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SARS-CoV-2刺突糖蛋白对神经细胞的损伤效应及机制
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作者 王娇 李佳佳 +3 位作者 肖文一 韦冬晖 蒋宁 周文霞 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期375-383,共9页
目的探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S蛋白)对人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)的损伤效应及其机制。方法用S蛋白0(细胞对照组),25,50,75和100 mg·L^(-1)处理SH-SY5Y 24 h,CCK-8法检测细胞活力;比色法检测乳... 目的探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S蛋白)对人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)的损伤效应及其机制。方法用S蛋白0(细胞对照组),25,50,75和100 mg·L^(-1)处理SH-SY5Y 24 h,CCK-8法检测细胞活力;比色法检测乳酸脱氢酶(LDH)释放率;EdU试剂盒检测细胞增殖;荧光素酶发光法检测细胞内ATP含量;JC-1荧光探针法检测细胞线粒体膜电位(MMP);Seahorse XF检测细胞糖酵解及线粒体氧化磷酸化水平。结果与细胞对照组相比,S蛋白25,50,75和100 mg·L^(-1)组细胞活力显著降低(P<0.01),半数抑制浓度(IC_(50))为65.05 mg·L^(-1);LDH释放率显著增加(P<0.01);EdU阳性细胞比例显著降低(P<0.01);S蛋白75和100 mg·L^(-1)组细胞内ATP含量显著降低(P<0.01);S蛋白50和75 mg·L^(-1)组细胞内MMP显著降低(P<0.05,P<0.01);S蛋白50 mg·L^(-1)组基础糖酵解水平和糖酵解能力的最大值显著升高(P<0.05,P<0.01),S蛋白25和50 mg·L^(-1)组呼吸能力最大值显著升高(P<0.05,P<0.01)。SH-SY5Y细胞活力与细胞内ATP含量和MMP均呈正相关(r^(2)=0.9209,P=0.001;r^(2)=0.6170,P=0.0025);与反映细胞糖酵解水平的细胞基础糖酵解水平和糖酵解能力最大值呈负相关(r^(2)=0.5194,P=0.0285;r^(2)=0.6664,P=0.0073),与反映线粒体氧化磷酸化水平的ATP生成能力呈负相关(r^(2)=0.8204,P=0.0008)。结论S蛋白使SH-SY5Y细胞活力下降,抑制细胞增殖,其机制可能与干扰神经细胞内能量代谢密切相关。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2) 刺突糖蛋白 人神经母细胞瘤细胞 神经损伤 糖酵解 能量代谢
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SARS相关冠状病毒刺突糖蛋白的研究(综述) 被引量:2
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作者 唐小龙 江振友 +1 位作者 向军俭 孙晗笑 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 2004年第4期474-477,共4页
概述了SARS -CoV的S蛋白的结构及功能相关研究。严重急性呼吸综合症相关的冠状病毒 (SARS -CoV)引起 2 0 0 3年我国南方非典型肺炎爆发流行 ,波及多个国家和地区。目前全球许多学者对SARS -CoV进行了广泛的研究 ,发现S蛋白是病毒表面的... 概述了SARS -CoV的S蛋白的结构及功能相关研究。严重急性呼吸综合症相关的冠状病毒 (SARS -CoV)引起 2 0 0 3年我国南方非典型肺炎爆发流行 ,波及多个国家和地区。目前全球许多学者对SARS -CoV进行了广泛的研究 ,发现S蛋白是病毒表面的主要蛋白 ,它构成冠状病毒科特征性的冠状样结构 ,在严重急性呼吸综合症的发病机制起着关键性作用 ,可介导表达相关受体的宿主细胞感染。现已鉴定出SARS -CoV的S蛋白相关受体 。 展开更多
关键词 刺突糖蛋白 血管紧张素转换酶2 严重急性呼吸综合症 冠状病毒
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新型冠状病毒刺突糖蛋白氨基酸序列特征分析
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作者 杨春伟 孙海燕 +1 位作者 崔大伟 丁伟 《临床检验杂志》 CAS 2020年第7期491-493,497,共4页
