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热带假丝酵母肉毒碱乙酰基转移酶基因的删除及功能鉴定 被引量:4
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作者 张利华 陈献忠 +2 位作者 陈振 沈微 樊游 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期880-887,共8页
缺乏高效基因删除技术是限制热带假丝酵母菌株代谢工程育种的重要因素。论文发展了一种新型的基因删除技术并利用该技术成功删除了肉毒碱乙酰基转移酶的两个等位基因。首先PCR扩增标记基因(URA3)的3'端324 bp序列作为基因删除辅助序... 缺乏高效基因删除技术是限制热带假丝酵母菌株代谢工程育种的重要因素。论文发展了一种新型的基因删除技术并利用该技术成功删除了肉毒碱乙酰基转移酶的两个等位基因。首先PCR扩增标记基因(URA3)的3'端324 bp序列作为基因删除辅助序列(gda序列),同向插入到URA3基因的5'端,在此基础上构建两端含有CAT基因同源臂序列的基因删除突变盒,转化宿主菌XZX,获得CAT基因单拷贝和双拷贝敲除的突变株。PCR鉴定和DNA测序结果表明,获得的URA3基因弹出后的突变株,仅在基因组重组位点上残留一个gda序列。进一步鉴定了突变株的生理性能,单拷贝敲除菌株CAT活性较亲本下降80%,但在葡萄糖或烷烃上的生长性能并不受显著影响。双拷贝缺失菌株CAT活性完全丧失,不能利用烷烃生长,同时在葡萄糖培养基中的生长受到显著影响,最终生物量达到7.56(OD600),仅为出发菌株的57.8%。 展开更多
关键词 热带假丝酵母 肉毒碱乙酰基转移酶 基因敲除 URA3基因 基因删除辅助序列
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可变形带洞形状的表示与检测
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作者 黄辉 关履泰 +1 位作者 龚永义 朱庆勇 《中国图象图形学报》 CSCD 北大核心 2007年第11期2073-2080,共8页
可变形形状(shape)的表示与检测是图像处理领域的重要研究内容。提出了一种关于可变形带洞形状表示与检测的方法,采用带洞形状多边形表示可变形带洞目标形状,有效地解决了带洞形状中不同封闭曲线之间位置的表示关系;通过在带洞形状多边... 可变形形状(shape)的表示与检测是图像处理领域的重要研究内容。提出了一种关于可变形带洞形状表示与检测的方法,采用带洞形状多边形表示可变形带洞目标形状,有效地解决了带洞形状中不同封闭曲线之间位置的表示关系;通过在带洞形状多边形中添加辅助边,将每条辅助边看成两条完全不相交的边的方法,将带洞形状多边形转化成不带洞的简单多边形,运用受限Delaunay三角剖分法(CDT)剖分多边形,得到关于带洞形状多边形的完全删除序列,运用非序列动态规划实现可变形带洞形状检测。实验结果表明,与其他相关方法相比,本文方法能够较有效地检测带洞形状目标。 展开更多
关键词 带洞形状(shape)多边形 辅助边 完全删除序列 序列动态规划
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尖毛虫属ActinⅠ、α-TBP和DNA polα乱序基因的模式研究 被引量:1
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作者 杨然 陈天兵 +3 位作者 黄俊 石文俊 区淑青 伊珍珍 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期285-295,共11页
研究旨在对尖毛虫属内现有物种的3种乱序小核基因结构进行比较,探讨其乱序模式。于湛江湖光红树林水域中采集到一个尖毛虫属物种Oxytricha sp.(ZJ),成功扩增了其肌动蛋白Ⅰ(ActinⅠ)、端粒结合蛋白(α-TBP)、DNA聚合酶α(DNA polα)3个... 研究旨在对尖毛虫属内现有物种的3种乱序小核基因结构进行比较,探讨其乱序模式。于湛江湖光红树林水域中采集到一个尖毛虫属物种Oxytricha sp.(ZJ),成功扩增了其肌动蛋白Ⅰ(ActinⅠ)、端粒结合蛋白(α-TBP)、DNA聚合酶α(DNA polα)3个乱序基因的完整大核基因序列和完整/部分小核基因序列,并结合已有资料对比研究了尖毛虫属这3个乱序基因的进化。结果表明:(1)Oxytricha sp.(ZJ)与O.nova的小核ActinⅠ基因具有相同的乱序模式,区别于其余的尖毛虫属物种;在增加尖毛虫属物种的基础上,对前人推测提出了质疑,我们认为MDS-IES接合处移动现象在乱序MDSs之间并非比非乱序MDSs之间更保守。(2)Oxytricha sp.(ZJ)与O.nova的小核α-TBP基因具有相同乱序模式和相似长度的IESs。(3)Oxytricha sp.(ZJ)的小核DNA polα基因乱序模式,区别于任一已报道物种,与属内O.trifallax最为相近。基于序列分析,在DNA polα基因中发现了一例IES转换为MDS的痕迹,以及由此导致原先MDS的丢失。研究发现在编码区内IES向MDS的转变,使得本应删除的序列成为基因组永久保留的一部分。 展开更多
关键词 尖毛虫 乱序基因 大核命运序列 内部删除序列 肌动蛋白Ⅰ型 端粒结合蛋白 DNA聚合酶α
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如何开发UNIX下的安装包
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作者 田嵘 《无线电通信技术》 北大核心 1998年第2期30-32,共3页
