从基因组学到功能蛋白质组学的研究

人类基因组草图绘制的完成,标志着生命科学已实质性地跨入了后基因组时代,研究重心已从揭示生命的所有遗传信息转移到在分子整体水平对功能的研究[1]。这种转向表明目前已进入功能基因组学(functional genom ics)以及随之产生的功能蛋白质组学(functional proteomics)等新学科领域的研究。

系统生物学视野下的功能氨基酸组学

传统营养学将氨基酸作为蛋白质的构建单元来研究蛋白质和氨基酸。近年来的研究表明,氨基酸在物质代谢和免疫功能调控等方面亦发挥重要作用,并提出功能性氨基酸的概念。随着各种组学技术的不断发展,通过系统生物学的理念与方法整合组学数据,系统地分析功能氨基酸的分子作用机制、药效学、体内动态过程成为可能。为此,本文提出功能氨基酸组学的概念,指出功能氨基酸组学领域的科学问题,提出功能氨基酸组学的研究内容。研究结果可用于朝向特定目标的氨基酸组合设计。

研究生功能蛋白质组学课程教学改革与探索

功能蛋白质组学是生命科学学院学术研究生的一门重要的专业选修课。为了满足新时代对研究生创新能力培养的需求,结合教学实践与思考,该文梳理总结该课程中采用的教学内容、教学方法与手段和考核方式等方面的改革办法,以期为生命科学相关专业功能蛋白质组学的课程教学与改革提供思路。

功能蛋白质组学在胃癌研究中的应用进展

目前,人类主要疾病相关蛋白质组学研究集中于功能蛋白质组学研究。对与胃癌发生转移(组织蛋白酶,βAMP-18,α1-抗胰蛋白酶,HSP27,Destin和PTEN等蛋白)、癌细胞增殖与分化(P62,rab-35等蛋白)及耐药性方面的相关蛋白质群体(分子伴侣HSPs,钙连接蛋白,丙酮酸激酶PK-M2等蛋白)进行检测,有利于动态、整体地了解胃癌的发病机制,寻找特异性的肿瘤标记物以进行早期诊断和改善药物的耐药性。

动物细胞核功能蛋白质组学研究进展

细胞核是细胞遗传和代谢的调控中心,细胞核功能蛋白质组已成为蛋白质组学研究的热点。细胞核内含有较多的功能蛋白质,有些参与转录调控,有些参与核质转运。在蛋白质组学水平检测特定状态下细胞核中的功能蛋白活性对深入研究基因表达调控的分子机制具有重要的意义。本文就目前的细胞核功能蛋白质组学研究成果进行综述。

功能蛋白质组学研究

1990年国际上开始实施人类基因组计划,2001年2月,完成人类基因组图谱,标志着后基因组时代已经到来.新时代的最终目的,是阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达模式和生命功能.目前,我们更为注重那些可能涉及到特定功能机理的蛋白质群体,即功能蛋白质组的研究,主要的研究手段为双向凝胶电泳、Edman降解法测N端序列、质谱技术.功能蛋白质组学的提出,可从动态整体的角度对那些重大疾病的机理进行研究.

功能代谢组学在生物医药领域中的应用

功能代谢组学是代谢组学的延伸,即通过检测生物体受到特定刺激与干扰后内源性代谢物的变化,获取生物代谢标志物并进一步采用实验方法验证代谢标志物及其关联的酶、基因与蛋白等的功能,可从“代谢物-酶-基因-蛋白”角度系统揭示病理生理改变的分子机制,阐明代谢物关联的上下游生物机制。本文对目前功能代谢组学在生物医药领域中的常用方法和研究策略、疾病靶点及发病机制探索、药物作用机制分析等进行综述,同时对功能代谢组学与网络药理学、重编程代谢组学相结合的延伸研究进行总结,最后分析并展望功能代谢组学在生物医药领域的应用前景。

功能蛋白质组学

编者按：蛋白质组，不仅在国内是一个陌生的话题，在国际生物学界也同样陌生。然而，中国的科学工作者并没有疏忽这一生命科学的最新动向。基于中科院上海生化所已开展有关的工作，今年５月生化所为配合国家自然科学基金委的有关重大项目，在该所举行了国内首次关于蛋白质...

