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35份水稻骨干亲本氮高效基因分析及功能分子标记开发
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作者 龙武华 吴朝昕 +3 位作者 刘雪薇 吴娴 姜雪 朱速松 《现代农业科技》 2024年第17期163-167,共5页
氮是影响水稻产量形成最重要的元素之一,其合理和高效利用是农业可持续发展的重要保障。通过靶向测序技术鉴定了35份水稻骨干亲本OsNPF6.1、NRT1.1B、OsNR2和OsGRF4的基因型,并基于PARMS技术(penta-primer amplification refractory mut... 氮是影响水稻产量形成最重要的元素之一,其合理和高效利用是农业可持续发展的重要保障。通过靶向测序技术鉴定了35份水稻骨干亲本OsNPF6.1、NRT1.1B、OsNR2和OsGRF4的基因型,并基于PARMS技术(penta-primer amplification refractory mutation system)开发了OsNPF6.1、OsNR2和OsGRF4的荧光功能分子标记。结果表明,荧光功能分子标记检测结果与靶向测序结果一致,并且明确了靶向测序未明确的氮高效基因型。综上所述,开发的氮高效基因功能分子标记为培育氮高效水稻新品种提供了技术支撑。 展开更多
关键词 水稻 骨干亲本 氮高效基因 靶向测序 分子标记
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小麦条锈病抗性基因定位及分子标记技术研究进展 被引量:3
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作者 杨芳萍 曹世勤 +8 位作者 郭莹 杜久元 鲁清林 吕迎春 白斌 周刚 张文涛 马瑞 何瑞 《寒旱农业科学》 2024年第1期1-10,共10页
条锈病流行对小麦生产造成巨大损失,选育和种植持久抗性品种是防治小麦条锈病最经济有效的策略。为达到多基因聚合培育持久抗病品种的目标,必须不断发掘抗病种质、解析其抗病遗传机制并开发分子标记。基于文献,对条锈病抗性基因发掘涉... 条锈病流行对小麦生产造成巨大损失,选育和种植持久抗性品种是防治小麦条锈病最经济有效的策略。为达到多基因聚合培育持久抗病品种的目标,必须不断发掘抗病种质、解析其抗病遗传机制并开发分子标记。基于文献,对条锈病抗性基因发掘涉及的抗病性、分子标记、基因定位方法和定位进展及其在育种中的应用进行了综述,明确了小麦条锈病基因定位涉及技术的现状、局限性及优势,从而为后续的条锈病抗性基因发掘、多基因聚合和持久抗性小麦品种的选育与生产布局提供技术指导,以降低西北麦区和小麦主产区条锈病流行的频率,进一步促进国家粮食安全。 展开更多
关键词 小麦 抗条锈基因 分子标记 连锁和关联分析 测序技术 育种应用
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大豆花叶病毒抗性基因及分子标记研究进展
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作者 王大刚 黄志平 +2 位作者 杨勇 李杰坤 吴倩 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期882-897,共16页
大豆花叶病毒(SMV,soybean mosaic virus)病是世界大豆主产区广泛存在且普遍发生的主要病害之一,对大豆的产量和品质均可造成严重危害。本文综合分析了近年来通过遗传定位发现的大豆花叶病毒抗性基因及其紧密连锁的分子标记,探讨了分子... 大豆花叶病毒(SMV,soybean mosaic virus)病是世界大豆主产区广泛存在且普遍发生的主要病害之一,对大豆的产量和品质均可造成严重危害。本文综合分析了近年来通过遗传定位发现的大豆花叶病毒抗性基因及其紧密连锁的分子标记,探讨了分子标记在提高大豆抗病育种中的应用,总结了R_(SC3(w))、R_(SC14-r)和R_(SC18)等抗大豆花叶病毒基因的物理位置及其候选基因。基于候选基因测序、实时荧光定量PCR、病毒介导基因沉默(VIGS,virus induced gene silencing)和基因编辑CRISPR/Cas9等技术梳理出GsCAD1、GmCAL和GmMLRK1等一系列直接或间接参与大豆花叶病毒抗性的相关基因,为大豆抗大豆花叶病毒基因调控网络的完善奠定了基础。本综述总结分析了大豆与大豆花叶病毒的相互作用机制,聚焦分析大豆抗性基因Rsv3等对大豆花叶病毒抗病机制研究进展,并对抗大豆花叶病毒育种的研究方向提出了展望,以期为大豆抗性基因分子标记的应用和分子调控机制的研究提供参考。 展开更多
关键词 大豆 病毒 抗性 分子标记 基因
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基于大球盖菇基因组的SSR分子标记开发及指纹数据库应用 被引量:1
