功能性单核苷酸多态性调控结核病易感的分子机制研究

目的通过构建花生四烯酸12-脂氧合酶（ALOX-12）基因（ALOX-12基因）启动子区域rs3840880位点不同基因型的双荧光素酶表达质粒，分析此单核苷酸多态性（singlenucleotide polymorphisms，SNP）对ALOX-12基因启动子活性的影响及其对基因表达的影响，阐明功能性SNP调控结核病易感的分子机制。方法从全血样本中提取人全基因组，PCR扩增ALOX-12基因启动子区域包含rs3840880位点在内的约1700bp的基因片段，构建pGL3-Basic-rs3840880G质粒，对此质粒进行定点突变得到pGL3-Basim-rs3840880D放散型（DEL）质粒，分别转染人宫颈癌细胞株Hela细胞后使用双荧光报告酶检测系统（dual luciferase assay system）检测相对荧光值。结果成功构建了ALOX-12基因启动子区rs3840880位点等位基因G的表达质粒pGL3-basim-G，采用定点突变技术成功将pGL3-basic-G质粒改造为pGL3-Basic-DEL质粒，测序验证后，两质粒其他序列完全相同。分别将此两个质粒转染Hela细胞并检测相对荧光比值[荧光值（F）／荧光（R）]后，发现pGL3-Basic质粒F／R=0．129，等位基因G的F／R=0．194，低于等位基因DEL质粒的F／R（0．274），采用单因素方差分析，二者之间的差异有统计学意义（F=25．09，P=0．001）。结论不同等位基因构建的质粒转染细胞后，荧光报告基因的表达差异具有统计学意义，故ALOX-12基因启动子区域的功能性SNPs确实能够影响启动子的活性，从而调控结核病的易感性。

Ghrelin基因单核苷酸多态性与老年痴呆及认知功能的相关性

目的 探讨饥饿素(Ghrelin)基因单核苷酸多态性与老年痴呆及认知功能的相关性。方法 选择老年痴呆患者100例;另选择健康体检老年人72例为对照组。采用荧光定量多聚合酶链反应检测Ghrelin基因多态性。采用简易精神状态检查(MMSE)量表和阿尔茨海默病评定量表-认知(ADAS-Cog)量表评定患者认知功能;采用痴呆患者生活质量量表(QOL-AD)和日常生活活动能力(ADL)评价患者生活能力。观察两组rs55821288位点等位基因分布情况;观察两组rs55821288位点基因型分布情况;观察两组MMSE评分和ADAS-Cog评分变化;观察两组QOL-AD评分和ADL评分变化;分析rs55821288位点等位基因与MMSE和ADAS-Cog相关性;分析rs55821288位点基因型分布与MMSE和ADAS-Cog相关性。结果 AD组rs55821288位点A等位基因频率显著高于对照组(P<0.05)。AD组rs55821288位点AA基因型频率显著高于对照组(P<0.05)。AD组MMSE评分和ADAS-Cog评分显著低于对照组(P<0.05)。AD组QOL-AD评分和ADL评分显著低于对照组(P<0.05)。经Pearson分析显示,rs55821288位点A等位基因与MMSE和ADAS-Cog呈线性负相关(P<0.05)。经Pearson分析显示,rs55821288位点AA基因型分布与MMSE和ADAS-Cog呈线性负相关(P<0.05)。结论 Ghrelin等位基因A及基因型AA对老年痴呆患者认知功能具有促进作用,且与认知功能密切相关。

Toll样受体和白细胞介素-17单核苷酸多态性与口腔扁平苔藓易感性的相关性研究

目的探讨Toll样受体(TLR)和白细胞介素-17(IL-17)基因的遗传多态性及与口腔扁平苔藓(OLP)的相关性。方法选取病例组(OLP组)患者与对照组(未患OLP人群)外周血提取的DNA为研究对象,选取TLR与IL-17上的7个单核苷酸多态性(SNP)位点,分别是TLR3中的rs5743312、TLR2中的rs121917864和IL-17A中的5个SNP位点(rs4711998、rs3819024、rs8193036、rs3748067和rs17878530)。采用高分辨率熔解曲线分析法进行外周血细胞PCR产物基因多态性检测,并与DNA测序结果比对。统计分析SNP位点与OLP发生的相关性。结果rs5743312(TLR3)、rs3819024(IL-17A)与OLP的发生相关,并有统计学意义(P<0.05)。其余5个SNP位点未检测出与OLP相关。结论rs5743312(TLR3)和rs3819024(IL-17A)可能与OLP的易感性相关。

