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题名白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析
被引量:2
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作者
张倩
张德全
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机构
大理大学药学院
云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室
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出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1750-1761,共12页
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基金
国家自然科学基金(32060091)
云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202105AC160063)
+1 种基金
大理大学中药资源与民族药创新团队项目(ZKLX2019318)
云南省李剑专家工作站(202005AF150013)。
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文摘
白花刺续断在中国西藏是一种常用的药用植物,但其叶绿体全基因组的相关研究较少。为揭示该物种叶绿体全基因组的基本特征并探讨其谱系遗传结构,该研究利用Illumina测序平台对来自5个野生居群的10个白花刺续断个体进行二代测序,经组装、注释,得到10条完整的叶绿体全基因组序列,并对它们的基因组特征和居群间的谱系进化关系进行了初步研究。结果表明:(1)白花刺续断的叶绿体全基因组大小为155335~156266 bp,共注释113个基因,包括72个蛋白编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因,其叶绿体基因组的大小、结构、GC含量及基因组成等方面在种内高度保守。(2)基因组比较分析表明,白花刺续断变异较大的片段均位于单拷贝区,且IR边界未出现明显的扩张和收缩。(3)群体遗传分析发现,白花刺续断的野生居群具有明显的地理遗传结构,不同居群间在遗传距离与地理距离上具有一定的相关性。研究认为,白花刺续断叶绿体基因组在种内居群水平上比较保守,且叶绿体基因组可在居群水平上揭示物种的地理遗传结构。这为后续开展刺续断属物种群体遗传学和系统发育基因组学研究奠定了基础。
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关键词
白花刺续断
叶绿体全基因组
药用植物
基因
系统发育基因组学
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Keywords
Acanthocalyx alba
complete chloroplast genome
medicinal plant
gene
phylogenomics
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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题名刺续断的形态组织学鉴定
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作者
伍龙
李涛
曹丹
葛志乐
雷洋
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机构
四川大学华西药学院
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出处
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期61-63,共3页
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文摘
目的对藏药刺续断进行系统的生药学鉴定。方法采用植物基源、性状、显微和薄层鉴定方法。结果描述了刺续断的原植物、性状、显微和薄层色谱鉴别特征。结论方法简便易操作,为刺续断药材的鉴定和临床应用奠定了基础。
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关键词
刺续断
原植物
形态组织学
显微鉴定
薄层色谱
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Keywords
Morina nepalensis
Original plant
Morphology and histology
Microscopic identification
Thin layer chromatography
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分类号
R28
[医药卫生—中药学]
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