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作者 李雪松 孙达锋 +4 位作者 刘绍雄 张俊波 岳万松 李建英 华蓉 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期84-93,共10页
以13个大球盖菇菌株及其已公布的基因组为试材,采用生物信息学和试验验证相结合的方法,研究了大球盖菇基因组上的SSR类型及分布,设计了100对SSR引物开展试验验证,以期为大球盖菇的种质资源鉴定、品种选育、分子标记辅助育种等研究提供... 以13个大球盖菇菌株及其已公布的基因组为试材,采用生物信息学和试验验证相结合的方法,研究了大球盖菇基因组上的SSR类型及分布,设计了100对SSR引物开展试验验证,以期为大球盖菇的种质资源鉴定、品种选育、分子标记辅助育种等研究提供参考依据。结果表明:总计检索到6种SSR类型的2 124条序列,其中主要以三核苷酸类型为主,共计704,占SSR总数的33.15%;五、六碱基重复类型较多,但总和只占全部SSR数量的14.59%。由验证试验获得16对引物,其中引物DQGSSR020、DQGSSR031、DQGSSR077的多态性较高、特异性好、无杂峰、荧光亮度高、区分度好。同时,基于16对SSR引物进行大球盖菇DNA指纹编码构建,获得了13个大球盖菇菌株的32位数分子指纹数据库编码。 展开更多
关键词 大球盖菇 基因 SSR分子标记开发
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水稻云恢1973恢复基因关联分子标记筛选及应用
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作者 杨丹丹 吕莹 +6 位作者 董阳均 徐雨然 奎丽梅 涂建 张笑 邓伟 李小林 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期55-64,共10页
恢复系作为三系杂交稻关键亲本之一,在杂种后代的性状方面发挥着主要的调控作用,但目前生产上用的水稻恢复系同质化严重,创制遗传背景丰富的新恢复系显得尤为重要.选用WA型强恢复系—云恢1973和WA型不育系广8A构建F_(2)群体,筛选与云恢1... 恢复系作为三系杂交稻关键亲本之一,在杂种后代的性状方面发挥着主要的调控作用,但目前生产上用的水稻恢复系同质化严重,创制遗传背景丰富的新恢复系显得尤为重要.选用WA型强恢复系—云恢1973和WA型不育系广8A构建F_(2)群体,筛选与云恢1973恢复基因紧密连锁的标记,利用筛选到的标记对云恢1973与云恢290构建的重组自交系材料进行恢复基因的快速扫描;筛选出含有云恢1973恢复基因的重组自交系材料进行后代育性及农艺性状鉴定,筛选出新的具有丰富遗传背景的恢复系,为杂交水稻的可持续发展奠定物质基础.结果表明:在2,10,11号染色体上筛选到12个与育性恢复紧密连锁的分子标记,综合12个分子标记结果,于300株云恢290/云恢1973重组自交系中筛选到72份含恢复基因的新恢复系材料;在峨山和水富试验点对72份新恢复系材料进行鉴定,结果显示72份新恢复系花粉育性均表现为正常,单株有效穗在10穗以上的材料有11份,每穗粒数在250粒以上的材料有8份,千粒质量在30.53 g以上的材料有8份,结实率在80%以上的材料有8份,单株产量高于对照的材料有19份,并有6份低直链淀粉含量材料、29份高直链淀粉含量材料. 展开更多
关键词 水稻 恢复系 恢复基因 分子标记辅助选择
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基于全基因组重测序的油莎豆InDel位点鉴定及分子标记开发
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作者 张向歌 程珊 +6 位作者 陈晨 朱雅婧 李春鑫 许欣然 王树峰 武林海 王会伟 《种子》 北大核心 2024年第8期52-59,共8页
选取4种不同类型油莎豆种质资源进行全基因组重测序,以此全基因组水平鉴定油莎豆的InDel位点,并根据多态性InDel位点序列信息开发有效的分子标记。基于重测序数据与油莎豆参考基因组的序列比对,利用GATK和SAMtools软件共鉴定到321271个I... 选取4种不同类型油莎豆种质资源进行全基因组重测序,以此全基因组水平鉴定油莎豆的InDel位点,并根据多态性InDel位点序列信息开发有效的分子标记。基于重测序数据与油莎豆参考基因组的序列比对,利用GATK和SAMtools软件共鉴定到321271个InDel位点,在油莎豆各个scaffold上呈现高密度分布,其中93%以上位点呈现出杂合类型。通过4种油莎豆种质间InDel位点的多态性分析,发现98%的InDel位点不具有多态性,最终鉴定出6036个多态性InDel位点。基于多态性InDel位点的插入/缺失序列长度分析,筛选出829个插入/缺失序列长度大于20 bp的多态性InDel位点,适用于开发可通过琼脂糖凝胶电泳检测的InDel分子标记。选择8个多态性位点进行InDel分子标记开发和琼脂糖凝胶电泳检验,结果表明,鉴定的多态性InDel位点真实可靠以及开发的InDel分子标记合适可用。本研究利用不同类型油莎豆种质鉴定出大量的多态性InDel位点,能够开发出适合、准确、有效的InDel分子标记,极大地丰富了油莎豆的分子标记资源,为油莎豆种质资源更加精确的评价、鉴定和利用提供可靠的技术支撑。 展开更多