PXR基因单核苷酸多态性与2型糖尿病患病风险的关系

目的探讨孕烷X受体(PXR)基因单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病(T2DM)患病风险的关系。方法选择T2DM患者285例(观察组)、同期体检健康的志愿者230例(对照组),采集所有研究对象空腹外周静脉血,提取基因组DNA,然后对PXR基因rs1523127、rs3814055、rs6785049位点进行测序和基因分型;采用ELISA法检测血清PXR、葡萄糖转运体2(GLUT2)、葡萄糖激酶(GCK)。比较两组PXR基因rs1523127、rs3814055、rs6785049位点基因型及等位基因频率,以及血清PXR、GLUT2、GCK水平。分析PXR基因SNP与T2DM患病风险的关系。结果经Hardy-Weinberg遗传平衡检验,两组PXR基因不同位点基因型、等位基因频率均符合遗传平衡定律。两组PXR基因rs1523127、rs6785049位点基因型及等位基因频率比较差异均无统计学意义(P均>0.05)。观察组PXR基因rs3814055位点CT/TT基因型及T等位基因频率均高于对照组(P均<0.05),携带CT、TT基因型者罹患T2DM的优势比(OR)分别为携带CC基因型者的1.591、2.398倍,携带T等位基因者罹患T2DM的OR为携带C等位基因者的1.638倍。观察组血清PXR水平高于对照组,血清GLUT2、GCK水平低于对照组(P均<0.05)。T2DM患者PXR基因rs3814055位点CT/TT基因型者血清PXR水平高于CC基因型者,血清GLUT2、GCK水平低于CC基因型者(P均<0.05)。结论PXR基因rs3814055位点C等位基因突变为T等位基因能够增加其转录活性,抑制血清GLUT2、GCK水平,使其糖耐量受损,进而增加T2DM的患病风险。

指长比(2D∶4D)与胶原蛋白基因家族单核苷酸多态性的关联性

目的:探讨指长比(2D︰4D)与胶原蛋白基因家族4个基因COL4A2、COL5A1、COL6A2、COL10A1的10个单核苷酸多态性位点(rs3809346、rs3825490、rs7984100、rs1134170、rs3128575、rs1042917、rs2839110、rs3812111、rs1064583、rs2228547)的关联性。方法:采用体质测量法和多重PCR法,分别对2D︰4D及COL4A2、COL5A1、COL6A2和COL10A1基因多态性在宁夏地区大学生的分布特征进行比较,并分析其间的关联性。结果:宁夏女性大学生双手2D︰4D均值均显著高于男性;10个位点基因型和等位基因分布频率性别间均无显著差异;COL4A2基因rs3825490和rs3809346位点基因型分别与男性和女性双手2D︰4D显著关联,COL5A1基因rs1134170位点基因型和COL6A2基因rs1042917位点基因型分别与女性左手2D︰4D和男性右手2D︰4D显著关联。结论:宁夏人群2D︰4D的形成可能与COL4A2(rs3809346、rs3825490)、COL5A1(rs1134170)及COL6A2(rs1042917)基因多态性有关。

瘦素受体基因Gln223Arg单核苷酸多态性与精液质量参数的相关性研究

目的探讨瘦素受体(LEPR)基因Gln223Arg单核苷酸多态性与精液质量参数的相关性。方法选取2021年1月至12月在甘肃省妇幼保健院进行育前检查的肥胖男性156人作为观察组,另选取非肥胖男性150人作为对照组。检测LEPR基因Gln223Arg基因型,分析LEPR基因Gln223Arg多态性在两组间的分布及差异,分析基因型与精液质量各参数变化的相互关系。结果G/G型基因携带人群较A/A、A/G型携带人群发生精子密度、活力、畸形率、DFI异常的风险分别提高了1.21、2.36、1.68、1.85倍。结论LEPR基因Gln223Arg多态性可能造成男性发生肥胖的风险增加,G型等位基因较A型等位基因可能更容易造成精子质量异常的发生。

