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基于网络药理学和实验验证探讨五苓散防治顺铂肾毒性的作用机制 被引量:3
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作者 李刘生 蔡琳琳 吴煜 《世界中西医结合杂志》 2023年第8期1587-1595,共9页
目的 基于网络药理学和实验验证研究五苓散防治顺铂肾毒性的作用机制。方法 在中草药系统药理学平台(TCMSP)筛选药物活性成分及靶点;使用OMIM、Genecards数据库筛选疾病靶点;使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”关系网... 目的 基于网络药理学和实验验证研究五苓散防治顺铂肾毒性的作用机制。方法 在中草药系统药理学平台(TCMSP)筛选药物活性成分及靶点;使用OMIM、Genecards数据库筛选疾病靶点;使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”关系网络图;使用STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,基于拓扑分析筛选核心靶点;基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组(KEGG)通路分析。建立顺铂肾毒性小鼠模型,分别采用低剂量(13 g/kg)、高剂量(26 g/kg)五苓散处理,检测血清肌酐(Creatinine,CRE)、尿素氮(Blood urea nitrogen,BUN)水平,对肾组织进行HE染色,采用TUNEL法检测细胞凋亡,采用qPCR检测肿瘤坏死因子-α(Tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白细胞介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β)mRNA的表达水平。结果 网络药理学部分获得关键靶点有TNF、IL-1β等,生物过程主要涉及炎症反应、凋亡的调控等,主要信号通路有TNF信号通路、IL-17信号通路等。动物实验证实,五苓散能够降低BUN、CRE,改善肾脏病理损伤,减轻肾组织细胞凋亡和降低肾脏炎症指标TNF-α、IL-1β mRNA。结论 五苓散可能通过减轻肾组织炎症反应和降低肾组织细胞凋亡水平改善顺铂肾毒性。 展开更多
关键词 网络药理学 动物实验验证 五苓散 顺铂肾毒性 机制 炎症 凋亡
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基于网络药理学和实验验证探讨白虎加人参汤治疗2型糖尿病的分子机制 被引量:4
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作者 黄雅兰 张艳玲 +3 位作者 吴勇军 刘秀 向琴 喻嵘 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2022年第6期2217-2229,共13页
目的 通过网络药理学方法全面系统筛选白虎加人参汤治疗2型糖尿病(T2DM)的治疗靶点及相关信号通路,并通过动物实验进一步明确其作用机制。方法 应用TCMSP、TCMID和PubChem数据库获取白虎加人参汤的化学活性成分及相关靶点信息,在GEO数... 目的 通过网络药理学方法全面系统筛选白虎加人参汤治疗2型糖尿病(T2DM)的治疗靶点及相关信号通路,并通过动物实验进一步明确其作用机制。方法 应用TCMSP、TCMID和PubChem数据库获取白虎加人参汤的化学活性成分及相关靶点信息,在GEO数据库获得影响T2DM的差异基因,并与白虎人参汤靶点交集获取共同靶点;运用STRING V11.0数据库进行蛋白互作分析并获取蛋白互作网络图及核心靶点;通过DAVID 6.8分析平台,获得GO功能注释结果及KEGG通路富集结果,分析通路相关基因及功能,并通过实验进行验证。选取MKR小鼠24只,随机分为模型组、低剂量白虎加人参汤组、高剂量白虎加人参汤组,各8只,另选取8只同龄同性别FVB小鼠作为对照组。各组给药4周后,测定小鼠空腹血糖(FBG),采用酶联免疫吸附测定(ELISA)检测小鼠血清中白细胞介素-6(IL-6)、IL-1β、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测PI3K、AKT、NF-κB的蛋白表达,实时荧光定量聚合酶链式反应(RTqPCR)检测PI3K、AKT、NF-κB的mRNA相对表达量。结果 筛选得到白虎加人参汤中101种潜在成分和70个共同靶点,成分-靶点网络图显示白虎加人参汤可能通过VEGFA、FYN、AR、ABL1等蛋白靶点,经由磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路发挥治疗T2DM的作用。动物实验结果显示,与模型组比较,白虎加人参汤降低MKR小鼠空腹血糖及血清中IL-6、IL-1β及TNF-α水平(P<0.05,P<0.01),下调PI3K/AKT信号通路上的PI3K、AKT、NF-κB蛋白表达及其mRNA相对表达量(P<0.01)。结论 白虎加人参汤可以通过多成分、多靶点、多通路的作用效应治疗T2DM,实验证实了白虎加人参汤能够下调PI3K/AKT通路相关蛋白表达及mRNA相对表达量,降低MKR小鼠血糖和血清炎症因子水平,验证了网络药理学结果,为深入研究白虎加人参汤治疗T2DM提供了依据。 展开更多
关键词 白虎加人参汤 2型糖尿病 网络药理学 分子机制 动物实验验证 MKR转基因小鼠
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基于生物信息学和实验探究艾灸对肺纤维化的作用及其机制 被引量:2
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作者 董怀洋 叶雨萌 +1 位作者 李包娟 张䶮之 《中南药学》 CAS 2022年第6期1217-1225,共9页