关键词 油莎豆 种质资源 基因组重测序 InDel位点 分子标记
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水稻中八个稻瘟病抗性基因特异分子标记的开发及应用
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作者 杨好 黄衍焱 +5 位作者 王剑 易春霖 石军 谭楮湉 任文芮 王文明 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期525-534,共10页
【目的】为了明确水稻亲本的稻瘟病抗性基因组成,并有效地应用于水稻抗性育种,开发不受遗传背景限制的分子标记至关重要。这些分子标记能够精确地识别亲本中的抗性基因,为分子辅助育种提供重要的工具。【方法】发掘抗性基因编码区在155... 【目的】为了明确水稻亲本的稻瘟病抗性基因组成,并有效地应用于水稻抗性育种,开发不受遗传背景限制的分子标记至关重要。这些分子标记能够精确地识别亲本中的抗性基因,为分子辅助育种提供重要的工具。【方法】发掘抗性基因编码区在155份水稻材料中等位基因的核苷酸多态性位点,在特异性最强位点开发分子标记。【结果】经多重阳性及阴性对照或部分结果的重测序检验,为Pit、Pish、Pib、Pid3、Pi5、Pia、Pi54和Pita2/Ptr等8个抗性基因开发了有效的分子标记,并明确这些抗性基因在109个四川盆地常用育种亲本中的组成。其中,Pia基因不存在于这些亲本中,Pit、Pish、Pi54、Pid3、Ptr/Pita2、Pi5和Pib基因分别存在于3.67%、13.76%、14.68%、18.35%、24.77%、26.61%和38.53%的亲本中。另外,有21.10%的水稻亲本不含这些基因,35.78%的亲本只含有1个抗性基因,43.12%的亲本聚合了2~4个抗性基因。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 抗性基因 分子标记
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基于简化基因组测序宽鳍鱲的微卫星分子标记及遗传多样性分析
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作者 覃宁 张桂蓉 +1 位作者 马徐发 魏开建 《贵州农业科学》 CAS 2024年第8期78-83,共6页
【目的】建立基于简化基因组测序(2b-RAD)宽鳍鱲(Zacco platypus)的微卫星分子标记,并进行遗传多样性分析,为有效开展宽鳍鱲品种间遗传多样性分析和分子育种,挖掘和利用宽鳍鱲种质资源提供参考。【方法】利用限制性内切酶EcoRⅠ打断基因... 【目的】建立基于简化基因组测序(2b-RAD)宽鳍鱲(Zacco platypus)的微卫星分子标记,并进行遗传多样性分析,为有效开展宽鳍鱲品种间遗传多样性分析和分子育种,挖掘和利用宽鳍鱲种质资源提供参考。【方法】利用限制性内切酶EcoRⅠ打断基因组DNA,每个样本分别进行物理打碎,选取300~700 bp插入片段文库,利用Illumina HiSeq PE150测序平台进行双末端(Paired-End)测序获得海量遗传多态性标签序列。【结果】2b-RAD筛选宽鳍鱲的微卫星位点得到两端各留100 bp作为引物的SSR数量为41018个,带有引物片段的SSR数量为1522个,片段引物的设计率为37.1%,构建的文库质量较高,测序深度达高准确度下的分型标准。在筛选的64个微卫星位点中,有14个位点(21.88%)具有多态性,由于存在无效等位基因,有3个位点(Zpla08、Zpla09和Zpla10)显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),因此选用其中的11个微卫星位点分析宽鳍鱲群体遗传多样性。基于11个微卫星DNA位点的分析表明,宽鳍鱲7个群体的平均等位基因数(N_(A))为3.66,平均Shannon;s信息指数(I)为0.689,平均观测杂合度(H_(O))为0.315,平均期望杂合度(H_(E))为0.354,平均多态信息含量(PIC)为0.409。【结论】基于简化基因组测序(2b-RAD)开发宽鳍鱲的微卫星分子标记可用于评估野生宽鳍鱲种群的遗传多样性、遗传结构和物种鉴定。宽鳍鱲基因组DNA 14个微卫星位点中有11个微卫星位点具有中高多态性,3个位点(Zpla08、Zpla09、Zpla10)偏离Hardy-Weinberg平衡,在群体遗传研究中应慎用。 展开更多