目的探讨我国大陆新型冠状病毒(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S)的分子特征,为特效药物和疫苗的研发提供参考依据。方法从全球共享禽流感数据库(GISAID)和GenBank数据库收集2019年12月至2020年3月27日我国大陆255株新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的... 目的探讨我国大陆新型冠状病毒(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S)的分子特征,为特效药物和疫苗的研发提供参考依据。方法从全球共享禽流感数据库(GISAID)和GenBank数据库收集2019年12月至2020年3月27日我国大陆255株新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的S蛋白基因序列,利用MEGA6.0软件分析S蛋白氨基酸序列的分子变异特征。结果 255株SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸序列处于系统进化树的同一分支,同源性为96.8%~100%;bat-coronavirus-RaTG13病毒的S蛋白序列与255株SARS-CoV-2的氨基酸同源性为86.6%~93.4%。S蛋白6个关键位点和受体结合域(RBD)的3个关键位点均未发生变异,但4株病毒S蛋白的RBD域发生个别氨基酸突变。结论中国大陆SARS-CoV-2 S蛋白的氨基酸序列同源性较高,但仍需密切监测其分子特征。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 刺突糖蛋白 受体结合域 分子特征
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SARS-CoV-2刺突糖蛋白突变体与血管紧张素转化酶2结合的热点残基分析
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作者 马学婧 李俊甫 +2 位作者 张兆英 白静 李末 《生命科学研究》 CAS CSCD 2022年第2期131-138,共8页
严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe scute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的刺突糖蛋白(spike glycoprotein,S protein)通过其受体结构域(receptor binding domain,RBD)识别并结合宿主细胞表面受体血管紧张素转换酶2... 严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe scute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的刺突糖蛋白(spike glycoprotein,S protein)通过其受体结构域(receptor binding domain,RBD)识别并结合宿主细胞表面受体血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2),但S蛋白的突变对其与受体相互作用的影响尚不清楚。本研究通过S蛋白与ACE2的分子对接和蛋白质结合分析发现,相比野生型,501Y和B.1.617谱系与ACE2的结合更稳定,其中501Y.V1突变体与ACE2的结合最稳定;结合界面上RBD中18%的氨基酸突变可以增强S蛋白与受体结合的稳定性。S蛋白突变体与受体的结合信息将对中和抗体和疫苗的设计有所助益。 展开更多
关键词 刺突糖蛋白 自由能 热点氨基酸残基 分子对接
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济南市1例输入性奥密克戎毒株刺突糖蛋白结构和功能的生物信息学分析
5
作者 刘保华 白飒 +4 位作者 闫荣军 赵辉 滕新栋 黄伟 韩焕美 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2024年第3期321-325,共5页
目的分析新冠病毒奥密克戎变异株刺突糖蛋白的结构和功能,为疫苗研发提供数据。方法对济南市1例输入性新冠病毒奥密克戎毒株,采用二代测序技术进行全基因组测序,分析刺突糖蛋白基因序列;用生物信息学方法分析刺突糖蛋白氨基酸组成、理... 目的分析新冠病毒奥密克戎变异株刺突糖蛋白的结构和功能,为疫苗研发提供数据。方法对济南市1例输入性新冠病毒奥密克戎毒株,采用二代测序技术进行全基因组测序,分析刺突糖蛋白基因序列;用生物信息学方法分析刺突糖蛋白氨基酸组成、理化性质、跨膜结构、磷酸化修饰、糖基化修饰、结构域和B细胞抗原表位等生物学特性。结果测序获得1株输入性新冠病毒全基因组序列,基因组全长29847 nt,毒株基因型为XBB.1.16.1;其刺突糖蛋白由1269个氨基酸组成,存在1个跨膜螺旋区,主要分布于宿主细胞的内质网和细胞质膜中;有134个磷酸化位点、23个糖基化位点,3个蛋白结构域和11个可能的B细胞抗原表位,蛋白二级结构主要由无规则卷曲组成。结论采用生物信息学方法分析奥密克戎变异株刺突糖蛋白结构与功能,为了解刺突糖蛋白生物学信息提供数据。 展开更多
关键词 奥密克戎变异株 刺突糖蛋白 生信息学分析
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抗SARS-CoV-2刺突糖蛋白受体结合域单链抗体的筛选及鉴定 被引量:1
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作者 金佳佩 蔡雪飞 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期295-305,共11页