TNIP1基因单核苷酸多态性及其mRNA表达水平与老年慢性心力衰竭患者肺部感染的相关性分析

目的探讨肿瘤坏死因子诱导蛋白3相互作用蛋白1(TNFAIP3-interacting protein 1,TNIP1)基因单核苷酸多态性及其mRNA表达水平与老年慢性心力衰竭患者肺部感染的相关性。方法选择2019年10月至2022年10月于上海建工医院重症医学科就诊的130例老年慢性心力衰竭患者作为研究对象,根据是否于院内发生肺部感染分为感染组(32例)和未感染组(98例)。对TNIP1基因的两个SNP位点rs6889239(T>C)、rs17728338(A>G)进行基因分型,并检测外周血TNIP1基因的mRNA表达水平。结果TNIP1基因rs6889239位点在感染组和非感染组之间的基因型分布以及等位基因频率的差异均无统计学意义(P>0.05);两组的rs17728338位点AA、AG、GG基因型分布比较差异有统计学意义(P<0.05),且感染组等位基因G的频率显著高于未感染组(P<0.05)。相较于未感染组,感染组患者的外周血TNIP1基因mRNA表达水平显著增加,差异有统计学意义(P<0.001)。受试者工作特征(Receiver operating characteristic,ROC)曲线分析结果显示外周血TNIP1基因表达水平预测慢性心力衰竭患者发生肺部感染的灵敏度和特异度分别为71.9%和95.9%。感染组和非感染组TNIP1基因rs6889239位点不同基因型患者的外周血TNIP1基因的表达水平比较差异均无统计学意义(P>0.05),而rs17728338位点不同基因型患者的外周血TNIP1基因表达水平比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论TNIP1基因rs17728338表达水平与老年慢性心力衰竭患者发生肺部感染有关。

TLR3基因单核苷酸多态性与儿童紫癜性肾炎的相关性

目的探讨TLR3基因单核苷酸多态性与儿童过敏性紫癜(Henoch-Schönlein purpura,HSP)及紫癜性肾炎(Henoch-Sch nleinöpurpura nephritis,HSPN)易感性的相关性。方法选择HSP患儿174例作为病例组,选择同期体检的162例健康儿童作为对照组。根据病例组患儿在随访过程中是否合并肾脏损害分为HSP组、HSPN组。采用多重聚合酶链反应技术(M-PCR)靶向捕获TLR3基因rs35311343、rs121434431、rs199768900、rs768091235、rs1244010954位点,通过高通量测序技术对所有样本的上述位点进行测序,根据测序结果进行各位点基因型以及基因频率的统计分析。结果病例组与对照组TLR3基因rs35311343、rs121434431、rs199768900、rs768091235、rs1244010954位点的各基因型频率和各等位基因频率比较,差异无显著意义(P>0.05)。病例组中HSP组与HSPN组TLR3基因rs121434431、rs199768900、rs768091235、rs1244010954位点的各基因型频率和各等位基因频率比较,差异无显著性(P>0.05);rs35311343位点的基因型频率与等位基因频率比较差异有显著性(χ^(2)=9.492,OR=2.662,95%CI=1.342~5.281,P<0.05)。结论TLR3基因rs35311343位点CG基因型与儿童过敏性紫癜肾脏受累有关,等位基因G可能是HSPN的易感基因。

