MOOC结合PBL在中药药理学教学改革中的应用

目的:研究MOOC结合问题式教学(problem-based learning,PBL)在中药药理学教学改革中的应用效果。方法:选取南京中医药大学中药学18级1班学生作为试验组,2班学生作为对照组,在进行MOOC线上教学的同时,线下对试验组学生开展PBL教学,对对照组学生开展传统教学,比较两组学生的成绩。结果:试验组总成绩、分析设计题的成绩明显高于对照组。结论:MOOC结合PBL更有利于培养学生的中药药理学科研思维,提高学生的综合素质。

基于数据挖掘和网络药理学分析中药熏洗方治疗肛周湿疹的用药规律及机制

目的:应用数据挖掘和网络药理学方法探讨中药熏洗方治疗肛周湿疹的用药规律及机制。方法:检索中国知网、万方、维普、中国生物医学文献数据库2011年1月1日至2020年12月31日关于中药熏洗治疗肛周湿疹的文献;采用中医传承辅助平台V3.0软件对处方用药频次、药性、药味、归经、组方规律、药物核心组合进行分析。通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索用药规律所得苦参汤中8味药物的活性成分及其对应的药物靶点;运用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)获取肛周湿疹的疾病靶点;使用Venny 2.1.0作图工具映射药物与疾病交集靶点,并构建韦恩图;运用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建靶点蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI),筛选核心作用靶点,构建“药物-活性成分-作用靶点”网络;应用R语言的clusterProfiler包进行基因本体论(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果:共筛选出符合标准的文献386篇,纳入中药处方360首,涉及中药188味;用药频次≥10次的药物共51味,四气分类以寒性为主,五味分类以苦味及辛味为主,药物归经以肝经、胃经及脾经为主;组方规律分析得到高频药对30对,最终演化得到核心组合4个,从用药规律得出苦参汤是治疗肛周湿疹的特效方。共筛选出苦参汤中137个活性成分和224个潜在靶点,与肛周湿疹相关作用靶点24个,经拓扑分析得到3个核心治疗靶点;筛选出槲皮素、木犀草素、山柰酚、金合欢素、苦参碱5个有效活性成分;GO富集分析得到1354个生物学过程、34个细胞组成及71个分子功能;KEGG通路富集分析得到97条信号通路。结论:苦参汤是治疗肛周湿疹的中药古方,苦参汤通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗肛周湿疹的作用。

病毒性肺炎中药网络药理学初探

病毒性肺炎对全球人民的身体健康构成了极大威胁,中医药在其治疗过程中发挥着举足轻重的作用,目前从分子层面上的作用机制尚不明确。文章聚焦于病毒性肺炎的病症特点及其治疗,探讨中药潜力与网络药理学应用;介绍病毒性肺炎的基本概况、流行病学特征及病理机制;评述中药发展历史和现代研究进展;进一步强调网络药理学在解析中药成分作用机制方面的新视角;结合网络药理学的病毒性肺炎中药研究现状、挑战和未来方向进行概述,旨在推动传统中医药与现代科技整合,创新病毒性肺炎治疗方法。

基于网络药理学和分子对接技术探讨菟丝子和覆盆子联合中药治疗少弱精子症的作用机制

目的运用网络药理学和分子对接技术对菟丝子和覆盆子联合中药(CSRFCH)进行研究,探究CSRFCH治疗少弱精子症(OA)可能的作用机制。方法利用TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM、Swiss Target Predition和GeneCards数据库及相关文献资料检索CSRFCH的有效成分靶点及OA相关靶点,利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用网络,获取核心靶点。利用DAVID数据库进行富集分析。最后对有效成分及核心靶点进行分子对接。结果CSRFCH的山柰酚、槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素和欧前胡素等成分可能通过关键靶点SRC、MAPK3、PIK3R1、PIK3CA和AKT1作用于癌症通路、PI3K-Akt信号通路等。分子对接结果显示核心成分与核心靶点均有较好的结合能力。结论通过网络药理学方法预测了CSRFCH治疗OA可能通过SRC、MAPK3、PIK3R1、PIK3CA和AKT1相关靶点调控癌症通路、PI3K-Akt信号通路等通路。

