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一种新的非翻译区剪接位点识别方法
1
作者
吕俊杰
王科俊
+1 位作者
冯伟兴
王鑫
《生命科学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期20-24,共5页
为提高非翻译区剪接位点识别的精度,提出一种统计概率与支持向量机相结合的识别方法 .该方法主要分为两个阶段,第一阶段应用统计学方法对非翻译区(UTR)序列进行描述,将序列中各碱基之间的相关性、位置特异性、保守性等特征用概率形式描...
为提高非翻译区剪接位点识别的精度,提出一种统计概率与支持向量机相结合的识别方法 .该方法主要分为两个阶段,第一阶段应用统计学方法对非翻译区(UTR)序列进行描述,将序列中各碱基之间的相关性、位置特异性、保守性等特征用概率形式描述,以概率参数作为第二阶段支持向量机的输入向量,第二阶段应用带有多项式核函数的支持向量机(SVM)对剪接位点进行识别.通过对人类5′UTR剪接位点数据集进行测试,结果表明:该方法对非翻译区剪接位点的识别取得了很好的效果.
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关键词
剪接
位点
:
非
翻译
区
剪接
序列
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职称材料
题名
一种新的非翻译区剪接位点识别方法
1
作者
吕俊杰
王科俊
冯伟兴
王鑫
机构
哈尔滨工程大学自动化学院
剑桥大学癌症分子研究中心
出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期20-24,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(61071174)
国家"863"高科技资助项目(2008AA01Z148)
中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(HEUCFT1102)
文摘
为提高非翻译区剪接位点识别的精度,提出一种统计概率与支持向量机相结合的识别方法 .该方法主要分为两个阶段,第一阶段应用统计学方法对非翻译区(UTR)序列进行描述,将序列中各碱基之间的相关性、位置特异性、保守性等特征用概率形式描述,以概率参数作为第二阶段支持向量机的输入向量,第二阶段应用带有多项式核函数的支持向量机(SVM)对剪接位点进行识别.通过对人类5′UTR剪接位点数据集进行测试,结果表明:该方法对非翻译区剪接位点的识别取得了很好的效果.
关键词
剪接
位点
:
非
翻译
区
剪接
序列
Keywords
splice site
untranslated regions(UTR)
splice sequence
分类号
Q522.2 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种新的非翻译区剪接位点识别方法
吕俊杰
王科俊
冯伟兴
王鑫
《生命科学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
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