为了解拟穴青蟹(Scylla paramamosain)前列腺6跨膜上皮抗原4基因(six-transmembrane protein of prostate 4,STEAP4)在拟穴青蟹抗白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)免疫应答中的作用,表达与纯化GST-STEAP4重组蛋白,(1)通...为了解拟穴青蟹(Scylla paramamosain)前列腺6跨膜上皮抗原4基因(six-transmembrane protein of prostate 4,STEAP4)在拟穴青蟹抗白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)免疫应答中的作用,表达与纯化GST-STEAP4重组蛋白,(1)通过聚合酶链式反应(PCR)克隆了STEAP4基因,利用生物信息学分析软件分析其序列特征;(2)通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测其组织分布及WSSV感染后的表达情况;(3)构建原核表达载体pGEX-6p-1-STEAP4-like,诱导表达与纯化重组蛋白GST-STEAP4-like。结果表明:(1)拟穴青蟹STEAP4-like基因ORF长1443 bp,编码480个氨基酸,N端含有NAD结合位点和一个NADP氧化还原酶辅酶结构域,C端含有一个铁还原酶跨膜结构域;(2)氨基酸序列与三疣梭子蟹STEAP4-like相似性最高,与三疣梭子蟹和突眼蟹亲缘关系最接近;(3)STEAP4-like基因在被检测组织中均有表达;(4)WSSV刺激后STEAP4-like基因显著性下调表达。综上,STEAP4-like可能在拟穴青蟹抗病毒侵染免疫反应中具有重要作用。展开更多
目的对1株在九江地区分离的柯萨奇A6病毒(CoxA6)VP1区域进行克隆,并对其编码蛋白的结构、功能及B细胞表位进行分析和预测,为CoxA6疫苗制备和诊断方法的研究提供理论基础。方法采用RT-PCR法对CoxA6分离株VP1区进行扩增和克隆、序列分析,...目的对1株在九江地区分离的柯萨奇A6病毒(CoxA6)VP1区域进行克隆,并对其编码蛋白的结构、功能及B细胞表位进行分析和预测,为CoxA6疫苗制备和诊断方法的研究提供理论基础。方法采用RT-PCR法对CoxA6分离株VP1区进行扩增和克隆、序列分析,应用SigaIP、TMPRED、TMHMM、Big-PI Predictor、Cell-Ploc、PSORT、NetNES、Netphos、SOPMA、NetNGlyc、MotifScan、InterProscan、SMART、PROSITE、GOR4、Bepipred Linear Epitope Prediction等生物信息学方法预测其VP1基因编码蛋白特性和潜在的B细胞表位。结果该CoxA6分离株VP1基因编码305aa的多肽,分子量为33.5kDa。该蛋白无信号肽、跨膜区,是亲水性蛋白;二级结构主要以无规则卷曲为主,其次为α-螺旋及β-片层。该蛋白共有7个可能的B细胞抗原表位,位于151~173aa区域内的表位分值最高为2.774。结论成功克隆了1株CoxA6的VP1基因,并对其进行序列分析、蛋白质结构和B细胞表位预测,为制备CoxA6疫苗和开发诊断方法提供了分子生物学基础。展开更多
目的:研究前列腺跨膜上皮抗原1(six-transmembrane epithelial antigen of prostate protein 1,STEAP1)在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:收集2007年1月至2016年12月山东省千佛山医院40例女性乳腺正常组织及52例乳腺纤维腺瘤、211例乳...目的:研究前列腺跨膜上皮抗原1(six-transmembrane epithelial antigen of prostate protein 1,STEAP1)在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:收集2007年1月至2016年12月山东省千佛山医院40例女性乳腺正常组织及52例乳腺纤维腺瘤、211例乳腺癌患者的组织标本,应用免疫组织化学法检测STEAP1的表达情况。根据STEAP1表达的高低将乳腺癌患者分为高表达组和低表达组,对两组行临床病理特征和Kaplan-Meier生存分析。运用RT-PCR及Western blot法检测STEAP1在人正常乳腺上皮细胞HBL-100及乳腺癌细胞MDA-MB-468、BT549和MCF-7中的表达情况,使用Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库分析STEAP1的表达及预后。结果:免疫组织化学法检测显示乳腺癌组织中的STEAP1高表达者占11.8%(25/211),低于乳腺正常组织的85.0%(34/40)和乳腺纤维腺瘤的84.6%(44/52),3者之间具有显著性差异(P<0.001),与Oncomine数据库分析获得的乳腺癌组织中表达低于乳腺正常组织的结果一致。RT-PCR和Western blot法检测显示乳腺上皮细胞中的STEAP1 m RNA和蛋白质表达明显高于乳腺癌细胞MDA-MB-468、BT549和MCF-7,4种细胞之间具有显著性差异(均P<0.001)。Kaplan-Meier生存分析与Kaplan-Meier Plotter数据库分析均表明STEAP1高表达者预后更佳(均P<0.05)。结论:正常乳腺中的STEAP1表达水平高于乳腺癌,STEAP1高表达与良好的预后相关。展开更多