目的 构建抗严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-Co V-2)刺突糖蛋白(spike protein,S)受体结合域(receptor-binding domain,RBD)的单链抗体(single-chain fragment variable,scFv)噬菌... 目的 构建抗严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-Co V-2)刺突糖蛋白(spike protein,S)受体结合域(receptor-binding domain,RBD)的单链抗体(single-chain fragment variable,scFv)噬菌体展示文库,筛选特异性scFv,并进行功能鉴定。方法 提取RBD蛋白免疫小鼠的脾细胞m RNA,逆转录为c DNA,以其为模板扩增scFv的重链可变区(hight chain fragment of variable,VH)和轻链可变区(light chain fragment of variable,VL)基因,经过重叠延伸PCR扩增(splicing overlap extension PCR,SOE-PCR)组装为scFv基因片段。将scFv基因片段插入噬菌体载体,构建scFv噬菌体展示文库。经4轮生物淘洗,筛选出与RBD结合能力较强的scFv基因,进行重组表达、纯化和生物活性鉴定。结果 构建的scFv噬菌体文库滴度为6.0×10^(11)pfu/m L。经4轮生物淘选后,共筛选出4株与RBD结合较强的scFv,分别为scFv11、scFv12、scFv25、scFv28。scFv相对分子质量约为27 000,多以包涵体形式存在,纯化后可与HRP标记的鼠抗His单克隆抗体发生特异性结合,浓度达2.4 mg/m L,纯度约90%。4株scFv均可与RBD重组蛋白发生特异性结合;除scFv28外,其他3株scFv均可与野生型和多突变株S蛋白结合;与RBD均存在剂量依赖性相互作用,亲和力动态拟合解离常数(K_(D))分别为8.9、5.92、10.67、2.36 nmol/L,稳态拟合解离常数(K_(D))分别为5.3、6.5、8.7、5.8 nmol/L;scFv11、scFv12和scFv25可同时识别3个独立的RBD多肽,包括RBD2(S^(334~353))、RBD9(S^(439~458))和RBD13(S^(499~518));在线服务器SWISS-MODEL对scFv进行同源建模的模型质量良好,可用于分子对接;scFv11及人肺泡上皮细胞表面血管紧张素转换酶2(human angiotensin converting enzyme 2,ACE2)与RBD相互作用的界面仅部分重合,scFv12和scFv25与RBD的相互作用界面和ACE2与RBD相互作用界面存在较大差异。结论 本研究通过构建抗SARS-Co V-2 RBD的scFv噬菌体文库,筛选并制备了可与SARS-Co V-2 RBD特异结合的scFv,为进一步抗SARS-Co V-2药物和检测试剂的研发提供了实验依据。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 单链抗体 刺突糖蛋白 受体结合域 噬菌体文库
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SARS-CoV-2刺突糖蛋白结构特征和抗原表位分析 被引量:1
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作者 王道 陈建林 《湖南师范大学学报(医学版)》 2022年第6期29-37,共9页
目的:为深入了解新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的刺突糖蛋白(spike glycoprotein)的结构特征和抗原表位.方法:以SARS-CoV-2的刺突糖蛋白的氨基酸序列为对象,通过Clustalw2.1比对分析与SARS... 目的:为深入了解新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的刺突糖蛋白(spike glycoprotein)的结构特征和抗原表位.方法:以SARS-CoV-2的刺突糖蛋白的氨基酸序列为对象,通过Clustalw2.1比对分析与SARS-CoV的相似性;并且利用ProtParam分析刺突糖蛋白的理化性质;ProtScale分析亲/疏水性;TMHMM 2.0、SignalP 4.0、Netphos 3.1、NetGlyc 1.0对刺突糖蛋白的跨膜区域、信号肽、磷酸化和糖基化位点进行预测和分析;SOMPA和SWISS-MODEL服务器预测刺突糖蛋白的二级结构、三级结构模型;Prankweb平台分析可能的配体结合区域位点;ABCpred和SYFPEITHI对刺突糖蛋白进行B/T细胞表位的预测分析.结果:SARS-CoV-2刺突糖蛋白由1273个氨基酸构成,其中亮氨基酸含量最高;分子量为141178.47 kDa,等电点为6.24,半衰期为30 h,稳定系数为33.01;含有一个跨膜结构域和信号肽;存在136个磷酸化与17个N-糖基化修饰位点;二级结构主要以不规则卷曲结构构成,三级结构能与已知的7cn8.1.A(SMTL ID)模型同源建模;具有多个配体结合位点区域以及24个B细胞表位和12个T细胞表位.结论:通过生物信息学方法分析SARS-CoV-2刺突糖蛋白性质和表位,为促进新冠病毒肺炎疫苗和药物的研发提供参考. 展开更多
关键词 新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 刺突糖蛋白 抗原表位 生物信息学
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新冠病毒刺突糖蛋白结构与功能的生物信息学分析及原核表达 被引量:6
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作者 徐本锦 宣焱 +6 位作者 杜淼 刘玲 吴惠文 宋彬妤 侯艳香 陈利荣 刘晓梁 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期41-56,共16页