关键词 宽鳍鱲 简化基因组测序 微卫星分子标记 微卫星位点 遗传多样性 等位基因
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48份小麦品种(系)抗条锈病和条锈病基因的分子标记检测及其抗性评价
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作者 刁文达 李超玲 +3 位作者 李昭燕 权衡 亢玲 闫晓翠 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第18期154-159,共6页
为明确宁夏小麦品种(系)对小麦条锈病和赤霉病的抗病水平,采用与已知抗病基因紧密连锁的特异性标记法对48份小麦材料进行分子标记检测,并对供试小麦品种(系)进行系谱分析。通过对抗条锈病和抗赤霉病典型代表基因Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Y... 为明确宁夏小麦品种(系)对小麦条锈病和赤霉病的抗病水平,采用与已知抗病基因紧密连锁的特异性标记法对48份小麦材料进行分子标记检测,并对供试小麦品种(系)进行系谱分析。通过对抗条锈病和抗赤霉病典型代表基因Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18、Yr26、Yr30和Fhb1进行检测,并对其在宁夏小麦中的分布频率进行分析。结果表明,在48份参试品种(系)中,分别含有Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18、Yr26、Yr30抗性基因的小麦材料有41、15、5、16、20、45、26份,占供试材料的85%、31%、1%、33%、41%、93%、54%;在所测的小麦品系中有42份供试材料携带Fhb1基因,占供试材料的87%。本研究,通过选用中国宁夏48份典型小麦品种(系)进行抗条锈病和赤霉病的分子标记检测,为作物育种和遗传研究提供有效遗传信息。 展开更多
关键词 小麦 条锈病 分子标记 基因检测 种质资源 抗性评价
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甜瓜果形基因CmSUN25-26-27a的鉴定和分子标记
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作者 郑静文 曹晨晨 +4 位作者 曹磊 李文龙 王盼乔 李翔 胡建斌 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期195-204,共10页
【目的】挖掘甜瓜果形相关基因,为甜瓜果实形状的遗传改良提供理论基础。【方法】通过全基因组鉴定,系统发育分析,结合表达量与果形的关联分析来鉴定参与甜瓜果形调控的CmSUN基因,并利用候选基因在自然群体中的序列变异开发相关分子标... 【目的】挖掘甜瓜果形相关基因,为甜瓜果实形状的遗传改良提供理论基础。【方法】通过全基因组鉴定,系统发育分析,结合表达量与果形的关联分析来鉴定参与甜瓜果形调控的CmSUN基因,并利用候选基因在自然群体中的序列变异开发相关分子标记。【结果】通过全基因组鉴定及系统发育分析,鉴定到甜瓜CmSUN家族的CmSUN25-26-27a基因。该基因在开花当天的雌花中有显著的表达,并且在不同果形甜瓜中的表达量与果形指数(fruit shape index,FSI)呈正相关关系;对200份自然群体的序列分析发现,CmSUN25-26-27a基因编码区存在一个SNP-Single Nucleotide Polymorphism(A/G),导致了编码氨基酸的非同义突变,含有CmSUN25-26-27a^(A)等位基因的厚皮甜瓜的FSI显著高于含CmSUN25-26-27a^(G)等位基因的厚皮种质。该SNP位点将厚皮甜瓜按果形大致分为FSI>1.5(A)和FSI<1.5(G)两种类型。根据该SNP位点设计了用于区分甜瓜果形的dCAPS标记。【结论】CmSUN25-26-27a同源基因广泛参与葫芦科作物的果形调控,该基因在甜瓜中的表达量及序列变异与甜瓜FSI具有显著相关性。 展开更多
关键词 甜瓜 CmSUN基因家族 CmSUN25-26-27a基因 果实形状 分子标记
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分子标记辅助选择W_(x)^(mp)基因改良晚粳品种宁84稻米品质
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作者 黄宣 叶朝辉 严成其 《作物研究》 2024年第4期308-313,共6页