《中药药理学》之苦杏仁的教学设计研究

中药药理学因知识更新迅速、内容繁杂抽象、学时分配少等原因一直是一门讲授难度较大的课程。为了提升授课效果,以化痰止咳平喘药苦杏仁的教学设计为例,通过课前问题导入、视听导入、引入科研论文分析、引导归纳思维导图和构建中药药理作用及机制的文献再评价体系等方法,探索提高中药药理学课程教学的新模式,激发学生学习兴趣,提高自学能力,培养中医临床思维,希望为中药药理学教学改革提供参考。

基于中药药理学教学特点集成化教学模式的应用与探讨

中药药理学是一门传统中医药学与现代医药学相结合的新兴学科,课程内容复杂,涉及应用面广,具有理论性和实践性强、教学难度大的特点。药物作用机制、临床应用和实验教学方法等与现代医学和药理学重复较多,结合中医药理论,体现出中医临床思维特色的教学还存在很多问题。针对中药药理学课程特点,本文运用多种不同的教学方法和手段系统化构建集成化的教学模式,对其应用进行探讨,期望能为中药药理学课程教学改革提供有价值的参考和建议。

翻转课堂+虚拟仿真在中药药理学实验课中的实践

翻转课堂是将课堂由教师主导转为学生为主导,强调学生在线下教学的主体地位,提高学生的能动性,促进学生综合素质发展的一种授课形式。虚拟仿真实验既可以推动实验教学的改革,提高学生实验技能,又可以解决单纯实验讲义和实验视频可操作性不强等弊端。本文总结了中药药理学实验教学采用线上线下混合教学模式的应用经验,探讨不足,以期能为日后的中药药理学实验课程设计和改革提供一定思路。

基于数据挖掘和网络药理学探讨治疗抑郁症的中药复方专利用药规律及机制

目的基于数据挖掘、网络药理学方法,分析探讨治疗抑郁症的中药复方专利用药规律以及核心药物的分子作用机制。方法通过中国专利公布公告网检索获得治疗抑郁症的中药复方,提取中药名称、药味、药性、归经等信息,借助Microsoft Excel 2016、SPSS Modeler 18.0、Cytoscape 3.9.1、中医传承计算平台V3.5软件,对中药进行用药频次、性味归经、关联规则分析,并筛选出核心药物。在数据挖掘基础上,借助中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)获取核心药物的活性成分并预测其作用靶点;通过DisGeNET、GeneCards数据库收集抑郁症靶点,并利用EVenn在线平台获得核心药物治疗抑郁症的潜在靶点;通过STRING 11.5数据库分析蛋白-蛋白相互作用(PPI)及关键靶点网络;借助Cytoscape 3.9.1软件构建核心药物-成分-潜在靶点-通路网络;利用R软件包org.Hs.eg.db(version 3.1.0)和ClusterProfiler(version 3.14.3)对潜在靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果①本研究共收集303首中药复方、涉及中药663味,其中使用频次≥30次的中药有26味,共出现1469次,占总频次的39.93%。②本研究涉及的663味中药的药性以温、寒、平为主,药味以甘、苦、辛为主,归经以肝、心、脾、肺、肾、胃为主。③关联规则显示,中药复方治疗抑郁症常用药物组合有15组,涉及中药有当归、柴胡、甘草、郁金、白芍、茯苓等。④网络药理学分析结果显示,中药复方核心药物当归、柴胡、甘草、郁金、酸枣仁、白芍、茯苓的主要活性成分可能是植物甾醇、茯苓酸D、胡萝卜苷、芍药吉酮和当药黄素,这些成分可能作用于非受体酪氨酸蛋白激酶(SRC)、V-Rel网状内皮增生病毒癌基因同源物A(RELA)、蛋白激酶B(AKT)1等关键靶点,并通过调控白介素-17(IL^(-1)7)、C型凝集素受体(CLRs)、肿瘤坏死因子(TNF)、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/AKT等多条信号通路发挥作用。结论治疗抑郁症的中药复方专利主要涉及疏肝药、理气药、补血药,核心药物有当归、柴胡、甘草、郁金、酸枣仁、白芍、茯苓;其作用机制可能主要与免疫系统信号通路以及神经炎症相关。

