基于Web的CML化学结构搜索方法初探

化学标记语言CML已得到广泛应用，目前web上存在着大量的以CML表示的化学结构信息，google、百度等Web搜索引擎只能实现对文本的检索，无法实现对化学结构的检索。本文在分析CML特点的基础上，介绍了提取与验证web上CML表示的化学结构信息的方法。利用Daylight公司的THOR—Merlin化学信息数据库系统，提出一种化学结构搜索引擎的设计方案。

化学标记语言发展综述

CML是XML语言的一个应用,主要用来表示包含化学信息的各种文档。本文简要介绍了CML的基本概念和应用背景,以及CML的发展与应用情况,并给出了一个示例说明CML的构成,并简要分析了文档中各元素所代表的意义。

化学标记语言及其应用

化学标记语言CML是可扩展标记语言XML的一个应用,用于表示化学信息。CML可以表示原子、分子和晶体学信息。其他的分子格式文件可以转换成为CML文档而没有信息的丢失。本文详细回顾了CML的起源、设计目标、发展历程、现状和应用,分析了CML未来的应用和发展。

Molecular Properties在海藻糖分子构象分析中的应用

应用Molecular Properties(MP)软件中内置的分子动力学计算功能,对海藻糖分子构象进行了研究,所得到的可能的最优构象的结构参数与文献报道数值基本吻合,表明了利用MP软件研究分子构象的可行性。按照XML 1.0标准编写了海藻糖分子可能的最优构象的CML格式分子结构文件,以便于网上交流和检索。

基于XML数据库服务系统的框架

针对分布式异构数据库的跨数据库联合检索和自动发布问题,构建基于XML和Web Services技术的数据库服务系统。该系统框架由元数据应用管理、数据库自动发布和跨数据库联合检索模块构成。参考科学数据库核心元数据标准,开发元数据管理工具,并设计基于元数据的数据库在线自动发布及导航目录服务系统。该系统以工程化学数据库为案例并得到应用,实现其多个数据库的资源共享与数据集成服务。