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大白菜重组自交系群体构建过程中剩余杂合位点的变化趋势
被引量:
3
1
作者
刘栓桃
张志刚
+6 位作者
李巧云
赵智中
王立华
王淑芬
徐文玲
刘贤娴
刘辰
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第7期2730-2735,共6页
剩余杂合系是QTL精细定位的较好衍生群体,它是在重组自交系构建过程中形成的。本研究均匀选择了遍布大白菜全基因组的51对前景/背景标记,随机选择了重组自交系群体构建过程中的57个家系,从中选株系的F_5跟踪检测至F_8。研究数据表明:从...
剩余杂合系是QTL精细定位的较好衍生群体,它是在重组自交系构建过程中形成的。本研究均匀选择了遍布大白菜全基因组的51对前景/背景标记,随机选择了重组自交系群体构建过程中的57个家系,从中选株系的F_5跟踪检测至F_8。研究数据表明:从F_5至F_8,特定位点的平均剩余杂合率分别是7.06%、3.51%、1.38%和0.38%;剩余杂合位点在所选株系内的基因组覆盖率分别是90.19%、76.47%、52.94%和21.57%,覆盖率迅速降低。值得关注的是:在F_5代时,剩余杂合位点不仅覆盖了90%以上的基因组范围,且特定家系多个杂合位点多位于不同的染色体上,在接下来F_6代的筛选中很容易得到单位点剩余杂合单株。因此,本研究基于前景/背景标记的检测数据认为,高效率筛选剩余杂合单株的时期是F_5~F_6世代。这为提高作物农艺性状精细解析和精准定位提供了参考依据。
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关键词
大白菜
重组自交系群体
前景/背景标记
剩余杂合位点
基因组覆盖率
原文传递
题名
大白菜重组自交系群体构建过程中剩余杂合位点的变化趋势
被引量:
3
1
作者
刘栓桃
张志刚
李巧云
赵智中
王立华
王淑芬
徐文玲
刘贤娴
刘辰
机构
山东省农业科学院蔬菜花卉研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室国家蔬菜改良中心山东分中心
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第7期2730-2735,共6页
基金
山东省自然科学基金(ZR2014CM021
ZR2015YL073)
+1 种基金
山东省农业科学院青年基金(No.2014QNM11)
山东省农业良种工程2014项目(2014LNK-96-PZTP-10)共同资助
文摘
剩余杂合系是QTL精细定位的较好衍生群体,它是在重组自交系构建过程中形成的。本研究均匀选择了遍布大白菜全基因组的51对前景/背景标记,随机选择了重组自交系群体构建过程中的57个家系,从中选株系的F_5跟踪检测至F_8。研究数据表明:从F_5至F_8,特定位点的平均剩余杂合率分别是7.06%、3.51%、1.38%和0.38%;剩余杂合位点在所选株系内的基因组覆盖率分别是90.19%、76.47%、52.94%和21.57%,覆盖率迅速降低。值得关注的是:在F_5代时,剩余杂合位点不仅覆盖了90%以上的基因组范围,且特定家系多个杂合位点多位于不同的染色体上,在接下来F_6代的筛选中很容易得到单位点剩余杂合单株。因此,本研究基于前景/背景标记的检测数据认为,高效率筛选剩余杂合单株的时期是F_5~F_6世代。这为提高作物农艺性状精细解析和精准定位提供了参考依据。
关键词
大白菜
重组自交系群体
前景/背景标记
剩余杂合位点
基因组覆盖率
Keywords
Brassica rapa
Recombination inbred lines population
Foreground/background markers
Residual heterozygous locus
Genome coverage
分类号
S634.1 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大白菜重组自交系群体构建过程中剩余杂合位点的变化趋势
刘栓桃
张志刚
李巧云
赵智中
王立华
王淑芬
徐文玲
刘贤娴
刘辰
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
原文传递
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参考文献
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