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嗜热蛋白酶PH1704别构中心量子化学计算与突变体动力学
被引量:
6
1
作者
詹冬玲
高楠
+1 位作者
韩葳葳
冯雁
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期146-153,共8页
通过量子化学计算,确定嗜热菌PyrococcushorikoshiiOT3的PHl704蛋白酶别构位点的关键残基为Argll3,Tyrl20和Asnl29.其中,Argll3及Asnl29与别构抑制剂结合,参与别构调控.Tyrl20残基位于亚基交界面附近,并与亲核残基Cys100之间以...
通过量子化学计算,确定嗜热菌PyrococcushorikoshiiOT3的PHl704蛋白酶别构位点的关键残基为Argll3,Tyrl20和Asnl29.其中,Argll3及Asnl29与别构抑制剂结合,参与别构调控.Tyrl20残基位于亚基交界面附近,并与亲核残基Cys100之间以氢键相连,可通过影响亚基聚合来影响酶的亲核催化.DJ-1超家族的4种构建蛋白的结构显示,120位点位于亚基交界面处,影响亚基的聚合,进而影响蛋白酶的活力,并间接参与别构调控.分子生物学实验显示,突变体R113T/Y120P/N129D的kcat/km(L·μmol^-1·min^-1)值是野生型kcat/km。值的6倍,h系数由野生型的0.86转变为1.3,负协同效应消失.113和129位点处阴离子别构剂脱离,从而破坏113,120和129位点间的封闭环结构,使AC交界面胡螺旋(124~129,524—529)间聚合度增强;120位点残基由rryr转变为Pro,与Cys100间氢键断裂,亲核进攻的阻力减小,从而使酶活力提高,别构负调控消失.
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关键词
嗜热蛋白酶
量子化学计算
别构中心
定点突变
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职称材料
题名
嗜热蛋白酶PH1704别构中心量子化学计算与突变体动力学
被引量:
6
1
作者
詹冬玲
高楠
韩葳葳
冯雁
机构
吉林大学分子酶学工程教育部重点实验室
吉林农业大学食品科学与工程学院
中国科学院长春应用化学研究所
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期146-153,共8页
基金
国家'九七三'计划项目(批准号:2012CB721003)
国家自然科学基金(批准号:31070638)
吉林省自然科学基金(批准号:201015109)资助~~
文摘
通过量子化学计算,确定嗜热菌PyrococcushorikoshiiOT3的PHl704蛋白酶别构位点的关键残基为Argll3,Tyrl20和Asnl29.其中,Argll3及Asnl29与别构抑制剂结合,参与别构调控.Tyrl20残基位于亚基交界面附近,并与亲核残基Cys100之间以氢键相连,可通过影响亚基聚合来影响酶的亲核催化.DJ-1超家族的4种构建蛋白的结构显示,120位点位于亚基交界面处,影响亚基的聚合,进而影响蛋白酶的活力,并间接参与别构调控.分子生物学实验显示,突变体R113T/Y120P/N129D的kcat/km(L·μmol^-1·min^-1)值是野生型kcat/km。值的6倍,h系数由野生型的0.86转变为1.3,负协同效应消失.113和129位点处阴离子别构剂脱离,从而破坏113,120和129位点间的封闭环结构,使AC交界面胡螺旋(124~129,524—529)间聚合度增强;120位点残基由rryr转变为Pro,与Cys100间氢键断裂,亲核进攻的阻力减小,从而使酶活力提高,别构负调控消失.
关键词
嗜热蛋白酶
量子化学计算
别构中心
定点突变
Keywords
Thermophilic protease
Quantum chemistry calculation
Allosteric center
Site-mutant
分类号
O641 [理学—物理化学]
O623 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
嗜热蛋白酶PH1704别构中心量子化学计算与突变体动力学
詹冬玲
高楠
韩葳葳
冯雁
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014
6
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职称材料
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参考文献
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