为改良晚粳水稻品种宁84的稻米品质,培育低直链淀粉含量的软米粳稻新品系,利用携带软米基因W_(x)^(mp)的水稻品种南粳9108为供体亲本,以晚粳品种宁84为受体亲本,利用分子标记辅助选择将W_(x)^(mp)基因回交导入到宁84中,创制了宁84(W_(x)... 为改良晚粳水稻品种宁84的稻米品质,培育低直链淀粉含量的软米粳稻新品系,利用携带软米基因W_(x)^(mp)的水稻品种南粳9108为供体亲本,以晚粳品种宁84为受体亲本,利用分子标记辅助选择将W_(x)^(mp)基因回交导入到宁84中,创制了宁84(W_(x)^(mp))改良系。结果显示:宁84(W_(x)^(mp))改良系的农艺性状与宁84差异不显著,其背景回复率达到98.7%;与宁84相比,其直链淀粉含量由17%降低到10%左右,胶稠度由70 mm增加到最高80 mm;改良系的垩白度和垩白粒率显著增高,透明度显著降低,碱消值保持不变,整精米率和精米率显著高于对照,食味品质明显提升。宁84(W_(x)^(mp))改良系的成功培育,为今后粳稻软米新品系的选育及推广打下了良好基础。 展开更多
关键词 水稻 育种 分子标记辅助选择 W_(x)^(mp)基因 稻米品质 宁84
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分子标记技术在基因分型中的应用进展
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作者 叶长胜 黄佳美 +1 位作者 邢娟娟 刘士奇 《江西畜牧兽医杂志》 2024年第2期16-20,共5页
分子标记技术立足于遗传物质多态性,具有一定的稳定性、准确性和高效性。基于分子标记技术的基因分型,不仅可以建立外在性状与内在基因的联系,而且根据试验结果可分析出优势基因型,有利于进行流行病学调查统计及监控,同时可探讨遗传变... 分子标记技术立足于遗传物质多态性,具有一定的稳定性、准确性和高效性。基于分子标记技术的基因分型,不仅可以建立外在性状与内在基因的联系,而且根据试验结果可分析出优势基因型,有利于进行流行病学调查统计及监控,同时可探讨遗传变异情况及其亲缘关系。此外,特异性片段还提供了新的基因组信息。因此,分子标记技术在基因分型中发挥着举足轻重的作用。本文简要介绍几类常用于基因分型的分子标记技术,并结合国内外的应用情况,比较各类分子标记技术在应用过程中的优势与不足,探讨分子标记技术在基因分型特别是在动物病原菌方面的发展应用前景,为实际应用中分子标记技术的选择提供依据。 展开更多
关键词 基因分型 分子标记 DNA序列多态性
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小麦四个抗白粉病基因的KASP标记检测
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作者 李玮 宋国琦 +6 位作者 张迎迎 李玉莲 张淑娟 张荣志 李吉虎 高洁 李根英 《山东农业科学》 北大核心 2024年第5期36-41,共6页
为提高Pm13的检测效率,了解Pm21、PmV、Pm12和Pm13共4个小麦抗白粉病基因在山东小麦育种中的利用情况,本研究通过测序和引物设计成功转化了Pm13的KASP标记,并采用4个基因的KASP标记对2022—2023年山东省小麦高产区试组和强筋区试组的14... 为提高Pm13的检测效率,了解Pm21、PmV、Pm12和Pm13共4个小麦抗白粉病基因在山东小麦育种中的利用情况,本研究通过测序和引物设计成功转化了Pm13的KASP标记,并采用4个基因的KASP标记对2022—2023年山东省小麦高产区试组和强筋区试组的140份参试品系和2份区试对照品种进行检测,结果显示140份材料均不含上述4个基因,表明它们在山东小麦育种中应用较少。本研究可为利用KASP标记开展小麦抗白粉病基因的分子标记辅助选择提供参考,促进其育种应用。 展开更多
关键词 小麦 抗白粉病基因 Pm13 KASP标记 分子标记辅助选择
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抗稻瘟病水稻恢复系的分子标记辅助选育及抗性鉴定
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作者 孙富 唐梅 +2 位作者 卢宏琮 何聪 廖张波 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1070-1078,共9页
【目的】开展抗稻瘟病水稻恢复系的分子标记辅助选育及抗性鉴定,为育成持久、广谱抗病优质杂交水稻新品种提供优异的遗传资源和技术参考。【方法】利用分子标记辅助选择和回交育种技术,将持久、广谱的抗稻瘟病基因Pi1、Pi2和Pigm导入恢... 【目的】开展抗稻瘟病水稻恢复系的分子标记辅助选育及抗性鉴定,为育成持久、广谱抗病优质杂交水稻新品种提供优异的遗传资源和技术参考。【方法】利用分子标记辅助选择和回交育种技术,将持久、广谱的抗稻瘟病基因Pi1、Pi2和Pigm导入恢复系桂R1703,获得了单基因、双基因和三基因导入系,并对其进行稻瘟病鉴定和农艺性状调查,分析不同抗稻瘟病基因间的抗性效应及抗性基因导入对受体亲本农艺性状的影响。【结果】通过对杂交后代和回交群体的Pi1、Pi2和Pigm基因相关分子标记检测,发现抗稻瘟病基因Pi1、Pi2和Pigm已成功导入到桂R1703中,筛选获得7个携带有抗稻瘟病基因且抗性和农艺性状综合表现优良的导入株系,表现出较强的稻瘟病抗性。