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韭菜种质资源初级核心库的构建与分析
被引量:
9
1
作者
王贞
张明
+3 位作者
李延龙
曹秀敏
王利亚
杨婉玉
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2011年第9期101-104,共4页
以韭菜种质资源圃的174份韭菜种质资源为材料,根据15个表型性状进行聚类,在遗传距离5.3处将聚类结果分为14类,利用简单比例法和人工选择相结合的方法对每一类进行筛选,共选出69份种质资源建立韭菜种质资源初级核心库,占总体样本比例的40...
以韭菜种质资源圃的174份韭菜种质资源为材料,根据15个表型性状进行聚类,在遗传距离5.3处将聚类结果分为14类,利用简单比例法和人工选择相结合的方法对每一类进行筛选,共选出69份种质资源建立韭菜种质资源初级核心库,占总体样本比例的40%。对该初级核心库的遗传多样性进行检测,除了鞘长和叶宽遗传多样性指数较总种质资源库略有降低外,其他性状都有所提高;初级核心库与原始种质资源库的均值差异百分率为0,变异系数变化率为106.14%,极差符合率为94.43%;初级核心资源库中与叶厚、叶数显著相关的性状分别损失2个,其他性状间的相关性与总种质资源基本保持一致。结果表明,所构建的初级核心库能够很好地保留韭菜种质资源的遗传多样性和遗传结构。
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关键词
韭菜
种质资源
聚类分析
初级核心库
遗传多样性
下载PDF
职称材料
萱草属种质遗传多样性分析及初级核心种质库的构建
被引量:
8
2
作者
冀芳芳
李森
+2 位作者
史青青
侯非凡
亢秀萍
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期55-61,共7页
本试验在系统收集萱草属种质资源的基础上,以155份萱草属种质资源为材料,采用EST-SSR分子标记对其进行遗传多样性和聚类分析,基于分子标记聚类结果采用多次聚类优先取样策略构建萱草属初级核心种质库,并对初级核心种质库进行遗传多样性...
本试验在系统收集萱草属种质资源的基础上,以155份萱草属种质资源为材料,采用EST-SSR分子标记对其进行遗传多样性和聚类分析,基于分子标记聚类结果采用多次聚类优先取样策略构建萱草属初级核心种质库,并对初级核心种质库进行遗传多样性和聚类分析。结果表明:(1)43对引物对155份萱草属种质共扩增出396条多态片段,平均扩增9.21条,引物多态性信息含量(PIC)平均值为0.6064,不同材料间的遗传相似系数平均为0.8642,依据遗传相似系数及聚类树状图,将155份种质聚类分为"黄花菜"和"萱草"2大类群。(2)通过6次取样建立萱草属初级核心种质库,包含32份种质(4个种、1个变种、27个品种)。初级核心种质库为原始群体的20.65%,保留了291个(68.69%)多态性位点,其中‘黄花菜’类群种质8份,占‘黄花菜’类群资源总数的13.56%;‘萱草’类群种质24份,占‘萱草’类群资源总数的25.00%。(3)43对引物对32份核心种质共扩增出272条多态片段,平均扩增6.3256条,PIC值平均值0.6060,不同种质间的遗传相似系数平均为0.7940;32份材料聚类分为"黄花菜"和"萱草"2大类群。
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关键词
萱草属
遗传多样性
初级
核心
种质
库
EST-SSR
下载PDF
职称材料
粗皮侧耳栽培种EST-SSR分子标记的开发应用及初级核心种质库的构建
被引量:
4
3
作者
张雪梅
姚强
+7 位作者
宫志远
高兴喜
李瑾
刘晓
韩建东
任鹏飞
万鲁长
任海霞
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期64-80,共17页
根据已知的粗皮侧耳、灵芝、香菇EST序列开发出9条粗皮侧耳EST-SSR引物、58条灵芝EST-SSR引物和35条香菇EST-SSR引物,从中筛选出4条多态性好、条带清晰的引物,对选取的185株粗皮侧耳栽培种进行扩增分析。共扩增得到59条带,每个引物扩增...