胎儿右锁骨下动脉迷走应用单核苷酸多态性微阵列技术检查的价值

目的探讨单核苷酸多态性微阵列(SNP-array)检查对胎儿右锁骨下动脉迷走(ARSA)的临床意义。方法选取2018年1月1日至2022年7月31日于该院进行产检的75例孕妇的胎儿为研究对象,所有胎儿Ⅱ~Ⅲ级彩超检查提示ARSA,且所有孕妇均在该院产前诊断中心进行羊水/脐血染色体核型分析及SNP-array检查,总结分析其染色体检查结果、临床表型及妊娠结局。结果染色体核型分析检出4例染色体结构异常,包含2例致病性变异和2例46,XN,inv(9)(p11q13),致病性变异检出率为2.67%(2/75);SNP-array检出12例异常,包含5例致病性变异(pCNVs)、2例存在杂合性缺失(LOH)、5例临床意义尚不明确(VOUS),致病性变异检出率为6.67%(5/75)。合并心脏其他结构畸形的ARSA胎儿染色体pCNVs检出率最高(33.33%),其次为孤立性ARSA胎儿(10.71%)。结论ARSA胎儿建议进行染色体SNP-array检查排除染色体微小病变。

中国儿童2型炎症型哮喘单核苷酸多态性和相关基因关系的研究进展

支气管哮喘是严重影响儿童身心健康的一种慢性炎症性疾病,根据炎症机制与表现的不同,分为2型炎症型哮喘及非2型炎症型哮喘。2型炎症型哮喘患儿数量多、占比大、症状重、疗效差。哮喘的发病机制复杂,其中遗传变异在哮喘的发生和发展中发挥着至关重要的作用,通过基因学研究设置诊断模型及个体化治疗方案具有重要意义。作者系统地回顾目前2型炎症型哮喘相关基因区域及单核苷酸多态性的研究,以更好地了解遗传因素与哮喘发生和发展之间的关系,为未来的哮喘预测诊断模型及个体化治疗方案制定提供依据。

安顺地区受检妇女中高危型人乳头瘤状病毒的检出及单核苷酸多态性特征

目的 探讨安顺地区受检妇女中高危型人乳头瘤病毒(HR-HPV)的检出及单核苷酸基因多态性(SNP)特征。方法 采集10 774例行HPV分型检测妇女的宫颈脱落细胞为细胞标本来源,选取其中HR-HPV阳性且有组织病理学活检指征的298例受检者的宫颈组织为组织标本来源,采用聚合酶链式反应(PCR)体外扩增和反向点杂交相结合检测宫颈脱落细胞的HPV基因分型,进一步采用SnapGene、MEGA11分析HPV52、HPV58型的SNP,采用苏木精-伊红(HE)染色判定宫颈组织的宫颈病变级别。结果 受检妇女中HR-HPV以单一感染为主、阳性率为20.36%,HR-HPV感染亚型主要为HPV52、HPV16、HPV58、HPV53及HPV51;宫颈病变中HR-HPV优势型别为HPV16、HPV52、HPV58、HPV18及HPV33;SNP和进化树分析发现,HPV52型E6和E7区SNP点分别有7个(其中A125T、A294G是新的突变位点,G350T、A379G突变率最高)和3个(其中T666C是新的突变位点,C751T、A801G突变率最高)、且HPV 52型均分布于B谱系,HPV58型E6、E7区SNP点分别有3个和8个、突变位点最高的是T744G、且HPV58型均分布于A谱系。结论 安顺地区受检妇女主要HPV阳性型别为HPV52、HPV16及HPV58型,宫颈病变中主要优势型别为HPV16、HPV52及HPV58型,且HPV52、HPV58有其特定的SNP。