单基因导入系中,抗稻瘟病基因的抗性效应排序为为Pigm>Pi2>Pi1;双基因和三基因导入系的稻瘟病抗性均强于单基因导入系,尤其以三基因导入系抗性最强,不同基因聚合的抗性效应排序为Pi1+Pi2+Pigm>Pi2+Pigm>Pi1+Pigm>Pi1+Pi2。7个瘟病抗性基因导入株系与桂R1703在穗长和千粒重方面无显著差异(P>0.05,下同),有2个瘟病抗性基因导入系的株高显著高于桂R1703(P<0.05,下同);有1个瘟病抗性基因导入系的单株有效穗显著高于桂R1703;有3个瘟病抗性基因导入系的单穗总粒数显著高于桂R1703;有5个瘟病抗性基因导入系结实率显著低于桂R1703;有2个瘟病抗性基因导入系的单株产量显著低于桂R1703;有4个瘟病抗性基因导入系的单株产量显著高于桂R1703。【结论】通过分子标记辅助选育可有效聚合多基因(Pi1、Pi2和Pigm基因),使恢复系桂R1703的稻瘟病抗性得到明显提升,获得一系列抗稻瘟病且与亲本其他性状相近的遗传材料,可作为亲本材料用于选育抗病优质的杂交稻。 展开更多
关键词 水稻 恢复系 稻瘟病 抗性基因 分子标记辅助育种 抗性评价
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《动物分子遗传标记》实验教学设计与实践
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作者 房希碧 刘博群 +4 位作者 张金玉 潘英树 闫守庆 丁雪梅 官员 《畜牧兽医杂志》 2024年第3期75-78,81,共5页
基于“新农科”动物生产类专业创新型复合畜牧人才培养的需求,将CRISPR/Cas9介导的基因敲除小鼠模型引入动物分子遗传标记实验课程中,设计了基因缺失分子标记检测与分析实验,采用基于PBL的混合式教学模式,学生能系统掌握基因组DNA提取、... 基于“新农科”动物生产类专业创新型复合畜牧人才培养的需求,将CRISPR/Cas9介导的基因敲除小鼠模型引入动物分子遗传标记实验课程中,设计了基因缺失分子标记检测与分析实验,采用基于PBL的混合式教学模式,学生能系统掌握基因组DNA提取、PCR扩增技术、琼脂糖凝胶电泳分析、基因型判定等相关理论和实验技术,将多门专业课程的实践环节有机结合,促进了学生理论知识与实验技能的融会贯通,激发了学生的学习热情,提升了专业认同感,培养了综合素质和创新能力。 展开更多
关键词 分子遗传标记 基因缺失鉴定 实验设计 混合式教学
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全基因组关联分析筛选鹅蛋品质相关分子标记 被引量:2
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作者 高广亮 张克山 +5 位作者 赵献芝 许国洋 谢友慧 周莉 张昌莲 王启贵 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第19期3894-3904,共11页
【目的】通过筛选与鹅蛋品质性状相关的分子标记和候选基因,为解析蛋品质性状的遗传机制及分子标记辅助选择提供理论支撑。【方法】采用同批次健康四川白鹅群体(209只)作为研究对象。收集了每只鹅在产蛋高峰期连续生产的5枚蛋,并测定了... 【目的】通过筛选与鹅蛋品质性状相关的分子标记和候选基因,为解析蛋品质性状的遗传机制及分子标记辅助选择提供理论支撑。【方法】采用同批次健康四川白鹅群体(209只)作为研究对象。收集了每只鹅在产蛋高峰期连续生产的5枚蛋,并测定了蛋重、蛋形指数、蛋壳强度、蛋壳厚度、蛋壳重和蛋黄重量等6个蛋品质性状。基于前期209只四川白鹅(母鹅)2.896 Tb全基因组重测序数据(12.44×/个体),采用全基因组关联分析的方法,筛选与蛋品质性状相关的SNP位点和重要候选基因,并通过核酸飞行时间质谱方法检测了这些SNP位点的基因型频率。【结果】经过筛选过滤,共有9279339个SNPs和209个个体用于后续研究。GWAS研究发现,48个SNP位点与6个鹅蛋品质性状显著或建议性显著相关(阈值分别为5.43×10-9和1.09×10-7),并注释出27个蛋品质性状相关的候选基因,包括妊娠相关血浆蛋白A(pappalysin1,PAPPA)、蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸酶调节亚基2基因(serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2,PP4R2)、乙醇胺磷酸转移酶1(ethanolamine phosphotransferase 1,EPT1)和离子型谷氨酸受体K2(glutamate receptor ionotropic,kainate 2,GRIK2)等,其中候选基因PAPPA参与蛋白质代谢,促进生长因子IGF生成,在PP4R2的11bp范围内存在5个SNPs与蛋壳厚度显著相关,另外在GRIK2上有6个SNPs与蛋黄重量显著相关,GRIK2和PP4R2分别与机体血钙维持功能以及胆固醇代谢相关。