SARS-CoV-2是一种高致病性且传播迅速的病原体,通过刺突糖蛋白(Spike glycoprotein,S蛋白)识别宿主细胞表面的受体来实现入侵和感染。对S蛋白进行系统的生物信息学分析和原核表达,有助于深入理解S蛋白的功能和阐明该蛋白介导病毒感染的... SARS-CoV-2是一种高致病性且传播迅速的病原体,通过刺突糖蛋白(Spike glycoprotein,S蛋白)识别宿主细胞表面的受体来实现入侵和感染。对S蛋白进行系统的生物信息学分析和原核表达,有助于深入理解S蛋白的功能和阐明该蛋白介导病毒感染的分子机制。本文采用Protparam、Pfam、TMHMM、ExPASy-ProtScale、PSORTⅡ、SignalP、UniProt、NetPhos 3.1、NetNGlyc 1.0、NetOGlyc 4.0和BLAST等生物信息学软件和数据库对S蛋白的理化性质、亚细胞定位、翻译后修饰及相互作用网络等生物学特性进行了系统分析。利用Clustal X2和MEGA7.0软件对该蛋白进行了基于氨基酸序列的同源性分析和系统进化分析。最后,通过分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-S并进行原核表达。结果显示,S蛋白由1273个氨基酸组成,分子量141.2 kD,等电点6.24,有两个卷曲螺旋结构,一个跨膜螺旋区,疏水性较强。S蛋白包含刺突受体结合结构域和S2糖蛋白结构域,主要分布于宿主细胞的内质网膜和细胞膜,含有136个潜在的磷酸化位点和20个可能的糖基化位点。与SARS-CoV-2 S蛋白序列一致性最高的是SARS冠状病毒、SARS冠状病毒WH20和蝙蝠冠状病毒HKU3,均为76%。SARS-CoV-2与SARS冠状病毒和蝙蝠冠状病毒聚为一大支,提示它们可能具有共同的祖先。S蛋白主要在细菌裂解液离心之后的沉淀中表达,这为后续的结构分析和疫苗研发奠定了基础。S蛋白在SARS冠状病毒和蝙蝠冠状病毒之间保守性较高,提示其在病毒入侵过程中具有重要功能。SARS-CoV-2与SARS冠状病毒和蝙蝠冠状病毒可能具有共同的祖先。本研究为SARS-CoV-2 S蛋白的表达纯化、结构与功能研究提供了重要的数据基础,有助于全面揭示S蛋白的生物学功能,同时为设计和筛选靶向S蛋白的新型抗病毒药物提供了科学依据。 展开更多
关键词 新冠病毒(SARS-CoV-2) 刺突糖蛋白(S蛋白) 生物信息学分析 原核表达
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严重急性呼吸综合征冠状病毒2的Spike蛋白点突变后与受体蛋白质及潜在抗病毒药物结合能力的同源建模分析
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作者 曹泽 王乐童 刘振明 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期150-158,共9页
目的:分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的全长测序信息中,其刺突蛋白(Spike protein,S蛋白)的自发突变情况,以及S蛋白突变前后与宿主相关受体蛋白质和潜在抗病毒药物结合... 目的:分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的全长测序信息中,其刺突蛋白(Spike protein,S蛋白)的自发突变情况,以及S蛋白突变前后与宿主相关受体蛋白质和潜在抗病毒药物结合能力的变化。方法:对SARS-CoV-2的一级序列进行生物信息学分析,确定高频突变位点,利用PolyPhen-2软件逐一对S蛋白突变后的功能进行预测和分析。使用SWISS-MODEL系统对突变后的S蛋白序列进行基于相似性的同源建模,利用ZDOCK程序对所建模型与血管紧张素转化酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)、二肽基肽酶-4(dipeptidyl peptidase-4,DPP4,又称CD26)以及氨基肽酶N(aminopeptidase N,APN,又称CD13)进行蛋白质对接,用FiPD软件对结合能力评价结果进行分析,最后采用AutoDock-Chimera 1.14对突变前后的S蛋白与潜在抗病毒药物的结合能力进行预测和比较分析。结果:S蛋白的某些特定区域发生突变能够更大程度地影响其功能,突变之后,S蛋白与ACE2的结合能力趋向于减弱,而与DPP4的结合能力趋向于增强,与APN的结合能力无显著变化。抗人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)药物aplaviroc与S蛋白的亲和能力显著高于其他候选小分子药物。结论:SARS-CoV-2在自然状态下发生突变,其S蛋白第400~1100个氨基酸的区域为点突变高频区,突变趋势为与DPP4结合力增强,DPP4可能成为SARS-CoV-2感染细胞的新受体,aplaviroc可能成为一种SARS-CoV-2治疗药物的潜在选择。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 刺突糖蛋白 冠状病毒 序列比对 分子对接模拟
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SARS冠状病毒spike蛋白上的CoV的受体结合域的研究进展 被引量:1
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作者 高俊 林勇平 肖洪广 《广州医学院学报》 2006年第5期59-62,共4页
