚族其他个体的系统进化关系进行研究发现,中甸牦牛与斯布牦牛、帕里牦牛、雪多牦牛、美仁牦牛、央隆牦牛亲缘关系最为密切。

乳杆菌属分类学地位变迁后菌种名称英解汉译检索表(一)

截至2020年3月,乳杆菌属已涵盖261个种,在表型、生态和基因型水平上极为多样化,远超其他菌属多样性水平.2020年4月15位科学家通过对已公布的大量乳杆菌属全基因组数据分析完成了乳杆菌属的重要分类学变迁研究[1].该研究将原乳杆菌属重新划分为25个属(其中包括23个新属,以及对Paralactobacillus的修订),并对分类学地位变迁菌种进行了描述。中国工业微生物菌种保藏管理中心(China Center of Industrial Culture Collection,CICC)原乳杆菌属中发生分类学变迁的新菌种中文名称及相应描述总结如下,以便广大微生物研究与应用工作者使用规范的微生物名称。

短毛柽柳(Tamarix karelinii Bge)的分类学地位探讨

短毛柽柳的分类学地位一直是柽柳属中争论的焦点之一。由于所持划分依据不同 ,认为短毛柽柳为刚毛柽柳杂种、变种或一独立的种。本文系统回顾了短毛柽柳的研究历史 ,对前人所做的有关刚毛柽柳和短毛柽柳形态学、解剖学、孢粉学、植物化学及分子生物学的研究结果进行了分析 ,并查阅了大量的标本 ,认为短毛柽柳是刚毛柽柳的一个变种 ,是从刚毛柽柳进化到另一个极端种的中间过渡阶段 ,同意Baum的意见 ,将其学名恢复为Tamarixhispidavarkarelinii (Bge)Baum .。

阔他阿木特在植物分类学中的地位及其营养价值

根据历史资料记载进一步证实新疆是历史悠久的“梨乡” ,而阔他阿木特则为土户梨之一个品种。通过对阔他阿木特形态及结构的分析研究并经过深入的植物检索确定了阔他阿木特在西洋梨属 (Pyruscommunis.L)的一个地方品种地位。通过化学定性定量分析阔他阿木特中不确定之营养成分得以揭示 。

贝莱斯芽胞杆菌(Bacillus velezensis)分类学及功能研究进展

近年来,贝莱斯芽胞杆菌( Bacillus velezensis )、甲基营养型芽胞杆菌( Bacillus methylotrophicus )、解淀粉芽胞杆菌植物亚种( Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum )在农业、工业、食品加工、环境保护等领域的应用日益增多。然而,有研究表明甲基营养型芽胞杆菌和解淀粉芽胞杆菌植物亚种是贝莱斯芽胞杆菌的同物异名,且当前科学命名为贝莱斯芽胞杆菌。为了明确贝莱斯芽胞杆菌的分类学地位,该文梳理了其与甲基营养型芽胞杆菌、解淀粉芽胞杆菌植物亚种之间的关系,并从功能研究方面介绍了贝莱斯芽胞杆菌的国内外研究现状,同时对其研究前景进行了展望,为贝莱斯芽胞杆菌的深入研究与应用提供参考。

硫磺菌研究进展

硫磺菌(Laetiporus spp.)是一类世界广泛分布的食药两用真菌,在中国已经实现人工栽培。笔者总结硫磺菌的分类学地位、人工栽培、化学成分、药理作用和应用研究进展,分析目前存在的问题,展望其研究和应用方向。

好氧甲烷氧化菌生态学研究进展

好氧甲烷氧化菌是以甲烷为碳源和能源的细菌。好氧甲烷氧化菌在自然环境中分布广泛,人类已从土壤、淡水和海洋沉积物、泥炭沼泽、热泉、海水和南极环境分离到甲烷氧化菌的纯培养。好氧甲烷氧化菌可分为14个属,包括研究较为深入的隶属于变形菌门Alpha和Gamma纲的细菌,以及属于疣微菌门的极端嗜热嗜酸甲烷氧化菌。最近,好氧甲烷氧化菌还被发现存在于苔藓类植物(尤其是泥炭苔藓)共生体中,兼性营养好氧甲烷氧化菌也被发现。通过对好氧甲烷氧化菌的分类、生理生化特征、分子生物学检测方法以及微生物生态学中的研究成果的总结与分析,以及对甲烷氧化菌研究所面临的问题进行讨论,以期为今后进一步开展好氧甲烷氧化菌及其在碳循环中的作用研究提供参考。

松口蘑复合种形态学及生物地理学研究

松口蘑复合种含有松口蘑Tricholoma matsutake (也称松茸)、北欧口蘑T. nauseosum、喜栎口蘑T. zangii和美洲口蘑T. magnivelare等4个分类单元。在对来自中国、日本、法国、西班牙、瑞典、芬兰和美国的标本进行形态学研究的基础上,认为松口蘑、北欧口蘑、喜栎口蘑形态十分接近,它们的分类地位应该重新考虑。美洲口蘑和它们的差别也不大。对松口蘑复合种的寄主和地理分布也进行了总结,发现松口蘑和美洲口蘑的寄主范围较广,寄主专化性不强,而北欧口蘑和喜栎口蘑的寄主比较专一。在地理分布上,松口蘑和美洲口蘑形成亚洲—北美地理替代种的分布格局;松口蘑和北欧口蘑形成欧亚间断分布的分布格局;喜栎口蘑的地理分布范围完全包含在松口蘑的分布范围中。松口蘑复合种种类的分布区和它们各自寄主的分布不一定完全相同。在松口蘑复合种内,北欧口蘑和松口蘑已被认为是同一个种,而其余两个分类单元的分类地位值得进一步研究。

一株产类胡萝卜素细菌的分离与鉴定

从武汉东湖发生水华的水样中分离到一株产橙黄色色素的菌株OB 2 ,经可见光光谱扫描分析 ,证明该菌株所产色素为类胡萝卜素。为了确定OB 2的分类学地位 ,PCR扩增后测定其 16SrRNA基因序列 ,在GenBank中进行同源性比较 ,并与一些相关细菌构建系统发育树。综合分析后将菌株OB 2鉴定为Microbacteriumkitamiense。

马铃薯晚疫病菌分子遗传及与寄主互作研究

近年来马铃薯晚疫病的重新暴发再次引起世界各国极大关注,特别对马铃薯晚疫病菌的分子遗传学的研究,包括病菌基因组遗传、转录和物理图谱的构建,病菌致病的分子机制以及马铃薯-马铃薯晚疫病菌互作分子机制等。本文就近几十年来对马铃薯晚疫病菌在生物学和病理学,分子遗传学等研究方面作简要综述,并对其研究趋势进行了展望。

铁线莲属研究随记(VI)(英文)

讨论了Clematis eriopoda Maxim.和sect.Atragenopsis Boiss.的地位,认为这二分类群均应成立;描述了2新种,1新变种;过去长期被归并的卷萼铁线莲C.tubulosa得到恢复;Clematisheracleifoliavar.ichangensis被转移改作卷萼铁线莲的变种;首次给出光叶铁线莲Clematisglabrifolia的果实的形态描述。