功能富集研究发现,候选基因主要参与了response to growth factor(GO:0070848)、intracellular chemical homeostasis(GO:0055082)、response to hormone(GO:0009725)和regulation of the monoatomic ion transport(GO:43269)等代谢通路。【结论】经GWAS方法筛选出PAPPA、GRIK2、ASCC3和EPT1分别作为蛋重、蛋黄重、蛋壳强度等蛋品质性状潜在功能基因,为鹅蛋品质性状的改良提供了分子遗传标记的理论参考。 展开更多
关键词 基因组关联分析 分子标记辅助选择 蛋品质性状
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分子标记辅助选择小麦赤霉病抗病基因聚合体 被引量:2
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作者 陈天青 李红艳 +5 位作者 王伟 隋建枢 罗永露 吴文强 程斌 何庆才 《种子》 北大核心 2023年第8期114-119,共6页
赤霉病和条锈病是小麦的两种主要病害,两种病害都会影响小麦的品质和产量。贵协2号高抗条锈病、感赤霉病,NMAS22高抗赤霉病并携带4个抗赤霉病基因。为选育抗赤霉病、抗条锈病的品种,本研究将贵协2号与NMAS22组配,在其分离世代(F 2)采用... 赤霉病和条锈病是小麦的两种主要病害,两种病害都会影响小麦的品质和产量。贵协2号高抗条锈病、感赤霉病,NMAS22高抗赤霉病并携带4个抗赤霉病基因。为选育抗赤霉病、抗条锈病的品种,本研究将贵协2号与NMAS22组配,在其分离世代(F 2)采用自然诱发法、单花滴注法分别对条锈病和赤霉病进行抗性鉴定,同时利用与抗赤霉病基因Fhb1、Fhb2、Fhb4、Fhb5紧密连锁的6个分子标记对群体中条锈病抗病株进行检测,筛选具有单个或多个抗赤霉病基因组合的抗病株。抗性鉴定显示,共有349个单株抗条锈病,467个单株抗赤霉病;分子检测显示,携带Fhb1、Fhb2、Fhb4、Fhb5基因的单株分别有201,245,248,194株,同时携带有2,3,4个基因的单株分别有79,140,85株。相关分析显示,携带Fhb1基因与赤霉病抗性呈极显著相关。 展开更多
关键词 小麦 条锈病 赤霉病 基因组合 分子标记辅助育种
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与辣椒抗TMV L^(3)基因连锁的分子标记的筛选及种质资源抗TMV鉴定 被引量:1
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作者 陈灵芝 张茹 +1 位作者 王兰兰 高彦萍 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期585-592,共8页
以含抗辣椒TMV的L^(3)基因的材料L15为基础,利用与L^(3)基因连锁的3个分子标记189D23MF、PMFR11和PMFR21对种质资源进行鉴定.对L15、3份感病材料H8/H9/H11×L15 F_(1)、46份辣椒种质资源进行室内人工TMV接种并对其进行表型抗性鉴定... 以含抗辣椒TMV的L^(3)基因的材料L15为基础,利用与L^(3)基因连锁的3个分子标记189D23MF、PMFR11和PMFR21对种质资源进行鉴定.对L15、3份感病材料H8/H9/H11×L15 F_(1)、46份辣椒种质资源进行室内人工TMV接种并对其进行表型抗性鉴定和RT-PCR检测.对筛选出的标记在F_(1)及BC_(1)P_(1)群体中进行验证.结果表明:分子标记189D23MF在L15和12份辣椒种质上均未扩增出条带;SCAR标记PMFR11在L15和46份辣椒种质上呈现共显性分离,SCAR标记PMFR21为显性标记.通过室内人工接种鉴定方式,2份材料L15、H11×L15表现为高抗.H9×L15表现为抗,H8×L15及5份材料A1、A35、A39、A55、L16表现为中抗,11份材料表现为感病,30份材料表现为高感.在F1及BC1P1群体中PCR扩增结果表明SCAR标记PMFR21可用于辣椒抗TMV分子标记辅助选择. 展开更多
关键词 辣椒 L^(3)基因 分子标记 种质资源 TMV
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水稻抗稻瘟病基因Pi35功能性分子标记的开发及其应用 被引量:16
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作者 马建 马小定 +5 位作者 赵志超 王帅 王久林 王洁 程治军 雷财林 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1779-1790,共12页