目的基于现代生物信息技术,预测艾灸干预肺纤维化的作用靶点和通路,并通过动物实验验证作用效果及其机制。方法通过生物信息预测得到艾灸干预肺纤维化的作用靶点,蛋白互作获得作用的关键靶点,GO和KEGG将通路可视化,采用AutoDock4.2.6对... 目的基于现代生物信息技术,预测艾灸干预肺纤维化的作用靶点和通路,并通过动物实验验证作用效果及其机制。方法通过生物信息预测得到艾灸干预肺纤维化的作用靶点,蛋白互作获得作用的关键靶点,GO和KEGG将通路可视化,采用AutoDock4.2.6对接软件进行验证。博来霉素4 U·kg^(-1)构建肺纤维化模型,连续给药干预28 d。每日观察小鼠外观,测量小鼠饮食、体质量,计算肺指数,HE和Masson染色观察肺组织病变及纤维化程度,ELISA测定相关因子,蛋白免疫印迹法检测相关蛋白表达,荧光定量法测定mRNA水平。结果得到关键靶点8个,关键通路为EGFR/JAK/STAT1,分子对接显示4种核心成分有极好的对接活性。动物实验结果表明艾灸可改善小鼠体质量,提高存活率,HE和Masson染色结果显示艾灸后炎症细胞和胶原细胞减少。艾灸组小鼠的肺系数、肺组织Hyp和血清IL-6、CCL2炎症因子水平显著降低,肺组织EGFR、JAK、STAT1、p-STAT1蛋白表达显著降低,相关mRNA水平显著降低。结论艾灸可通过抑制EGFR/JAK/STAT1通路延缓肺纤维化进程。 展开更多
关键词 肺纤维化模型 艾灸 生物信息分析 动物实验验证 EGFR/JAK/STAT1通路
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Evaluating information-seeking approaches to metacognition
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作者 Jonathon D. CRYSTAL Allison L. FOOTE 《Current Zoology》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第4期531-542,共12页
Metacognition has been divided into information monitoring and control processes. Monitoring involves knowing that you know or do not know some information without taking corrective action. Control involves taking cor... Metacognition has been divided into information monitoring and control processes. Monitoring involves knowing that you know or do not know some information without taking corrective action. Control involves taking corrective action based on the knowledge that you know or do not know some information. In comparative metacognition, considerable attention has been paid toward critically assessing putative evidence for information monitoring in non-human animals. However, less attention has been paid toward critically evaluating evidence for control processes in animals. We briefly review a critique of information-monitoring in animals. Next, we apply these concepts to a number of studies that focus on information seeking in animals. The main type of evidence for control processes in animals come from tube tipping experiments. Before having the opportunity to search for the bait in these experiments, the subject sometimes observes opaque tubes being baited but is sometimes prevented from seeing the baiting. The observations that the subjects look more if baiting was not seen and are more accurate if baiting was seen have been taken as evidence for metacognition in information-seeking experiments. We propose simple alternative hypotheses that are sufficient to explain putative evidence for information seeking in animals without positing metacognition. The alternative explanation focuses on two relatively simple principles: First, an animal has a default "look before you go" response which supersedes random searches in space. Second, spatially guided behavior follows a default rule of "go where something good is." These principles can explain the results of tube tipping experiments without proposing metacognition [Current Zoology 57 (4): 531-542, 2011]. 展开更多
关键词 METACOGNITION Metacognitive control Information seeking Metacognitive monitoring Information monitoring Comparative cognition
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