严重急性呼吸综合征(SARS)是由一种新发现的动物源性SARS冠状病毒(SARS coronavirus)引起,具有高致病性、高传染性和高病死率的新型人类疾病。现已鉴定SARS-CoV的刺突糖蛋白上的受体结合域(RBD)介导了病毒与靶细胞的相互作用,在跨种属... 严重急性呼吸综合征(SARS)是由一种新发现的动物源性SARS冠状病毒(SARS coronavirus)引起,具有高致病性、高传染性和高病死率的新型人类疾病。现已鉴定SARS-CoV的刺突糖蛋白上的受体结合域(RBD)介导了病毒与靶细胞的相互作用,在跨种属传播起了十分重要的作用。现综述RBD的组成、功能和应用等方面的研究进展。 展开更多
关键词 SARS冠状病毒 刺突糖蛋白 受体结合域 血管紧张素转化酶2
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ACE2在SARS-CoV-2感染及致病机制中的研究进展 被引量:5
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作者 刘琪 肖卫 +2 位作者 张煦 郑兵 龚权 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期451-455,共5页
ACE2是一种I型跨膜糖蛋白,高表达于心脏、肾脏和睾丸,作为肾素血管紧张素系统的负调节因子,发挥舒张血管、抗炎、抗氧化应激、抗血栓、抗纤维化等重要作用。2020年随着新型冠状病毒肺炎的全球爆发,引起该病的病原体随后被鉴定为一种新... ACE2是一种I型跨膜糖蛋白,高表达于心脏、肾脏和睾丸,作为肾素血管紧张素系统的负调节因子,发挥舒张血管、抗炎、抗氧化应激、抗血栓、抗纤维化等重要作用。2020年随着新型冠状病毒肺炎的全球爆发,引起该病的病原体随后被鉴定为一种新型冠状病毒,该病毒被命名为SARS-CoV-2。本研究将对ACE2和SARS-CoV-2的基本特征、结构进行介绍,并重点阐述ACE2表达与SARS-CoV-2感染的关系、SARS-CoV-2感染后的主要致病机制和针对ACE2-S蛋白结合的中和抗体疗法。深入了解ACE2在SARS-CoV-2感染及致病机制中的作用并解析宿主-病毒互作机制,将有助于我们未来更好地研发针对SARS-CoV-2感染的靶点药物。 展开更多
关键词 血管紧张素转化酶Ⅱ 肾素-血管紧张素系统 新型冠状病毒 刺突糖蛋白 中和抗体疗法
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基于网络药理学及分子对接虚拟筛选疏风解毒胶囊治疗新冠病毒肺炎(COVID-19)活性成分研究 被引量:8
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作者 谢平 王晨情 +2 位作者 叶雅惠 沈金海 郝春莉 《药学研究》 CAS 2021年第9期590-597,604,共9页
目的筛选疏风解毒胶囊(SJC)治疗COVID-19的潜在活性成分。方法借助TCMSP、TCMID数据库检索SJC中活性成分及靶点,在GeneCards、OMIM数据库中收集COVID-19相关靶点,通过Cytoscape 3.8.0软件和STRING数据库建立“药材-活性成分-靶点”网络... 目的筛选疏风解毒胶囊(SJC)治疗COVID-19的潜在活性成分。方法借助TCMSP、TCMID数据库检索SJC中活性成分及靶点,在GeneCards、OMIM数据库中收集COVID-19相关靶点,通过Cytoscape 3.8.0软件和STRING数据库建立“药材-活性成分-靶点”网络,绘制靶标蛋白互作(PPI)网络,使用R语言对核心靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,运用Cytoscape 3.8.0软件建立“成分-靶点-共有通路”网络,预测其作用机制,将活性成分作为配体与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶、刺突糖蛋白(S蛋白)及受体血管紧张素转换酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接。结果“药材-活性成分-靶点”网络包含8种药材,179个化合物和143个靶点,PPI网络得到疏风解毒胶囊治疗COVID-19的49个关键靶标蛋白;GO功能富集分析取得1330个条目(P<0.05),KEGG通路富集筛选得到142条信号通路(P<0.05),其中涉及人类巨细胞病毒感染,卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染,白介素-17(IL-17)信号通路,肿瘤坏死因子(TNF)信号通路,辅助性T细胞17(Th17细胞)细胞分化和缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。荷包牡丹碱、新黄烷酮和青黛酮符合Lipinski类药五规则且结合能远小于目前所报道具有抗SARS-CoV-2的临床用药。结论SJC“多成分-多靶点-多通路”协同作用,影响与SARS-CoV-23CL水解酶、S蛋白和ACE2的结合,实现对COVID-19的治疗作用。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 虚拟筛选 疏风解毒胶囊 新型冠状病毒肺炎 刺突糖蛋白
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新型冠状病毒S蛋白表达、纯化及应用
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作者 于彩君 李明明 +2 位作者 陈珂 盛军 朱强强 《生物技术》 CAS 2022年第6期671-676,共6页