稻瘟病是水稻生产上的严重病害,利用抗病基因培育抗病品种是控制稻瘟病最经济而有效的措施。在日本,稻瘟病部分抗性基因Pi35作为广谱持久抗性基因已广泛应用于水稻育种和稻瘟病防治实践。但是,Pi35基因在我国的资源和品种中的分布情况不... 稻瘟病是水稻生产上的严重病害,利用抗病基因培育抗病品种是控制稻瘟病最经济而有效的措施。在日本,稻瘟病部分抗性基因Pi35作为广谱持久抗性基因已广泛应用于水稻育种和稻瘟病防治实践。但是,Pi35基因在我国的资源和品种中的分布情况不清,制约了这一重要基因在我国育种实践中的应用,急需开发实用的分子标记,并系统研究该基因在我国的品种及其亲本中的分布情况,为稻瘟病抗性育种服务。本研究通过比对抗、感品种中Pi35等位基因序列,发现一个能检测抗、感病性差异的特异SNP(3780 T),并据此开发了Pi35基因的功能性分子标记Pi35-d CAPS。利用该标记检测了抗源藤系138的衍生品种10份、微核心种质204份和主栽品种67份,结合测序鉴定,确认5份藤系138衍生品种(垦鉴稻3号、垦鉴稻6号、垦稻8号、绥粳3号和龙粳34)及2份微核心种质(粳稻品种抚宁紫皮粳子和籼稻品种细麻线)携带Pi35基因。本研究结果为通过分子育种手段高效利用Pi35基因改良我国水稻(特别是籼稻)品种的稻瘟病抗性提供了手段。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 部分抗性基因 功能性标记 分子标记辅助选择
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马铃薯主栽品种抗马铃薯金线虫鉴定及抗性分子标记检测
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作者 黄立强 江如 +7 位作者 朱波汁 彭焕 许翀 宋家雄 陈敏 李永青 黄文坤 彭德良 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1506-1516,共11页
[目的]马铃薯金线虫(Globodera rostochiensis)是国际公认的重要检疫性有害生物,目前已在云南、贵州、四川3省7县(市)发生危害,产区内多个种薯基地受到传播威胁。通过西南地区马铃薯主栽品种对马铃薯金线虫的抗性鉴定、分子标记检测及... [目的]马铃薯金线虫(Globodera rostochiensis)是国际公认的重要检疫性有害生物,目前已在云南、贵州、四川3省7县(市)发生危害,产区内多个种薯基地受到传播威胁。通过西南地区马铃薯主栽品种对马铃薯金线虫的抗性鉴定、分子标记检测及田间抗性评价,明确已知抗病基因的分布情况,为该地区马铃薯金线虫应急防控、抗病品种合理布局和良种推广提供依据。[方法]利用云南马铃薯金线虫群体对15份马铃薯主栽品种进行室内盆栽接种,计算最终单株孢囊数和相对感病性,根据抗性等级划分标准进行抗性评价;同时利用57R和TG689分子标记鉴定抗马铃薯金线虫H1,以β-胡萝卜素羟化酶基因的BCH分子标记为对照;并于2020年和2021年在云南省昭通市开展两年度的田间试验,在播种前和收获后分别采集土壤样品并分离孢囊,计算播种前初始群体密度(Pi)、最终群体密度(Pf)及平均繁殖系数(Pf/Pi)。马铃薯现蕾至始花期测定株高,收获时测定产量。[结果]15个马铃薯主栽品种中的云薯505、宣薯5号、会薯15号、会薯19号以及云薯304共5个品种为高抗品种,马铃薯金线虫基本不能在这些品种上繁殖;丽薯6号、宣薯6号为中感品种;其余8个为高感品种,尤其是会-2、丽薯15号以及宣薯8号的平均繁殖系数高于感病对照品种会薯16号(Pf/Pi=17.15)。两个H1基因鉴定分子标记结果大致相同,5个马铃薯品种,即云薯505、宣薯5号、会薯15号、云薯304和宣薯6号含H1。马铃薯金线虫的繁殖系数在田间抗/感马铃薯品种上具有显著性差异,抗性等级为9的高抗品种田间平均繁殖系数在2021年(0.04-0.12)和2022年(0.05-0.14)均<1.00,表明高抗品种种植后线虫田间群体密度有一定程度的降低。高感品种平均繁殖系数在2021年(1.18-2.75)和2022年(1.76-3.24)均>1.00,高感品种种植后田间线虫种群数量增加。不同品种间株高和产量差异显著(P<0.05),5个高抗品种株高的均值在两年间均显著高于8个高感品种。宣薯5号、会薯15号和会薯19号产量最高,两年度分别为51.67-56.48和33.28-40.57 t·hm^(-2),会-2产量最低。[结论]西南混作区主栽马铃薯高抗品种对马铃薯金线虫具有优良抗性,主要携带H1抗病基因且能够显著减少田间马铃薯金线虫群体密度。高抗品种中宣薯5号、会薯15号和会薯19号为高产抗病良种,云薯304为富锌薯片加工型品种。亟待根据马铃薯金线虫的发生分布,进一步有针对性地扩大对主栽品种抗性水平的鉴定。 展开更多
关键词 马铃薯金线虫 马铃薯抗性品种 H1抗病基因 分子标记检测
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