基于数据挖掘和网络药理学探讨中药复方治疗抑郁症的用药规律与作用机制

【目的】探讨临床中药复方治疗抑郁症的核心药物及其抗抑郁分子机制。【方法】通过中国知网、万方数据和维普网检索相关文献,筛选并整理临床使用的中药复方。通过分析用药频率和中药关联规则,确定柴胡、白芍和郁金为治疗抑郁症的核心中药。利用TCMSP数据库筛选核心药物的活性成分及靶蛋白,并从TTD、OMIM、DrugBank和GeneCards中获取抑郁症相关靶点。通过STRING和Cytoscape数据库构建蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络和“核心药物-活性成分-交集靶点”网络,利用Metascape进行基因本体论(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。分子对接分析使用RCSB数据库、AutoDockTools和PyMOL,验证关键活性成分与核心靶标的结合活性。【结果】临床中药复方治疗抑郁症的药物以寒性、甘味、苦味和辛味为主,归经以肝经为首。柴胡、白芍和郁金用药频次最高,且“白芍-柴胡”和“郁金-白芍-柴胡”组合支持度最高。PPI网络中,SLC6A4、AKT1和CHRNA4为关键靶点。GO富集分析表明,核心药物通过化学突触传递等生物过程以及G蛋白偶联受体活性等分子功能,在突触膜等部位发挥作用。KEGG通路富集分析结果显示,核心药物可能通过神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路等治疗抑郁症。分子对接证实关键活性成分与核心靶标间有强结合活性。【结论】柴胡、白芍和郁金是临床治疗抑郁症的核心中药,其可通过多成分、多靶点、多通路治疗抑郁症。

子痫前期的中药临床应用与现代药理学进展

子痫前期是一种妊娠特异性疾病,临床以妊娠20周后出现高血压、蛋白尿等症状为主要特征,子痫前期严重危害母婴生命健康,是导致孕产妇和围产儿死亡率增高的重要因素之一。近年来,采用中药汤剂、活血化瘀类中药注射液等治疗子痫前期的研究增多,取得了良好的临床疗效。现代药理学研究发现,葛根素、天麻素、钩藤碱、人参皂苷、白术内酯、丹参素、川芎嗪、黄芪甲苷等成分能够促进滋养细胞增殖和侵袭,改善实验动物妊娠过程,对子痫前期的治疗起到积极作用。梳理相关文献,通过结合临床疗效与机制研究,分析中药临床用药合理性,为中药防治子痫前期的临床应用与开发提供参考。

基于网络药理学的中药治疗肥胖的机制研究进展

中药应用临床治疗肥胖疗效确切,但相关机制尚缺乏系统性总结。随着生物信息学的不断发展,基于网络药理学探讨中药治疗肥胖潜在机制已成为研究焦点。本文通过对相关文献的检索分析,整理出单药单成分、药对以及中药复方治疗肥胖的作用机制,主要涉及药物成分、靶点、信号通路等方面,旨在为今后中药治疗肥胖提供新思路与理论参考。