[目的]克隆严重急性呼吸综合征冠状病毒2(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2,SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(Spike,S蛋白),纯化重组蛋白为制备鼠多克隆抗体提供免疫原,并鉴定抗体活性。[方法]依据对S蛋白的氨基酸序列解析,设计... [目的]克隆严重急性呼吸综合征冠状病毒2(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2,SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(Spike,S蛋白),纯化重组蛋白为制备鼠多克隆抗体提供免疫原,并鉴定抗体活性。[方法]依据对S蛋白的氨基酸序列解析,设计并构建了S蛋白重组质粒S713 pcDNA3.1(+)-C-6His,经酶切和测序正确后,转入中国仓鼠卵巢细胞(CHO-K1)中进行诱导表达,SDS-PAGE鉴定融合蛋白表达情况。表达产物利用Ni柱和分子筛纯化,目的蛋白混合免疫佐剂AS03免疫ICR小鼠,制备S蛋白多克隆抗体并对通过中和实验进行鉴定。[结果]成功构建重组质粒S713 pcDNA3.1(+)-C-6His,在CHO-K1细胞中S蛋白以可溶性形式表达。可溶性目的蛋白纯化后,蛋白纯度为94.4%,作为免疫原制备鼠多克隆抗体,抗体效价为1∶400,中和实验显示该多抗具有保护作用。[结论]成功诱导表达、纯化重组S蛋白并制备其多克隆抗体,为深入研究新冠病毒感染、发病机制及新型肺炎的防治奠定基础。 展开更多
关键词 新冠病毒 刺突糖蛋白 蛋白纯化 中和实验 多克隆抗体
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SARS-CoV-2突变背景下的病毒入侵机制研究进展与干预策略
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作者 王革 白宇昊 +1 位作者 王泽轩 徐颖洁 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第28期3386-3410,共25页
自2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019, COVID-19)被报道以来,其病原体重症急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)已在世界范围内大流行超过2年,目前仍有持续流行的趋势. SARS-C... 自2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019, COVID-19)被报道以来,其病原体重症急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)已在世界范围内大流行超过2年,目前仍有持续流行的趋势. SARS-CoV-2入侵细胞的过程由其包膜上刺突糖蛋白(spike glycoprotein)结合人类血管紧张素转化酶2(human angiotensin converting enzyme 2, hACE2)受体后介导病毒-细胞间的膜融合来实现.在过去的2年内,大量的研究聚焦于SARS-CoV-2入侵细胞这一病毒感染的关键步骤上,有望通过阐明入侵相关分子机制,针对其中关键事件进行干预从而抑制病毒入侵,为药物设计和临床治疗提供依据.然而在COVID-19持续流行期间,不断有新的SARS-CoV-2突变株产生.入侵特性的差异常表现为传播性、致病力等方面的改变,对基础研究和疫情防控提出了巨大挑战.本文在概述SARS-CoV-2入侵分子机制主要研究进展的基础上,对几种主流突变株的入侵特点进行总结,并介绍干预SARS-CoV-2入侵的潜在药物靶点. 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 刺突糖蛋白 病毒入侵 新冠 病毒入侵抑制剂
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SARS-CoV-2入侵细胞相关分子结构与机制的研究进展 被引量:8
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作者 李沛霖 刘海英 《生命科学》 CSCD 北大核心 2021年第3期337-345,共9页
新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)疫情的迅速发展与其病原体新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)具有的高传播、高感染能力关系密切。这是一种新型β属冠状病毒,为了探究... 新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)疫情的迅速发展与其病原体新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)具有的高传播、高感染能力关系密切。这是一种新型β属冠状病毒,为了探究其高传染性的原因,并为治疗药物和防控疫苗的开发提供理论依据,研究人员迅速展开了针对新型冠状病毒入侵细胞分子机制的研究,并取得了较多进展。该文以新型冠状病毒表面的刺突糖蛋白(spike glycoprotein,S protein)和宿主细胞表面的血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)的相互作用为重点,介绍了此病毒入侵细胞的分子结构与机制的最新研究进展,总结了病毒入侵环节中潜在的药物靶点,并对新型冠状病毒的研究提出了展望。 展开更多