ABCG2基因启动子区rs2231142位点单核苷酸多态性与新疆维吾尔自治区汉族男性人群高尿酸血症易感性分析

目的探讨ABCG2基因rs2231142(G/T)位点单核苷酸多态性与高尿酸血症易感性的关系。方法以2018~2020年在新疆医科大学附属中医医院、新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院就诊的865例男性为研究对象,收集其血液样本,按其血尿酸水平分为高尿酸血症组(n=367)和健康对照组(n=498)。采用多重荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测ABCG2基因rs2231142(G/T)位点的基因型并观察两组的基因多态性。利用双荧光素酶报告基因实验证实该序列对荧光素酶表达活性的影响。结果高尿酸血症组的尿酸、体重指数、葡萄糖、肌酐、甘油三酯、舒张压、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白高于健康对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。两组基因rs2231142位点均符合Hardy-Weinberg平衡性检验(P>0.05),表明该位点具有群体代表性。高尿酸血症组和健康对照组中GG、GT、TT 3种基因型的分布频率差异有统计学意义(χ^(2)=17.146,P<0.001),等位基因G和T在两组间分布频率比较差异有统计学意义(χ^(2)=19.115,P<0.001)。不同遗传模型中,TT基因型均表现为高尿酸血症的危险因素(加性模型OR=2.302,95%CI:1.472~3.603;显性模型OR=1.689,95%CI:1.283~2.210;隐性模型OR=1.867,95%CI:1.221~2.874)。尿酸、葡萄糖、甘油三酯在不同基因型分组间比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。两两比较结果显示,G/T组与G/G组、T/T组与G/G组组间的尿酸、葡萄糖、甘油三酯水平差异均有统计学意义(P<0.05)。其中T/T组尿酸水平最高,G/G组葡萄糖和甘油三酯水平最高。双荧光素酶活性测定结果显示,rs2231142(G/T)具有启动子功能;且含G等位基因比含T等位基因的重组质粒荧光素酶报告基因的表达水平较高,是其1.120倍(P=0.012)。结论ABCG2基因rs2231142(G/T)位点单核苷酸多态性与高尿酸血症易感性间存在关联,等位基因T可能是高尿酸血症的危险因素。

PGC-1α基因及其单核苷酸多态性与糖尿病肾病的相关性

目的:探讨糖尿病肾病(DKD)易感性与过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子(PGC)-1α基因SNP位点rs8192678的相关性。方法:招募200例糖尿病(DM)患者,无肾脏病损伤,200例DKD患者。利用DNA提取试剂盒提取患者外周血DNA,应用TaqMan-MGB探针法对SNP rs8192678进行基因分型,分析PGC-1α基因rs8192678(G>A)等位基因分布,并评估其与DKD易感性的相关性。利用实时定量PCR检测DM患者和DKD患者血液PGC-1αmRNA表达与rs8192678基因多态性之间的关系。观察不同中医证型DKD患者rs8192678等位基因及基因型频率分布。结果:PGC-1α基因rs8192678基因型GG在DM中比例较DKD更少见(47.5%比72.5%,P<0.001)。在三个遗传模型(加性、显性和隐性)中,在年龄和性别校正后,GG基因型与较高的DKD风险相关(P=0.000)。在DM组和DKD组全血中,AA基因型患者PGC-1αmRNA水平显著高于GG基因型(P<0.01)。PGC1-α基因rs8192678位点的等位基因中,G等位基因频率在所有DKD证型中均较A等位基因频率高。DKD患者中医证候由阴虚燥热证逐渐转向阴阳两虚证过程中,患者GG表达占比逐渐增多。结论:rs8192678的风险相关G等位基因与DKD相关,G等位基因增加了DKD风险,且DKD患者中医证候分型与PGC1-α基因rs8192678多态性位点有内在关系。

乙酸脱氧酶2基因G487A位点的单核苷酸多态性与脑梗死的风险分析

目的探讨乙酸脱氧酶2(ALDH2)基因G487A位点的单核苷酸多态性与脑梗死的相关性,为临床提供参考。方法选取2021年10月至2023年5月于海口市人民医院确诊的150例脑梗死患者作为脑梗死组,选取同期在海口市人民医院进行体检的150例健康者作为非脑梗死组进行回顾性分析。比较两组研究对象的临床资料、基因型和等位基因型频率。结果脑梗死组研究对象有吸烟史、饮酒史、糖尿病史、高血压史占比,收缩压(SBP)、舒张压(DBP)、三酰甘油(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和葡萄糖(GLU)水平均高于非脑梗死组,高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、载脂蛋白Ⅰ(ApoAⅠ)水平均低非脑梗死组(均P<0.05)。脑梗死组研究对象A等位基因携带者(GA+AA基因型)占比、A等位基因频率均高于非脑梗死组(均P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,ALDH2基因编码区G487A的A等位基因携带是脑梗死发病的独立危险因素(P<0.05)。结论ALDH2基因G487A位点的多态性可能是影响脑梗死的危险因素,临床应注意筛查。