文摘为了解拟穴青蟹(Scylla paramamosain)前列腺6跨膜上皮抗原4基因(six-transmembrane protein of prostate 4,STEAP4)在拟穴青蟹抗白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)免疫应答中的作用,表达与纯化GST-STEAP4重组蛋白,(1)通过聚合酶链式反应(PCR)克隆了STEAP4基因,利用生物信息学分析软件分析其序列特征;(2)通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测其组织分布及WSSV感染后的表达情况;(3)构建原核表达载体pGEX-6p-1-STEAP4-like,诱导表达与纯化重组蛋白GST-STEAP4-like。结果表明:(1)拟穴青蟹STEAP4-like基因ORF长1443 bp,编码480个氨基酸,N端含有NAD结合位点和一个NADP氧化还原酶辅酶结构域,C端含有一个铁还原酶跨膜结构域;(2)氨基酸序列与三疣梭子蟹STEAP4-like相似性最高,与三疣梭子蟹和突眼蟹亲缘关系最接近;(3)STEAP4-like基因在被检测组织中均有表达;(4)WSSV刺激后STEAP4-like基因显著性下调表达。综上,STEAP4-like可能在拟穴青蟹抗病毒侵染免疫反应中具有重要作用。
文摘目的对1株在九江地区分离的柯萨奇A6病毒(CoxA6)VP1区域进行克隆,并对其编码蛋白的结构、功能及B细胞表位进行分析和预测,为CoxA6疫苗制备和诊断方法的研究提供理论基础。方法采用RT-PCR法对CoxA6分离株VP1区进行扩增和克隆、序列分析,应用SigaIP、TMPRED、TMHMM、Big-PI Predictor、Cell-Ploc、PSORT、NetNES、Netphos、SOPMA、NetNGlyc、MotifScan、InterProscan、SMART、PROSITE、GOR4、Bepipred Linear Epitope Prediction等生物信息学方法预测其VP1基因编码蛋白特性和潜在的B细胞表位。结果该CoxA6分离株VP1基因编码305aa的多肽,分子量为33.5kDa。该蛋白无信号肽、跨膜区,是亲水性蛋白;二级结构主要以无规则卷曲为主,其次为α-螺旋及β-片层。该蛋白共有7个可能的B细胞抗原表位,位于151~173aa区域内的表位分值最高为2.774。结论成功克隆了1株CoxA6的VP1基因,并对其进行序列分析、蛋白质结构和B细胞表位预测,为制备CoxA6疫苗和开发诊断方法提供了分子生物学基础。
文摘目的:研究前列腺跨膜上皮抗原1(six-transmembrane epithelial antigen of prostate protein 1,STEAP1)在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:收集2007年1月至2016年12月山东省千佛山医院40例女性乳腺正常组织及52例乳腺纤维腺瘤、211例乳腺癌患者的组织标本,应用免疫组织化学法检测STEAP1的表达情况。根据STEAP1表达的高低将乳腺癌患者分为高表达组和低表达组,对两组行临床病理特征和Kaplan-Meier生存分析。运用RT-PCR及Western blot法检测STEAP1在人正常乳腺上皮细胞HBL-100及乳腺癌细胞MDA-MB-468、BT549和MCF-7中的表达情况,使用Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库分析STEAP1的表达及预后。结果:免疫组织化学法检测显示乳腺癌组织中的STEAP1高表达者占11.8%(25/211),低于乳腺正常组织的85.0%(34/40)和乳腺纤维腺瘤的84.6%(44/52),3者之间具有显著性差异(P<0.001),与Oncomine数据库分析获得的乳腺癌组织中表达低于乳腺正常组织的结果一致。RT-PCR和Western blot法检测显示乳腺上皮细胞中的STEAP1 m RNA和蛋白质表达明显高于乳腺癌细胞MDA-MB-468、BT549和MCF-7,4种细胞之间具有显著性差异(均P<0.001)。Kaplan-Meier生存分析与Kaplan-Meier Plotter数据库分析均表明STEAP1高表达者预后更佳(均P<0.05)。结论:正常乳腺中的STEAP1表达水平高于乳腺癌,STEAP1高表达与良好的预后相关。