关键词 新冠肺炎 新型冠状病毒 刺突糖蛋白 血管紧张素转换酶2 病毒入侵
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血管紧张素转换酶2抗新冠病毒药理作用机制的研究进展 被引量:6
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作者 齐阳 黄爱文 宋洪涛 《中国医院药学杂志》 CAS 北大核心 2020年第9期968-971,共4页
血管紧张素转换酶2(ACE2)是肾素-血管紧张素系统负向调节血压的关键因子,主要分布在心脏、肾脏和胃肠等部位。最新研究发现ACE2是新型冠状病毒(SARS-CoV-2)入侵的功能性受体。新型冠状病毒和SARS相关冠状病毒(SARS-CoV)都能利用宿主细... 血管紧张素转换酶2(ACE2)是肾素-血管紧张素系统负向调节血压的关键因子,主要分布在心脏、肾脏和胃肠等部位。最新研究发现ACE2是新型冠状病毒(SARS-CoV-2)入侵的功能性受体。新型冠状病毒和SARS相关冠状病毒(SARS-CoV)都能利用宿主细胞表面ACE2作为受体,与病毒刺突糖蛋白(Spike)受体结合结构域(RBD)结合发生相互作用,介导病毒入侵宿主细胞。回顾性分析ACE2在抗SARS-CoV中的研究进展,结合目前对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防治的认识及Spike-ACE2蛋白相互作用的最新研究成果,对ACE2抗新型冠状病毒的药理作用机制研究进行简要综述,以期为新冠肺炎抗病毒特效药的研发提供参考。 展开更多
关键词 血管紧张素转换酶2 刺突糖蛋白 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 SARS相关冠状病毒
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Binding of the SARS-CoV-2 spike protein to glycans 被引量:6
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作者 Wei Hao Bo Ma +7 位作者 Ziheng Li Xiaoyu Wang Xiaopan Gao Yaohao Li Bo Qin Shiying Shang Sheng Cui Zhongping Tan 《Science Bulletin》 SCIE EI CSCD 2021年第12期1205-1214,M0004,共11页
The pandemic of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)has caused a high number of deaths in the world.To combat it,it is necessary to develop a better understanding of how the virus infects ho... The pandemic of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2)has caused a high number of deaths in the world.To combat it,it is necessary to develop a better understanding of how the virus infects host cells.Infection normally starts with the attachment of the virus to cell-surface glycans like heparan sulfate(HS)and sialic acid-containing glycolipids/glycoproteins.In this study,we examined and compared the binding of the subunits and spike(S)proteins of SARS-CoV-2,SARS-Co V,and Middle East respiratory disease(MERS)-Co V to these glycans.Our results revealed that the S proteins and subunits can bind to HS in a sulfation-dependent manner and no binding with sialic acid residues was detected.Overall,this work suggests that HS binding may be a general mechanism for the attachment of these coronaviruses to host cells,and supports the potential importance of HS in infection and in the development of antiviral agents against these viruses. 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 S protein Heparan sulfate Glycan microarray Surface plasmon resonance SULFATION Sialic acid
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