基于功能磁共振影像组学预测乳腺癌新辅助化疗疗效的应用研究

目的探讨基于功能磁共振影像组学预测乳腺癌新辅助化疗疗效的应用。方法选取2017年9月—2018年9月入住我院接受新辅助化疗的乳腺癌患者42例,按化疗后病理组织检查结果分为两组,对照组为化疗无效组(6例),观察组为化疗有效组(36例),分析两组化疗前后病灶最大径、DCE曲线类型、复合胆碱(tCho)浓度以及ADC值的变化情况,并预测化疗疗效。结果与化疗前相比,化疗后所有患者病灶最大径减小、tCho浓度降低、DCE曲线类型变化明显,ADC值升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。由于第二次MRI检查时间不同,指标出现变化的时间也存在差异。12例化疗后7 d内接受第二次MRI检查,tCho浓度显著降低(P<0.05),其他指标与化疗前无明显差异(P>0.05);8例化疗后7~14 d内接受第二次MRI检查,病灶最大径、tCho浓度、ADC值与化疗前无明显差异(P>0.05),而DCE曲线类型有明显变化(P<0.05);16例化疗后14~27 d内接受第二次MRI检查,与化疗前相比,各指标均有明显变化(P<0.05)。对照组在化疗后21 d内进行第二次MRI检查,各项指标与化疗前无明显差异(P>0.05),病灶缩小的特异度为67.1%、灵敏度为55.8%、阳性预测值为91.0%;DCE曲线类型变化的特异度为100.0%、灵敏度为66.9%、阳性预测值为100.0%;tCho浓度降低的特异度为100.0%、灵敏度为93.9%、阳性预测值为100.0%;ADC值变化的特异度为100.0%、灵敏度为45.1%、阳性预测值为100.0%。观察组化疗后病情较化疗前显著改善,近期疗效良好(P<0.05)。结论功能磁共振影像可预测新辅助化疗疗效,DCE曲线类型、病灶最大径、ADC值、tCho浓度的阳性预测值良好,且预测化疗疗效灵敏度最高的是tCho浓度。

细菌外膜功能蛋白质组学的研究

病原菌严重危害人类健康、家畜家禽和水产养殖业。抗生素耐药性和疫苗保护谱等问题，使我们不得不面临卷土而来和日益严重的细菌性疾病的威胁。

化学蛋白质组学在中药现代化研究中的应用

如何借助现代化新理论和新技术诠释中药的科学内涵,是中药现代化进程中亟待解决的关键问题之一。化学蛋白质组学是利用能够与靶蛋白质发生特异性相互作用的化学小分子来研究和探测蛋白质组的技术。本文综述了化学蛋白质组学在中药有效成分筛选、靶蛋白质的发现、中药协同作用机制研究和中药新药研发中的应用,对该技术指导下的中药现代化研究进行了初步探讨。化学蛋白质组学为中药现代化研究提供了新的思路,将有助于从分子水平上深刻揭示中药的科学内涵,指导中药新药研发,更好地传承和发展中医药理论。

截形苜蓿蛋白质组学研究进展

蛋白质组学研究是功能基因组研究的重要手段。简述了蛋白质组学研究的概念和主要技术,详述了蛋白质组学在截形苜蓿组织或细胞器蛋白质组成、生长发育、响应生物和非生物胁迫等方面应用研究成果,分析了存在的问题与发展前景。

质谱技术在蛋白质组学研究中的应用

随着蛋白质组学研究的迅速发展,质谱技术已成为应用于蛋白质组学研究中的强有力工具和核心技术。质谱技术的先进性在于为蛋白质组学研究提供的通量和分子信息。笔者重点概述了基于质谱路线的蛋白质组学研究,介绍了基于质谱的定量蛋白质组学?翻译后修饰蛋白质组学、定向蛋白质组学、功能蛋白质组学以及基于串联质谱技术的蛋白质组学数据解析的研究进展。

差异蛋白质组学在水生动物免疫研究中的应用

差异蛋白质组学是指依据蛋白质样品在不同时期、不同组织、不同状态或不同外界条件下表达不同，来筛选、鉴定蛋白质，可以通过对差异蛋白质的分析鉴定研究编码该差异蛋白的基因，扩展对该基因功能的研究，也可以结合功能蛋白质组学研究，发现新的蛋白质，完善已有的蛋白质组数据库。差异蛋白质组学技术主要有双向电泳技术（2-DE）、荧光双向差异凝胶电泳技术（DIGE）、多维色谱技术（HPLC）以及蛋白质芯片技术（Protein Chip）。

中医证候学与蛋白组学探析

1蛋白质组学的概述 蛋白质组学和功能蛋白质组学随着蛋白质组的提出,蛋白质组学（Proteomics）也自然而然地孕育产生。但目前,蛋白质组学仍无明确的定义。一般认为它是研究蛋白质组或应用大规模蛋白质分离和识别技术研究蛋白质组的一门学科,是对基因组所表达的整套蛋白质的分析。现阶段,蛋白质组学研究的内容不仅包括对各种蛋白质的识别和定量化,还包括确定它们的细胞内外的定位、修饰、相互反应、活性,和最终确定它们的功能。

蛋白质组学在神经科学中的应用

蛋白质组学是指对基因组编码的所有蛋白质进行大规模分析的一门学科,它分为表达蛋白质组 学和功能蛋白质组学。新的蛋白质组学工具将为高度复杂的神经科学的研究提供便利。作者简述了表达 蛋白质组学和功能蛋白质组学在这一领域的应用。