miRNAs及其单核苷酸多态性在缺血性脑卒中的研究进展

缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)是由环境因素和遗传因素共同作用所致的一种多因素疾病,其遗传易感性及缺血性脑损伤机制仍是近年来研究的热点。微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱异常在IS的病因、病理生理、神经保护和卒中后脑水肿等多个过程均有参与。单核苷酸多态性(single nueleotide polymorphism,SNP)指在有遗传效应的DNA片段上由单个核苷酸发生颠换、转换、插入、缺失等所引起的DNA序列多态性。当miRNA存在SNP时可能直接或间接影响其靶基因的表达,从而作用于IS的发生发展,故miRNA的SNP可成为研究miRNA与IS之间相互作用的新的切入点。本文拟对部分miRNAs及其SNP与IS之间的关系进行综述,以期为IS的诊断、治疗及预后评估提供科学依据。

IFITM3单核苷酸多态性与急性白血病的患病风险评估

分别探讨IFITM3基因3个位点(rs3888188、rs7478728、rs7479267)单核苷酸多态性与急性髓系白血病、急性淋巴细胞白血病、男性急性白血病、女性急性白血病的患病风险。方法 共收集437例研究对象,使用SNaPshot测序并对结果进行统计分析。结果 rs7478728和rs7479267的CT基因型、C等位基因、(CT+CC)联合基因均表明是急性髓系白血病的保护性因子。结论 IFITM3基因位点rs7478728和rs7479267的部分基因变异可能与急性髓系白血病的患病风险呈负相关。

许氏平鲉5-HT1A基因单核苷酸多态性与攻击行为表型相关性研究

以许氏平鲉(Sebastes schlegelii)幼鱼为研究对象,旨在探究5-HT1A受体基因在攻击行为调控中的作用。首先,通过注射8-OH-DPAT(特异性5-HT1A受体激动剂)对许氏平鲉幼鱼的攻击行为进行了分析,评估了受体对幼鱼攻击行为的影响;其次,对不同攻击表型的许氏平鲉幼鱼进行了5-HT1A受体基因的多态性位点筛选,以期获得与许氏平鲉攻击行为显著相关的潜在SNP标记。结果显示:(1)8-OH-DPAT处理组幼鱼攻击行为的频率和时间显著低于对照组(P<0.05),但攻击潜伏期显著高于对照组(P<0.05);(2)在5-HT1Aα启动子区域中发现了7个与攻击表型差异显著相关的多态性位点(P<0.05),分别为SNP 1236、SNP 1245、SNP 1260、SNP1301、SNP 1302、SNP 1309和SNP 1330位点;在5-HT1Aβ启动子区域中发现了2个与攻击表型差异显著相关的多态性位点(P<0.05),分别为SNP 892和SNP 1147位点,但在5-HT1A基因CDS编码区并未发现与攻击差异表型显著相关的多态性位点(P>0.05)。综上所述,研究结果证明了5-HT1A受体的激活能够显著抑制许氏平鲉的攻击行为,筛选了与攻击性差异个体相关的5-HT1A受体基因SNP位点。

脂代谢相关基因单核苷酸多态性与男性精液质量的关联研究

目的:探究脂质代谢基因单核苷酸多态性对男性精液质量的影响。方法:选取2023年2月至2023年10月邢台不孕不育专科医院和河北省人类精子库284例精液样本,CASA进行精液检测,提取血液DNA并利用MassARRAY^(■)Systems进行目标基因分型,对13个脂质代谢相关基因的单核苷酸多态性位点进行基因型分型,比较不同组别及BMI分层下基因型的分布差异及不同基因型精液质量的差异。结果:FADS2 rs2727270突变纯合(TT)基因型可能是弱精子症的危险因素(OR=4.420,P=0.047)。APOA2 rs5082-A等位基因和MC4R rs17782313杂合(TC)基因型可能是少精子症的保护性因素(OR=0.422,0.389;P=0.045,0.043)。MC4R rs17782313杂合基因型(TC)的精子浓度显著高于纯合基因型,分层分析显示伴随BMI的增加会降低TC基因型的保护作用。APOA2 rs5082和MC4R rs17782313基因型交互对弱精子症的保护作用仍存在。结论:FADS2(rs2727270)、APOA2(rs5082)和MC4R(rs17782313)与精液参数异常发生的风险显著相关。