根据已知的粗皮侧耳、灵芝、香菇EST序列开发出9条粗皮侧耳EST-SSR引物、58条灵芝EST-SSR引物和35条香菇EST-SSR引物,从中筛选出4条多态性好、条带清晰的引物,对选取的185株粗皮侧耳栽培种进行扩增分析。共扩增得到59条带,每个引物扩增条带数为12–19条,扩增片段在100–1,100bp之间。根据扩增结果构建了一个含47株粗皮侧耳栽培种的初级核心种质库P-core47。分析得出P-core47占原群体样品数25%,占资源库的13%,有效等位基因数和多态性位点占有率与原群体一致,多样性指数均值比原群体高0.12747,在原群体的低频率等位基因有所增强。P-core47内菌株来源广泛,基本已覆盖各个栽培地区,统计的质量性状和数量性状均可在其中找到代表性菌株。表明了用EST-SSR分子标记构建粗皮侧耳栽培种初级核心种质库的可行性。
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关键词
粗皮侧耳
EST—SSR分子标记
初级
核心
种质
库
有效等位基因
多态性位点
原文传递
题名
韭菜种质资源初级核心库的构建与分析
被引量:
9
1
作者
王贞
张明
李延龙
曹秀敏
王利亚
杨婉玉
机构
平顶山市农业科学院
出处
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2011年第9期101-104,共4页
基金
河南省科技攻关项目(623010200)
文摘
以韭菜种质资源圃的174份韭菜种质资源为材料,根据15个表型性状进行聚类,在遗传距离5.3处将聚类结果分为14类,利用简单比例法和人工选择相结合的方法对每一类进行筛选,共选出69份种质资源建立韭菜种质资源初级核心库,占总体样本比例的40%。对该初级核心库的遗传多样性进行检测,除了鞘长和叶宽遗传多样性指数较总种质资源库略有降低外,其他性状都有所提高;初级核心库与原始种质资源库的均值差异百分率为0,变异系数变化率为106.14%,极差符合率为94.43%;初级核心资源库中与叶厚、叶数显著相关的性状分别损失2个,其他性状间的相关性与总种质资源基本保持一致。结果表明,所构建的初级核心库能够很好地保留韭菜种质资源的遗传多样性和遗传结构。
关键词
韭菜
种质资源
聚类分析
初级核心库
遗传多样性
Keywords
Leek
Germplasm
Cluster analysis
Primary core collection
Genetic diversity
分类号
S633.3 [农业科学—蔬菜学]
下载PDF
职称材料
题名
萱草属种质遗传多样性分析及初级核心种质库的构建
被引量:
8
2
作者
冀芳芳
李森
史青青
侯非凡
亢秀萍
机构
山西农业大学园艺学院/山西省设施蔬菜提质增效协同创新中心
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期55-61,共7页
基金
山西农业大学青年拔尖创新人才支持计划"园艺植物分子遗传与育种"(BJRC201601)
山西省回国留学人员科研资助项目"黄花菜种质资源遗传结构分析与核心库的初步构建"(2015-065)
文摘
本试验在系统收集萱草属种质资源的基础上,以155份萱草属种质资源为材料,采用EST-SSR分子标记对其进行遗传多样性和聚类分析,基于分子标记聚类结果采用多次聚类优先取样策略构建萱草属初级核心种质库,并对初级核心种质库进行遗传多样性和聚类分析。结果表明:(1)43对引物对155份萱草属种质共扩增出396条多态片段,平均扩增9.21条,引物多态性信息含量(PIC)平均值为0.6064,不同材料间的遗传相似系数平均为0.8642,依据遗传相似系数及聚类树状图,将155份种质聚类分为"黄花菜"和"萱草"2大类群。(2)通过6次取样建立萱草属初级核心种质库,包含32份种质(4个种、1个变种、27个品种)。初级核心种质库为原始群体的20.65%,保留了291个(68.69%)多态性位点,其中‘黄花菜’类群种质8份,占‘黄花菜’类群资源总数的13.56%;‘萱草’类群种质24份,占‘萱草’类群资源总数的25.00%。(3)43对引物对32份核心种质共扩增出272条多态片段,平均扩增6.3256条,PIC值平均值0.6060,不同种质间的遗传相似系数平均为0.7940;32份材料聚类分为"黄花菜"和"萱草"2大类群。
关键词
萱草属
遗传多样性
初级
核心
种质
库
EST-SSR
Keywords
Hemerocallis L.
Genetic diversity
Primary core collection
EST-SSR
分类号
S682.1 [农业科学—观赏园艺]
下载PDF
职称材料
题名
粗皮侧耳栽培种EST-SSR分子标记的开发应用及初级核心种质库的构建
被引量:
4
3
作者
张雪梅
姚强
宫志远
高兴喜
李瑾
刘晓
韩建东
任鹏飞
万鲁长
任海霞
机构
青岛农业大学生命科学学院
山东省农业科学院农业资源与环境研究所
鲁东大学菌物科学与技术研究院
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期64-80,共17页
基金
国家食用菌产业技术体系建设项目(No.CARS-24)
山东省优秀中青年科学家科研奖励基金:侧耳栽培种核心种质及其指纹图谱库的构建研究
+2 种基金
山东省农业良种工程项目(No.2011LZ006-04)
山东省科技发展计划项目:基于宏基因组高通量测序的食用菌病害检测与监测技术及相关基因的研究
农业科技成果转化资金项目:城郊食用菌产业化开发
文摘
根据已知的粗皮侧耳、灵芝、香菇EST序列开发出9条粗皮侧耳EST-SSR引物、58条灵芝EST-SSR引物和35条香菇EST-SSR引物,从中筛选出4条多态性好、条带清晰的引物,对选取的185株粗皮侧耳栽培种进行扩增分析。共扩增得到59条带,每个引物扩增条带数为12–19条,扩增片段在100–1,100bp之间。根据扩增结果构建了一个含47株粗皮侧耳栽培种的初级核心种质库P-core47。分析得出P-core47占原群体样品数25%,占资源库的13%,有效等位基因数和多态性位点占有率与原群体一致,多样性指数均值比原群体高0.12747,在原群体的低频率等位基因有所增强。P-core47内菌株来源广泛,基本已覆盖各个栽培地区,统计的质量性状和数量性状均可在其中找到代表性菌株。表明了用EST-SSR分子标记构建粗皮侧耳栽培种初级核心种质库的可行性。
关键词
粗皮侧耳
EST—SSR分子标记
初级
核心
种质
库
有效等位基因
多态性位点
Keywords
Pleurotus ostreatus, EST-SSR marker, primary core collection, effective alleles, polymorphism sites
分类号
S646.141 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
韭菜种质资源初级核心库的构建与分析
王贞
张明
李延龙
曹秀敏
王利亚
杨婉玉
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2011
9
下载PDF
职称材料
2
萱草属种质遗传多样性分析及初级核心种质库的构建
冀芳芳
李森
史青青
侯非凡
亢秀萍
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
8
下载PDF
职称材料
3
粗皮侧耳栽培种EST-SSR分子标记的开发应用及初级核心种质库的构建
张雪梅
姚强
宫志远
高兴喜
李瑾
刘晓
韩建东
任鹏飞
万鲁长
任海霞
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
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