基于网络药理学和分子对接探讨清热类中药作用机制

目的运用网络药理学和分子对接探讨清热药作用机制。方法检索TCMSP、TCMID、NPASS数据库获取5类清热中药活性成分,检索DrugBank、NPASS数据库收集对应靶点,使用UniProt数据库规范靶点名称。使用STRING数据库构建交集靶点蛋白相互作用网络,采用Cytoscape3.9.1软件筛选核心靶点。使用在线软件DAVID进行GO功能、KEGG通路及疾病富集分析,使用Metascape数据库分析特有靶点。使用Discovery Studio 4.5.0软件对清热药共有成分与核心靶点进行分子对接。结果获得清热泻火药活性成分297个、清热燥湿药活性成分609个、清热解毒药活性成分1196个、清热凉血药活性成分224个、清虚热药活性成分为389个,对应靶点分别为117、241、402、87和260个;获得共有活性成分7个,对应靶点196个。GO功能、KEGG通路及疾病富集分析显示,清热药可能通过调节外源代谢过程、单碳代谢过程中的代谢途径对乳腺癌和肿瘤发挥治疗作用。分子对接结果表明,清热药发挥抗肿瘤、抗乳腺癌的核心化学成分可能为棕榈酸、槲皮素、亚油酸。结论清热类中药可通过多途径发挥治疗作用,其中,清热泻火药、清热燥湿药、清热解毒药的生物过程及信号通路较为相似,均可通过调节外源代谢过程、单碳代谢过程、葡萄糖醛酸基转移酶活性的负调控、细胞葡萄糖醛酸化的负调控、雌激素代谢过程、细胞葡萄糖醛酸化中的新陈代谢类信号通路发挥治疗乳腺癌的作用。

基于数据挖掘、网络药理学和分子对接技术的中药治疗高尿酸血症的用药规律及机制分析

目的基于数据挖掘和网络药理学技术探寻高尿酸血症的用药规律和新方药物组合并探讨该新方的理论基础和潜在机制.方法检索建库至2021年12月中国知网、维普数据库、万方数据库关于中医药治疗高尿酸血症的相关文献.采用中医传承辅助平台对其用药频次、四气五味等进行显性规律分析,通过熵聚类对其进行潜在规律分析,得到符合临床的新方药物组合.在此基础上采用网络药理学和分子对接的方法,通过Cytoscape软件,按照标准依次筛选核心靶点,最后通过DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,研究新方的生物信息通路并分析其作用机制.结果通过纳入及排除标准对文献进行筛选,最后得到符合标准的文献150篇,包含方剂160首,涉及中药196味.基于系统聚类分析获得新方(黄柏、牛膝、白术、茯苓),诸药合用有清热利湿、活血通络、健脾化浊之功,配伍恰当,直指病机,故选其进行下一步的蛋白质靶点和信号通路预测.对新方药物组合进行分析,得到治疗高尿酸血症的核心靶点20个.通过KEGG通路分析,其中P<0.05的通路共有121条.分子对接实验发现PTGS2和MAPK8可能是槲皮素的潜在靶点,TNF、EGFR、IL6和SIRT1可能是豆甾醇的潜在靶点.结论中药治疗高尿酸血症多以清热利湿、健脾益气、固肾泄浊为主,新方防治高尿酸血症的主要有效成分包括:小檗碱、槲皮素、黄藤素、汉黄芩素、豆甾醇等,作用于PTGS2、IL6、TNF、EGFR和MAPK8等关键靶点,调控脂质和动脉粥样硬化、IL-17信号通路、TNF信号通路,从而发挥抗炎、促进脂肪分解、改善胰岛素抵抗、调控细胞周期来起到降尿酸的作用.

生物信息学融入中药药理学实验教学设计的探索——以酸枣仁汤为例

以酸枣仁汤为例,将生物信息学融入实验教学设计与实践,实现了理论教学与实验教学的双融合。生物信息学多靶点、多途径的协同调控与中医药的“整体观念”相契合,而数据可视化帮助学生直观“看到”并理解中药复方的作用机制和科学内涵。将酸枣仁汤“异病同治”失眠和阿尔茨海默病的实验划分成3个教学模块,即基础生物信息实验、异病同治实验、机制探索实验,围绕预习探索、模拟实验和团队协作能力进行系统训练,引导学生自主设计并完善验证性实验。通过线上操作、线下考核、课程汇报等方式优化实验教学模式,全方位提升学生对关键知识的理解能力、应用能力和创新能力。

