日本结核分枝杆菌北京家族株的系统发生学与基因学特征

为评价目前在日本流行的结核分枝杆菌的基因结构特征,对从全日本结核病患者中分离到的237株北京家族株进行了系统发生学的研究。与之前来自于其他国家的报道不同,古老亚型菌株是日本的主要流行株。成簇分析建立在JATA-VNTR(日本防痨协会随机重复序列的可变数目)的基础上,这种方法可以描述日本结核分枝杆菌菌株的独特的VNTR方法,结果揭示了现代亚型菌株间没有地域来源的区别,具有高度的相似性。JATA-VNTR方法可能对在经常分离出古老亚型菌株的菌群中进行系统发生学研究是有价值的。

天津地区临床分离株结核分枝杆菌分子流行病学研究

目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日～11月25日就诊病人痰培养阳性的结核分枝杆菌100株，采用间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）和数目可变串联重复序列（VNTR）两种方法进行基因分型，并运用软件对二者的结果进行分析。依据北京分化支的定义。运用多重和实时定量PCR方法将其区分为W菌/典型北京家族菌株和非典型北京菌株，x^2检验分析两种亚群与患者年龄和耐药性之间的联系。结果排除污染菌株，共对96株结核分枝杆菌临床分离株进行两种方法的基因分型，Spoligotyping结果为91．7％为北京基因型（含3株类北京基因型）结核分枝杆菌（88／96）。VNTR分型可将北京基因型分为60种基因型。在北京分化支结核分枝杆菌中，W菌/典型北京家族菌株占93．2％（82／88）。两种北京分化支亚群与患者年龄和耐药性没有显著性统计学差异（P〉0.05）。结论天津地区结核病患者临床分离的结核分枝杆菌中，北京基因型呈现较为明显的优势。VNTR的分辨率明显高于Spoligotyping。北京分化支的两种亚群在天津地区临床结核病患者中均存在流行，但以W菌/典型北京家族菌株为主。

结核分枝杆菌W-北京家族菌株研究进展

近年来许多对结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, M.TB)的研究特别提到"W菌株"、"北京菌株"、"北京基因型菌株"或"W-北京家族菌株".这些菌株传播广泛,有时引起大范围的结核病(tuberculosis,TB)爆发,在某些情况下又与多耐药性(multidrug resistance,MDR)有联系,从而引起人们的极大关注.这种遗传上高度保守的M.TB菌株家族是包括中国在内的广大地区的优势菌株,是结核病控制工作中值得研究的问题.本文综述该菌株家族的分子特征、传播证据及对其分布优势的解释.

相同多态性位点对结核分枝杆菌北京家族菌株多位点可变数目串联重复序列基因型构成的影响

目的探讨多态性相同的位点对北京家族结核分枝杆菌多位点可变数目串联重复序列（MIRU-VNTR）基因分型的影响，为合理选择分型位点提供科学依据。方法分别选取9个及12个位点，构成4组MIRU—VNTR位点组合，其中，9位点组成的两个组合中，分别有两个不同位点（MIRU40／MIRUl6）多态性一致，其余为相同位点；12位点的两个组合则分别包括另外两个多态性相同的位点（MIRu39／MIRu31）。进行聚类分析，比较含有相同多态性的不同位点组合的分辨能力、成簇能力以及基因型特点。结果9位点两个组合都将菌株分为三群，其中，Ⅲ群菌株仅有1株相同，分别占组合1、2的2．0％和1．6％。12位点组合也将菌株分为三群，第Ⅱ群菌株组成差异非常明显，完全没有相同的菌株。结论多态性相同的位点对北京家族菌株MIRU—VNTR基因分型影响较大。在选择MIRU—VNTR分型位点时，应不仅仅检验位点的分辨能力和对成簇的影响，还应考虑有相同／相近多态性的位点对基因型构成的影响。

分枝杆菌散在分布重复单位分型法在分辨北京株结核分枝杆菌基因分型中的初步研究

随机按比例抽取武汉市结核病防治所2005年7—12月肺结核病患者的菌株，为评估分枝杆菌散在分布重复单位（MIRU）方法对北京家族株的分辨能力进行分型分析。

天津地区临床分离结核分枝杆菌分型的初步研究

目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日-11月25日就诊患者痰培养阳性的结核分枝杆菌100株,采用间隔区寡核苷酸分型(sp01igotyping)和多位点可变串联重复序列(VNTR)两种方法进行基因分型,并运用软件对二者的结果进行分析。依据北京分化支的定义,运用多重和实时定量PCR方法将其区分为W菌/典型北京家族菌株和非典型北京菌株,X^2检验分析两种亚群与患者年龄和耐药性之间的联系。结果排除污染菌株,共对96株结核分枝杆菌临床分离株进行两种方法的基因分型,spoligotyping结果91.7%为北京基因型(含3株类北京基因型)结核分枝杆菌(88/96)。VNTR分型可将北京基因型分为60种基因型。在北京分化支结核分枝杆菌中,W菌/典型北京家族菌株占93.2%(82/88)。两种北京分化支亚群与患者年龄及耐药性之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论天津地区结核病患者临床分离的结核分枝杆菌中,北京基因型呈现较为明显的优势。VNTR的分辨率明显高于spoligotyping。北京分化支的两种亚群在天津地区临床结核病患者中均有流行,但以W菌/典型北京家族菌株为主。