LncRNA HOTTIP单核苷酸多态性与宫颈癌及宫颈上皮内瘤变的关系

目的 探讨HOTTIP rs1859168和rs17427960单核苷酸多态性(SNP)与宫颈癌及宫颈上皮内瘤变(CIN)发病风险的关系。方法 收集2019年11月至2021年5月盐城市第一人民医院诊断为CIN的患者142例作为CIN组,被诊断为宫颈癌的患者103例作为宫颈癌组,以同期住院的170例无妇科疾病的非肿瘤患者为对照组,采用TaqMan-MGB探针法方法进行基因分型,采用χ^(2)检验和logistic回归分析SNP位点与宫颈癌及宫颈上皮内瘤变的相关性。结果 与对照组相比,HOTTIP rs1859168和rs17427960在宫颈癌患者中的基因型分布存在显著性差异。在共显性模型中,携带rs1859168 CA基因型(ORadj=1.897,95%CI:1.090~3.300,Padj=0.023)及rs17427960 AC基因型(ORadj=1.787,95%CI:1.020~3.131,Padj=0.042)均显著增加了宫颈癌的发病风险;在显性模型中,rs1859168 CA+AA基因型(ORadj=1.690, 95%CI:1.004~2.844,Padj=0.048)增加了宫颈癌的发病风险。结论 HOTTIP rs1859168和rs17427960的SNP与宫颈癌的发病风险相关,可作为宫颈癌的潜在易感性位点。

单核苷酸多态性微阵列分析技术在不同产前诊断指征孕妇中的应用价值

目的探讨单核苷酸多态性微阵列分析(SNP array)技术在不同产前诊断指征孕妇中的应用价值。方法选取2017年1月—2022年6月丽水市妇幼保健院具有产前诊断指征的2193例孕妇,根据产前诊断指征分为A组(单一高龄,预产期年龄>35岁)788例、B组(单一高风险,血清学筛查21-三体高风险或18-三体高风险)362例、C组(超声异常,包括单一超声异常、高风险超声异常、高龄超声异常)565例、D组(高龄高风险)103例、E组[无创产前基因检测(NIPT)高风险或合并其他指征异常(高龄、高风险)]179例、F组(不良孕产史、夫妻染色体异常、夫妻表型异常)196例。在超声引导下对所有孕妇行羊膜腔穿刺,收集羊水样本进行核型分析和SNP array检测。分析不同产前诊断指征孕妇SNP array检测结果和核型分析结果的差异。结果2193例羊水样本中,SNP array共检出异常336例(15.3%),其中非整倍体121例(5.5%)、拷贝数变异(CNV)215例(9.8%)。核型分析仅检出2例>10 M的CNV,对非整倍体的检出情况与SNP array一致。E组的总异常检出率、非整倍体检出率和CNV检出率均显著高于A组、B组、C组、D组和F组(P<0.05)。在无NIPT异常的情况下,总异常检出率最高的是C组(15.9%),非整倍体检出率最高的是D组(5.8%),CNV检出率最高的是F组(12.7%)。C组的总异常检出率为15.9%(90/565),高龄超声异常孕妇的总异常检出率、非整倍体检出率和CNV检出率均高于单一超声异常孕妇和高风险超声异常孕妇(P<0.05)。根据超声异常部位数将565例超声异常孕妇分为单项异常组(532例)和多系统异常(含2个及以上的超声异常指征)组(33例)。多系统异常组SNP array的异常检出率显著高于单项异常组(P<0.05)。在单项异常组中,SNP array总异常检出率最高的是神经系统(19.2%),非整倍体检出率最高的是颈项透明层(NT)增厚(8.9%),致病/可能致病CNV检出率最高的是神经系统(7.7%),临床意义未明CNV检出率最高的是消化系统(11.1%)。结论SNP array技术可有效提高CNV的检出率。在不同的超声异常类型中,SNP array对高龄超声异常、多系统异常和神经系统异常的检出率较高。