基于数据挖掘和网络药理学研究中药免疫增强剂的作用机制及用药规律

目的采用数据挖掘的方法探究复方专利处方中用于增强免疫力的中药配伍规律,并运用网络药理学、分子对接技术分析其中核心药物的潜在作用机制。方法挖掘国家知识产权局中药增强免疫力的复方专利数据,进行中药频次、关联规则以及复杂网络分析,并筛选出核心药物。利用TCMSP平台筛选核心药物活性成分并进行靶点预测,于疾病数据库OMIM、DrugBank、GeneCards、Uniprot筛选免疫力相关靶点,获取核心中药与免疫力的交集靶点;对交集靶点进行蛋白互作(PPI)分析和基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用分子对接技术对药物活性成分、关键靶点进行验证。结果分析中药复方专利得出5味核心药物:黄芪、人参、枸杞子、茯苓、当归,有效活性成分对应靶点214个,1784个免疫力相关靶点,交集靶点55个,关键作用靶点有RELA、TNF、TP53、IL-6。GO分析结果显示主要调控对细菌起源分子的反应、对脂多糖的反应、对生物刺激的反应等。KEGG通路160条,主要涉及脂质与动脉粥样硬化、南美洲锥虫病、TNF信号通路、癌症通路等多条信号通路。分子对接结果显示,槲皮素、山柰酚能较好地与RELA、TNF、TP53、IL-6进行结合。结论专利文献中增强免疫力的中药以补虚药为主,主要有效成分为槲皮素、山柰酚等化合物,以RELA、TNF、TP53、IL-6为关键靶点,通过脂质和动脉粥样硬化、南美洲锥虫病、TNF信号通路、癌症通路等多条通路发挥增强免疫力的作用。

基于网络药理学和分子对接技术探讨中药外敷1号应用于唇炎的相关机制

目的应用网络药理学和分子对接技术探讨中药外敷1号(TCM-EAN1)对于唇炎的相关作用机制。方法在TCMSP数据库中获取TCM-EAN1的活性成分和潜在靶点,疾病靶点利用DisGeNet和GeneCards获取,采用Venny取疾病-药物的交集,采用String数据库构建蛋白互作网络,采用Cytoscape软件构建疾病-靶点-中药有效成分-药物网络,应用David数据库将TCM-EAN1进行GO和KEGG富集分析,应用AutoDock对TCM-EAN1的活性成分和关键治疗唇炎靶点进行分子对接验证。结果TCM-EAN1与唇炎的相关作用靶点共35个,蛋白相互作用(PPI)结果显示核心靶点分别是TP53、TNF、HIF1A、BCL-2、RXRA、EGFR、IL-6、PTGS2、CDKN1A,通过网络构建核心有效成分分别为槲皮素、汉黄芩素、木犀草素、山柰酚、β-谷甾醇、白鲜明碱、前茵芋碱、豆甾醇和苦参素。GO分析共获得429条生物过程,主要有:基因表达的正向调控、凋亡过程的负调控、转录的正调控、炎症反应、细胞外空间、细胞因子活性、生长因子活性等,KEGG共获得107条通路,主要与IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路、Th17细胞分化、TNF信号通路等相关,分子对接结果显示,豆甾醇、β-谷甾醇与核心靶点有较好的结合性。结论通过网络药理学和分子对接技术初步探讨TCM-EAN1对于唇炎的作用机制,为今后临床治疗提供科学依据。

中药防治化疗所致恶心呕吐的网络药理学研究

目的分析中药防治化疗所致恶心呕吐(CINV)的处方规律,探索其作用靶点及相关信号通路,揭示可能的作用机制。方法收集中药防治CINV的方剂,应用中医传承辅助平台V 2.5分析组方规律,筛选核心药物;应用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)v 2.0探索核心药物防治CINV的作用靶点和信号通路。结果收集、处理后,得到方剂119首,生姜出现的频次最高(49次),其次是半夏(39次)、人参(39次);得到6891个靶点基因,富集到157条信号通路。结论大半夏汤为中药防治CINV的核心方剂,其作用机制与抑制炎症反应相关,可能通过调控肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)信号通路实现。