介绍了在UNIX操作系统下制作软件安装包的方法,使应用软件包和系统软件包一起共享由系统提供的安装、卸载、查阅等一系列的管理资源,提高软件对用户的友好度。
关键词 安装包 安装序列 删除序列 UNIX 操作系统
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基于高通量显微成像及分析技术的DNA重排研究
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作者 黄亚佳 倪磊 +1 位作者 金帆 杨光 《集成技术》 2019年第6期31-38,共8页
直接的重复序列广泛地存在于真核和原核细胞基因组中,并且与多种疾病(如遗传性神经肌肉神经退行性疾病等)相关,因此定量重复序列的删除变得非常重要。结合高通量显微成像和分析技术,该文设计了基于三色荧光报告系统的方法来定量重复序... 直接的重复序列广泛地存在于真核和原核细胞基因组中,并且与多种疾病(如遗传性神经肌肉神经退行性疾病等)相关,因此定量重复序列的删除变得非常重要。结合高通量显微成像和分析技术,该文设计了基于三色荧光报告系统的方法来定量重复序列删除的发生。结果显示,在铜绿假单胞菌中,重复序列的删除频率在recA基因缺失突变株中明显降低,而RadA蛋白和UvrD蛋白的缺失则会提高重复序列的删除频率,并且重复序列的删除与细菌的生长率和启动子等因素无关。该研究有助于加深对直接重复序列相关问题的理解,并为直接重复序列删除定量提供了新的方法。 展开更多
关键词 高通量 显微成像和分析技术 DNA重排 重复序列删除
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纤毛虫两型核之间的基因组重组 被引量:1
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作者 郑维波 高凤 《生命科学》 CSCD 2015年第4期486-494,共9页
纤毛虫原生动物是一大类结构高度特化、多样性极高的单细胞真核生物。该类群的主要特征是具有高度分化的细胞器、分司不同功能(负责生殖的小核和营养的大核)的两型细胞核以及特有的接合生殖方式。纤毛虫独特的两型核结构为有性生殖过程... 纤毛虫原生动物是一大类结构高度特化、多样性极高的单细胞真核生物。该类群的主要特征是具有高度分化的细胞器、分司不同功能(负责生殖的小核和营养的大核)的两型细胞核以及特有的接合生殖方式。纤毛虫独特的两型核结构为有性生殖过程中全基因组范围的DNA重组提供了可能:包括染色体的断裂、序列的删除、基因组的重排、染色体多倍化等。新近的研究显示,这一过程由RNA介导的表观遗传学控制。现就纤毛虫的基因组重组过程及其RNA相关的分子机理进行概述,并简要介绍作为其基础的大小核结构特点和有性生殖行为。 展开更多
关键词 纤毛虫 两型核 接合生殖 基因组重组 基因乱序 选择性拼接 内部删除序列 大核命运序列
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Experimental quantum deletion in an NMR quantum information processor 被引量:3
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作者 LONG Yu FENG GuanRu +1 位作者 PEARSON Jasong LONG GuiLu 《Science China(Physics,Mechanics & Astronomy)》 SCIE EI CAS 2014年第7期1256-1261,共6页
We report an NMR experimental realization of a rapid quantum deletion algorithm that deletes marked states in an unsorted database.Unlike classical deletion,where search and deletion are equivalent,quantum deletion ca... We report an NMR experimental realization of a rapid quantum deletion algorithm that deletes marked states in an unsorted database.Unlike classical deletion,where search and deletion are equivalent,quantum deletion can be implemented with only a single query,which achieves exponential speed-up compared to the optimal classical analog.In the experimental realization,the GRAPE algorithm was used to obtain an optimized NMR pulse sequence,and the efficient method of maximum-likelihood has been used to reconstruct the experimental output state. 展开更多
关键词 quantum deletion algorithm quantum computing nuclear magnetic resonance quantum search algorithm
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