基于转录组学和网络药理学探讨肉鸡免疫应激的发病机制并预测有效中药

为了基于转录组学和网络药理学方法揭示肉鸡免疫应激的可能发生机制,并进行有效中药的预测。本试验将8只红羽肉鸡随机分成对照组和模型组[注射脂多糖(LPS)诱导免疫应激],采用转录组学技术筛选差异表达基因;通过STRING数据库将差异表达基因构建蛋白-蛋白互作网络,应用MCODE和CytoHubba插件筛选网络中显著模块和关键靶点;分别利用DAVID和Metscape数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;应用Coremine Medical数据库预测作用于关键靶点的中药。结果显示,共获得129个差异表达基因,利用Cytoscape插件筛选出15个关键靶点,主要富集于蛋白质折叠,对内质网应激的反应,内质网中的蛋白质加工,脂肪酸降解(β-氧化),缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解以及过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等;有效中药预测结果显示,补益药和清热药可能是预防和治疗肉鸡免疫应激的有效中药。肉鸡免疫应激核心靶点的预测和分析揭示了肉鸡免疫应激的发病机制,内质网应激和脂肪酸代谢调控网络失衡可能是肉鸡免疫应激发生发展中的关键环节。本试验结果为养殖过程中肉鸡免疫应激的防治提供了参考依据。

基于数据挖掘及网络药理学探讨中药治疗肺癌脑转移的用药规律及相关机制

目的 基于数据挖掘及网络药理学探讨中药治疗肺癌脑转移的用药规律和作用机制。方法 (1)通过中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文期刊服务平台、中国生物医学文献服务系统检索中药治疗肺癌脑转移的文献,提取文献中的处方及中药组成等信息,分析药物的使用频次和性味归经频次,并进行关联规则分析和聚类分析。(2)通过中药系统药理数据和分析平台、本草组鉴数据库、中医药百科全书数据库收集并筛选核心药对的有效活性成分,利用SwissTargetPrediction平台获取其作用靶点。在DrugBank数据库、GeneCards■数据库、DisGeNET数据库检索肺癌脑转移的疾病靶点。取两者交集后,构建蛋白-蛋白相互作用网络和药物-成分-靶点网络筛选核心靶点和主要活性成分,并进行富集分析,通过分子对接技术进行验证。结果 纳入46篇文献,共包含47首处方,涉及204味中药,总使用频次为853次,药性以寒性、温性、平性为主,药味以甘味、苦味、辛味为主,归经以肺经、肝经、脾经为主。关联规则分析得到10个药对,其中黄芪-地龙为核心药对,聚类分析得到4类药物组合。黄芪-地龙的主要活性成分为华良姜素、二氢辣椒素、常春藤皂苷元、肉豆蔻油酸等,主要作用于酪氨酸激酶、肿瘤抑制蛋白、细胞色素P450家族1亚家族A成员1、信号传导及转录激活蛋白(STAT3)等核心靶点,通过癌症通路、癌症中的蛋白聚糖、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信号通路等信号通路发挥治疗作用。分子对接显示主要活性成分与核心靶点对接良好,其中常春藤皂苷元与STAT3结合性最佳。结论 肺癌脑转移病机属本虚标实,“虚、热、痰、瘀、风”为其基本病理因素。中药治疗肺癌脑转移以扶正祛邪为主要治则,其核心药物通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗作用。

网络药理学和斑马鱼模型在中药药效物质及作用机制研究中的应用进展

网络药理学高度契合中药多成分、多靶点的整体观和系统论思想,在中药现代化过程中迅速发展。实验验证是网络药理学的关键研究内容之一。斑马鱼模型具有完整的药物代谢系统、复杂的体内环境和靶点、通路调控机制,且利用该模型开展实验具有用药量少、高通量、周期短等优势。近年来,网络药理学预测结合斑马鱼模型实验验证的研究模式,在阐明中药药效物质及作用机制方面得到广泛应用。本文对网络药理学和斑马鱼模型综合应用的进展及发展趋势进行综述,以期为该方法在阐明中药功效现代科学内涵中的应用提供参考。